Details for gene set HALLMARK_E2F

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MPP.MPP_Pheno.cls#Group2_versus_Group3.MPP_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Phenotype	MPP_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_E2F_TARGETS
Enrichment Score (ES)	0.27197078
Normalized Enrichment Score (NES)	0.7757351
Nominal p-value	0.6003976
FDR q-value	0.98145664
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Prps1	125	0.743	0.0107	Yes
2	Ccne1	148	0.708	0.0260	Yes
3	Psmc3ip	167	0.687	0.0410	Yes
4	Rpa3	243	0.641	0.0519	Yes
5	Dnmt1	376	0.587	0.0587	Yes
6	Dck	411	0.577	0.0703	Yes
7	Mcm4	487	0.558	0.0793	Yes
8	Cse1l	560	0.538	0.0880	Yes
9	Srsf1	891	0.466	0.0817	Yes
10	Mcm3	914	0.464	0.0913	Yes
11	Ipo7	929	0.461	0.1013	Yes
12	Smc1a	967	0.455	0.1099	Yes
13	Zw10	990	0.452	0.1192	Yes
14	Rbbp7	1052	0.445	0.1263	Yes
15	Mcm2	1156	0.431	0.1310	Yes
16	Rad51ap1	1242	0.421	0.1363	Yes
17	Mcm6	1397	0.402	0.1377	Yes
18	Mcm7	1416	0.399	0.1460	Yes
19	Mybl2	1478	0.393	0.1519	Yes
20	Pola2	1516	0.390	0.1590	Yes
21	Msh2	1537	0.388	0.1670	Yes
22	Ubr7	1706	0.371	0.1669	Yes
23	Prkdc	1728	0.369	0.1743	Yes
24	Timeless	1833	0.360	0.1773	Yes
25	Hnrnpd	1855	0.358	0.1845	Yes
26	Pnn	1881	0.357	0.1914	Yes
27	Pcna	1921	0.355	0.1976	Yes
28	Nbn	2016	0.347	0.2008	Yes
29	Xpo1	2039	0.345	0.2076	Yes
30	Lmnb1	2052	0.344	0.2150	Yes
31	Smc3	2218	0.331	0.2141	Yes
32	Nap1l1	2294	0.325	0.2177	Yes
33	Ccp110	2361	0.320	0.2217	Yes
34	Lig1	2365	0.320	0.2290	Yes
35	Tfrc	2411	0.318	0.2340	Yes
36	Lyar	2477	0.313	0.2379	Yes
37	Hells	2513	0.311	0.2433	Yes
38	Nasp	2551	0.309	0.2485	Yes
39	Dut	2753	0.295	0.2449	Yes
40	Eed	2755	0.295	0.2517	Yes
41	Kif22	3101	0.272	0.2401	Yes
42	Rpa1	3133	0.269	0.2447	Yes
43	Cdc25a	3159	0.268	0.2496	Yes
44	Donson	3467	0.248	0.2395	Yes
45	Melk	3469	0.248	0.2452	Yes
46	Pold3	3529	0.244	0.2478	Yes
47	Lbr	3641	0.238	0.2475	Yes
48	Cdkn1b	3711	0.234	0.2494	Yes
49	Eif2s1	3747	0.232	0.2529	Yes
50	Rad21	3780	0.230	0.2566	Yes
51	Cdkn1a	4008	0.219	0.2499	Yes
52	Chek2	4036	0.218	0.2536	Yes
53	Chek1	4164	0.212	0.2519	Yes
54	Cdkn2c	4183	0.211	0.2559	Yes
55	Nolc1	4271	0.206	0.2561	Yes
56	Tacc3	4332	0.203	0.2577	Yes
57	Brca1	4366	0.201	0.2607	Yes
58	Anp32e	4372	0.201	0.2651	Yes
59	Ilf3	4701	0.185	0.2524	Yes
