Details for gene set HALLMARK_G2M

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Mast.Mast_Pheno.cls #Group2_versus_Group3.Mast_Pheno.cls #Group2_versus_Group3_repos
Phenotype	Mast_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_G2M_CHECKPOINT
Enrichment Score (ES)	0.24289404
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0429075
Nominal p-value	0.3859649
FDR q-value	0.9492029
FWER p-Value	0.997

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Cdk1	18	1.017	0.0200	Yes
2	Ndc80	80	0.823	0.0323	Yes
3	Kif23	85	0.811	0.0491	Yes
4	Rasal2	118	0.770	0.0627	Yes
5	Dmd	167	0.727	0.0741	Yes
6	Hspa8	213	0.698	0.0852	Yes
7	Plk1	337	0.637	0.0886	Yes
8	Incenp	532	0.563	0.0846	Yes
9	Ccnt1	575	0.549	0.0927	Yes
10	Nsd2	622	0.535	0.1003	Yes
11	Odf2	771	0.501	0.0988	Yes
12	Tle3	798	0.494	0.1070	Yes
13	Ezh2	858	0.478	0.1123	Yes
14	Tmpo	885	0.473	0.1201	Yes
15	Lbr	963	0.457	0.1235	Yes
16	Meis1	1029	0.445	0.1276	Yes
17	Orc5	1034	0.444	0.1366	Yes
18	Pbk	1082	0.435	0.1420	Yes
19	Sqle	1189	0.420	0.1422	Yes
20	Pura	1278	0.404	0.1435	Yes
21	Cdc7	1309	0.400	0.1495	Yes
22	Srsf1	1379	0.390	0.1521	Yes
23	H2az1	1569	0.361	0.1442	Yes
24	Amd1	1669	0.347	0.1435	Yes
25	Casp8ap2	1679	0.345	0.1500	Yes
26	Hnrnpu	1684	0.344	0.1569	Yes
27	Numa1	1711	0.340	0.1620	Yes
28	Top1	1715	0.340	0.1689	Yes
29	Kif15	1848	0.323	0.1649	Yes
30	Exo1	1877	0.319	0.1694	Yes
31	Upf1	1898	0.317	0.1744	Yes
32	Cul5	1899	0.317	0.1811	Yes
33	Prc1	1999	0.305	0.1795	Yes
34	Egf	2087	0.295	0.1786	Yes
35	Smc4	2088	0.295	0.1848	Yes
36	Tfdp1	2103	0.294	0.1899	Yes
37	Slc7a1	2187	0.284	0.1891	Yes
38	Cul1	2215	0.282	0.1928	Yes
39	Xpo1	2232	0.279	0.1974	Yes
40	Tra2b	2308	0.274	0.1970	Yes
41	Pttg1	2309	0.274	0.2028	Yes
42	Ddx39a	2332	0.272	0.2068	Yes
43	Cdkn2c	2336	0.271	0.2122	Yes
44	Gins2	2414	0.265	0.2115	Yes
45	Smarcc1	2470	0.260	0.2125	Yes
46	Knl1	2529	0.254	0.2131	Yes
47	Jpt1	2539	0.253	0.2177	Yes
48	Ttk	2657	0.240	0.2132	Yes
49	Cdkn3	2676	0.238	0.2168	Yes
50	Slc12a2	2751	0.232	0.2156	Yes
51	Racgap1	2759	0.230	0.2199	Yes
52	Bub3	2828	0.223	0.2191	Yes
53	Plk4	2858	0.220	0.2213	Yes
54	Prim2	2880	0.218	0.2242	Yes
55	Tpx2	2888	0.217	0.2282	Yes
56	Ccnf	2919	0.214	0.2303	Yes
57	Arid4a	2928	0.213	0.2341	Yes
58	Bcl3	2961	0.210	0.2359	Yes
59	Cenpe	2986	0.208	0.2384	Yes
60	Kpnb1	3027	0.205	0.2394	Yes
61	Cdc27	3038	0.204	0.2429	Yes
62	Smad3	3380	0.176	0.2188	No
63	Pafah1b1	3566	0.160	0.2070	No
64	Cdc25a	3780	0.144	0.1927	No
65	Slc7a5	3799	0.143	0.1942	No
66	Prpf4b	3847	0.139	0.1933	No
67	Pds5b	3924	0.132	0.1899	No
68	Troap	3938	0.131	0.1916	No
69	Mcm3	4026	0.125	0.1872	No
70	Kif4	4129	0.117	0.1813	No
71	Fbxo5	4216	0.111	0.1766	No
72	Mad2l1	4250	0.108	0.1762	No
73	Rps6ka5	4304	0.104	0.1741	No
74	Ube2s	4306	0.104	0.1762	No
75	Sfpq	4388	0.096	0.1716	No
76	Sap30	4415	0.094	0.1715	No
77	Hif1a	4445	0.092	0.1710	No
78	Traip	4451	0.091	0.1725	No
79	Cenpf	4568	0.081	0.1648	No
80	Syncrip	4676	0.074	0.1576	No
81	Hmmr	4731	0.071	0.1547	No
82	Ythdc1	4794	0.068	0.1511	No
83	Hnrnpd	4878	0.062	0.1456	No
84	Smc2	4885	0.062	0.1464	No
85	Cdkn1b	4977	0.056	0.1402	No
86	Nasp	5078	0.049	0.1331	No
87	Smc1a	5097	0.047	0.1326	No
88	Dtymk	5110	0.047	0.1326	No
89	Mki67	5121	0.046	0.1327	No
90	Ctcf	5122	0.046	0.1337	No
