Details for gene set HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MPP.MPP_Pheno.cls#Group2_versus_Group3.MPP_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Phenotype	MPP_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA_NFKB
Enrichment Score (ES)	0.2714729
Normalized Enrichment Score (NES)	0.9925593
Nominal p-value	0.47173488
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	0.997

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Abca1	100	0.769	0.0149	Yes
2	Fos	154	0.699	0.0305	Yes
3	Socs3	282	0.621	0.0401	Yes
4	Bhlhe40	304	0.614	0.0551	Yes
5	Mcl1	335	0.602	0.0693	Yes
6	Lif	337	0.601	0.0849	Yes
7	Klf10	372	0.590	0.0986	Yes
8	Tnip2	678	0.508	0.0961	Yes
9	Fjx1	700	0.503	0.1082	Yes
10	Jun	923	0.462	0.1088	Yes
11	Il6st	930	0.461	0.1205	Yes
12	Spsb1	1055	0.444	0.1257	Yes
13	Fosb	1183	0.428	0.1304	Yes
14	Bcl3	1254	0.420	0.1377	Yes
15	Trib1	1303	0.414	0.1460	Yes
16	Gfpt2	1349	0.408	0.1544	Yes
17	Rigi	1386	0.403	0.1630	Yes
18	Zfp36	1435	0.397	0.1709	Yes
19	Ifit2	1530	0.389	0.1762	Yes
20	Ifih1	1611	0.381	0.1820	Yes
21	Klf6	1657	0.377	0.1896	Yes
22	Ppp1r15a	1660	0.376	0.1993	Yes
23	Nampt	1664	0.375	0.2089	Yes
24	Rhob	1779	0.364	0.2126	Yes
25	Map3k8	1846	0.359	0.2185	Yes
26	Sdc4	1904	0.355	0.2249	Yes
27	Tnfrsf9	1953	0.352	0.2316	Yes
28	Trip10	1980	0.350	0.2394	Yes
29	Dusp1	1985	0.349	0.2483	Yes
30	Hbegf	1987	0.349	0.2573	Yes
31	Junb	2032	0.345	0.2641	Yes
32	Tlr2	2279	0.327	0.2599	Yes
33	Hes1	2713	0.297	0.2453	Yes
34	Cebpb	2843	0.288	0.2462	Yes
35	Pfkfb3	2846	0.288	0.2536	Yes
36	Irf1	2950	0.282	0.2556	Yes
37	Phlda2	2995	0.279	0.2606	Yes
38	Ccnl1	3150	0.268	0.2597	Yes
39	Birc2	3151	0.268	0.2667	Yes
40	Klf2	3194	0.266	0.2715	Yes
41	Ier2	3525	0.244	0.2608	No
42	Efna1	3703	0.235	0.2578	No
43	B4galt1	3816	0.229	0.2580	No
44	Icam1	3859	0.226	0.2617	No
45	Cdkn1a	4008	0.219	0.2598	No
46	Ptger4	4059	0.217	0.2629	No
47	Ptgs2	4107	0.215	0.2661	No
48	Nr4a2	4188	0.211	0.2674	No
49	Dennd5a	4288	0.205	0.2677	No
50	Btg1	4483	0.195	0.2628	No
51	Nfkb2	4629	0.188	0.2602	No
52	Zbtb10	4964	0.172	0.2474	No
53	Serpinb8	5098	0.165	0.2449	No
54	Sat1	5185	0.161	0.2446	No
55	Ifngr2	5303	0.155	0.2426	No
56	Klf9	5429	0.149	0.2400	No
57	Tnfaip8	5584	0.141	0.2358	No
58	Traf1	5632	0.140	0.2370	No
59	Plaur	5748	0.135	0.2346	No
60	Kynu	5769	0.134	0.2371	No
61	Nr4a1	5810	0.132	0.2385	No
62	Dnajb4	5921	0.128	0.2361	No
63	Map2k3	6409	0.107	0.2137	No
64	Tsc22d1	6462	0.105	0.2138	No
65	Rela	6511	0.103	0.2140	No
66	Id2	6593	0.100	0.2124	No
67	Atf3	6651	0.098	0.2120	No
68	Phlda1	6677	0.096	0.2132	No
69	Atp2b1	6907	0.087	0.2037	No
70	Maff	6965	0.085	0.2029	No
71	Ier5	7109	0.080	0.1976	No
72	Nfkbie	7203	0.077	0.1948	No
73	Smad3	7209	0.076	0.1966	No
74	Panx1	7295	0.073	0.1941	No
75	Irs2	7314	0.072	0.1950	No
76	Sod2	7355	0.071	0.1948	No
77	Ehd1	7854	0.053	0.1705	No
78	Ier3	7906	0.050	0.1691	No
79	Pde4b	8130	0.042	0.1587	No
80	Litaf	8229	0.038	0.1547	No
