Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MPP.MPP_Pheno.cls#Group3_versus_Group4.MPP_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Phenotype	MPP_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Upregulated in class	2
GeneSet	HALLMARK_GLYCOLYSIS
Enrichment Score (ES)	0.20050986
Normalized Enrichment Score (NES)	0.9668252
Nominal p-value	0.561753
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Stc2	25	1.071	0.0248	Yes
2	Adora2b	70	0.910	0.0447	Yes
3	Pcx	309	0.686	0.0491	Yes
4	Cenpa	313	0.686	0.0657	Yes
5	Stmn1	326	0.679	0.0816	Yes
6	Dcn	377	0.652	0.0949	Yes
7	Ndst3	430	0.627	0.1075	Yes
8	Hmmr	439	0.624	0.1223	Yes
9	Dsc2	514	0.604	0.1331	Yes
10	B4galt4	547	0.591	0.1459	Yes
11	Tpbg	861	0.511	0.1421	Yes
12	Depdc1a	937	0.499	0.1504	Yes
13	Me2	1057	0.475	0.1558	Yes
14	Hk2	1466	0.420	0.1450	Yes
15	Il13ra1	1487	0.417	0.1541	Yes
16	Gpc1	1545	0.410	0.1612	Yes
17	Ppfia4	1594	0.404	0.1685	Yes
18	Cdk1	1624	0.401	0.1768	Yes
19	Ak4	1704	0.392	0.1823	Yes
20	Srd5a3	1710	0.391	0.1915	Yes
21	Egln3	1875	0.375	0.1922	Yes
22	Gpr87	2047	0.359	0.1921	Yes
23	Xylt2	2303	0.338	0.1871	Yes
24	Ppp2cb	2351	0.333	0.1928	Yes
25	Slc37a4	2360	0.332	0.2005	Yes
26	Pkp2	2615	0.316	0.1951	No
27	Phka2	2921	0.291	0.1864	No
28	B3gnt3	3237	0.272	0.1767	No
29	Gpc4	3276	0.269	0.1813	No
30	Lhpp	3361	0.264	0.1834	No
31	Eno2	3638	0.250	0.1752	No
32	Homer1	3650	0.250	0.1807	No
33	Chpf2	3754	0.243	0.1813	No
34	Chst12	3755	0.243	0.1872	No
35	Qsox1	3975	0.230	0.1815	No
36	Ext2	3984	0.230	0.1867	No
37	Ndufv3	4132	0.223	0.1845	No
38	Agl	4384	0.211	0.1767	No
39	Eno1b	4390	0.211	0.1816	No
40	Ext1	4694	0.194	0.1706	No
41	Plod2	4754	0.190	0.1722	No
42	Nanp	4801	0.187	0.1744	No
43	Cyb5a	4863	0.184	0.1757	No
44	Ppia	4924	0.181	0.1770	No
45	Bpnt1	4973	0.179	0.1789	No
46	B3galt6	5021	0.177	0.1808	No
47	Kif20a	5033	0.176	0.1845	No
48	Cited2	5037	0.176	0.1886	No
49	Gys1	5129	0.171	0.1881	No
50	Idh1	5151	0.170	0.1911	No
51	Agrn	5195	0.168	0.1930	No
52	Ier3	5223	0.166	0.1956	No
53	Mpi	5338	0.160	0.1937	No
54	Fam162a	5414	0.157	0.1936	No
55	Idua	5766	0.145	0.1790	No
56	Slc16a3	5790	0.144	0.1813	No
57	Sdc2	5933	0.137	0.1773	No
58	Mdh1	6425	0.117	0.1548	No
59	Tpi1	6456	0.115	0.1560	No
60	Paxip1	6633	0.108	0.1496	No
61	Nasp	6657	0.107	0.1510	No
62	Taldo1	6678	0.106	0.1525	No
63	Pfkfb1	6680	0.106	0.1551	No
64	Got2	6749	0.103	0.1541	No
65	Rpe	6975	0.095	0.1447	No
66	Mif	7133	0.089	0.1388	No
67	Nol3	7182	0.087	0.1384	No
68	Alg1	7216	0.086	0.1388	No
69	Pygb	7240	0.085	0.1397	No
70	Hspa5	7267	0.084	0.1404	No
71	Cxcr4	7314	0.082	0.1400	No
72	Pgm2	7685	0.070	0.1226	No
73	Sdhc	7714	0.069	0.1228	No
74	B4galt7	7729	0.068	0.1238	No
75	Pygl	7896	0.062	0.1167	No
76	Fkbp4	8219	0.051	0.1013	No
77	Nt5e	8220	0.051	0.1025	No
78	B4galt2	8296	0.047	0.0998	No
79	Cd44	8439	0.042	0.0935	No
80	Tgfa	8751	0.031	0.0781	No
81	Pfkp	8994	0.023	0.0662	No
82	B4galt1	8998	0.022	0.0666	No
83	Angptl4	9090	0.019	0.0623	No
84	Pgk1	9133	0.017	0.0606	No
85	P4ha1	9174	0.016	0.0589	No
