Details for gene set HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Mast.Mast_Pheno.cls #Group1_versus_Group4.Mast_Pheno.cls #Group1_versus_Group4_repos
Phenotype	Mast_Pheno.cls#Group1_versus_Group4_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA_NFKB
Enrichment Score (ES)	0.23829554
Normalized Enrichment Score (NES)	0.9858591
Nominal p-value	0.46542057
FDR q-value	0.7337759
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Fos	60	0.871	0.0201	Yes
2	Btg1	109	0.790	0.0388	Yes
3	Cd44	134	0.761	0.0586	Yes
4	Jun	176	0.726	0.0761	Yes
5	Vegfa	212	0.695	0.0931	Yes
6	Mxd1	235	0.674	0.1106	Yes
7	Sat1	396	0.601	0.1149	Yes
8	Litaf	416	0.595	0.1303	Yes
9	Cflar	486	0.569	0.1410	Yes
10	Rhob	605	0.535	0.1467	Yes
11	Zbtb10	615	0.530	0.1612	Yes
12	Fosb	636	0.523	0.1745	Yes
13	Birc3	720	0.501	0.1821	Yes
14	Rela	721	0.500	0.1965	Yes
15	Plaur	751	0.493	0.2082	Yes
16	Bhlhe40	960	0.451	0.2043	Yes
17	Nfkbie	996	0.444	0.2141	Yes
18	Ninj1	1275	0.389	0.2027	Yes
19	Tnip1	1291	0.387	0.2125	Yes
20	Ppp1r15a	1471	0.361	0.2083	Yes
21	Nfkb2	1499	0.357	0.2164	Yes
22	Snn	1648	0.337	0.2140	Yes
23	Rigi	1696	0.332	0.2197	Yes
24	Dusp1	1735	0.328	0.2260	Yes
25	Bcl6	1765	0.325	0.2330	Yes
26	Tnfaip2	1813	0.320	0.2383	Yes
27	Klf10	1995	0.299	0.2322	No
28	Nampt	2043	0.295	0.2368	No
29	Tnf	2297	0.269	0.2240	No
30	Ccrl2	2398	0.258	0.2232	No
31	B4galt5	2427	0.255	0.2282	No
32	Nfat5	2464	0.252	0.2325	No
33	Zc3h12a	2840	0.217	0.2083	No
34	Irf1	3052	0.196	0.1967	No
35	Tubb2a	3131	0.189	0.1958	No
36	Pnrc1	3345	0.175	0.1835	No
37	B4galt1	3413	0.168	0.1829	No
38	Marcks	3448	0.165	0.1848	No
39	Fosl2	3485	0.163	0.1866	No
40	Dram1	3497	0.162	0.1903	No
41	Lamb3	3578	0.155	0.1883	No
42	Kdm6b	3617	0.152	0.1895	No
43	Slc2a3	3711	0.145	0.1861	No
44	Csf1	3748	0.141	0.1873	No
45	Klf6	3817	0.136	0.1857	No
46	Panx1	3887	0.131	0.1838	No
47	Nfkbia	4047	0.118	0.1743	No
48	Pfkfb3	4234	0.106	0.1622	No
49	Clcf1	4248	0.105	0.1642	No
50	Bcl3	4332	0.098	0.1602	No
51	Ripk2	4378	0.095	0.1593	No
52	Tap1	4654	0.075	0.1391	No
53	Ier2	4708	0.070	0.1368	No
54	Pdlim5	4745	0.067	0.1358	No
55	Rcan1	4761	0.066	0.1365	No
56	Ptger4	4882	0.058	0.1284	No
57	Btg3	5106	0.045	0.1116	No
58	Mcl1	5131	0.042	0.1108	No
59	Smad3	5172	0.039	0.1087	No
60	Tnfaip3	5318	0.028	0.0978	No
61	Il6st	5366	0.026	0.0947	No
62	Ier5	5434	0.021	0.0898	No
63	Klf9	5599	0.010	0.0768	No
64	Rnf19b	5905	-0.009	0.0523	No
65	Dnajb4	6036	-0.016	0.0422	No
66	Fut4	6165	-0.024	0.0325	No
67	Atp2b1	6185	-0.025	0.0317	No
68	Pmepa1	6439	-0.043	0.0124	No
69	Cdkn1a	6512	-0.047	0.0079	No
70	Tank	6811	-0.065	-0.0144	No
71	Plek	6893	-0.070	-0.0190	No
72	Dusp5	6936	-0.073	-0.0203	No
73	Ldlr	7036	-0.079	-0.0261	No
74	Rel	7133	-0.085	-0.0315	No
75	Ehd1	7164	-0.087	-0.0314	No
76	Dusp2	7192	-0.090	-0.0310	No
77	Id2	7232	-0.093	-0.0315	No
78	Tnfaip8	7244	-0.094	-0.0298	No
79	Il6	7463	-0.108	-0.0444	No
80	Hes1	7598	-0.117	-0.0519	No
81	Sqstm1	7706	-0.125	-0.0570	No
82	Slc2a6	7727	-0.126	-0.0550	No
83	Tsc22d1	7854	-0.134	-0.0614	No
84	Nfe2l2	7918	-0.139	-0.0625	No
85	Trip10	8094	-0.151	-0.0724	No
86	Relb	8250	-0.162	-0.0803	No
87	Gpr183	8288	-0.164	-0.0786	No
88	Sgk1	8338	-0.168	-0.0778	No
89	Nr4a2	8521	-0.180	-0.0875	No
90	Ier3	8607	-0.187	-0.0890	No
91	Junb	8623	-0.188	-0.0848	No
92	Slc16a6	8698	-0.194	-0.0853	No
93	Btg2	8841	-0.206	-0.0910	No
94	Map2k3	9009	-0.217	-0.0983	No
95	Dennd5a	9061	-0.220	-0.0961	No
96	Tnip2	9074	-0.221	-0.0908	No
97	Irs2	9320	-0.241	-0.1038	No
98	Icam1	9381	-0.246	-0.1016	No
99	Gfpt2	9733	-0.276	-0.1222	No
100	Ets2	9769	-0.279	-0.1171	No
101	Ifit2	9834	-0.285	-0.1141	No
102	Tiparp	9855	-0.287	-0.1075	No
103	Tgif1	9896	-0.291	-0.1024	No
104	Pde4b	9941	-0.295	-0.0976	No
105	Il15ra	9991	-0.300	-0.0930	No
106	Eif1	10287	-0.325	-0.1076	No
107	Egr1	10348	-0.331	-0.1030	No
108	Ifih1	10352	-0.331	-0.0938	No
109	Il18	10413	-0.337	-0.0890	No
110	Ifngr2	10653	-0.367	-0.0979	No
111	Per1	10888	-0.394	-0.1056	No
112	Nfkb1	11008	-0.411	-0.1035	No
113	Abca1	11040	-0.416	-0.0941	No
114	Gch1	11069	-0.419	-0.0844	No
115	Birc2	11300	-0.456	-0.0900	No
116	Sphk1	11405	-0.476	-0.0849	No
117	Ccnl1	11456	-0.484	-0.0751	No
118	Gem	11785	-0.555	-0.0858	No
119	Sod2	11907	-0.595	-0.0786	No
120	Cd69	11920	-0.600	-0.0624	No
121	Yrdc	11994	-0.624	-0.0505	No
122	Ptpre	11999	-0.625	-0.0329	No
123	Myc	12227	-0.743	-0.0300	No
124	Stat5a	12288	-0.806	-0.0118	No
125	Gadd45a	12321	-0.845	0.0097	No