Details for gene set HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MPP.MPP_Pheno.cls#Group1_versus_Group3.MPP_Pheno.cls#Group1_versus_Group3_repos
Phenotype	MPP_Pheno.cls#Group1_versus_Group3_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA_NFKB
Enrichment Score (ES)	0.26677448
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0907805
Nominal p-value	0.32365146
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	0.993

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Ier2	12	0.989	0.0221	Yes
2	Dusp1	29	0.882	0.0416	Yes
3	Rhob	36	0.861	0.0610	Yes
4	Fos	58	0.814	0.0787	Yes
5	Lif	83	0.771	0.0951	Yes
6	Ppp1r15a	138	0.713	0.1087	Yes
7	Fosl2	317	0.610	0.1136	Yes
8	Btg1	341	0.603	0.1262	Yes
9	Jun	379	0.591	0.1379	Yes
10	Ehd1	396	0.585	0.1505	Yes
11	Ifit2	431	0.570	0.1618	Yes
12	Ccrl2	561	0.537	0.1675	Yes
13	Egr1	629	0.519	0.1760	Yes
14	Fjx1	631	0.518	0.1878	Yes
15	Tnip2	652	0.513	0.1986	Yes
16	Nr4a2	722	0.499	0.2065	Yes
17	Map2k3	723	0.498	0.2179	Yes
18	Serpinb8	725	0.498	0.2293	Yes
19	Vegfa	1101	0.441	0.2201	Yes
20	Klf10	1187	0.429	0.2255	Yes
21	Trib1	1265	0.419	0.2312	Yes
22	Bhlhe40	1406	0.401	0.2332	Yes
23	Fosb	1463	0.395	0.2394	Yes
24	Gfpt2	1652	0.375	0.2383	Yes
25	Plek	1829	0.359	0.2374	Yes
26	Tubb2a	1907	0.354	0.2416	Yes
27	Mcl1	1925	0.352	0.2488	Yes
28	Cebpb	2019	0.342	0.2518	Yes
29	Nr4a1	2025	0.342	0.2594	Yes
30	Tlr2	2035	0.341	0.2668	Yes
31	Phlda2	2392	0.314	0.2556	No
32	Slc2a6	2626	0.301	0.2505	No
33	Pfkfb3	2756	0.292	0.2505	No
34	Yrdc	2797	0.289	0.2551	No
35	Sat1	2958	0.277	0.2532	No
36	Klf2	3039	0.272	0.2553	No
37	Hbegf	3105	0.268	0.2581	No
38	Tsc22d1	3552	0.242	0.2406	No
39	Sdc4	3590	0.240	0.2442	No
40	Per1	3647	0.236	0.2468	No
41	Jag1	3728	0.233	0.2480	No
42	Kynu	3809	0.229	0.2491	No
43	Tnfsf9	3925	0.224	0.2483	No
44	Smad3	4199	0.209	0.2390	No
45	Birc2	4362	0.201	0.2353	No
46	Atp2b1	4404	0.199	0.2377	No
47	Klf4	4885	0.177	0.2170	No
48	Cd80	5095	0.167	0.2100	No
49	Tnfaip8	5115	0.167	0.2129	No
50	Nfe2l2	5127	0.166	0.2161	No
51	Nfkb2	5181	0.165	0.2172	No
52	Nfkbie	5223	0.163	0.2188	No
53	B4galt1	5466	0.152	0.2098	No
54	Cxcl10	5568	0.148	0.2080	No
55	Map3k8	5843	0.134	0.1969	No
56	Il6st	5872	0.133	0.1985	No
57	Tnip1	5953	0.129	0.1973	No
58	Sgk1	5984	0.127	0.1987	No
59	Id2	6000	0.127	0.2009	No
60	Stat5a	6074	0.124	0.1999	No
61	Kdm6b	6169	0.120	0.1978	No
62	Bcl6	6223	0.118	0.1978	No
63	Klf9	6226	0.118	0.2004	No
64	Dram1	6276	0.116	0.2006	No
65	Dusp4	6429	0.113	0.1953	No
66	Ninj1	6458	0.111	0.1964	No
67	Il7r	6478	0.111	0.1980	No
68	Tap1	6559	0.108	0.1963	No
69	Zfp36	6640	0.105	0.1946	No
70	Birc3	6651	0.104	0.1965	No
71	Efna1	6761	0.099	0.1931	No
72	Dnajb4	6818	0.096	0.1924	No
73	Ccnl1	6826	0.096	0.1943	No
74	B4galt5	7031	0.088	0.1857	No
75	Gadd45b	7066	0.086	0.1860	No
76	Ifih1	7201	0.081	0.1809	No
77	Slc16a6	7209	0.081	0.1824	No
78	Rigi	7276	0.078	0.1808	No
79	Abca1	7412	0.072	0.1755	No
80	Zc3h12a	7514	0.068	0.1718	No