91	Kif20b	5128	0.045	0.1342	No
92	Myc	5145	0.044	0.1339	No
93	Mnat1	5160	0.043	0.1336	No
94	Rpa2	5282	0.035	0.1245	No
95	Uck2	5309	0.033	0.1231	No
96	Ilf3	5324	0.032	0.1226	No
97	Nup98	5502	0.021	0.1086	No
98	Dr1	5509	0.020	0.1085	No
99	Notch2	5535	0.018	0.1069	No
100	Hus1	5728	0.006	0.0913	No
101	Kif5b	5805	0.001	0.0851	No
102	Cks1b	5821	0.000	0.0839	No
103	Lmnb1	5971	-0.010	0.0720	No
104	E2f1	6047	-0.015	0.0662	No
105	Atf5	6276	-0.031	0.0482	No
106	Dkc1	6374	-0.037	0.0411	No
107	Ube2c	6447	-0.043	0.0361	No
108	Cenpa	6456	-0.044	0.0364	No
109	Prmt5	6599	-0.053	0.0259	No
110	Kif2c	6666	-0.058	0.0218	No
111	Ccnb2	6699	-0.061	0.0204	No
112	Pole	6704	-0.061	0.0214	No
113	Cdk4	6720	-0.062	0.0215	No
114	Bard1	6723	-0.063	0.0227	No
115	Rad21	6836	-0.071	0.0150	No
116	Brca2	6863	-0.073	0.0144	No
117	Stag1	6878	-0.074	0.0149	No
118	Mcm2	7076	-0.089	0.0007	No
119	Birc5	7330	-0.105	-0.0178	No
120	Rbl1	7413	-0.111	-0.0221	No
121	H2ax	7419	-0.111	-0.0202	No
122	Nup50	7450	-0.113	-0.0203	No
123	Mybl2	7476	-0.115	-0.0199	No
124	G3bp1	7569	-0.121	-0.0248	No
125	Ss18	7613	-0.124	-0.0257	No
126	Mcm5	7621	-0.124	-0.0237	No
127	Nek2	7631	-0.125	-0.0218	No
128	Nusap1	7689	-0.129	-0.0237	No
129	Polq	7702	-0.130	-0.0219	No
130	Chek1	7741	-0.133	-0.0222	No
131	Abl1	7759	-0.134	-0.0208	No
132	Pola2	7823	-0.139	-0.0230	No
133	Rad23b	8009	-0.153	-0.0349	No
134	Lig3	8020	-0.154	-0.0324	No
135	Top2a	8076	-0.158	-0.0336	No
136	Srsf2	8295	-0.172	-0.0478	No
137	Kmt5a	8348	-0.176	-0.0483	No
138	Snrpd1	8391	-0.179	-0.0480	No
139	Bub1	8434	-0.181	-0.0476	No
140	Kif11	8448	-0.183	-0.0448	No
141	Mapk14	8487	-0.185	-0.0440	No
142	Stil	8499	-0.185	-0.0410	No
143	Nolc1	8776	-0.207	-0.0591	No
144	Mtf2	8794	-0.209	-0.0561	No
145	Ncl	8796	-0.209	-0.0518	No
146	Fancc	8800	-0.209	-0.0476	No
147	Stmn1	8929	-0.219	-0.0535	No
148	Gspt1	8968	-0.223	-0.0519	No
149	E2f3	9163	-0.237	-0.0627	No
150	Cdc25b	9174	-0.239	-0.0585	No
151	Chaf1a	9361	-0.254	-0.0683	No
152	Hmgb3	9496	-0.264	-0.0737	No
153	Aurkb	9562	-0.269	-0.0733	No
154	Chmp1a	9698	-0.280	-0.0784	No
155	Hira	9724	-0.283	-0.0745	No
156	Orc6	9728	-0.283	-0.0688	No
157	Dbf4	9732	-0.283	-0.0631	No
158	Cdc6	9739	-0.284	-0.0576	No
159	Aurka	9782	-0.288	-0.0550	No
160	Tnpo2	9867	-0.295	-0.0556	No
161	Tacc3	9957	-0.305	-0.0564	No
162	Srsf10	10090	-0.318	-0.0605	No
163	Ewsr1	10115	-0.320	-0.0557	No
164	Mcm6	10181	-0.327	-0.0541	No
165	Atrx	10256	-0.335	-0.0531	No
166	Cul3	10258	-0.335	-0.0461	No
167	Cdc45	10282	-0.337	-0.0409	No
168	Odc1	10358	-0.346	-0.0397	No
169	Slc38a1	10376	-0.347	-0.0338	No
170	Ccna2	10525	-0.363	-0.0382	No
171	Pml	10609	-0.373	-0.0371	No
172	Espl1	10640	-0.377	-0.0316	No
173	E2f2	10715	-0.385	-0.0295	No
174	Cdc20	10779	-0.392	-0.0264	No
175	Tgfb1	10813	-0.397	-0.0208	No
176	Wrn	10840	-0.400	-0.0144	No
177	Marcks	10859	-0.403	-0.0074	No
178	Suv39h1	11100	-0.433	-0.0179	No
179	Rad54l	11165	-0.441	-0.0138	No
180	Cul4a	11218	-0.450	-0.0086	No
181	Tent4a	11324	-0.466	-0.0073	No
182	Map3k20	11529	-0.499	-0.0135	No
183	H2az2	11605	-0.514	-0.0088	No
184	Kif22	11607	-0.515	0.0020	No
185	Katna1	11704	-0.538	0.0055	No
186	Cbx1	11843	-0.574	0.0064	No
187	Foxn3	11951	-0.607	0.0104	No
188	Cks2	11961	-0.611	0.0226	No
189	E2f4	12267	-0.784	0.0142	No