Details for gene set HALLMARK_G2M

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MPP.MPP_Pheno.cls#Group3_versus_Group4.MPP_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Phenotype	MPP_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Upregulated in class	2
GeneSet	HALLMARK_G2M_CHECKPOINT
Enrichment Score (ES)	0.5000345
Normalized Enrichment Score (NES)	1.737902
Nominal p-value	0.04517454
FDR q-value	0.08654397
FWER p-Value	0.098

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Racgap1	16	1.179	0.0256	Yes
2	Aurkb	35	1.037	0.0479	Yes
3	Kif2c	41	0.999	0.0700	Yes
4	Cdc25b	89	0.879	0.0873	Yes
5	Kif23	165	0.789	0.1011	Yes
6	Plk1	275	0.703	0.1112	Yes
7	Knl1	288	0.694	0.1261	Yes
8	Cenpa	313	0.686	0.1403	Yes
9	Stmn1	326	0.679	0.1549	Yes
10	Marcks	352	0.664	0.1685	Yes
11	Hmmr	439	0.624	0.1780	Yes
12	Jpt1	529	0.598	0.1868	Yes
13	Kif11	536	0.595	0.1998	Yes
14	Ccnd1	542	0.592	0.2128	Yes
15	Espl1	670	0.549	0.2186	Yes
16	Nusap1	756	0.534	0.2261	Yes
17	Ndc80	762	0.533	0.2378	Yes
18	Amd1	790	0.525	0.2482	Yes
19	Kif20b	827	0.516	0.2579	Yes
20	Top2a	917	0.502	0.2645	Yes
21	Mad2l1	925	0.501	0.2754	Yes
22	Ccnf	934	0.499	0.2862	Yes
23	Incenp	962	0.495	0.2959	Yes
24	Cenpe	1004	0.483	0.3046	Yes
25	Mki67	1137	0.463	0.3081	Yes
26	Ccnb2	1144	0.462	0.3182	Yes
27	Prc1	1211	0.452	0.3249	Yes
28	Cdkn3	1268	0.442	0.3319	Yes
29	Bard1	1311	0.436	0.3395	Yes
30	Kif4	1425	0.424	0.3431	Yes
31	Tpx2	1460	0.420	0.3508	Yes
32	Plk4	1563	0.408	0.3547	Yes
33	Tent4a	1577	0.406	0.3631	Yes
34	Traip	1621	0.401	0.3699	Yes
35	Cdk1	1624	0.401	0.3787	Yes
36	Tmpo	1768	0.385	0.3800	Yes
37	Prmt5	1851	0.377	0.3842	Yes
38	Kif15	1876	0.375	0.3913	Yes
39	Ccna2	1953	0.368	0.3956	Yes
40	Smc2	2050	0.359	0.3987	Yes
41	Cenpf	2075	0.356	0.4055	Yes
42	Fbxo5	2110	0.354	0.4116	Yes
43	Stil	2142	0.352	0.4179	Yes
44	Prim2	2230	0.346	0.4212	Yes
45	Exo1	2253	0.343	0.4277	Yes
46	Sqle	2384	0.329	0.4284	Yes
47	Odc1	2424	0.328	0.4337	Yes
48	Efna5	2427	0.327	0.4409	Yes
49	Upf1	2484	0.326	0.4453	Yes
50	Birc5	2604	0.316	0.4463	Yes
51	Cks1b	2685	0.309	0.4490	Yes
52	Nup98	2793	0.301	0.4502	Yes
53	E2f2	3178	0.275	0.4365	Yes
54	Ewsr1	3228	0.272	0.4401	Yes
55	Smc4	3230	0.272	0.4462	Yes
56	Hnrnpu	3376	0.263	0.4445	Yes
57	Cdc20	3399	0.262	0.4493	Yes
58	Bub1	3408	0.262	0.4547	Yes
59	Suv39h1	3548	0.255	0.4533	Yes
60	Dbf4	3585	0.253	0.4571	Yes
61	Lmnb1	3586	0.253	0.4628	Yes
62	Rad54l	3670	0.248	0.4640	Yes
63	Bub3	3765	0.242	0.4646	Yes
64	Mcm2	3811	0.240	0.4676	Yes
65	Polq	3959	0.231	0.4652	Yes
66	Pbk	3972	0.231	0.4698	Yes
67	Tacc3	3976	0.230	0.4748	Yes
68	Cks2	3985	0.230	0.4795	Yes
69	Hif1a	4021	0.228	0.4828	Yes
70	H2az1	4033	0.227	0.4873	Yes
71	Troap	4126	0.224	0.4875	Yes
72	G3bp1	4194	0.219	0.4890	Yes
73	Mcm5	4313	0.214	0.4877	Yes
74	Map3k20	4445	0.208	0.4856	Yes
75	Srsf2	4604	0.199	0.4818	Yes
76	Snrpd1	4622	0.198	0.4854	Yes
77	Kpnb1	4661	0.196	0.4878	Yes
78	Rasal2	4671	0.196	0.4917	Yes
79	Xpo1	4748	0.191	0.4921	Yes
80	Gspt1	4791	0.188	0.4941	Yes
81	Hmgb3	4838	0.185	0.4959	Yes
82	Ube2s	4839	0.185	0.5000	Yes
83	H2az2	5027	0.176	0.4943	No
84	Rad23b	5322	0.161	0.4827	No
85	Cdc25a	5348	0.160	0.4850	No
86	Pole	5371	0.159	0.4874	No
87	Kif22	5450	0.156	0.4869	No
88	Ttk	5539	0.153	0.4858	No
89	Notch2	5707	0.148	0.4804	No
90	Dtymk	5779	0.145	0.4800	No
91	Chmp1a	5817	0.143	0.4813	No
