Details for gene set HALLMARK_G2M

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MPP.MPP_Pheno.cls#Group1_versus_Group4.MPP_Pheno.cls#Group1_versus_Group4_repos
Phenotype	MPP_Pheno.cls#Group1_versus_Group4_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_G2M_CHECKPOINT
Enrichment Score (ES)	0.35169697
Normalized Enrichment Score (NES)	1.4464295
Nominal p-value	0.118
FDR q-value	0.2306212
FWER p-Value	0.531

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Tfdp1	97	0.810	0.0117	Yes
2	Hnrnpu	192	0.728	0.0219	Yes
3	Rasal2	222	0.710	0.0350	Yes
4	Chek1	339	0.642	0.0423	Yes
5	Upf1	344	0.640	0.0553	Yes
6	Hnrnpd	383	0.627	0.0663	Yes
7	Kpnb1	397	0.621	0.0784	Yes
8	Cdc25a	532	0.584	0.0836	Yes
9	Mcm2	569	0.574	0.0936	Yes
10	Rad54l	570	0.574	0.1054	Yes
11	Numa1	573	0.573	0.1172	Yes
12	Exo1	591	0.566	0.1280	Yes
13	Mcm6	716	0.542	0.1328	Yes
14	Racgap1	737	0.538	0.1428	Yes
15	Mcm5	908	0.505	0.1444	Yes
16	Hif1a	1059	0.482	0.1466	Yes
17	Prim2	1231	0.458	0.1472	Yes
18	Amd1	1249	0.455	0.1558	Yes
19	Slc7a5	1351	0.444	0.1597	Yes
20	Incenp	1511	0.426	0.1603	Yes
21	Nup98	1549	0.424	0.1671	Yes
22	Cdc6	1563	0.421	0.1751	Yes
23	Notch2	1619	0.414	0.1808	Yes
24	Bard1	1641	0.413	0.1883	Yes
25	Smc1a	1651	0.411	0.1963	Yes
26	Odc1	1657	0.411	0.2045	Yes
27	Tacc3	1747	0.402	0.2082	Yes
28	Mcm3	1808	0.396	0.2133	Yes
29	Srsf10	1828	0.395	0.2205	Yes
30	Nasp	1905	0.388	0.2245	Yes
31	Efna5	2028	0.376	0.2260	Yes
32	Chaf1a	2062	0.373	0.2320	Yes
33	Lmnb1	2086	0.369	0.2384	Yes
34	Syncrip	2110	0.368	0.2448	Yes
35	E2f1	2202	0.360	0.2476	Yes
36	Gspt1	2315	0.352	0.2490	Yes
37	Ccnd1	2379	0.347	0.2529	Yes
38	Traip	2416	0.344	0.2582	Yes
39	Mybl2	2448	0.341	0.2636	Yes
40	Xpo1	2528	0.333	0.2664	Yes
41	Cdkn2c	2529	0.333	0.2733	Yes
42	Fbxo5	2543	0.332	0.2795	Yes
43	Rad23b	2577	0.330	0.2846	Yes
44	Kif23	2637	0.325	0.2882	Yes
45	Smarcc1	2666	0.323	0.2934	Yes
46	Uck2	2668	0.322	0.3000	Yes
47	Ndc80	2726	0.319	0.3037	Yes
48	Tent4a	2738	0.318	0.3097	Yes
49	Lig3	2772	0.316	0.3145	Yes
50	Ewsr1	2819	0.315	0.3186	Yes
51	Pole	2841	0.313	0.3240	Yes
52	Cdc7	2854	0.312	0.3298	Yes
53	Sfpq	2871	0.311	0.3354	Yes
54	Hspa8	2938	0.307	0.3383	Yes
55	Rbl1	2980	0.305	0.3425	Yes
56	G3bp1	3028	0.303	0.3463	Yes