81	Nfe2l2	8568	0.025	0.1378	No
82	Jag1	8622	0.023	0.1357	No
83	Nfat5	8711	0.020	0.1316	No
84	Fosl2	8843	0.015	0.1253	No
85	Birc3	8862	0.015	0.1247	No
86	Stat5a	9079	0.007	0.1138	No
87	Egr1	9114	0.006	0.1122	No
88	Slc16a6	9122	0.006	0.1120	No
89	Tnfaip3	9446	-0.005	0.0954	No
90	Relb	9523	-0.008	0.0917	No
91	Yrdc	9548	-0.009	0.0907	No
92	Nfkbia	9578	-0.010	0.0894	No
93	Sqstm1	9579	-0.010	0.0897	No
94	Pdlim5	9633	-0.012	0.0873	No
95	Csf1	9666	-0.013	0.0859	No
96	Zc3h12a	9706	-0.014	0.0843	No
97	Per1	9901	-0.021	0.0748	No
98	Il7r	10027	-0.026	0.0690	No
99	Nfkb1	10350	-0.039	0.0534	No
100	Tiparp	10400	-0.041	0.0519	No
101	Snn	10448	-0.042	0.0506	No
102	Slc2a6	10548	-0.046	0.0467	No
103	Serpinb2	10565	-0.046	0.0471	No
104	Sgk1	10670	-0.049	0.0430	No
105	Ldlr	10801	-0.054	0.0377	No
106	Gpr183	10820	-0.055	0.0382	No
107	Cflar	10907	-0.059	0.0353	No
108	B4galt5	11039	-0.063	0.0301	No
109	Cd80	11058	-0.063	0.0309	No
110	Tank	11094	-0.065	0.0307	No
111	Tap1	11244	-0.071	0.0249	No
112	Pmepa1	11245	-0.071	0.0267	No
113	Cd83	11287	-0.072	0.0265	No
114	Rel	11290	-0.072	0.0283	No
115	Ninj1	11438	-0.078	0.0227	No
116	Plau	11483	-0.079	0.0225	No
117	Plk2	11690	-0.087	0.0141	No
118	Bcl6	11782	-0.092	0.0118	No
119	Fut4	11839	-0.094	0.0114	No
120	Lamb3	11917	-0.096	0.0099	No
121	Vegfa	12131	-0.105	0.0017	No
122	Kdm6b	12606	-0.125	-0.0196	No
123	Ccrl2	12847	-0.134	-0.0285	No
124	Tnip1	12889	-0.136	-0.0270	No
125	Il18	12967	-0.139	-0.0274	No
126	Nfil3	13328	-0.154	-0.0420	No
127	Tnfsf9	13340	-0.154	-0.0385	No
128	Cd69	13565	-0.165	-0.0458	No
129	Gadd45a	13667	-0.169	-0.0466	No
130	Ripk2	13756	-0.172	-0.0467	No
131	G0s2	13942	-0.181	-0.0515	No
132	Gadd45b	13957	-0.181	-0.0475	No
133	Tubb2a	14119	-0.188	-0.0509	No
134	Tnfaip2	14142	-0.189	-0.0471	No
135	Eif1	14360	-0.199	-0.0531	No
136	Cebpd	14425	-0.203	-0.0512	No
137	Dram1	14598	-0.210	-0.0545	No
138	Btg2	14644	-0.213	-0.0513	No
139	Ets2	14653	-0.213	-0.0461	No
140	Il15ra	15012	-0.230	-0.0586	No
141	Icosl	15041	-0.232	-0.0540	No
142	Cd44	15214	-0.241	-0.0566	No
143	Tnf	15218	-0.241	-0.0505	No
144	Btg3	15523	-0.257	-0.0595	No
145	Rcan1	15882	-0.276	-0.0708	No
146	Plpp3	16027	-0.284	-0.0708	No
147	Dusp5	16282	-0.302	-0.0760	No
148	Ccl5	16497	-0.315	-0.0788	No
149	Myc	16749	-0.334	-0.0831	No
150	Dusp4	16793	-0.337	-0.0765	No
151	Cxcl10	16799	-0.337	-0.0679	No
152	Ptpre	16862	-0.341	-0.0622	No
153	Sphk1	16923	-0.346	-0.0563	No
154	Pnrc1	17318	-0.373	-0.0669	No
155	Tgif1	17502	-0.390	-0.0662	No
156	Mxd1	17528	-0.394	-0.0572	No
157	Plek	17551	-0.396	-0.0480	No
158	Rnf19b	17572	-0.399	-0.0386	No
159	Gem	17755	-0.416	-0.0371	No
160	Slc2a3	17789	-0.419	-0.0279	No
161	Klf4	17911	-0.433	-0.0228	No
162	Dusp2	18065	-0.452	-0.0189	No
163	Fosl1	18180	-0.465	-0.0127	No
164	Clcf1	18212	-0.470	-0.0020	No
165	Gch1	18248	-0.474	0.0086	No
166	Marcks	19033	-0.618	-0.0158	No
167	Olr1	19132	-0.659	-0.0036	No
168	Ccnd1	19449	-0.889	0.0033	No