Details for gene set HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MPP.MPP_Pheno.cls#Group6_versus_Group8.MPP_Pheno.cls#Group6_versus_Group8_repos
Phenotype	MPP_Pheno.cls#Group6_versus_Group8_repos
Upregulated in class	4
GeneSet	HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA_NFKB
Enrichment Score (ES)	0.28832778
Normalized Enrichment Score (NES)	1.2546749
Nominal p-value	0.12840466
FDR q-value	0.54804367
FWER p-Value	0.867

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Klf4	38	1.039	0.0218	Yes
2	Plau	162	0.784	0.0333	Yes
3	Dusp4	218	0.747	0.0475	Yes
4	Ccnd1	234	0.740	0.0637	Yes
5	Per1	413	0.625	0.0688	Yes
6	Olr1	460	0.611	0.0803	Yes
7	Btg3	476	0.609	0.0935	Yes
8	Plpp3	477	0.609	0.1074	Yes
9	Vegfa	572	0.594	0.1161	Yes
10	Trib1	581	0.594	0.1292	Yes
11	Trip10	795	0.555	0.1309	Yes
12	Mcl1	800	0.553	0.1433	Yes
13	Gem	860	0.535	0.1525	Yes
14	Fos	874	0.530	0.1639	Yes
15	Ninj1	896	0.524	0.1748	Yes
16	Ets2	940	0.512	0.1842	Yes
17	Fosl2	956	0.509	0.1951	Yes
18	Zbtb10	970	0.505	0.2060	Yes
19	Fosb	975	0.504	0.2173	Yes
20	Cxcl10	1227	0.464	0.2149	Yes
21	Gpr183	1378	0.443	0.2173	Yes
22	Phlda1	1408	0.440	0.2258	Yes
23	Serpinb2	1685	0.423	0.2212	Yes
24	Il7r	1756	0.421	0.2272	Yes
25	Bcl6	1823	0.416	0.2333	Yes
26	Dusp1	1853	0.414	0.2412	Yes
27	Nr4a1	2142	0.384	0.2351	Yes
28	Birc2	2160	0.381	0.2429	Yes
29	Jag1	2187	0.379	0.2503	Yes
30	Tubb2a	2304	0.365	0.2526	Yes
31	Cd83	2418	0.354	0.2548	Yes
32	Serpinb8	2425	0.353	0.2626	Yes
33	Sqstm1	2521	0.345	0.2656	Yes
34	Map3k8	2528	0.345	0.2731	Yes
35	Klf6	2827	0.318	0.2650	Yes
36	Rela	2894	0.312	0.2687	Yes
37	Tnf	2908	0.312	0.2751	Yes
38	Bhlhe40	3020	0.303	0.2763	Yes
39	Tnfrsf9	3063	0.301	0.2810	Yes
40	Cd80	3131	0.297	0.2844	Yes
41	Relb	3185	0.294	0.2883	Yes
42	Plaur	3318	0.288	0.2881	No
43	Lif	3456	0.277	0.2873	No
44	G0s2	3949	0.252	0.2677	No
45	Nfat5	4224	0.249	0.2592	No
46	Dusp5	4725	0.223	0.2384	No
47	Fjx1	4815	0.218	0.2388	No
48	Tsc22d1	4830	0.217	0.2430	No
49	Pde4b	5041	0.204	0.2368	No
50	Csf1	5240	0.193	0.2310	No
51	Lamb3	5340	0.187	0.2302	No
52	Panx1	5354	0.186	0.2338	No
53	Id2	5486	0.180	0.2311	No
54	Fut4	5733	0.169	0.2222	No
55	Jun	5804	0.164	0.2224	No
56	Map2k3	5904	0.160	0.2209	No
57	Atp2b1	6008	0.156	0.2192	No
58	Hes1	6010	0.156	0.2227	No
59	Birc3	6164	0.147	0.2181	No
60	Kdm6b	6242	0.144	0.2174	No
61	Ier2	6287	0.142	0.2184	No
62	Smad3	6370	0.138	0.2173	No
63	Abca1	6565	0.129	0.2102	No
64	Tlr2	6668	0.123	0.2077	No
65	Il18	6871	0.115	0.1999	No
66	Slc16a6	7070	0.107	0.1921	No
67	Plk2	7080	0.106	0.1941	No
68	Tnfaip8	7096	0.105	0.1957	No
69	Ppp1r15a	7201	0.101	0.1926	No
70	Dnajb4	7281	0.097	0.1908	No
71	Il6st	7374	0.093	0.1882	No
72	Ptgs2	7473	0.089	0.1851	No
73	Bcl3	7506	0.088	0.1855	No
74	Dennd5a	7545	0.086	0.1855	No
75	B4galt1	7700	0.081	0.1794	No
76	Ifit2	7719	0.080	0.1803	No
77	Il15ra	7841	0.075	0.1757	No
78	Clcf1	7933	0.072	0.1727	No
79	Phlda2	8073	0.066	0.1670	No
80	Ier5	8084	0.065	0.1680	No