57	Ilf3	3049	0.301	0.3515	Yes
58	Cul1	3478	0.273	0.3350	Yes
59	Rad21	3630	0.262	0.3326	Yes
60	Mapk14	3675	0.259	0.3357	Yes
61	Slc7a1	3778	0.252	0.3356	Yes
62	Dr1	3870	0.246	0.3360	Yes
63	Stmn1	3954	0.241	0.3366	Yes
64	E2f3	3964	0.240	0.3411	Yes
65	Tmpo	4022	0.236	0.3431	Yes
66	Prmt5	4134	0.233	0.3421	Yes
67	Nolc1	4221	0.227	0.3424	Yes
68	Gins2	4271	0.224	0.3445	Yes
69	Hira	4320	0.221	0.3465	Yes
70	Nsd2	4374	0.218	0.3483	Yes
71	Smad3	4426	0.216	0.3501	Yes
72	Aurkb	4481	0.212	0.3517	Yes
73	Srsf2	4671	0.204	0.3461	No
74	Suv39h1	4897	0.192	0.3385	No
75	Fancc	4952	0.189	0.3396	No
76	Ss18	4961	0.189	0.3430	No
77	Ccna2	4988	0.187	0.3456	No
78	Srsf1	5023	0.186	0.3476	No
79	Marcks	5225	0.179	0.3409	No
80	Dtymk	5236	0.179	0.3441	No
81	Ctcf	5376	0.171	0.3404	No
82	Tra2b	5404	0.169	0.3425	No
83	Lbr	5448	0.167	0.3438	No
84	Smc2	5455	0.166	0.3469	No
85	Cks1b	5579	0.161	0.3438	No
86	Pds5b	5645	0.158	0.3438	No
87	Slc38a1	5676	0.157	0.3454	No
88	Top2a	5902	0.145	0.3368	No
89	Nup50	5944	0.143	0.3376	No
90	Cdc45	5945	0.143	0.3406	No
91	Slc12a2	5994	0.141	0.3410	No
92	Pafah1b1	6003	0.141	0.3435	No
93	Kif11	6055	0.138	0.3437	No
94	Ttk	6069	0.137	0.3459	No
95	Hmga1b	6209	0.130	0.3414	No
96	Ddx39a	6307	0.126	0.3389	No
97	Ncl	6315	0.125	0.3411	No
98	Ezh2	6633	0.114	0.3271	No
99	Chmp1a	6720	0.110	0.3249	No
100	Pola2	6878	0.105	0.3189	No
101	Pbk	6906	0.103	0.3197	No
102	Dkc1	7043	0.097	0.3147	No
103	Ccnf	7257	0.089	0.3055	No
104	Abl1	7284	0.087	0.3059	No
105	Plk4	7386	0.083	0.3024	No
106	Mtf2	7391	0.083	0.3039	No
107	Casp8ap2	7446	0.081	0.3028	No
108	Brca2	7504	0.078	0.3014	No
109	Atrx	8018	0.055	0.2760	No
110	Sqle	8127	0.051	0.2715	No
111	E2f2	8131	0.051	0.2724	No
112	Espl1	8142	0.050	0.2729	No
113	Stil	8312	0.044	0.2651	No
114	Tnpo2	8461	0.038	0.2582	No
115	Orc5	8527	0.034	0.2555	No
116	H2az1	8753	0.025	0.2444	No
117	Prpf4b	8787	0.024	0.2432	No
118	Ythdc1	8825	0.023	0.2417	No
119	Prc1	8938	0.017	0.2363	No
120	Myc	8957	0.017	0.2357	No
121	Kif5b	8979	0.016	0.2349	No
122	Polq	9044	0.013	0.2319	No
123	Mnat1	9326	0.002	0.2174	No
124	Knl1	9500	-0.002	0.2085	No
125	Map3k20	9650	-0.007	0.2009	No
126	Snrpd1	9661	-0.007	0.2006	No
127	Kif22	9726	-0.010	0.1974	No
