Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MPP.MPP_Pheno.cls#Group3_versus_Group4.MPP_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Phenotype	MPP_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Upregulated in class	2
GeneSet	HALLMARK_MYOGENESIS
Enrichment Score (ES)	0.26413882
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0391887
Nominal p-value	0.40733197
FDR q-value	0.9410949
FWER p-Value	0.997

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Stc2	25	1.071	0.0305	Yes
2	Lama2	53	0.938	0.0569	Yes
3	Tnnc1	108	0.858	0.0796	Yes
4	Ckb	249	0.721	0.0937	Yes
5	Pcx	309	0.686	0.1110	Yes
6	Kcnh2	325	0.679	0.1304	Yes
7	Smtn	431	0.627	0.1436	Yes
8	Vipr1	537	0.595	0.1558	Yes
9	Slc6a8	587	0.578	0.1704	Yes
10	Igfbp7	923	0.501	0.1680	Yes
11	Cox7a1	1017	0.482	0.1775	Yes
12	Klf5	1274	0.441	0.1773	Yes
13	Gsn	1424	0.424	0.1822	Yes
14	Ppfia4	1594	0.404	0.1855	Yes
15	Pygm	1633	0.399	0.1954	Yes
16	Foxo4	2231	0.346	0.1748	Yes
17	Flii	2275	0.341	0.1827	Yes
18	Myh11	2289	0.340	0.1921	Yes
19	Hdac5	2292	0.339	0.2021	Yes
20	Tpd52l1	2294	0.339	0.2121	Yes
21	Pick1	2309	0.337	0.2214	Yes
22	Itgb5	2404	0.328	0.2263	Yes
23	Gnao1	2548	0.321	0.2284	Yes
24	Prnp	2578	0.318	0.2363	Yes
25	Schip1	2595	0.317	0.2449	Yes
26	Ncam1	2606	0.316	0.2538	Yes
27	Myh9	2740	0.305	0.2559	Yes
28	Gpx3	2870	0.294	0.2580	Yes
29	Fgf2	2961	0.289	0.2620	Yes
30	Ptp4a3	3081	0.281	0.2641	Yes
31	Adam12	3394	0.262	0.2558	No
32	Eno3	3497	0.258	0.2582	No
33	Itgb4	3543	0.256	0.2635	No
34	Reep1	3914	0.234	0.2513	No
35	Agl	4384	0.211	0.2333	No
36	Gaa	4442	0.208	0.2366	No
37	Mapk12	4507	0.204	0.2393	No
38	App	4580	0.201	0.2415	No
39	Sgcd	4708	0.193	0.2407	No
40	Fkbp1b	5134	0.171	0.2238	No
41	Agrn	5195	0.168	0.2257	No
42	Dapk2	5332	0.161	0.2235	No
43	Sh2b1	5373	0.159	0.2261	No
44	Gja5	5378	0.159	0.2306	No
45	Plxnb2	5631	0.149	0.2220	No
46	Ldb3	5643	0.148	0.2259	No
47	Bin1	5753	0.146	0.2246	No
48	Pdlim7	6015	0.134	0.2151	No
49	Itgb1	6099	0.131	0.2147	No
50	Erbb3	6256	0.123	0.2103	No
51	Cdkn1a	6269	0.122	0.2133	No
52	Ablim1	6294	0.121	0.2156	No
53	Tagln	6324	0.120	0.2177	No
54	Sptan1	6340	0.120	0.2205	No
55	Kcnh1	6369	0.119	0.2226	No
56	Dtna	6618	0.109	0.2130	No
57	Mef2c	6707	0.105	0.2115	No
58	Kifc3	6827	0.100	0.2084	No
59	Tpm3	6956	0.096	0.2046	No
60	Csrp3	7081	0.091	0.2009	No
61	Actn2	7163	0.088	0.1993	No
62	Cryab	7894	0.062	0.1635	No
63	Tpm2	7947	0.060	0.1626	No
64	Cnn3	8029	0.058	0.1601	No
65	Sphk1	8060	0.056	0.1602	No