81	Yrdc	8221	0.060	0.1623	No
82	Kynu	8325	0.057	0.1583	No
83	Ehd1	8434	0.053	0.1539	No
84	Nfe2l2	8513	0.050	0.1510	No
85	Traf1	8521	0.050	0.1518	No
86	Pfkfb3	8583	0.047	0.1497	No
87	Klf10	8659	0.044	0.1468	No
88	Nfil3	8691	0.043	0.1462	No
89	Sgk1	8785	0.040	0.1423	No
90	Ldlr	8868	0.036	0.1389	No
91	Snn	8959	0.033	0.1350	No
92	Spsb1	9079	0.029	0.1295	No
93	Sod2	9153	0.026	0.1263	No
94	Rel	9724	0.004	0.0969	No
95	Tank	9750	0.003	0.0957	No
96	Atf3	10243	-0.003	0.0703	No
97	Btg2	10271	-0.003	0.0690	No
98	Icosl	10516	-0.011	0.0566	No
99	Egr1	10530	-0.011	0.0562	No
100	Sat1	10700	-0.016	0.0478	No
101	Nampt	10841	-0.021	0.0411	No
102	Zc3h12a	10946	-0.026	0.0363	No
103	Cdkn1a	10951	-0.026	0.0367	No
104	Cd44	10970	-0.027	0.0364	No
105	Slc2a3	10997	-0.028	0.0357	No
106	Litaf	11068	-0.031	0.0328	No
107	Gfpt2	11110	-0.032	0.0314	No
108	Tnip1	11250	-0.037	0.0251	No
109	Dusp2	11286	-0.039	0.0241	No
110	Fosl1	11817	-0.058	-0.0019	No
111	Ptpre	11919	-0.062	-0.0057	No
112	Ifih1	12184	-0.073	-0.0177	No
113	Irs2	12290	-0.077	-0.0214	No
114	Rigi	12358	-0.078	-0.0231	No
115	Icam1	12387	-0.079	-0.0227	No
116	Nr4a2	12571	-0.087	-0.0302	No
117	B4galt5	12607	-0.088	-0.0300	No
118	Tnfaip2	12692	-0.091	-0.0323	No
119	Sphk1	12894	-0.100	-0.0404	No
120	Klf2	12924	-0.101	-0.0395	No
121	Nfkb1	13249	-0.113	-0.0537	No
122	Irf1	13306	-0.116	-0.0540	No
123	Btg1	13354	-0.117	-0.0537	No
124	Gch1	13584	-0.128	-0.0626	No
125	Cd69	13658	-0.131	-0.0634	No
126	Pmepa1	14069	-0.148	-0.0812	No
127	Tgif1	14092	-0.150	-0.0789	No
128	Dram1	14365	-0.163	-0.0893	No
129	Klf9	14506	-0.170	-0.0926	No
130	Myc	14566	-0.173	-0.0917	No
131	Hbegf	14685	-0.178	-0.0938	No
132	Stat5a	14720	-0.179	-0.0914	No
133	Zfp36	14867	-0.188	-0.0947	No
134	Junb	15147	-0.203	-0.1045	No
135	Ccnl1	15150	-0.204	-0.0999	No
136	Slc2a6	15454	-0.219	-0.1106	No
137	Marcks	15867	-0.243	-0.1263	No
138	Efna1	15936	-0.247	-0.1242	No
139	Ier3	15965	-0.249	-0.1200	No
140	Cflar	16011	-0.251	-0.1165	No
141	Plek	16141	-0.260	-0.1173	No
142	Rcan1	16175	-0.262	-0.1130	No
143	Ripk2	16236	-0.266	-0.1100	No
144	Pnrc1	16612	-0.287	-0.1229	No
145	Rhob	16886	-0.302	-0.1301	No
146	Ccl5	16891	-0.303	-0.1234	No
147	Maff	16910	-0.305	-0.1173	No
148	Eif1	16960	-0.308	-0.1128	No
149	Tnfaip3	17395	-0.334	-0.1276	No
150	Gadd45b	17546	-0.350	-0.1274	No
151	Tap1	17939	-0.385	-0.1388	No
152	Cebpd	18201	-0.418	-0.1428	No
153	Tnip2	18385	-0.445	-0.1421	No
154	Tiparp	18409	-0.448	-0.1330	No
155	Gadd45a	18452	-0.455	-0.1248	No
156	Pdlim5	18532	-0.468	-0.1182	No
157	Nfkb2	18628	-0.480	-0.1122	No
158	Rnf19b	18691	-0.492	-0.1041	No
159	Cebpb	19008	-0.557	-0.1077	No
160	Ptger4	19017	-0.561	-0.0953	No
161	Tnfsf9	19044	-0.569	-0.0837	No
162	Nfkbie	19053	-0.575	-0.0710	No
163	Nfkbia	19128	-0.601	-0.0610	No
164	Ccrl2	19255	-0.670	-0.0523	No
165	Socs3	19281	-0.685	-0.0379	No
166	Ifngr2	19334	-0.715	-0.0243	No
167	Mxd1	19337	-0.715	-0.0081	No
168	Sdc4	19375	-0.746	0.0071	No