81	Pdlim5	7536	0.067	0.1723	No
82	Dennd5a	7543	0.067	0.1735	No
83	Dusp5	7598	0.064	0.1722	No
84	Irs2	7732	0.060	0.1667	No
85	Pmepa1	8009	0.049	0.1535	No
86	Plaur	8109	0.046	0.1495	No
87	Cd44	8192	0.042	0.1462	No
88	Zbtb10	8405	0.034	0.1360	No
89	Gpr183	8749	0.021	0.1188	No
90	Btg2	8818	0.019	0.1157	No
91	Maff	8921	0.015	0.1108	No
92	Phlda1	8931	0.014	0.1106	No
93	Myc	9017	0.011	0.1065	No
94	Tiparp	9478	-0.005	0.0828	No
95	Plpp3	9490	-0.005	0.0824	No
96	Nampt	9513	-0.006	0.0814	No
97	Il15ra	9636	-0.010	0.0753	No
98	Trip10	9715	-0.014	0.0716	No
99	Tnfrsf9	9929	-0.022	0.0611	No
100	Hes1	10046	-0.026	0.0557	No
101	Tnfaip2	10283	-0.035	0.0443	No
102	Sod2	10524	-0.044	0.0329	No
103	Ccnd1	10616	-0.048	0.0293	No
104	Fut4	10739	-0.053	0.0242	No
105	Irf1	10778	-0.054	0.0235	No
106	Panx1	10848	-0.057	0.0212	No
107	Socs3	10936	-0.061	0.0181	No
108	Atf3	11177	-0.071	0.0074	No
109	Ptpre	11200	-0.072	0.0079	No
110	Serpinb2	11295	-0.076	0.0048	No
111	Rel	11546	-0.084	-0.0062	No
112	Pde4b	11629	-0.087	-0.0084	No
113	Ldlr	11826	-0.094	-0.0164	No
114	Gem	11854	-0.096	-0.0156	No
115	Ripk2	11944	-0.099	-0.0179	No
116	Btg3	11950	-0.099	-0.0159	No
117	Il18	11968	-0.100	-0.0145	No
118	Snn	12005	-0.101	-0.0140	No
119	G0s2	12167	-0.108	-0.0199	No
120	Lamb3	12216	-0.110	-0.0198	No
121	Fosl1	12319	-0.115	-0.0224	No
122	Ccl5	12451	-0.121	-0.0264	No
123	Icam1	12588	-0.125	-0.0306	No
124	Csf1	12827	-0.137	-0.0397	No
125	Eif1	13293	-0.156	-0.0602	No
126	Cdkn1a	13574	-0.170	-0.0708	No
127	Nfat5	13651	-0.174	-0.0707	No
128	Bcl3	13687	-0.176	-0.0684	No
129	Cd83	13713	-0.177	-0.0657	No
130	Rela	13978	-0.189	-0.0750	No
131	Rcan1	14444	-0.211	-0.0942	No
132	Cflar	14599	-0.218	-0.0971	No
133	Pnrc1	14615	-0.219	-0.0929	No
134	Nfil3	14952	-0.237	-0.1048	No
135	Nfkbia	14970	-0.238	-0.1002	No
136	Nfkb1	15112	-0.246	-0.1018	No
137	Tank	15655	-0.275	-0.1235	No
138	Ptgs2	16086	-0.301	-0.1388	No
139	Ptger4	16268	-0.314	-0.1410	No
140	Junb	16284	-0.314	-0.1345	No
141	Rnf19b	16379	-0.321	-0.1320	No
142	Slc2a3	16403	-0.324	-0.1257	No
143	Cebpd	16413	-0.324	-0.1188	No
144	Spsb1	16611	-0.337	-0.1212	No
145	Tnf	16839	-0.353	-0.1248	No
146	Ifngr2	16880	-0.355	-0.1187	No
147	Sphk1	17006	-0.365	-0.1168	No
148	Plau	17172	-0.377	-0.1166	No
149	Tgif1	17359	-0.391	-0.1173	No
150	Litaf	17518	-0.407	-0.1161	No
151	Tnfaip3	17582	-0.413	-0.1098	No
152	Relb	17636	-0.418	-0.1030	No
153	Gch1	17675	-0.422	-0.0952	No
154	Clcf1	17707	-0.427	-0.0870	No
155	Mxd1	17817	-0.439	-0.0825	No
156	Klf6	17936	-0.451	-0.0783	No
157	Sqstm1	17987	-0.456	-0.0704	No
158	Dusp2	18331	-0.502	-0.0766	No
159	Cd69	18357	-0.506	-0.0662	No
160	Olr1	18360	-0.506	-0.0547	No
161	Ier3	18498	-0.527	-0.0497	No
162	Traf1	18628	-0.551	-0.0437	No
163	Gadd45a	18739	-0.572	-0.0362	No
164	Marcks	18751	-0.574	-0.0236	No
165	Plk2	18801	-0.582	-0.0128	No
166	Ier5	19080	-0.668	-0.0118	No
167	Ets2	19176	-0.703	-0.0005	No
168	Icosl	19300	-0.777	0.0110	No