Details for gene set HALLMARK_APICAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MPP.MPP_Pheno.cls#Group6_versus_Group8.MPP_Pheno.cls#Group6_versus_Group8_repos
Phenotype	MPP_Pheno.cls#Group6_versus_Group8_repos
Upregulated in class	4
GeneSet	HALLMARK_APICAL_JUNCTION
Enrichment Score (ES)	0.2175281
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0514284
Nominal p-value	0.3294347
FDR q-value	0.8675649
FWER p-Value	0.991

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Amigo2	70	0.908	0.0188	Yes
2	Fscn1	86	0.874	0.0395	Yes
3	Slit2	93	0.861	0.0605	Yes
4	Actn2	104	0.848	0.0809	Yes
5	Nectin2	115	0.825	0.1007	Yes
6	Itga3	144	0.796	0.1189	Yes
7	Myh10	274	0.703	0.1295	Yes
8	Nexn	376	0.644	0.1402	Yes
9	Thbs3	394	0.636	0.1550	Yes
10	Sgce	447	0.616	0.1675	Yes
11	Vcan	723	0.570	0.1673	Yes
12	Vwf	920	0.517	0.1700	Yes
13	Cercam	942	0.511	0.1815	Yes
14	Gnai1	955	0.509	0.1934	Yes
15	Speg	1049	0.491	0.2007	Yes
16	Actn3	1615	0.429	0.1821	Yes
17	Cdk8	1999	0.401	0.1722	Yes
18	Cap1	2083	0.390	0.1775	Yes
19	Actg1	2263	0.370	0.1774	Yes
20	Sirpa	2353	0.361	0.1817	Yes
21	Pard6g	2475	0.349	0.1841	Yes
22	Cadm3	2573	0.339	0.1874	Yes
23	Col16a1	2632	0.334	0.1926	Yes
24	Mapk11	2752	0.323	0.1945	Yes
25	Icam4	2855	0.316	0.1970	Yes
26	Irs1	3027	0.303	0.1956	Yes
27	Bmp1	3183	0.294	0.1948	Yes
28	Nrtn	3460	0.277	0.1874	Yes
29	Epb41l2	3513	0.276	0.1915	Yes
30	Cx3cl1	3525	0.276	0.1978	Yes
31	Rhof	3693	0.265	0.1956	Yes
32	Ptk2	3823	0.260	0.1954	Yes
33	Mapk13	3946	0.252	0.1953	Yes
34	Cldn4	3968	0.252	0.2004	Yes
35	Cdh11	4032	0.252	0.2034	Yes
36	Alox8	4130	0.251	0.2046	Yes
37	Shroom2	4145	0.251	0.2100	Yes
38	Rac2	4220	0.249	0.2123	Yes
39	Nlgn2	4239	0.248	0.2175	Yes
40	Cdh8	4425	0.236	0.2138	No
41	Msn	4775	0.220	0.2012	No
42	Actn4	4865	0.215	0.2019	No
43	Shc1	4957	0.210	0.2023	No
44	Src	5062	0.203	0.2020	No
45	Myh9	5159	0.198	0.2019	No
46	Sdc3	5213	0.195	0.2040	No
47	Cd276	5319	0.189	0.2032	No
48	Lamb3	5340	0.187	0.2068	No
49	Plcg1	5358	0.186	0.2105	No
50	Tjp1	5657	0.172	0.1993	No
51	Rras	5729	0.169	0.1998	No
52	Ywhah	5825	0.164	0.1990	No
53	Gtf2f1	5921	0.160	0.1980	No
54	Fbn1	5949	0.159	0.2005	No
55	Kcnh2	6094	0.152	0.1968	No
56	Vav2	6156	0.148	0.1973	No
57	Arhgef6	6217	0.145	0.1978	No
58	Rasa1	6252	0.143	0.1996	No
59	Cd86	6257	0.143	0.2029	No
60	Stx4a	6485	0.132	0.1944	No
61	Cadm2	6502	0.132	0.1968	No
62	Cdh4	6644	0.125	0.1926	No
63	Itgb4	6791	0.119	0.1880	No
64	Lima1	7103	0.105	0.1745	No
65	Nectin1	7219	0.100	0.1711	No
66	Inppl1	7439	0.090	0.1620	No
67	Jam3	7533	0.087	0.1593	No
68	Amh	7680	0.081	0.1538	No
69	B4galt1	7700	0.081	0.1548	No
70	Evl	7823	0.076	0.1503	No
71	Nf1	7992	0.069	0.1434	No
72	Traf1	8521	0.050	0.1173	No
73	Negr1	8658	0.044	0.1114	No
74	Tubg1	8699	0.043	0.1104	No
75	Exoc4	8735	0.042	0.1096	No
76	Mmp2	8832	0.038	0.1055	No
77	Dlg1	8841	0.037	0.1060	No