66	Myo1c	8231	0.050	0.1530	No
67	Ocel1	8260	0.049	0.1530	No
68	Tnnt1	8266	0.049	0.1542	No
69	Rit1	8503	0.040	0.1431	No
70	Crat	8533	0.038	0.1428	No
71	Tgfb1	8581	0.037	0.1415	No
72	Rb1	8604	0.036	0.1414	No
73	Myom1	8711	0.032	0.1369	No
74	Chrnb1	8717	0.032	0.1376	No
75	Psen2	8819	0.028	0.1332	No
76	Speg	9291	0.012	0.1092	No
77	Dmd	9410	0.008	0.1034	No
78	Svil	9415	0.008	0.1034	No
79	Nos1	9417	0.008	0.1036	No
80	Large1	9557	0.004	0.0965	No
81	Cfd	9716	0.000	0.0884	No
82	Adcy9	10791	-0.036	0.0340	No
83	Clu	10907	-0.041	0.0293	No
84	Acsl1	10918	-0.041	0.0300	No
85	Ctf1	11040	-0.045	0.0251	No
86	Cd36	11045	-0.045	0.0262	No
87	Igf1	11118	-0.048	0.0239	No
88	Mylk	11185	-0.050	0.0220	No
89	Tnni2	11322	-0.055	0.0166	No
90	Myl6b	11436	-0.059	0.0125	No
91	Tsc2	11818	-0.070	-0.0051	No
92	Bag1	11828	-0.070	-0.0035	No
93	Ak1	11895	-0.072	-0.0047	No
94	Gadd45b	11976	-0.075	-0.0066	No
95	Hspb8	12022	-0.077	-0.0066	No
96	Fdps	12033	-0.077	-0.0049	No
97	Mef2a	12100	-0.080	-0.0059	No
98	Aebp1	12301	-0.086	-0.0137	No
99	Notch1	12433	-0.091	-0.0177	No
100	Tnnt3	12491	-0.093	-0.0179	No
101	Nav2	13001	-0.111	-0.0409	No
102	Ache	13259	-0.121	-0.0506	No
103	Mef2d	13317	-0.123	-0.0499	No
104	Akt2	13710	-0.139	-0.0660	No
105	Atp6ap1	14568	-0.172	-0.1051	No
106	Eif4a2	14697	-0.177	-0.1064	No
107	Pfkm	14702	-0.178	-0.1014	No
108	Col1a1	15044	-0.189	-0.1134	No
109	Nqo1	15119	-0.192	-0.1115	No
110	Dmpk	15320	-0.203	-0.1158	No
111	Sorbs3	15433	-0.209	-0.1154	No
112	Fhl1	15913	-0.233	-0.1332	No
113	Sh3bgr	16204	-0.250	-0.1407	No
114	Ryr1	16320	-0.256	-0.1391	No
115	Ifrd1	16418	-0.262	-0.1363	No
116	Mras	16457	-0.264	-0.1304	No
117	Lsp1	16499	-0.268	-0.1246	No
118	Bhlhe40	16722	-0.281	-0.1277	No
119	Mybpc3	17070	-0.304	-0.1366	No
120	Sirt2	17129	-0.308	-0.1305	No
121	Cdh13	17364	-0.325	-0.1329	No
122	Efs	17382	-0.326	-0.1241	No
123	Pkia	17553	-0.342	-0.1228	No
124	Mylpf	17686	-0.353	-0.1191	No
125	Gabarapl2	17935	-0.379	-0.1207	No
126	Mapre3	18085	-0.393	-0.1167	No
127	Syngr2	18192	-0.404	-0.1102	No
128	Lpin1	18337	-0.421	-0.1051	No
129	Sspn	18385	-0.426	-0.0949	No
130	Hbegf	18595	-0.454	-0.0923	No
131	Sorbs1	18615	-0.457	-0.0797	No
132	Pde4dip	18636	-0.461	-0.0670	No
133	Sparc	18802	-0.493	-0.0609	No
134	Actn3	18812	-0.494	-0.0468	No
135	Camk2b	18872	-0.505	-0.0348	No
136	Myl4	18987	-0.527	-0.0251	No
137	Col4a2	19077	-0.556	-0.0132	No
138	Atp2a1	19161	-0.587	-0.0001	No
139	Wwtr1	19217	-0.611	0.0152	No