Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MPP.MPP_Pheno.cls#Group6_versus_Group8.MPP_Pheno.cls#Group6_versus_Group8_repos
Phenotype	MPP_Pheno.cls#Group6_versus_Group8_repos
Upregulated in class	4
GeneSet	HALLMARK_MYOGENESIS
Enrichment Score (ES)	0.22917286
Normalized Enrichment Score (NES)	0.9408551
Nominal p-value	0.5872093
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	0.997

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Mapk12	52	0.989	0.0290	Yes
2	Actn2	104	0.848	0.0535	Yes
3	Col4a2	253	0.720	0.0689	Yes
4	Cryab	594	0.591	0.0703	Yes
5	Ryr1	811	0.547	0.0766	Yes
6	Chrnb1	882	0.527	0.0899	Yes
7	Aebp1	954	0.510	0.1025	Yes
8	Pkia	1036	0.494	0.1141	Yes
9	Tsc2	1041	0.493	0.1297	Yes
10	Speg	1049	0.491	0.1451	Yes
11	Fdps	1089	0.483	0.1585	Yes
12	Large1	1561	0.434	0.1481	Yes
13	Actn3	1615	0.429	0.1591	Yes
14	Pygm	1682	0.423	0.1692	Yes
15	Tagln	1734	0.421	0.1801	Yes
16	Svil	1905	0.409	0.1844	Yes
17	Dmd	2270	0.369	0.1774	Yes
18	Ifrd1	2343	0.362	0.1853	Yes
19	Cox7a1	2623	0.334	0.1816	Yes
20	Kifc3	2645	0.332	0.1912	Yes
21	Psen2	2990	0.305	0.1832	Yes
22	Bhlhe40	3020	0.303	0.1914	Yes
23	Gpx3	3023	0.303	0.2009	Yes
24	Dtna	3161	0.295	0.2033	Yes
25	Hspb8	3333	0.286	0.2036	Yes
26	Eno3	3599	0.271	0.1986	Yes
27	Myom1	3694	0.264	0.2022	Yes
28	Cd36	3902	0.255	0.1997	Yes
29	Kcnh1	3926	0.254	0.2067	Yes
30	Sptan1	4030	0.252	0.2094	Yes
31	Ckb	4126	0.251	0.2125	Yes
32	Csrp3	4138	0.251	0.2200	Yes
33	Atp2a1	4205	0.250	0.2246	Yes
34	Sspn	4752	0.221	0.2035	Yes
35	Stc2	4784	0.219	0.2089	Yes
36	Acsl1	4885	0.214	0.2106	Yes
37	Efs	4919	0.212	0.2157	Yes
38	Adam12	5014	0.206	0.2174	Yes
39	Myh11	5106	0.200	0.2191	Yes
40	Myh9	5159	0.198	0.2228	Yes
41	Fgf2	5207	0.196	0.2266	Yes
42	Schip1	5277	0.191	0.2292	Yes
43	Adcy9	5619	0.174	0.2171	No
44	Tpm3	5741	0.168	0.2163	No
45	Sorbs1	5769	0.167	0.2202	No
46	Mybpc3	5851	0.163	0.2212	No
47	Tnnt3	6080	0.152	0.2143	No
48	Kcnh2	6094	0.152	0.2185	No
49	Mylk	6349	0.139	0.2099	No
50	Clu	6437	0.135	0.2097	No
51	Cdh13	6497	0.132	0.2108	No
52	Pick1	6575	0.128	0.2110	No
53	Klf5	6752	0.120	0.2057	No
54	Itgb4	6791	0.119	0.2076	No
55	Tnnc1	6881	0.114	0.2066	No
56	Myl4	7380	0.093	0.1839	No
57	Agl	7390	0.093	0.1864	No
58	Prnp	7575	0.085	0.1797	No
59	Fhl1	7694	0.081	0.1762	No
60	Slc6a8	7752	0.079	0.1757	No
61	Nos1	7982	0.070	0.1662	No
62	Reep1	7995	0.069	0.1678	No
63	Eif4a2	8143	0.063	0.1622	No
64	Sparc	8222	0.060	0.1601	No
65	Myl6b	8404	0.054	0.1525	No
