Details for gene set HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Mast.Mast_Pheno.cls #Group2_versus_Group4.Mast_Pheno.cls #Group2_versus_Group4_repos
Phenotype	Mast_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA_NFKB
Enrichment Score (ES)	0.34232375
Normalized Enrichment Score (NES)	1.3197304
Nominal p-value	0.13806707
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	0.694

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Sat1	8	1.214	0.0368	Yes
2	Birc3	87	0.835	0.0562	Yes
3	Bcl3	174	0.732	0.0718	Yes
4	Rigi	260	0.668	0.0855	Yes
5	Tnip1	289	0.652	0.1033	Yes
6	Rnf19b	310	0.641	0.1214	Yes
7	Fos	369	0.619	0.1358	Yes
8	Litaf	436	0.592	0.1487	Yes
9	Nfkbie	465	0.583	0.1644	Yes
10	Mxd1	494	0.574	0.1798	Yes
11	Plaur	572	0.550	0.1905	Yes
12	Ppp1r15a	735	0.502	0.1928	Yes
13	Fosb	785	0.491	0.2040	Yes
14	Nfat5	852	0.475	0.2133	Yes
15	Cflar	866	0.473	0.2268	Yes
16	Nfkb2	906	0.464	0.2379	Yes
17	Ninj1	936	0.458	0.2497	Yes
18	Irf1	1292	0.404	0.2333	Yes
19	Snn	1338	0.397	0.2419	Yes
20	Ier5	1389	0.389	0.2498	Yes
21	Tnf	1427	0.383	0.2587	Yes
22	Cd44	1522	0.371	0.2625	Yes
23	Bhlhe40	1639	0.352	0.2639	Yes
24	Tnfaip3	1645	0.352	0.2743	Yes
25	Btg1	1658	0.350	0.2842	Yes
26	Ldlr	1677	0.349	0.2934	Yes
27	Plek	1700	0.345	0.3023	Yes
28	Rel	1874	0.320	0.2981	Yes
29	Rela	1902	0.317	0.3057	Yes
30	Ets2	1970	0.310	0.3098	Yes
31	Rcan1	2003	0.307	0.3167	Yes
32	Nampt	2006	0.307	0.3259	Yes
33	Fosl2	2043	0.303	0.3323	Yes
34	Btg3	2046	0.302	0.3415	Yes
35	Klf10	2146	0.288	0.3423	Yes
36	Pdlim5	2286	0.273	0.3394	No
37	Vegfa	2379	0.264	0.3401	No
38	Panx1	2465	0.256	0.3411	No
39	Nfe2l2	2581	0.245	0.3393	No
40	Jun	2908	0.216	0.3195	No
41	Id2	3038	0.203	0.3153	No
42	Slc2a3	3149	0.192	0.3123	No
43	Tnfaip2	3205	0.187	0.3136	No
44	Atp2b1	3318	0.177	0.3099	No
45	Klf9	3334	0.176	0.3141	No
46	Rhob	3428	0.169	0.3118	No
47	Relb	3442	0.168	0.3159	No
48	B4galt5	3580	0.155	0.3096	No
49	Abca1	3713	0.142	0.3032	No
50	Marcks	3785	0.137	0.3017	No
51	Irs2	3858	0.132	0.2999	No
52	Kdm6b	4228	0.104	0.2732	No
53	Tnfaip8	4468	0.085	0.2564	No
54	Hes1	4519	0.081	0.2548	No
55	Cdkn1a	4579	0.077	0.2524	No
56	Pmepa1	4601	0.074	0.2530	No
57	Nr4a2	4622	0.072	0.2536	No
58	Cd69	4734	0.065	0.2466	No
59	Il6	4754	0.064	0.2470	No
60	Pde4b	4783	0.063	0.2467	No
61	Tsc22d1	4961	0.051	0.2339	No
62	Trip10	4990	0.050	0.2332	No
63	Nfkbia	5055	0.046	0.2294	No
64	Nfkb1	5070	0.044	0.2296	No
65	Slc2a6	5093	0.043	0.2291	No
66	Sgk1	5112	0.042	0.2289	No
67	Sqstm1	5243	0.034	0.2194	No
68	Csf1	5264	0.032	0.2188	No
69	Zbtb10	5331	0.029	0.2143	No
70	Dusp1	5551	0.013	0.1970	No
71	Per1	5640	0.007	0.1900	No
72	Bcl6	5648	0.006	0.1896	No
73	Dram1	5764	-0.001	0.1803	No
74	Mcl1	5955	-0.015	0.1654	No
75	Tgif1	6027	-0.020	0.1602	No
76	Tap1	6134	-0.028	0.1525	No
77	Zc3h12a	6136	-0.029	0.1533	No
78	Ier2	6272	-0.038	0.1435	No
79	Tubb2a	6315	-0.041	0.1414	No
80	Eif1	6359	-0.045	0.1392	No
81	Map2k3	6368	-0.045	0.1400	No
82	Il6st	6382	-0.046	0.1404	No
83	Pnrc1	6414	-0.048	0.1393	No
84	Egr1	6603	-0.060	0.1259	No
85	Ccrl2	6768	-0.072	0.1148	No
86	Tiparp	6884	-0.079	0.1079	No
87	Gfpt2	7067	-0.091	0.0959	No
88	Klf6	7168	-0.099	0.0909	No
89	Tank	7345	-0.110	0.0800	No
90	Smad3	7574	-0.124	0.0653	No
91	Clcf1	7790	-0.138	0.0521	No
92	Junb	7935	-0.147	0.0450	No
93	Slc16a6	8105	-0.160	0.0362	No
94	Tnip2	8130	-0.162	0.0392	No
95	Gpr183	8274	-0.173	0.0329	No
96	Ier3	8367	-0.180	0.0310	No
97	Dennd5a	8681	-0.202	0.0119	No
98	Ehd1	8720	-0.205	0.0151	No
99	Gem	8819	-0.212	0.0137	No
100	Dnajb4	9035	-0.230	0.0033	No
101	Ifit2	9036	-0.230	0.0104	No
102	Ptpre	9082	-0.233	0.0139	No
103	Ptger4	9134	-0.239	0.0171	No
104	Ifih1	9339	-0.254	0.0084	No
105	Birc2	9369	-0.256	0.0140	No
106	Il18	9416	-0.259	0.0182	No
107	Fut4	9465	-0.262	0.0224	No
108	Il15ra	9613	-0.274	0.0189	No
109	Dusp2	9635	-0.275	0.0257	No
110	Dusp5	9863	-0.294	0.0163	No
111	Btg2	9904	-0.298	0.0222	No
112	Ifngr2	9933	-0.301	0.0292	No
113	Sphk1	10082	-0.314	0.0269	No
114	Icam1	10085	-0.314	0.0364	No
115	Gch1	10255	-0.331	0.0329	No
116	Lamb3	10367	-0.344	0.0345	No
117	Stat5a	10476	-0.354	0.0366	No
118	Pfkfb3	10568	-0.366	0.0405	No
119	Ripk2	10703	-0.381	0.0414	No
120	Sod2	11375	-0.471	0.0014	No
121	Yrdc	11416	-0.477	0.0129	No
122	Myc	11429	-0.480	0.0267	No
123	Ccnl1	11677	-0.525	0.0228	No
124	B4galt1	11959	-0.607	0.0187	No
125	Gadd45a	12109	-0.660	0.0270	No