Details for gene set HALLMARK_DNA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MPP.MPP_Pheno.cls#Group2_versus_Group4.MPP_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Phenotype	MPP_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_DNA_REPAIR
Enrichment Score (ES)	0.20857906
Normalized Enrichment Score (NES)	0.8982049
Nominal p-value	0.61290324
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Rad51	186	0.745	0.0119	Yes
2	Gtf2f1	224	0.713	0.0305	Yes
3	Polr2k	296	0.671	0.0462	Yes
4	Cda	403	0.627	0.0587	Yes
5	Ddb1	613	0.569	0.0644	Yes
6	Srsf6	707	0.546	0.0753	Yes
7	Dgcr8	745	0.539	0.0889	Yes
8	Supt4a	754	0.537	0.1039	Yes
9	Umps	836	0.525	0.1149	Yes
10	Pde6g	904	0.512	0.1262	Yes
11	Rpa3	1168	0.472	0.1262	Yes
12	Taf9	1283	0.456	0.1334	Yes
13	Lig1	1368	0.446	0.1419	Yes
14	Nelfb	1484	0.430	0.1484	Yes
15	Rfc4	1655	0.411	0.1514	Yes
16	Npr2	1751	0.402	0.1581	Yes
17	Polr2a	1874	0.391	0.1631	Yes
18	Impdh2	2059	0.371	0.1642	Yes
19	Prim1	2325	0.346	0.1605	Yes
20	Brf2	2327	0.346	0.1704	Yes
21	Ak1	2469	0.336	0.1728	Yes
22	Dut	2631	0.324	0.1739	Yes
23	Ssrp1	2990	0.300	0.1640	Yes
24	Gtf2a2	3130	0.292	0.1652	Yes
25	Tarbp2	3168	0.289	0.1717	Yes
26	Pola1	3419	0.276	0.1667	Yes
27	Pnp	3433	0.275	0.1739	Yes
28	Usp11	3494	0.271	0.1786	Yes
29	Gtf2h1	3506	0.270	0.1858	Yes
30	Smad5	3560	0.266	0.1907	Yes
31	Stx3	3561	0.265	0.1984	Yes
32	Pola2	3642	0.261	0.2018	Yes
33	Sf3a3	3692	0.257	0.2067	Yes
34	Taf12	3796	0.251	0.2086	Yes
35	Polr1d	4129	0.232	0.1981	No
36	Supt5	4400	0.218	0.1904	No
37	Snapc4	4427	0.216	0.1953	No
38	Xpc	4473	0.215	0.1992	No
39	Taf6	5056	0.186	0.1745	No
40	Pcna	5182	0.179	0.1732	No
41	Mrpl40	5207	0.178	0.1771	No
42	Zwint	5407	0.167	0.1716	No
43	Pold1	5434	0.166	0.1751	No
44	Sdcbp	5437	0.166	0.1798	No
45	Nt5c3	5506	0.162	0.1809	No
46	Gpx4	5676	0.154	0.1766	No
47	Polr1c	5718	0.153	0.1789	No
48	Pold3	5787	0.149	0.1797	No
49	Rfc5	6191	0.130	0.1626	No
50	Hcls1	6293	0.125	0.1610	No
51	Ak3	6680	0.109	0.1442	No
52	Tsg101	6689	0.109	0.1470	No
53	Rfc3	6782	0.104	0.1452	No
54	Bcap31	6984	0.095	0.1376	No
55	Nudt21	7079	0.091	0.1353	No
56	Poll	7081	0.091	0.1379	No
57	Nt5c	7123	0.089	0.1383	No
58	Nudt9	7256	0.083	0.1339	No
59	Alyref	7258	0.083	0.1363	No
60	Cox17	7498	0.075	0.1261	No
61	Aaas	7580	0.072	0.1240	No
62	Polr2d	7595	0.071	0.1253	No
63	Ada	7646	0.070	0.1247	No
64	Rnmt	8057	0.053	0.1051	No
65	Rbx1	8158	0.049	0.1013	No
66	Vps37b	8174	0.048	0.1019	No
67	Fen1	8226	0.046	0.1006	No
68	Gtf2b	8335	0.042	0.0963	No
69	Adrm1	8462	0.036	0.0908	No
