Details for gene set HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MPP.MPP_Pheno.cls#Group1_versus_Group4.MPP_Pheno.cls#Group1_versus_Group4_repos
Phenotype	MPP_Pheno.cls#Group1_versus_Group4_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA_NFKB
Enrichment Score (ES)	0.18262559
Normalized Enrichment Score (NES)	0.7728046
Nominal p-value	0.8734694
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Snn	92	0.814	0.0154	Yes
2	Fos	93	0.813	0.0356	Yes
3	Lif	131	0.771	0.0528	Yes
4	Dusp1	203	0.718	0.0670	Yes
5	Klf2	282	0.671	0.0796	Yes
6	Jun	335	0.643	0.0929	Yes
7	Klf4	336	0.642	0.1088	Yes
8	Ier2	392	0.622	0.1214	Yes
9	Fosb	720	0.541	0.1179	Yes
10	Plek	783	0.527	0.1278	Yes
11	Dusp4	851	0.514	0.1371	Yes
12	Il6st	1035	0.486	0.1397	Yes
13	Egr1	1148	0.470	0.1455	Yes
14	Fosl2	1156	0.469	0.1568	Yes
15	B4galt5	1665	0.409	0.1407	Yes
16	Cd80	1691	0.407	0.1495	Yes
17	Cxcl10	1722	0.404	0.1580	Yes
18	Ifit2	1779	0.399	0.1650	Yes
19	Tnfaip3	1862	0.392	0.1704	Yes
20	Id2	2015	0.377	0.1719	Yes
21	Ehd1	2170	0.362	0.1730	Yes
22	Cd83	2186	0.361	0.1811	Yes
23	Ccnd1	2379	0.347	0.1798	Yes
24	Nfkbie	2500	0.336	0.1820	Yes
25	Fosl1	2864	0.312	0.1709	Yes
26	Mcl1	2899	0.309	0.1768	Yes
27	Tnip1	3010	0.305	0.1787	Yes
28	Il15ra	3197	0.292	0.1763	Yes
29	Tubb2a	3216	0.291	0.1826	Yes
30	Tlr2	3763	0.253	0.1607	No
31	Atp2b1	3797	0.250	0.1652	No
32	Olr1	3908	0.244	0.1656	No
33	Zc3h12a	4060	0.235	0.1636	No
34	Phlda2	4065	0.235	0.1692	No
35	Atf3	4081	0.234	0.1742	No
36	Slc16a6	4218	0.227	0.1729	No
37	Panx1	4410	0.216	0.1683	No
38	Smad3	4426	0.216	0.1729	No
39	Jag1	4485	0.212	0.1752	No
40	Plaur	4597	0.207	0.1746	No
41	Tnip2	4673	0.204	0.1757	No
42	Zfp36	4692	0.203	0.1799	No
43	Yrdc	4877	0.194	0.1751	No
44	Fjx1	4882	0.193	0.1797	No
45	Marcks	5225	0.179	0.1665	No
46	B4galt1	5304	0.175	0.1668	No
47	Nr4a2	5343	0.173	0.1691	No
48	Kynu	5374	0.171	0.1718	No
49	Cd69	5662	0.157	0.1609	No
50	Birc2	6067	0.137	0.1434	No
51	G0s2	6123	0.135	0.1439	No
52	Tnfsf9	6138	0.134	0.1465	No
53	Ets2	6142	0.134	0.1497	No
54	Vegfa	6249	0.128	0.1474	No
55	Ldlr	6413	0.120	0.1419	No
56	Nfe2l2	6483	0.117	0.1412	No
57	Slc2a6	6488	0.117	0.1439	No
58	Gpr183	6524	0.115	0.1450	No
59	Dennd5a	6768	0.109	0.1351	No
60	Maff	7027	0.098	0.1242	No
61	Rhob	7099	0.095	0.1229	No
62	Cd44	7361	0.084	0.1115	No
63	Ppp1r15a	7423	0.082	0.1104	No
64	Btg3	7442	0.081	0.1114	No
65	Cebpb	7459	0.080	0.1126	No
66	Gfpt2	7487	0.079	0.1132	No
67	Sat1	7584	0.075	0.1101	No
68	Klf10	7609	0.074	0.1106	No
69	Tiparp	7632	0.072	0.1113	No
70	Kdm6b	7703	0.069	0.1094	No
71	Icam1	7740	0.066	0.1092	No
72	Birc3	7933	0.059	0.1007	No
73	Gem	7986	0.057	0.0994	No
74	Fut4	7993	0.056	0.1005	No
75	Phlda1	8025	0.055	0.1003	No
76	Sdc4	8193	0.049	0.0928	No
77	Trip10	8215	0.048	0.0929	No
78	Irf1	8292	0.044	0.0901	No
79	Nr4a1	8399	0.040	0.0856	No
80	Pmepa1	8467	0.037	0.0831	No
81	Mxd1	8491	0.036	0.0828	No
82	Ninj1	8492	0.036	0.0836	No
