Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MPP.MPP_Pheno.cls#Group2_versus_Group4.MPP_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Phenotype	MPP_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Upregulated in class	3
GeneSet	HALLMARK_HYPOXIA
Enrichment Score (ES)	-0.18678877
Normalized Enrichment Score (NES)	-0.8204546
Nominal p-value	0.7946257
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Fos	232	0.708	0.0058	No
2	Myh9	394	0.630	0.0132	No
3	Vldlr	462	0.607	0.0250	No
4	Hk2	543	0.583	0.0355	No
5	Eno3	706	0.546	0.0408	No
6	Tnfaip3	781	0.533	0.0503	No
7	Ets1	844	0.524	0.0602	No
8	Zfp36	860	0.520	0.0725	No
9	Jun	963	0.503	0.0798	No
10	Klf6	1093	0.483	0.0853	No
11	Pgk1	1218	0.464	0.0905	No
12	Car12	1441	0.437	0.0900	No
13	Cdkn1a	1446	0.437	0.1007	No
14	Angptl4	1490	0.429	0.1093	No
15	Map3k1	1600	0.417	0.1141	No
16	Wsb1	1697	0.406	0.1193	No
17	Atf3	1713	0.405	0.1287	No
18	Nr3c1	1848	0.393	0.1316	No
19	Tpbg	2187	0.358	0.1231	No
20	Hspa5	2230	0.355	0.1298	No
21	Stc2	2459	0.336	0.1265	No
22	Gpc4	2654	0.322	0.1245	No
23	Adora2b	2667	0.321	0.1319	No
24	Gpi1	2766	0.314	0.1347	No
25	Hexa	2773	0.313	0.1423	No
26	Tgfbi	2804	0.311	0.1485	No
27	Vhl	2848	0.308	0.1540	No
28	Plaur	3051	0.297	0.1510	No
29	Hdlbp	3207	0.286	0.1502	No
30	Ier3	3305	0.281	0.1522	No
31	Dcn	3341	0.278	0.1573	No
32	Slc37a4	3382	0.277	0.1622	No
33	Bhlhe40	3621	0.262	0.1565	No
34	Tgfb3	3767	0.253	0.1553	No
35	Gck	3968	0.240	0.1510	No
36	Grhpr	4033	0.237	0.1537	No
37	Rbpj	4119	0.233	0.1551	No
38	Noct	4408	0.217	0.1457	No
39	Jmjd6	4556	0.211	0.1433	No
40	Hs3st1	4638	0.207	0.1443	No
41	Prkca	4675	0.204	0.1476	No
42	Pfkl	4736	0.201	0.1495	No
43	Gpc3	4738	0.201	0.1545	No
44	Cavin1	4819	0.196	0.1553	No
45	Dusp1	4866	0.194	0.1578	No
46	Pfkp	5095	0.184	0.1506	No
47	Ppargc1a	5205	0.178	0.1494	No
48	Klhl24	5398	0.168	0.1437	No
49	Maff	5416	0.167	0.1470	No
50	Bnip3l	5426	0.166	0.1507	No
51	Aldoc	5624	0.157	0.1445	No
52	Slc2a1	5762	0.151	0.1412	No
53	Ppfia4	5802	0.148	0.1429	No
54	S100a4	5839	0.147	0.1447	No
55	Slc25a1	5858	0.146	0.1474	No
56	Foxo3	5957	0.140	0.1459	No
57	Akap12	6062	0.135	0.1439	No
58	Pam	6192	0.130	0.1405	No
59	Hmox1	6433	0.121	0.1311	No
60	Ugp2	6462	0.119	0.1327	No
61	Sap30	6647	0.112	0.1259	No
62	Mt1	6781	0.104	0.1217	No
63	Dtna	6797	0.103	0.1235	No
64	Ankzf1	6824	0.102	0.1247	No
65	Ndst1	6848	0.101	0.1260	No
66	Ampd3	6877	0.099	0.1271	No
67	Pim1	6954	0.096	0.1256	No
68	Ddit3	7017	0.093	0.1247	No
69	Ccng2	7113	0.089	0.1220	No
70	Kif5a	7132	0.088	0.1233	No
71	Ak4	7206	0.085	0.1217	No
72	Scarb1	7307	0.081	0.1185	No
73	Errfi1	7350	0.080	0.1184	No
74	Sdc4	7430	0.077	0.1162	No
75	Nedd4l	7571	0.072	0.1108	No
76	Bgn	7659	0.069	0.1081	No
77	Anxa2	7832	0.063	0.1007	No
78	Klf7	7839	0.062	0.1020	No
79	Inha	8002	0.055	0.0950	No
80	Stbd1	8034	0.054	0.0947	No
81	Eno2	8150	0.049	0.0900	No
82	Pklr	8157	0.049	0.0909	No