70	Rrm2b	8547	0.033	0.0874	No
71	Itpa	8568	0.032	0.0873	No
72	Pom121	8651	0.028	0.0839	No
73	Ercc4	8714	0.026	0.0814	No
74	Ercc3	8755	0.024	0.0801	No
75	Cstf3	8788	0.023	0.0791	No
76	Polr2f	9094	0.012	0.0637	No
77	Pole4	9169	0.009	0.0601	No
78	Pold4	9199	0.008	0.0589	No
79	Cmpk2	9240	0.007	0.0570	No
80	Polh	9303	0.005	0.0539	No
81	Gtf2h3	9847	-0.014	0.0263	No
82	Ercc1	9848	-0.014	0.0267	No
83	Tyms	9974	-0.020	0.0208	No
84	Nme3	9991	-0.020	0.0206	No
85	Polr3c	10159	-0.027	0.0127	No
86	Edf1	10359	-0.035	0.0034	No
87	Eloa	10495	-0.040	-0.0024	No
88	Gtf3c5	10634	-0.045	-0.0082	No
89	Nelfcd	10694	-0.047	-0.0099	No
90	Nme4	10704	-0.048	-0.0090	No
91	Zfp707	10855	-0.054	-0.0152	No
92	Tk2	10856	-0.054	-0.0136	No
93	Ercc8	11168	-0.067	-0.0277	No
94	Ddb2	11259	-0.070	-0.0304	No
95	Ercc2	11386	-0.075	-0.0347	No
96	Gsdme	11604	-0.084	-0.0435	No
97	Nfx1	11795	-0.093	-0.0507	No
98	Nme1	11923	-0.098	-0.0544	No
99	Nelfe	11936	-0.099	-0.0522	No
100	Dctn4	12019	-0.102	-0.0535	No
101	Pde4b	12043	-0.103	-0.0517	No
102	Polr2i	12060	-0.105	-0.0495	No
103	Taf1c	12400	-0.118	-0.0636	No
104	Taf13	12483	-0.121	-0.0643	No
105	Snapc5	12755	-0.131	-0.0745	No
106	Rpa2	13007	-0.141	-0.0834	No
107	Gmpr2	13144	-0.147	-0.0862	No
108	Cetn2	13212	-0.151	-0.0853	No
109	Ncbp2	13229	-0.151	-0.0818	No
110	Rala	13513	-0.166	-0.0916	No
111	Polr1h	13637	-0.171	-0.0931	No
112	Polr2j	13706	-0.173	-0.0916	No
113	Rfc2	14061	-0.190	-0.1044	No
114	Dguok	14341	-0.203	-0.1129	No
115	Adcy6	14543	-0.213	-0.1172	No
116	Gtf2h5	14667	-0.220	-0.1172	No
117	Mpc2	15825	-0.283	-0.1688	No
118	Clp1	15917	-0.288	-0.1652	No
119	Upf3b	15922	-0.288	-0.1571	No
120	Surf1	16088	-0.298	-0.1570	No
121	Polr2e	16192	-0.302	-0.1537	No
122	Rev3l	16237	-0.304	-0.1472	No
123	Ercc5	16287	-0.308	-0.1408	No
124	Trp53	16451	-0.318	-0.1401	No
125	Sec61a1	16537	-0.322	-0.1352	No
126	Ell	16976	-0.353	-0.1476	No
127	Arl6ip1	17066	-0.360	-0.1419	No
128	Rad52	17217	-0.370	-0.1390	No
129	Rae1	17281	-0.375	-0.1314	No
130	Ago4	17414	-0.386	-0.1271	No
131	Polb	17548	-0.398	-0.1225	No
132	Eif1b	17839	-0.425	-0.1253	No
133	Polr2c	17982	-0.440	-0.1199	No
134	Aprt	18240	-0.470	-0.1196	No
135	Guk1	18262	-0.472	-0.1071	No
136	Sac3d1	18284	-0.475	-0.0945	No
137	Polr3gl	18370	-0.487	-0.0849	No
138	Mpg	18556	-0.517	-0.0796	No
139	Cant1	18606	-0.525	-0.0670	No
140	Dad1	18805	-0.561	-0.0610	No
141	Bcam	18807	-0.562	-0.0449	No
142	Vps28	19044	-0.629	-0.0390	No
143	Polr2h	19205	-0.694	-0.0272	No
144	Polr2g	19246	-0.719	-0.0086	No
145	Taf10	19312	-0.773	0.0103	No