78	Map3k20	8961	0.033	0.1007	No
79	Nf2	9147	0.026	0.0918	No
80	Cdh1	9206	0.023	0.0894	No
81	Actn1	9698	0.005	0.0641	No
82	Pkd1	9765	0.002	0.0607	No
83	Tial1	9781	0.001	0.0600	No
84	Itgb1	10206	-0.001	0.0381	No
85	Crb3	10319	-0.006	0.0325	No
86	Ctnna1	10522	-0.011	0.0223	No
87	Mapk14	10592	-0.013	0.0190	No
88	Gamt	10797	-0.020	0.0090	No
89	Tro	10809	-0.020	0.0089	No
90	Zyx	10884	-0.023	0.0057	No
91	Pfn1	10968	-0.027	0.0020	No
92	Taok2	10981	-0.027	0.0021	No
93	Sympk	11147	-0.034	-0.0056	No
94	Sorbs3	11284	-0.039	-0.0117	No
95	Dsc1	11602	-0.050	-0.0268	No
96	Hadh	11675	-0.052	-0.0293	No
97	Wasl	11942	-0.063	-0.0415	No
98	Skap2	12097	-0.070	-0.0477	No
99	Rsu1	12365	-0.079	-0.0595	No
100	Icam1	12387	-0.079	-0.0587	No
101	Jup	12484	-0.083	-0.0616	No
102	Tsc1	12485	-0.083	-0.0596	No
103	Ctnnd1	12749	-0.094	-0.0708	No
104	Amigo1	12764	-0.095	-0.0692	No
105	Nrap	12786	-0.096	-0.0679	No
106	Mvd	12810	-0.097	-0.0667	No
107	Pten	13212	-0.111	-0.0847	No
108	Arpc2	13314	-0.116	-0.0871	No
109	Baiap2	13402	-0.120	-0.0886	No
110	Mdk	13501	-0.124	-0.0907	No
111	Tmem8b	13540	-0.126	-0.0895	No
112	Pik3cb	13560	-0.127	-0.0874	No
113	Adam9	13589	-0.128	-0.0857	No
114	Cntn1	13696	-0.133	-0.0879	No
115	Nlgn3	13768	-0.136	-0.0882	No
116	Cldn7	13980	-0.145	-0.0955	No
117	Cd274	13984	-0.145	-0.0921	No
118	Itga9	14129	-0.152	-0.0958	No
119	Akt3	14187	-0.155	-0.0949	No
120	Map4k2	14277	-0.159	-0.0956	No
121	Syk	14429	-0.166	-0.0993	No
122	Ptprc	14441	-0.167	-0.0958	No
123	Vcam1	14488	-0.169	-0.0940	No
124	Icam2	14570	-0.173	-0.0939	No
125	Cldn15	14794	-0.183	-0.1009	No
126	Itga2	14849	-0.187	-0.0991	No
127	Vasp	14894	-0.189	-0.0967	No
128	Pals1	14972	-0.194	-0.0959	No
129	Cd34	15210	-0.207	-0.1030	No
130	Gnai2	15253	-0.209	-0.1000	No
131	Itga10	15674	-0.231	-0.1160	No
132	Insig1	15878	-0.244	-0.1205	No
133	Akt2	16079	-0.256	-0.1246	No
134	Adam15	16205	-0.264	-0.1245	No
135	Icam5	16276	-0.269	-0.1215	No
136	Nrxn2	16737	-0.295	-0.1380	No
137	Wnk4	16741	-0.295	-0.1309	No
138	Dhx16	16893	-0.303	-0.1312	No
139	Tgfbi	16945	-0.307	-0.1263	No
140	Nectin3	17044	-0.311	-0.1237	No
141	Adamts5	17053	-0.311	-0.1164	No
142	Adam23	17238	-0.325	-0.1179	No
143	Pbx2	17283	-0.326	-0.1121	No
144	Actb	17450	-0.339	-0.1123	No
145	Vcl	17463	-0.340	-0.1046	No
146	Cnn2	17519	-0.346	-0.0989	No
147	Myl12b	17692	-0.361	-0.0989	No
148	Nectin4	17963	-0.388	-0.1033	No
149	Lama3	18189	-0.417	-0.1046	No
150	Mpzl1	18274	-0.428	-0.0984	No
151	Pik3r3	18455	-0.455	-0.0965	No
152	Cdh6	18585	-0.477	-0.0914	No
153	Ikbkg	18624	-0.480	-0.0815	No
154	Ldlrap1	18663	-0.487	-0.0715	No
155	Nfasc	18696	-0.493	-0.0610	No
156	Tspan4	18893	-0.528	-0.0581	No
157	Atp1a3	18930	-0.536	-0.0467	No
158	Hras	19031	-0.565	-0.0380	No
159	Pecam1	19117	-0.599	-0.0276	No
160	Thy1	19126	-0.601	-0.0132	No
161	Layn	19153	-0.613	0.0006	No
162	Crat	19351	-0.727	0.0083	No