Details for gene set HALLMARK_P53

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Mast.Mast_Pheno.cls #Group3_versus_Group4.Mast_Pheno.cls #Group3_versus_Group4_repos
Phenotype	Mast_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Upregulated in class	2
GeneSet	HALLMARK_P53_PATHWAY
Enrichment Score (ES)	0.27908942
Normalized Enrichment Score (NES)	1.2776173
Nominal p-value	0.07007576
FDR q-value	0.55331916
FWER p-Value	0.832

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Ptpn14	12	1.154	0.0272	Yes
2	Ppm1d	24	1.028	0.0514	Yes
3	Sat1	50	0.914	0.0717	Yes
4	Vdr	94	0.829	0.0885	Yes
5	Tax1bp3	95	0.828	0.1087	Yes
6	Coq8a	113	0.798	0.1268	Yes
7	Hspa4l	146	0.766	0.1429	Yes
8	Pidd1	330	0.634	0.1435	Yes
9	Vwa5a	344	0.624	0.1577	Yes
10	Wrap73	358	0.621	0.1718	Yes
11	Ninj1	403	0.608	0.1831	Yes
12	Mxd1	451	0.591	0.1937	Yes
13	Fos	708	0.504	0.1852	Yes
14	Ccnd2	729	0.500	0.1958	Yes
15	Iscu	927	0.464	0.1911	Yes
16	Abat	1115	0.422	0.1862	Yes
17	F2r	1138	0.421	0.1947	Yes
18	App	1149	0.419	0.2041	Yes
19	Zmat3	1159	0.418	0.2136	Yes
20	Rhbdf2	1168	0.417	0.2231	Yes
21	Triap1	1214	0.412	0.2295	Yes
22	Aen	1257	0.407	0.2360	Yes
23	Mxd4	1302	0.400	0.2422	Yes
24	Stom	1431	0.381	0.2411	Yes
25	Fdxr	1545	0.361	0.2408	Yes
26	Fbxw7	1558	0.360	0.2486	Yes
27	Ccng1	1589	0.354	0.2548	Yes
28	Notch1	1660	0.346	0.2575	Yes
29	Pmm1	1849	0.320	0.2501	Yes
30	Abcc5	1862	0.320	0.2569	Yes
31	Dcxr	1873	0.318	0.2639	Yes
32	Pom121	1887	0.317	0.2706	Yes
33	Csrnp2	1985	0.304	0.2701	Yes
34	Acvr1b	2000	0.302	0.2763	Yes
35	Hras	2056	0.297	0.2791	Yes
36	Elp1	2248	0.276	0.2703	No
37	Slc19a2	2394	0.266	0.2650	No
38	Ier3	2412	0.265	0.2701	No
39	Rnf19b	2436	0.263	0.2746	No
40	Kif13b	2474	0.259	0.2780	No
41	Foxo3	2594	0.247	0.2743	No
42	Traf4	2621	0.244	0.2782	No
43	Rrp8	2702	0.235	0.2774	No
44	Ralgds	2904	0.220	0.2664	No
45	Ankra2	2941	0.216	0.2688	No
46	Pitpnc1	3111	0.207	0.2601	No
47	Ppp1r15a	3199	0.199	0.2579	No
48	Plk3	3229	0.196	0.2603	No
49	Klk8	3292	0.191	0.2599	No
50	Ctsd	3319	0.189	0.2624	No
51	Tprkb	3367	0.185	0.2631	No
52	Mdm2	3374	0.185	0.2672	No
53	Steap3	3496	0.173	0.2616	No
54	Rb1	3547	0.169	0.2616	No
55	Fuca1	3563	0.168	0.2645	No
56	H2ac25	3772	0.151	0.2513	No
57	H2aj	4059	0.129	0.2312	No
58	Btg1	4104	0.126	0.2307	No
59	Rpl18	4223	0.117	0.2239	No
60	Pvt1	4315	0.111	0.2192	No
61	Polh	4350	0.109	0.2191	No
62	Cd81	4379	0.107	0.2195	No
63	Dram1	4456	0.102	0.2158	No
64	Tm7sf3	4467	0.100	0.2174	No
65	Rad9a	4799	0.077	0.1924	No
66	Apaf1	4807	0.077	0.1937	No
67	Ip6k2	4907	0.069	0.1873	No
68	Casp1	4910	0.069	0.1888	No
69	Rxra	4928	0.068	0.1891	No
70	Slc3a2	5015	0.062	0.1836	No