86	Gne	9452	0.007	0.0447	No
87	Aldoa	9527	0.005	0.0410	No
88	Capn5	9668	0.001	0.0338	No
89	Aldh7a1	9781	-0.001	0.0280	No
90	Sod1	9954	-0.007	0.0193	No
91	Pam	10113	-0.012	0.0114	No
92	Ugp2	10132	-0.013	0.0108	No
93	Aurka	10413	-0.022	-0.0031	No
94	Aldh9a1	10735	-0.034	-0.0189	No
95	Ddit4	10873	-0.039	-0.0250	No
96	Cln6	10875	-0.039	-0.0241	No
97	Hax1	10997	-0.044	-0.0293	No
98	Slc25a13	11116	-0.048	-0.0342	No
99	Polr3k	11166	-0.050	-0.0356	No
100	Rragd	11180	-0.050	-0.0350	No
101	Chst2	11264	-0.053	-0.0380	No
102	Gale	11317	-0.055	-0.0394	No
103	Dld	11562	-0.063	-0.0505	No
104	Mxi1	11571	-0.064	-0.0493	No
105	Cog2	11589	-0.064	-0.0487	No
106	Hdlbp	12024	-0.077	-0.0692	No
107	Zfp292	12139	-0.081	-0.0731	No
108	Glrx	12391	-0.090	-0.0839	No
109	Gfpt1	12563	-0.095	-0.0905	No
110	Kif2a	12646	-0.098	-0.0923	No
111	Irs2	12712	-0.100	-0.0932	No
112	Vldlr	13054	-0.114	-0.1081	No
113	Me1	13084	-0.115	-0.1068	No
114	Gnpda1	13098	-0.116	-0.1046	No
115	Vegfa	13218	-0.120	-0.1079	No
116	Ak3	13578	-0.134	-0.1232	No
117	Rbck1	13623	-0.135	-0.1222	No
118	Pkm	13687	-0.138	-0.1220	No
119	Bik	13723	-0.140	-0.1205	No
120	Pmm2	13954	-0.147	-0.1288	No
121	Slc25a10	14048	-0.151	-0.1299	No
122	Slc35a3	14162	-0.155	-0.1320	No
123	Glce	14466	-0.168	-0.1436	No
124	Isg20	14763	-0.180	-0.1545	No
125	Arpp19	14842	-0.181	-0.1541	No
126	Gclc	14863	-0.182	-0.1507	No
127	Mdh2	14988	-0.187	-0.1526	No
128	Sdc1	15060	-0.190	-0.1516	No
129	Galk2	15243	-0.199	-0.1562	No
130	Kdelr3	15245	-0.199	-0.1514	No
131	Copb2	15318	-0.203	-0.1502	No
132	Akr1a1	15559	-0.215	-0.1573	No
133	Ero1a	15578	-0.216	-0.1530	No
134	Pdk3	15594	-0.217	-0.1485	No
135	Met	15721	-0.223	-0.1496	No
136	Gusb	15785	-0.226	-0.1473	No
137	Gmppa	15807	-0.228	-0.1429	No
138	Psmc4	15871	-0.231	-0.1405	No
139	B3gat3	15872	-0.231	-0.1348	No
140	Nsdhl	16029	-0.240	-0.1371	No
141	Pgam1	16134	-0.246	-0.1364	No
142	Ecd	16140	-0.247	-0.1307	No
143	Chpf	16203	-0.250	-0.1278	No
144	Gpc3	16233	-0.251	-0.1232	No
145	G6pdx	16523	-0.270	-0.1316	No
146	Tpst1	16605	-0.274	-0.1291	No
147	Got1	16680	-0.279	-0.1261	No
148	Col5a1	16718	-0.281	-0.1212	No
149	Hs2st1	16766	-0.284	-0.1167	No
150	Med24	16788	-0.285	-0.1108	No
151	Plod1	17095	-0.306	-0.1192	No
152	Sdc3	17117	-0.307	-0.1128	No
153	Sap30	17204	-0.312	-0.1096	No
154	Gapdhs	17376	-0.325	-0.1105	No
155	Galk1	17438	-0.329	-0.1057	No
156	Ankzf1	17603	-0.347	-0.1057	No
157	Mertk	17620	-0.349	-0.0980	No
158	Lct	17634	-0.350	-0.0902	No
159	Ang	17649	-0.352	-0.0823	No
160	Hs6st2	17729	-0.357	-0.0777	No
161	Ldha	17839	-0.370	-0.0743	No
162	Gal3st1	17860	-0.371	-0.0663	No
163	Casp6	18107	-0.396	-0.0694	No
164	Pgls	18181	-0.403	-0.0633	No
165	Gfus	18265	-0.412	-0.0576	No
166	Spag4	18275	-0.413	-0.0480	No
167	Fut8	18373	-0.426	-0.0426	No
168	Prps1	18479	-0.438	-0.0374	No
169	Txn1	18563	-0.449	-0.0307	No
170	P4ha2	18777	-0.487	-0.0299	No
171	Gmppb	18837	-0.500	-0.0208	No
172	Tgfbi	19066	-0.552	-0.0191	No
173	Abcb6	19363	-0.707	-0.0172	No
174	Vcan	19498	-1.021	0.0007	No