128	Cul5	9969	-0.020	0.1853	No
129	Cdk1	10065	-0.024	0.1809	No
130	Hmmr	10073	-0.024	0.1810	No
131	Tle3	10132	-0.026	0.1786	No
132	Mad2l1	10243	-0.031	0.1735	No
133	Jpt1	10305	-0.033	0.1711	No
134	Wrn	10536	-0.042	0.1600	No
135	Pml	10670	-0.047	0.1541	No
136	Cul4a	10813	-0.052	0.1478	No
137	E2f4	10907	-0.057	0.1442	No
138	Stag1	10911	-0.057	0.1452	No
139	Cul3	10965	-0.059	0.1437	No
140	Rps6ka5	11035	-0.061	0.1414	No
141	Egf	11085	-0.063	0.1401	No
142	Katna1	11214	-0.070	0.1350	No
143	Kif2c	11271	-0.072	0.1335	No
144	Foxn3	11330	-0.075	0.1321	No
145	Kif15	11485	-0.081	0.1258	No
146	Ccnt1	11554	-0.083	0.1240	No
147	Bub1	11691	-0.089	0.1188	No
148	Hus1	12062	-0.105	0.1018	No
149	Hmgb3	12271	-0.115	0.0934	No
150	Cenpe	12284	-0.116	0.0952	No
151	Kif20b	12329	-0.118	0.0953	No
152	Top1	12441	-0.124	0.0921	No
153	Meis1	12449	-0.124	0.0944	No
154	Kif4	12505	-0.127	0.0941	No
155	Arid4a	12664	-0.135	0.0887	No
156	Cenpf	12701	-0.137	0.0897	No
157	H2bc12	12768	-0.138	0.0891	No
158	Birc5	12943	-0.144	0.0831	No
159	Atf5	13071	-0.150	0.0796	No
160	Cdc25b	13398	-0.167	0.0662	No
161	Orc6	13504	-0.171	0.0643	No
162	Cbx1	13524	-0.172	0.0669	No
163	Smc4	13563	-0.174	0.0685	No
164	Cdc27	13748	-0.181	0.0627	No
165	Mki67	13907	-0.189	0.0585	No
166	Nek2	14140	-0.200	0.0506	No
167	Cks2	14308	-0.208	0.0462	No
168	Ube2s	14474	-0.216	0.0422	No
169	Dmd	14810	-0.231	0.0296	No
170	H2az2	14874	-0.234	0.0312	No
171	Cdc20	14986	-0.240	0.0304	No
172	Bcl3	15231	-0.254	0.0230	No
173	Cdkn1b	15333	-0.259	0.0231	No
174	Odf2	15458	-0.268	0.0222	No
175	Troap	15486	-0.270	0.0264	No
176	Aurka	15967	-0.301	0.0078	No
177	Rpa2	16070	-0.306	0.0088	No
178	Plk1	16141	-0.309	0.0116	No
179	Pttg1	16186	-0.313	0.0158	No
180	Pura	16297	-0.320	0.0167	No
181	Kmt5a	16306	-0.321	0.0229	No
182	Tpx2	16465	-0.329	0.0215	No
183	Sap30	17032	-0.375	-0.0000	No
184	Dbf4	17194	-0.387	-0.0004	No
185	Tgfb1	17218	-0.390	0.0065	No
186	Ccnb2	17277	-0.395	0.0116	No
187	H2ax	17337	-0.400	0.0168	No
188	Cdk4	18083	-0.474	-0.0119	No
189	Bub3	18123	-0.478	-0.0041	No
190	Meis2	18321	-0.510	-0.0037	No
191	Nusap1	18549	-0.541	-0.0043	No
192	Cenpa	19169	-0.695	-0.0220	No
193	Ube2c	19399	-0.856	-0.0162	No
194	Cdkn3	19489	-1.064	0.0012	No