83	Gadd45b	8650	0.029	0.0763	No
84	Plau	8691	0.027	0.0749	No
85	Bcl6	8772	0.025	0.0713	No
86	Btg2	8903	0.019	0.0651	No
87	Myc	8957	0.017	0.0628	No
88	Klf9	8982	0.016	0.0619	No
89	Serpinb8	9025	0.014	0.0601	No
90	Map2k3	9032	0.014	0.0601	No
91	Rel	9143	0.009	0.0547	No
92	Pdlim5	9167	0.008	0.0537	No
93	Dnajb4	9217	0.006	0.0513	No
94	Ccnl1	9233	0.006	0.0507	No
95	Nfkb2	9288	0.003	0.0480	No
96	Stat5a	9568	-0.004	0.0336	No
97	Lamb3	9571	-0.004	0.0336	No
98	Tnfaip2	9946	-0.019	0.0148	No
99	Litaf	10623	-0.045	-0.0190	No
100	Nampt	10689	-0.047	-0.0212	No
101	Irs2	10749	-0.050	-0.0230	No
102	Cdkn1a	10760	-0.050	-0.0223	No
103	Pfkfb3	10841	-0.054	-0.0251	No
104	Tnfaip8	11024	-0.061	-0.0330	No
105	Bhlhe40	11048	-0.062	-0.0326	No
106	Per1	11160	-0.067	-0.0367	No
107	Tsc22d1	11226	-0.070	-0.0383	No
108	Btg1	11346	-0.075	-0.0426	No
109	Map3k8	11431	-0.079	-0.0450	No
110	Dram1	11511	-0.082	-0.0471	No
111	Ptpre	11759	-0.092	-0.0576	No
112	Rcan1	11766	-0.092	-0.0556	No
113	Dusp5	12082	-0.106	-0.0692	No
114	Slc2a3	12159	-0.109	-0.0704	No
115	Plpp3	12245	-0.114	-0.0720	No
116	Il7r	12252	-0.114	-0.0695	No
117	Ier5	12650	-0.134	-0.0867	No
118	Ripk2	12713	-0.137	-0.0865	No
119	Nfkb1	13067	-0.150	-0.1010	No
120	Rela	13154	-0.155	-0.1016	No
121	Cflar	13236	-0.159	-0.1019	No
122	Hes1	13337	-0.165	-0.1029	No
123	Icosl	13666	-0.179	-0.1154	No
124	Csf1	13880	-0.188	-0.1218	No
125	Eif1	14193	-0.203	-0.1329	No
126	Pnrc1	14331	-0.209	-0.1348	No
127	Gadd45a	14418	-0.213	-0.1340	No
128	Rnf19b	14434	-0.214	-0.1294	No
129	Hbegf	14481	-0.216	-0.1264	No
130	Tap1	14543	-0.219	-0.1242	No
131	Tank	14695	-0.225	-0.1264	No
132	Pde4b	14783	-0.230	-0.1252	No
133	Gch1	15032	-0.243	-0.1319	No
134	Sgk1	15057	-0.245	-0.1271	No
135	Ccl5	15121	-0.248	-0.1242	No
136	Bcl3	15231	-0.254	-0.1236	No
137	Sphk1	15276	-0.256	-0.1195	No
138	Nfkbia	15290	-0.257	-0.1138	No
139	Ifngr2	15349	-0.261	-0.1103	No
140	Zbtb10	15684	-0.283	-0.1205	No
141	Relb	15930	-0.298	-0.1258	No
142	Efna1	16033	-0.304	-0.1235	No
143	Ccrl2	16088	-0.308	-0.1187	No
144	Klf6	16097	-0.308	-0.1115	No
145	Trib1	16189	-0.313	-0.1084	No
146	Nfat5	16254	-0.317	-0.1039	No
147	Ifih1	16371	-0.324	-0.1018	No
148	Ptger4	16576	-0.338	-0.1040	No
149	Cebpd	16634	-0.342	-0.0984	No
150	Tnf	16741	-0.351	-0.0952	No
151	Junb	17071	-0.378	-0.1028	No
152	Il18	17114	-0.382	-0.0955	No
153	Clcf1	17204	-0.389	-0.0905	No
154	Tnfrsf9	17734	-0.436	-0.1070	No
155	Sod2	17813	-0.444	-0.1000	No
156	Rigi	17841	-0.447	-0.0903	No
157	Dusp2	17863	-0.451	-0.0802	No
158	Nfil3	18073	-0.472	-0.0793	No
159	Plk2	18295	-0.504	-0.0782	No
160	Serpinb2	18550	-0.541	-0.0779	No
161	Ptgs2	18576	-0.545	-0.0657	No
162	Tgif1	18605	-0.549	-0.0535	No
163	Ier3	18622	-0.552	-0.0406	No
164	Traf1	18693	-0.565	-0.0302	No
165	Socs3	18881	-0.607	-0.0248	No
166	Abca1	18912	-0.613	-0.0112	No
167	Sqstm1	19040	-0.653	-0.0016	No
168	Spsb1	19485	-1.044	0.0014	No