60	Psip1	4726	0.184	0.2554	Yes
61	Mre11a	4746	0.183	0.2586	Yes
62	Nup205	4750	0.183	0.2627	Yes
63	Pole	4765	0.182	0.2662	Yes
64	Aurka	4841	0.177	0.2664	Yes
65	Ddx39a	4877	0.175	0.2686	Yes
66	H2az1	5022	0.169	0.2651	Yes
67	Ncapd2	5069	0.167	0.2666	Yes
68	Mlh1	5203	0.160	0.2634	Yes
69	Syncrip	5326	0.154	0.2607	Yes
70	Nup107	5329	0.153	0.2641	Yes
71	Pa2g4	5356	0.152	0.2663	Yes
72	Ssrp1	5450	0.148	0.2649	Yes
73	Rad51c	5458	0.147	0.2679	Yes
74	Atad2	5502	0.145	0.2691	Yes
75	Hus1	5512	0.145	0.2720	Yes
76	Tra2b	5626	0.140	0.2694	No
77	Lsm8	5651	0.139	0.2713	No
78	Tipin	5831	0.132	0.2651	No
79	Ezh2	5961	0.126	0.2613	No
80	Ppp1r8	6027	0.123	0.2608	No
81	Stag1	6052	0.122	0.2624	No
82	Mms22l	6099	0.121	0.2628	No
83	Ran	6148	0.119	0.2631	No
84	Shmt1	6174	0.118	0.2645	No
85	Usp1	6238	0.115	0.2639	No
86	Orc2	6282	0.113	0.2643	No
87	Gins4	6334	0.110	0.2642	No
88	Asf1b	6395	0.108	0.2636	No
89	Brca2	6647	0.098	0.2529	No
90	Rrm2	6792	0.091	0.2475	No
91	Paics	6793	0.091	0.2497	No
92	Rfc3	6852	0.089	0.2487	No
93	Wdr90	6983	0.084	0.2439	No
94	Ak2	7006	0.083	0.2447	No
95	Ranbp1	7378	0.070	0.2271	No
96	Mcm5	7563	0.064	0.2191	No
97	Slbp	7730	0.057	0.2118	No
98	Rfc1	7796	0.055	0.2097	No
99	Pold2	8091	0.044	0.1955	No
100	Brms1l	8199	0.039	0.1908	No
101	Bub1b	8200	0.039	0.1918	No
102	Smc6	8221	0.039	0.1916	No
103	Spc25	8312	0.035	0.1878	No
104	Gspt1	8592	0.024	0.1739	No
105	Cdk4	8877	0.015	0.1595	No
106	Nme1	9100	0.007	0.1482	No
107	Tmpo	9179	0.004	0.1442	No
108	Cbx5	9205	0.003	0.1430	No
109	Pds5b	9217	0.002	0.1425	No
110	Rad50	9512	-0.008	0.1274	No
111	Nup153	9565	-0.009	0.1249	No
112	Snrpb	9586	-0.010	0.1241	No
113	Top2a	9593	-0.011	0.1241	No
114	Bard1	9652	-0.012	0.1214	No
115	Cdca8	9683	-0.014	0.1201	No
116	Suv39h1	9685	-0.014	0.1204	No
117	Tbrg4	9779	-0.017	0.1160	No
118	Luc7l3	9808	-0.018	0.1149	No
119	Kif4	9900	-0.021	0.1107	No
120	Dscc1	10022	-0.026	0.1050	No
121	Rpa2	10084	-0.028	0.1025	No
122	Tk1	10101	-0.029	0.1024	No
123	Prim2	10198	-0.032	0.0981	No
124	Hmgb3	10240	-0.034	0.0968	No
125	Orc6	10332	-0.038	0.0930	No
126	Hmga1b	10518	-0.044	0.0844	No
127	Ctcf	10678	-0.050	0.0773	No
128	Gins3	10796	-0.054	0.0725	No
129	Rnaseh2a	10996	-0.061	0.0636	No
130	Nop56	11019	-0.062	0.0639	No
131	Trp53	11041	-0.063	0.0643	No