71	Dgka	5479	0.033	0.1468	No
72	Rap2b	5498	0.032	0.1461	No
73	Vamp8	5554	0.027	0.1423	No
74	Zbtb16	5555	0.027	0.1429	No
75	Trp53	5633	0.023	0.1372	No
76	Tap1	5663	0.021	0.1354	No
77	Ctsf	5831	0.012	0.1221	No
78	Xpc	5840	0.011	0.1217	No
79	Tspyl2	5887	0.007	0.1181	No
80	Tcn2	6078	-0.000	0.1027	No
81	Ercc5	6183	-0.005	0.0943	No
82	Ccp110	6277	-0.011	0.0870	No
83	Ptpre	6407	-0.020	0.0770	No
84	Ier5	6506	-0.026	0.0697	No
85	Tsc22d1	6554	-0.028	0.0665	No
86	Trafd1	6556	-0.028	0.0671	No
87	Fam162a	6590	-0.030	0.0652	No
88	Ddb2	6603	-0.031	0.0650	No
89	Cd82	6711	-0.039	0.0572	No
90	Prmt2	7103	-0.063	0.0270	No
91	Sp1	7149	-0.066	0.0249	No
92	Tgfb1	7224	-0.069	0.0206	No
93	Rpl36	7367	-0.078	0.0109	No
94	Rab40c	7424	-0.082	0.0084	No
95	Dnttip2	7695	-0.100	-0.0111	No
96	Ada	7734	-0.103	-0.0117	No
97	Def6	7792	-0.107	-0.0137	No
98	Rps12	7827	-0.110	-0.0138	No
99	Blcap	7843	-0.112	-0.0123	No
100	Ei24	7874	-0.113	-0.0120	No
101	Bak1	7901	-0.115	-0.0113	No
102	Hdac3	8179	-0.133	-0.0306	No
103	Mapkapk3	8232	-0.136	-0.0315	No
104	Sphk1	8278	-0.139	-0.0317	No
105	Itgb4	8298	-0.141	-0.0298	No
106	Wwp1	8308	-0.142	-0.0271	No
107	Tob1	8553	-0.158	-0.0431	No
108	Pcna	8573	-0.161	-0.0407	No
109	Gm2a	8609	-0.163	-0.0396	No
110	Ddit3	8626	-0.165	-0.0368	No
111	Sesn1	8637	-0.166	-0.0336	No
112	Btg2	8796	-0.177	-0.0421	No
113	Sertad3	8876	-0.183	-0.0441	No
114	Mknk2	9013	-0.193	-0.0504	No
115	Plxnb2	9088	-0.198	-0.0516	No
116	Cebpa	9263	-0.211	-0.0606	No
117	Retsat	9325	-0.216	-0.0603	No
118	Ddit4	9340	-0.217	-0.0561	No
119	Cdk5r1	9487	-0.226	-0.0625	No
120	Osgin1	9536	-0.228	-0.0608	No
121	Sec61a1	9588	-0.233	-0.0593	No
122	Cgrrf1	9816	-0.251	-0.0716	No
123	Tgfa	9864	-0.256	-0.0692	No
124	Ccnd3	10034	-0.270	-0.0763	No
125	Cdkn1a	10046	-0.270	-0.0706	No
126	Abhd4	10085	-0.273	-0.0670	No
127	Zfp36l1	10136	-0.278	-0.0643	No
128	Cdkn2aip	10260	-0.289	-0.0673	No
129	Cdh13	10381	-0.298	-0.0697	No
130	Irak1	10494	-0.310	-0.0713	No
131	Rps27l	10846	-0.350	-0.0913	No
132	H1f2	10888	-0.355	-0.0859	No
133	Hexim1	11030	-0.373	-0.0883	No
134	Hint1	11056	-0.376	-0.0811	No
135	Slc35d1	11152	-0.390	-0.0793	No
136	Rack1	11190	-0.395	-0.0727	No
137	Jun	11222	-0.399	-0.0655	No
138	Baiap2	11244	-0.403	-0.0573	No
139	Ndrg1	11261	-0.405	-0.0487	No
140	Txnip	11275	-0.407	-0.0398	No
141	Cyfip2	11591	-0.459	-0.0542	No
142	Irag2	11633	-0.467	-0.0462	No
143	S100a10	11642	-0.469	-0.0354	No
144	Nol8	11824	-0.502	-0.0378	No
145	Bax	12153	-0.633	-0.0490	No
146	Ccnk	12199	-0.662	-0.0365	No
147	Gadd45a	12217	-0.676	-0.0214	No
148	Prkab1	12302	-0.749	-0.0099	No
149	Rchy1	12369	-0.866	0.0059	No