66	Lama2	8493	0.051	0.1495	No
67	Sh2b1	8562	0.048	0.1476	No
68	Agrn	8570	0.048	0.1487	No
69	Ptp4a3	8584	0.047	0.1496	No
70	Ablim1	8648	0.045	0.1478	No
71	Pcx	8726	0.042	0.1451	No
72	Dmpk	8998	0.031	0.1321	No
73	Mylpf	9015	0.031	0.1323	No
74	Smtn	9085	0.028	0.1296	No
75	Igf1	9173	0.024	0.1259	No
76	Ache	9333	0.019	0.1183	No
77	Tnnt1	9487	0.013	0.1108	No
78	Mef2a	9497	0.013	0.1108	No
79	App	9828	0.000	0.0937	No
80	Itgb1	10206	-0.001	0.0743	No
81	Mef2c	10248	-0.003	0.0723	No
82	Bin1	10352	-0.007	0.0672	No
83	Nav2	10498	-0.010	0.0600	No
84	Ncam1	10660	-0.014	0.0522	No
85	Mras	10816	-0.021	0.0448	No
86	Cdkn1a	10951	-0.026	0.0387	No
87	Flii	11039	-0.029	0.0352	No
88	Sh3bgr	11219	-0.036	0.0271	No
89	Sorbs3	11284	-0.039	0.0250	No
90	Mapre3	11960	-0.064	-0.0078	No
91	Lpin1	12060	-0.068	-0.0107	No
92	Notch1	12296	-0.077	-0.0203	No
93	Tnni2	12404	-0.080	-0.0233	No
94	Ldb3	12429	-0.081	-0.0220	No
95	Sphk1	12894	-0.100	-0.0427	No
96	Myo1c	13047	-0.106	-0.0472	No
97	Wwtr1	13289	-0.115	-0.0559	No
98	Fkbp1b	13356	-0.117	-0.0556	No
99	Pfkm	13361	-0.118	-0.0520	No
100	Sgcd	13428	-0.121	-0.0516	No
101	Gja5	13545	-0.126	-0.0535	No
102	Foxo4	13592	-0.128	-0.0518	No
103	Plxnb2	13707	-0.134	-0.0534	No
104	Ak1	13720	-0.134	-0.0497	No
105	Pde4dip	13782	-0.137	-0.0485	No
106	Tgfb1	14198	-0.155	-0.0650	No
107	Gnao1	14257	-0.158	-0.0629	No
108	Bag1	14354	-0.163	-0.0626	No
109	Rb1	14587	-0.174	-0.0691	No
110	Camk2b	14630	-0.175	-0.0656	No
111	Hbegf	14685	-0.178	-0.0627	No
112	Atp6ap1	14822	-0.185	-0.0638	No
113	Tpm2	14872	-0.188	-0.0603	No
114	Hdac5	14881	-0.189	-0.0547	No
115	Gaa	15058	-0.199	-0.0574	No
116	Tpd52l1	15068	-0.200	-0.0515	No
117	Erbb3	15686	-0.232	-0.0759	No
118	Mef2d	15951	-0.248	-0.0816	No
119	Ppfia4	16021	-0.251	-0.0771	No
120	Akt2	16079	-0.256	-0.0719	No
121	Pdlim7	16497	-0.278	-0.0845	No
122	Itgb5	16512	-0.279	-0.0763	No
123	Cnn3	16595	-0.286	-0.0714	No
124	Ctf1	17101	-0.315	-0.0874	No
125	Cfd	17252	-0.325	-0.0847	No
126	Col1a1	17339	-0.330	-0.0786	No
127	Lsp1	17372	-0.332	-0.0696	No
128	Vipr1	17428	-0.338	-0.0617	No
129	Gadd45b	17546	-0.350	-0.0565	No
130	Nqo1	17756	-0.365	-0.0556	No
131	Gabarapl2	18166	-0.414	-0.0635	No
132	Igfbp7	18196	-0.417	-0.0516	No
133	Dapk2	18472	-0.459	-0.0511	No
134	Syngr2	18486	-0.462	-0.0370	No
135	Rit1	18502	-0.463	-0.0230	No
136	Ocel1	18525	-0.466	-0.0092	No
137	Gsn	19030	-0.565	-0.0171	No
138	Sirt2	19067	-0.582	-0.0003	No
139	Crat	19351	-0.727	0.0083	No