Details for gene set HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Mast.Mast_Pheno.cls #Group2_versus_Group3.Mast_Pheno.cls #Group2_versus_Group3_repos
Phenotype	Mast_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA_NFKB
Enrichment Score (ES)	0.30553603
Normalized Enrichment Score (NES)	1.1781276
Nominal p-value	0.23856859
FDR q-value	0.9678935
FWER p-Value	0.941

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Gpr183	106	0.784	0.0144	Yes
2	Ifit2	115	0.776	0.0366	Yes
3	Litaf	138	0.750	0.0569	Yes
4	Tnfaip3	184	0.717	0.0743	Yes
5	Ier2	396	0.611	0.0752	Yes
6	Rel	412	0.605	0.0918	Yes
7	Il6	428	0.598	0.1081	Yes
8	Jun	441	0.595	0.1247	Yes
9	Abca1	479	0.584	0.1388	Yes
10	Cd69	526	0.566	0.1518	Yes
11	Nr4a2	743	0.508	0.1492	Yes
12	Ldlr	814	0.489	0.1579	Yes
13	Fosl2	863	0.478	0.1680	Yes
14	Rigi	938	0.462	0.1756	Yes
15	Pmepa1	940	0.462	0.1891	Yes
16	Birc2	1065	0.438	0.1920	Yes
17	Klf10	1095	0.435	0.2024	Yes
18	Nfkbie	1149	0.425	0.2106	Yes
19	Egr1	1183	0.421	0.2203	Yes
20	Ier5	1204	0.417	0.2310	Yes
21	Il15ra	1253	0.408	0.2391	Yes
22	Gfpt2	1325	0.397	0.2450	Yes
23	Cdkn1a	1465	0.376	0.2448	Yes
24	Ppp1r15a	1507	0.370	0.2523	Yes
25	Ccnl1	1562	0.361	0.2586	Yes
26	Hes1	1576	0.360	0.2681	Yes
27	Tnfaip8	1590	0.359	0.2776	Yes
28	Rnf19b	1636	0.353	0.2843	Yes
29	Bhlhe40	1638	0.352	0.2946	Yes
30	Slc2a3	2150	0.288	0.2616	Yes
31	Relb	2165	0.286	0.2689	Yes
32	Rcan1	2219	0.281	0.2729	Yes
33	Zc3h12a	2269	0.277	0.2770	Yes
34	Tnip2	2342	0.271	0.2791	Yes
35	Btg3	2353	0.270	0.2863	Yes
36	Btg1	2355	0.269	0.2941	Yes
37	Vegfa	2420	0.264	0.2967	Yes
38	Klf6	2507	0.257	0.2973	Yes
39	Cd44	2659	0.239	0.2920	Yes
40	Gch1	2668	0.239	0.2984	Yes
41	Id2	2812	0.225	0.2934	Yes
42	Junb	2901	0.216	0.2926	Yes
43	Bcl3	2961	0.210	0.2940	Yes
44	Sat1	3013	0.206	0.2959	Yes
45	Tnf	3018	0.205	0.3017	Yes
46	Icam1	3110	0.197	0.3001	Yes
47	Per1	3115	0.197	0.3055	Yes
48	Fos	3188	0.190	0.3053	No
49	Sgk1	3378	0.176	0.2951	No
50	Atp2b1	3379	0.176	0.3003	No
51	Smad3	3380	0.176	0.3055	No
52	Birc3	3476	0.167	0.3027	No
53	Sqstm1	3744	0.147	0.2853	No
54	Fosb	3782	0.144	0.2865	No
55	Mxd1	3789	0.143	0.2903	No
56	Tiparp	3796	0.143	0.2940	No
57	Ccrl2	3846	0.140	0.2941	No
58	Panx1	3852	0.139	0.2978	No
59	B4galt5	3896	0.135	0.2983	No
60	Nfkbia	4169	0.114	0.2795	No
61	Slc2a6	4321	0.103	0.2703	No
62	Cflar	4426	0.093	0.2646	No
63	Tsc22d1	4528	0.084	0.2589	No
64	Nampt	4541	0.084	0.2604	No
65	Bcl6	4549	0.083	0.2622	No
66	Rhob	4562	0.081	0.2636	No
67	Plaur	4723	0.072	0.2528	No
68	Fut4	4812	0.067	0.2476	No
69	Map2k3	5142	0.044	0.2222	No
70	Myc	5145	0.044	0.2233	No
71	Nfe2l2	5366	0.030	0.2063	No
72	Kdm6b	5385	0.028	0.2057	No
73	Dusp1	5501	0.021	0.1970	No
74	Ninj1	5531	0.018	0.1952	No
75	Dnajb4	5608	0.014	0.1894	No
76	Ifih1	5743	0.005	0.1786	No
77	Nfkb1	5800	0.002	0.1742	No
78	Nfat5	6160	-0.023	0.1457	No
79	Plek	6172	-0.024	0.1455	No
80	Trip10	6196	-0.026	0.1444	No
81	Irf1	6343	-0.035	0.1335	No
82	Klf9	6555	-0.051	0.1179	No
83	Tap1	6581	-0.053	0.1174	No
84	Rela	6621	-0.055	0.1159	No
85	Tubb2a	6757	-0.065	0.1068	No
86	Eif1	7220	-0.098	0.0722	No
87	Ehd1	7357	-0.107	0.0643	No
88	Tnip1	7408	-0.111	0.0635	No
89	Gadd45a	7411	-0.111	0.0666	No
90	Dram1	7769	-0.135	0.0416	No
91	Dennd5a	7780	-0.136	0.0448	No
92	Mcl1	7824	-0.140	0.0454	No
93	Dusp2	7828	-0.140	0.0493	No
94	Btg2	7875	-0.144	0.0498	No
95	Pde4b	7930	-0.148	0.0497	No
96	Snn	8031	-0.155	0.0462	No
97	Ptger4	8197	-0.165	0.0376	No
98	Il18	8318	-0.174	0.0330	No
99	Pdlim5	8471	-0.184	0.0261	No
100	Sphk1	8572	-0.191	0.0236	No
101	Ptpre	8858	-0.213	0.0067	No
102	Ripk2	8923	-0.218	0.0079	No
103	Pfkfb3	8981	-0.224	0.0099	No
104	Il6st	9033	-0.227	0.0124	No
105	Tank	9061	-0.229	0.0170	No
106	Clcf1	9098	-0.232	0.0209	No
107	Ifngr2	9105	-0.233	0.0273	No
108	Irs2	9124	-0.234	0.0327	No
109	Dusp5	9144	-0.236	0.0381	No
110	Gem	9281	-0.246	0.0343	No
111	Stat5a	9321	-0.251	0.0385	No
112	Nfkb2	9479	-0.262	0.0335	No
113	Ets2	9767	-0.287	0.0186	No
114	Csf1	10261	-0.336	-0.0116	No
115	Marcks	10859	-0.403	-0.0482	No
116	Zbtb10	11131	-0.436	-0.0573	No
117	Tnfaip2	11323	-0.466	-0.0591	No
118	Tgif1	11545	-0.502	-0.0623	No
119	Sod2	11599	-0.513	-0.0515	No
120	Yrdc	11656	-0.527	-0.0406	No
121	Ier3	11689	-0.534	-0.0274	No
122	Pnrc1	11751	-0.550	-0.0162	No
123	Slc16a6	12099	-0.669	-0.0247	No
124	B4galt1	12352	-0.873	-0.0195	No
125	Lamb3	12368	-0.904	0.0059	No