92	Mapk14	5890	0.140	0.4807	No
93	Srsf1	5923	0.138	0.4821	No
94	Syncrip	5931	0.138	0.4849	No
95	Ddx39a	6192	0.126	0.4742	No
96	Tra2b	6299	0.121	0.4714	No
97	Chek1	6354	0.119	0.4713	No
98	Orc5	6461	0.115	0.4684	No
99	Chaf1a	6551	0.111	0.4663	No
100	Nasp	6657	0.107	0.4633	No
101	Sfpq	6729	0.104	0.4619	No
102	Ctcf	6770	0.102	0.4621	No
103	Hira	6853	0.099	0.4601	No
104	Rbl1	6864	0.099	0.4618	No
105	Slc7a1	6899	0.097	0.4622	No
106	Cdc45	7049	0.092	0.4566	No
107	Hus1	7083	0.091	0.4569	No
108	Mcm6	7177	0.087	0.4540	No
109	Pds5b	7399	0.079	0.4444	No
110	Cdkn2c	7597	0.073	0.4358	No
111	Kmt5a	7724	0.069	0.4308	No
112	Ilf3	7730	0.068	0.4321	No
113	Rad21	7772	0.067	0.4315	No
114	Hnrnpd	7809	0.065	0.4311	No
115	Cbx1	7822	0.065	0.4319	No
116	Casp8ap2	7836	0.064	0.4327	No
117	Brca2	7935	0.061	0.4289	No
118	Nsd2	7960	0.060	0.4290	No
119	Cdc7	8196	0.051	0.4180	No
120	Srsf10	8205	0.051	0.4188	No
121	H2ax	8378	0.044	0.4108	No
122	Numa1	8482	0.041	0.4064	No
123	Hmga1b	8502	0.040	0.4063	No
124	Atrx	8515	0.039	0.4066	No
125	Pttg1	8575	0.037	0.4044	No
126	Tgfb1	8581	0.037	0.4049	No
127	Dkc1	8675	0.033	0.4009	No
128	Cdc6	8735	0.031	0.3985	No
129	Uck2	8742	0.031	0.3989	No
130	Cul1	8810	0.029	0.3961	No
131	Nek2	8864	0.027	0.3939	No
132	Cdc27	8881	0.026	0.3937	No
133	Ube2c	8885	0.026	0.3941	No
134	Pafah1b1	9011	0.022	0.3881	No
135	E2f3	9082	0.019	0.3849	No
136	Nup50	9147	0.017	0.3820	No
137	Lig3	9331	0.010	0.3727	No
138	Odf2	9366	0.009	0.3712	No
139	Ss18	9405	0.008	0.3694	No
140	Dmd	9410	0.008	0.3694	No
141	Smad3	9478	0.006	0.3661	No
142	Tfdp1	9511	0.006	0.3645	No
143	Lbr	9529	0.005	0.3638	No
144	Myc	9550	0.004	0.3628	No
145	Ezh2	9769	-0.000	0.3516	No
146	Fancc	10062	-0.010	0.3367	No
147	Mcm3	10259	-0.017	0.3269	No
148	Cul5	10283	-0.018	0.3261	No
149	Pura	10313	-0.018	0.3250	No
150	Cul3	10319	-0.018	0.3252	No
151	Mtf2	10329	-0.019	0.3251	No
152	Wrn	10370	-0.021	0.3235	No
153	Aurka	10413	-0.022	0.3219	No
154	Foxn3	10562	-0.028	0.3148	No
155	Slc7a5	10691	-0.032	0.3089	No
156	Smarcc1	10761	-0.035	0.3061	No
157	Mnat1	10941	-0.042	0.2978	No
158	Mybl2	11154	-0.049	0.2879	No
159	Katna1	11268	-0.053	0.2833	No
160	Smc1a	11471	-0.060	0.2741	No
161	Hspa8	11497	-0.061	0.2742	No
162	Ythdc1	11511	-0.061	0.2749	No
163	Slc38a1	11997	-0.076	0.2515	No
164	Meis1	12041	-0.078	0.2510	No
165	Bcl3	12115	-0.080	0.2490	No
166	Kif5b	12518	-0.094	0.2303	No
167	Stag1	12959	-0.110	0.2100	No
168	Top1	13113	-0.116	0.2047	No
169	Rpa2	13410	-0.127	0.1922	No
170	Gins2	13419	-0.127	0.1947	No
171	Pola2	13459	-0.129	0.1955	No
172	Pml	13540	-0.133	0.1944	No
173	Prpf4b	13574	-0.134	0.1957	No
174	Tle3	13707	-0.139	0.1919	No
175	Orc6	13712	-0.139	0.1949	No
176	Rps6ka5	13736	-0.140	0.1968	No
177	Egf	14000	-0.149	0.1865	No
178	Nolc1	14503	-0.169	0.1643	No
179	Ncl	14588	-0.173	0.1639	No
180	Cul4a	14648	-0.175	0.1647	No
181	Arid4a	15093	-0.191	0.1460	No
182	Abl1	15481	-0.211	0.1307	No
183	E2f1	15859	-0.230	0.1164	No
184	Atf5	16041	-0.241	0.1124	No
185	Meis2	16077	-0.243	0.1161	No
186	Cdk4	16155	-0.248	0.1176	No
187	H2bc12	16210	-0.250	0.1204	No
188	Cdkn1b	16501	-0.268	0.1114	No
189	Tnpo2	16728	-0.282	0.1060	No
190	Dr1	16861	-0.291	0.1057	No
191	Sap30	17204	-0.312	0.0950	No
192	Slc12a2	17309	-0.320	0.0968	No
193	E2f4	17881	-0.373	0.0756	No
194	Ccnt1	18065	-0.392	0.0749	No