Details for gene set HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Mast.Mast_Pheno.cls #Group1_versus_Group3.Mast_Pheno.cls #Group1_versus_Group3_repos
Phenotype	Mast_Pheno.cls#Group1_versus_Group3_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA_NFKB
Enrichment Score (ES)	0.20488754
Normalized Enrichment Score (NES)	0.92996913
Nominal p-value	0.60784316
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Jun	36	0.971	0.0231	Yes
2	Zc3h12a	81	0.856	0.0424	Yes
3	Litaf	155	0.737	0.0562	Yes
4	Cd44	161	0.734	0.0754	Yes
5	Btg1	170	0.725	0.0942	Yes
6	Vegfa	222	0.695	0.1086	Yes
7	Il6	411	0.596	0.1093	Yes
8	Il15ra	453	0.579	0.1215	Yes
9	Ier2	499	0.564	0.1329	Yes
10	Gpr183	567	0.545	0.1421	Yes
11	Klf6	669	0.514	0.1476	Yes
12	Ccrl2	751	0.494	0.1542	Yes
13	Rhob	854	0.471	0.1586	Yes
14	Bhlhe40	949	0.451	0.1630	Yes
15	Tnfaip3	983	0.444	0.1722	Yes
16	Dusp1	996	0.442	0.1831	Yes
17	Klf10	1013	0.437	0.1935	Yes
18	Cd69	1117	0.417	0.1963	Yes
19	Ccnl1	1219	0.400	0.1988	Yes
20	Gfpt2	1337	0.380	0.1995	Yes
21	Bcl6	1471	0.363	0.1984	Yes
22	Pmepa1	1638	0.340	0.1940	Yes
23	Fosl2	1743	0.328	0.1943	Yes
24	Smad3	1783	0.324	0.1998	Yes
25	Icam1	1872	0.313	0.2011	Yes
26	Ifit2	1952	0.305	0.2028	Yes
27	Slc2a3	2026	0.299	0.2049	Yes
28	Fos	2145	0.286	0.2030	No
29	Tnip2	2302	0.272	0.1976	No
30	Fut4	2335	0.270	0.2022	No
31	Cdkn1a	2566	0.248	0.1902	No
32	Nfkbie	2601	0.245	0.1940	No
33	Nr4a2	2662	0.240	0.1955	No
34	Fosb	2677	0.239	0.2008	No
35	Egr1	2754	0.231	0.2008	No
36	B4galt5	2814	0.226	0.2020	No
37	Ldlr	3000	0.210	0.1926	No
38	Nfkbia	3112	0.200	0.1890	No
39	Tnfaip8	3187	0.194	0.1881	No
40	Junb	3279	0.186	0.1857	No
41	Tubb2a	3292	0.185	0.1897	No
42	Cflar	3403	0.176	0.1855	No
43	Ppp1r15a	3414	0.175	0.1894	No
44	Birc2	3606	0.159	0.1781	No
45	Rigi	3622	0.158	0.1812	No
46	Ptger4	3665	0.155	0.1819	No
47	Dnajb4	3749	0.148	0.1791	No
48	Gch1	3882	0.136	0.1721	No
49	Pfkfb3	3948	0.131	0.1703	No
50	Clcf1	4007	0.127	0.1690	No
51	Nampt	4158	0.115	0.1599	No
52	Tnf	4222	0.113	0.1578	No
53	Mxd1	4273	0.109	0.1566	No
54	Rcan1	4326	0.106	0.1552	No
55	Ripk2	4640	0.083	0.1321	No
56	Dram1	4742	0.076	0.1259	No
57	Rela	4945	0.060	0.1111	No
58	Kdm6b	5053	0.053	0.1038	No
59	Tap1	5057	0.053	0.1050	No
60	Ier5	5083	0.051	0.1043	No
61	Birc3	5140	0.047	0.1010	No
62	Panx1	5326	0.033	0.0869	No
63	Plaur	5388	0.029	0.0827	No
64	Tiparp	5446	0.025	0.0788	No
65	Abca1	5454	0.025	0.0789	No
66	Sgk1	5511	0.021	0.0749	No
67	Zbtb10	5521	0.020	0.0747	No
68	Relb	5762	0.006	0.0554	No
69	Per1	5803	0.003	0.0522	No
70	Rel	5813	0.003	0.0516	No
71	Dusp2	5840	0.001	0.0495	No
72	Atp2b1	5879	-0.000	0.0464	No
73	Sqstm1	5883	-0.000	0.0462	No
74	Hes1	5945	-0.006	0.0414	No
75	Ehd1	6207	-0.025	0.0209	No
76	Slc2a6	6455	-0.041	0.0019	No
77	Btg3	6594	-0.051	-0.0079	No
78	Dusp5	6713	-0.059	-0.0159	No
79	Btg2	6723	-0.059	-0.0151	No
80	Ifih1	7145	-0.089	-0.0469	No
81	Mcl1	7238	-0.095	-0.0518	No
82	Bcl3	7672	-0.122	-0.0837	No
83	Id2	7842	-0.133	-0.0939	No
84	Tsc22d1	7846	-0.134	-0.0905	No
85	Ninj1	7881	-0.136	-0.0896	No
86	Map2k3	8005	-0.145	-0.0957	No
87	Dennd5a	8076	-0.150	-0.0974	No
88	Il6st	8112	-0.153	-0.0961	No
89	Irf1	8213	-0.161	-0.1000	No
90	Tank	8426	-0.177	-0.1124	No
91	Csf1	8439	-0.178	-0.1086	No
92	Nfkb2	8504	-0.183	-0.1089	No
93	Tnfaip2	9017	-0.219	-0.1446	No
94	Klf9	9037	-0.221	-0.1403	No
95	Nfat5	9115	-0.227	-0.1405	No
96	Trip10	9470	-0.254	-0.1624	No
97	Marcks	9537	-0.262	-0.1608	No
98	Myc	9576	-0.265	-0.1568	No
99	Il18	9835	-0.285	-0.1701	No
100	Rnf19b	9936	-0.294	-0.1703	No
101	Sat1	9963	-0.297	-0.1645	No
102	Snn	10119	-0.311	-0.1687	No
103	Ifngr2	10147	-0.313	-0.1626	No
104	Pnrc1	10245	-0.323	-0.1618	No
105	Gadd45a	10361	-0.333	-0.1622	No
106	Pdlim5	10540	-0.353	-0.1672	No
107	Eif1	10723	-0.374	-0.1720	No
108	Sphk1	11014	-0.408	-0.1846	No
109	Pde4b	11185	-0.434	-0.1868	No
110	B4galt1	11206	-0.438	-0.1767	No
111	Nfe2l2	11239	-0.443	-0.1675	No
112	Nfkb1	11264	-0.447	-0.1575	No
113	Tnip1	11627	-0.514	-0.1731	No
114	Lamb3	11722	-0.537	-0.1663	No
115	Plek	11765	-0.546	-0.1551	No
116	Ier3	11784	-0.551	-0.1419	No
117	Ptpre	11937	-0.606	-0.1380	No
118	Yrdc	12119	-0.674	-0.1347	No
119	Gem	12180	-0.708	-0.1206	No
120	Sod2	12261	-0.781	-0.1062	No
121	Stat5a	12262	-0.781	-0.0853	No
122	Slc16a6	12300	-0.819	-0.0664	No
123	Tgif1	12334	-0.864	-0.0460	No
124	Irs2	12343	-0.872	-0.0233	No
125	Ets2	12427	-1.164	0.0011	No