83	Gaa	8233	0.046	0.0882	No
84	Cp	8292	0.043	0.0863	No
85	Tpi1	8350	0.041	0.0844	No
86	Tiparp	8452	0.037	0.0801	No
87	Ppp1r15a	8612	0.030	0.0726	No
88	Nagk	8738	0.025	0.0668	No
89	Kdm3a	8934	0.017	0.0571	No
90	Chst2	9062	0.013	0.0509	No
91	Large1	9418	0.000	0.0325	No
92	Tes	9605	-0.005	0.0230	No
93	Sdc2	9650	-0.006	0.0209	No
94	Tgm2	9755	-0.010	0.0158	No
95	Slc2a5	9802	-0.012	0.0137	No
96	Zfp292	9906	-0.017	0.0088	No
97	Pgm1	9920	-0.017	0.0086	No
98	Plin2	10065	-0.023	0.0017	No
99	Cxcr4	10175	-0.027	-0.0032	No
100	Hk1	10203	-0.028	-0.0039	No
101	Irs2	10278	-0.032	-0.0069	No
102	Gpc1	10397	-0.037	-0.0121	No
103	Ext1	10527	-0.042	-0.0177	No
104	Pdk1	10554	-0.042	-0.0180	No
105	Aldoa	10577	-0.043	-0.0181	No
106	Pfkfb3	10949	-0.058	-0.0358	No
107	Siah2	10994	-0.060	-0.0366	No
108	Col5a1	11140	-0.066	-0.0424	No
109	Cdkn1b	11230	-0.069	-0.0453	No
110	Mxi1	11289	-0.071	-0.0465	No
111	Gcnt2	11301	-0.071	-0.0453	No
112	Slc6a6	11660	-0.087	-0.0616	No
113	Tpd52	11756	-0.091	-0.0643	No
114	Ero1a	11830	-0.095	-0.0657	No
115	Phkg1	12130	-0.107	-0.0784	No
116	Fosl2	12693	-0.128	-0.1043	No
117	Pygm	12747	-0.130	-0.1037	No
118	Fbp1	12787	-0.132	-0.1024	No
119	Ids	12890	-0.136	-0.1043	No
120	Vegfa	13223	-0.151	-0.1177	No
121	Xpnpep1	13477	-0.164	-0.1266	No
122	Gbe1	13799	-0.178	-0.1388	No
123	Efna1	13905	-0.183	-0.1396	No
124	Gapdhs	14024	-0.188	-0.1410	No
125	Ddit4	14083	-0.191	-0.1392	No
126	Bcl2	14158	-0.194	-0.1381	No
127	Eno1b	14175	-0.195	-0.1341	No
128	Plac8	14241	-0.199	-0.1325	No
129	Slc2a3	14394	-0.206	-0.1352	No
130	Glrx	14864	-0.229	-0.1537	No
131	Fam162a	15147	-0.244	-0.1621	No
132	Mif	15293	-0.252	-0.1633	No
133	Kdelr3	15354	-0.255	-0.1600	No
134	Atp7a	15686	-0.274	-0.1703	No
135	Tmem45a	15902	-0.287	-0.1742	No
136	Ndst2	15972	-0.291	-0.1704	No
137	Lxn	15992	-0.292	-0.1641	No
138	Pdk3	16432	-0.316	-0.1789	Yes
139	Gys1	16524	-0.321	-0.1755	Yes
140	B3galt6	16595	-0.326	-0.1709	Yes
141	Ndrg1	16749	-0.336	-0.1704	Yes
142	Casp6	17000	-0.355	-0.1745	Yes
143	Rora	17001	-0.355	-0.1656	Yes
144	Prdx5	17072	-0.360	-0.1602	Yes
145	Galk1	17073	-0.360	-0.1511	Yes
146	Selenbp1	17083	-0.360	-0.1426	Yes
147	Pnrc1	17116	-0.363	-0.1351	Yes
148	Ldha	17234	-0.371	-0.1319	Yes
149	Nfil3	17248	-0.372	-0.1232	Yes
150	Sdc3	17424	-0.386	-0.1226	Yes
151	Rragd	17430	-0.386	-0.1132	Yes
152	P4ha2	17476	-0.391	-0.1057	Yes
153	Cav1	17721	-0.413	-0.1080	Yes
154	P4ha1	17723	-0.413	-0.0977	Yes
155	Pdgfb	17897	-0.432	-0.0958	Yes
156	Csrp2	17909	-0.433	-0.0855	Yes
157	Btg1	18274	-0.473	-0.0925	Yes
158	Cited2	18373	-0.488	-0.0853	Yes
159	Pgm2	18601	-0.524	-0.0839	Yes
160	Sult2b1	18724	-0.545	-0.0766	Yes
161	Ilvbl	18857	-0.573	-0.0690	Yes
162	Cavin3	19054	-0.631	-0.0633	Yes
163	Tpst2	19377	-0.823	-0.0593	Yes
164	Isg20	19389	-0.831	-0.0391	Yes
165	Cdkn1c	19430	-0.879	-0.0191	Yes
166	B4galnt2	19460	-0.929	0.0027	Yes