Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Mast.Mast_Pheno.cls #Group6_versus_Group8.Mast_Pheno.cls #Group6_versus_Group8_repos
Phenotype	Mast_Pheno.cls#Group6_versus_Group8_repos
Upregulated in class	4
GeneSet	HALLMARK_HYPOXIA
Enrichment Score (ES)	0.27740508
Normalized Enrichment Score (NES)	1.167559
Nominal p-value	0.24765478
FDR q-value	0.5590429
FWER p-Value	0.944

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Ero1a	156	0.773	0.0129	Yes
2	Ets1	185	0.747	0.0352	Yes
3	Ugp2	197	0.734	0.0586	Yes
4	Ext1	214	0.724	0.0812	Yes
5	Mxi1	215	0.722	0.1050	Yes
6	Vhl	358	0.627	0.1142	Yes
7	Klf6	383	0.619	0.1327	Yes
8	Gbe1	442	0.604	0.1479	Yes
9	Xpnpep1	469	0.592	0.1653	Yes
10	Myh9	603	0.553	0.1728	Yes
11	Prdx5	609	0.552	0.1906	Yes
12	Gys1	645	0.536	0.2055	Yes
13	Tpd52	723	0.510	0.2161	Yes
14	Isg20	795	0.489	0.2265	Yes
15	Hexa	932	0.458	0.2305	Yes
16	Ndst2	950	0.456	0.2442	Yes
17	Gpi1	1125	0.435	0.2445	Yes
18	Vegfa	1309	0.410	0.2431	Yes
19	Pfkl	1339	0.407	0.2542	Yes
20	Grhpr	1478	0.386	0.2558	Yes
21	Ids	1499	0.383	0.2668	Yes
22	Ankzf1	1557	0.374	0.2745	Yes
23	Plin2	1667	0.356	0.2774	Yes
24	Ppp1r15a	2014	0.315	0.2597	No
25	Gcnt2	2287	0.287	0.2471	No
26	Foxo3	2350	0.281	0.2514	No
27	Hdlbp	2427	0.277	0.2544	No
28	Tgm2	2700	0.259	0.2408	No
29	Eno3	2762	0.255	0.2443	No
30	Casp6	2880	0.247	0.2430	No
31	Slc2a1	2916	0.244	0.2482	No
32	Hs3st1	3036	0.233	0.2462	No
33	Pklr	3111	0.228	0.2477	No
34	Plaur	3190	0.224	0.2488	No
35	Pgk1	3267	0.218	0.2498	No
36	Glrx	3415	0.203	0.2446	No
37	Cavin1	3538	0.192	0.2410	No
38	Nr3c1	3652	0.183	0.2379	No
39	Atp7a	3793	0.173	0.2323	No
40	Irs2	3985	0.159	0.2220	No
41	Rbpj	4001	0.158	0.2260	No
42	Tpi1	4090	0.149	0.2237	No
43	Nedd4l	4135	0.146	0.2250	No
44	Mif	4152	0.145	0.2285	No
45	Pgm2	4168	0.143	0.2320	No
46	Kif5a	4208	0.140	0.2335	No
47	Cdkn1a	4252	0.137	0.2345	No
48	Fosl2	4282	0.135	0.2366	No
49	Cdkn1b	4283	0.135	0.2410	No
50	Lxn	4324	0.131	0.2421	No
51	Jun	4385	0.126	0.2414	No
52	Wsb1	4406	0.124	0.2438	No
53	Hk1	4408	0.124	0.2478	No
54	Gaa	4816	0.093	0.2179	No
55	Pim1	4961	0.081	0.2089	No
56	Prkca	5034	0.076	0.2055	No
57	Ldha	5127	0.069	0.2003	No
58	Ndrg1	5135	0.069	0.2020	No
59	Fos	5189	0.065	0.1999	No
60	Dusp1	5280	0.057	0.1945	No
61	Ier3	5422	0.048	0.1846	No
62	Gpc1	5458	0.045	0.1833	No
63	Tnfaip3	5520	0.040	0.1796	No
64	P4ha1	5531	0.040	0.1801	No
65	Ddit3	5542	0.039	0.1806	No
66	Phkg1	5559	0.038	0.1805	No
67	Ampd3	5593	0.036	0.1791	No
68	Fam162a	5808	0.020	0.1624	No
69	Klf7	5949	0.011	0.1514	No
70	Sdc2	6123	0.000	0.1373	No
71	Vldlr	6127	0.000	0.1371	No
72	Gpc3	6210	0.000	0.1304	No
73	Ndst1	6633	-0.018	0.0968	No
74	Jmjd6	6679	-0.021	0.0938	No
75	Ccng2	7242	-0.055	0.0500	No
76	Angptl4	7259	-0.057	0.0506	No
77	Hk2	7549	-0.073	0.0295	No
78	Large1	7577	-0.075	0.0298	No
79	Col5a1	7692	-0.083	0.0233	No
80	Sap30	7701	-0.083	0.0254	No
81	Bcl2	7780	-0.088	0.0220	No
82	B3galt6	7794	-0.090	0.0239	No
83	Tiparp	8030	-0.107	0.0083	No
84	Il6	8050	-0.108	0.0103	No
85	Pnrc1	8167	-0.115	0.0047	No
86	Pdk3	8180	-0.117	0.0076	No
87	Btg1	8604	-0.148	-0.0218	No
88	Ilvbl	8614	-0.148	-0.0177	No
89	Cited2	8721	-0.156	-0.0211	No
90	Zfp292	8771	-0.159	-0.0199	No
91	Rora	8875	-0.168	-0.0227	No
92	Noct	9036	-0.180	-0.0297	No
93	Kdm3a	9142	-0.190	-0.0319	No
94	Nagk	9187	-0.193	-0.0292	No
95	Slc6a6	9225	-0.195	-0.0257	No
96	Bnip3l	9499	-0.218	-0.0407	No
97	Pdk1	9688	-0.234	-0.0482	No
98	Gpc4	9986	-0.258	-0.0638	No
99	Map3k1	9992	-0.258	-0.0557	No
100	Plac8	10008	-0.260	-0.0483	No
101	Selenbp1	10021	-0.261	-0.0407	No
102	Bhlhe40	10168	-0.267	-0.0437	No
103	Hspa5	10295	-0.275	-0.0448	No
104	Anxa2	10402	-0.288	-0.0439	No
105	Tpst2	10526	-0.301	-0.0440	No
106	Pgm1	10570	-0.306	-0.0374	No
107	Pfkp	10603	-0.310	-0.0297	No
108	Tes	10691	-0.319	-0.0263	No
109	Slc37a4	10724	-0.322	-0.0182	No
110	Scarb1	11063	-0.357	-0.0339	No
111	Klhl24	11103	-0.360	-0.0252	No
112	Aldoa	11231	-0.379	-0.0230	No
113	Siah2	11258	-0.383	-0.0124	No
114	Slc2a3	11279	-0.386	-0.0013	No
115	Pfkfb3	11391	-0.403	0.0030	No
116	Cxcr4	11408	-0.407	0.0151	No
117	Galk1	11664	-0.455	0.0094	No
118	Pam	11832	-0.480	0.0117	No
119	Ddit4	11976	-0.524	0.0174	No
120	Slc25a1	12196	-0.614	0.0199	No