132	Tubb5	11133	-0.066	0.0611	No
133	Ing3	11173	-0.068	0.0606	No
134	Cdkn2a	11276	-0.072	0.0570	No
135	Nudt21	11410	-0.077	0.0519	No
136	Xrcc6	11427	-0.077	0.0529	No
137	Pold1	11757	-0.091	0.0379	No
138	Dek	11907	-0.096	0.0324	No
139	Pole4	12026	-0.101	0.0287	No
140	Ung	12071	-0.103	0.0288	No
141	Hmgb2	12152	-0.106	0.0271	No
142	Cenpe	12637	-0.126	0.0049	No
143	Spag5	12693	-0.128	0.0051	No
144	Tubg1	12798	-0.132	0.0027	No
145	Ube2s	12849	-0.134	0.0033	No
146	Smc4	12964	-0.139	0.0006	No
147	Cnot9	13156	-0.147	-0.0059	No
148	Phf5a	13257	-0.150	-0.0076	No
149	Espl1	13335	-0.154	-0.0080	No
150	Ppm1d	13391	-0.156	-0.0073	No
151	Ube2t	13395	-0.156	-0.0038	No
152	Racgap1	13464	-0.159	-0.0037	No
153	Rad1	13505	-0.161	-0.0020	No
154	Cit	13556	-0.164	-0.0008	No
155	Mki67	14039	-0.185	-0.0215	No
156	Plk4	14043	-0.185	-0.0173	No
157	Cks1b	14076	-0.186	-0.0147	No
158	Birc5	14111	-0.188	-0.0121	No
159	Mxd3	14195	-0.191	-0.0120	No
160	Cenpm	14291	-0.196	-0.0124	No
161	Dlgap5	14317	-0.197	-0.0091	No
162	Cdc20	14376	-0.199	-0.0075	No
163	Diaph3	14501	-0.206	-0.0091	No
164	Cdk1	14621	-0.212	-0.0104	No
165	Kif2c	14665	-0.214	-0.0077	No
166	Srsf2	14946	-0.227	-0.0169	No
167	Pop7	14985	-0.229	-0.0136	No
168	Hmmr	15044	-0.232	-0.0112	No
169	Wee1	15076	-0.234	-0.0074	No
170	Spc24	15314	-0.247	-0.0140	No
171	Gins1	15322	-0.247	-0.0086	No
172	Pan2	15418	-0.251	-0.0077	No
173	E2f8	15521	-0.257	-0.0070	No
174	Prdx4	15530	-0.258	-0.0015	No
175	Mad2l1	15740	-0.269	-0.0061	No
176	Cdca3	15822	-0.273	-0.0040	No
177	Aurkb	16126	-0.292	-0.0129	No
178	Trip13	16220	-0.297	-0.0109	No
179	Ccnb2	16224	-0.297	-0.0041	No
180	Stmn1	16248	-0.299	0.0016	No
181	Dctpp1	16522	-0.318	-0.0052	No
182	Mthfd2	16542	-0.319	0.0012	No
183	Asf1a	16543	-0.319	0.0086	No
184	H2ax	16719	-0.331	0.0072	No
185	Myc	16749	-0.334	0.0134	No
186	Rfc2	16753	-0.334	0.0210	No
187	Jpt1	17056	-0.355	0.0136	No
188	Pttg1	17228	-0.366	0.0132	No
189	Pms2	17316	-0.373	0.0173	No
190	Tcf19	17412	-0.381	0.0213	No
191	Depdc1a	17631	-0.404	0.0193	No
192	Kif18b	17708	-0.412	0.0249	No
193	Exosc8	17720	-0.412	0.0339	No
194	Cks2	17722	-0.413	0.0434	No
195	Dclre1b	17933	-0.436	0.0426	No
196	Plk1	18063	-0.451	0.0464	No
197	Cdc25b	18275	-0.477	0.0465	No
198	Cdkn3	19312	-0.756	0.0104	No