Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MEP.MEP.mega_Pheno.cls #Group6_versus_Group8.MEP.mega_Pheno.cls #Group6_versus_Group8_repos
Phenotype	MEP.mega_Pheno.cls#Group6_versus_Group8_repos
Upregulated in class	4
GeneSet	HALLMARK_MYOGENESIS
Enrichment Score (ES)	0.29395634
Normalized Enrichment Score (NES)	1.1802661
Nominal p-value	0.18972331
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	0.943

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Igfbp7	118	0.800	0.0192	Yes
2	Itgb4	344	0.651	0.0281	Yes
3	Sh3bgr	545	0.573	0.0359	Yes
4	Tsc2	735	0.532	0.0429	Yes
5	Mylpf	784	0.523	0.0569	Yes
6	Acsl1	804	0.520	0.0724	Yes
7	Tagln	880	0.508	0.0846	Yes
8	Pygm	900	0.505	0.0997	Yes
9	Dmd	989	0.487	0.1105	Yes
10	Cryab	991	0.487	0.1259	Yes
11	Nqo1	1014	0.484	0.1401	Yes
12	Gadd45b	1050	0.476	0.1534	Yes
13	Gabarapl2	1303	0.436	0.1540	Yes
14	Wwtr1	1327	0.432	0.1666	Yes
15	App	1778	0.387	0.1554	Yes
16	Myl4	1795	0.386	0.1667	Yes
17	Dtna	1908	0.378	0.1729	Yes
18	Kcnh1	1954	0.375	0.1824	Yes
19	Adam12	1965	0.374	0.1937	Yes
20	Sorbs1	2212	0.351	0.1921	Yes
21	Ache	2246	0.348	0.2014	Yes
22	Slc6a8	2447	0.330	0.2014	Yes
23	Large1	2536	0.323	0.2070	Yes
24	Fhl1	2573	0.320	0.2153	Yes
25	Notch1	2683	0.310	0.2195	Yes
26	Myom1	2778	0.302	0.2241	Yes
27	Pdlim7	2813	0.299	0.2318	Yes
28	Cdkn1a	2943	0.290	0.2343	Yes
29	Mybpc3	2961	0.289	0.2426	Yes
30	Rit1	2976	0.288	0.2510	Yes
31	Fdps	3022	0.284	0.2576	Yes
32	Tpm2	3147	0.276	0.2599	Yes
33	Mapk12	3182	0.274	0.2668	Yes
34	Sptan1	3399	0.262	0.2639	Yes
35	Aebp1	3475	0.260	0.2682	Yes
36	Gja5	3586	0.254	0.2705	Yes
37	Sorbs3	3676	0.248	0.2738	Yes
38	Nav2	3764	0.245	0.2770	Yes
39	Myh9	3788	0.244	0.2835	Yes
40	Ppfia4	3852	0.240	0.2878	Yes
41	Erbb3	3880	0.237	0.2940	Yes
42	Pde4dip	4264	0.215	0.2808	No
43	Dmpk	4574	0.204	0.2711	No
44	Mylk	4766	0.197	0.2674	No
45	Agrn	4860	0.192	0.2686	No
46	Gaa	4910	0.189	0.2721	No
47	Agl	4937	0.187	0.2767	No
48	Lama2	5069	0.181	0.2756	No
49	Col4a2	5341	0.170	0.2668	No
50	Clu	5364	0.169	0.2710	No
51	Pcx	5502	0.162	0.2690	No
52	Myo1c	5542	0.161	0.2721	No
53	Schip1	5972	0.142	0.2542	No
54	Adcy9	6008	0.140	0.2568	No
55	Itgb5	6219	0.132	0.2501	No
56	Sirt2	6394	0.125	0.2449	No
57	Psen2	6493	0.120	0.2436	No
58	Hbegf	6654	0.114	0.2389	No
59	Hdac5	6760	0.109	0.2369	No
60	Actn2	6791	0.108	0.2387	No
61	Smtn	6817	0.107	0.2408	No
62	Bin1	6874	0.105	0.2412	No
63	Svil	6965	0.102	0.2398	No
64	Cnn3	7015	0.100	0.2404	No
65	Reep1	7159	0.095	0.2360	No
66	Nos1	7275	0.090	0.2328	No
67	Ldb3	7278	0.090	0.2356	No
68	Ablim1	7500	0.083	0.2267	No
69	Crat	8009	0.062	0.2021	No
70	Tpm3	8733	0.034	0.1655	No
71	Bhlhe40	8754	0.034	0.1655	No
72	Hspb8	8824	0.031	0.1629	No
73	Tead4	8831	0.031	0.1636	No
74	Myom2	9001	0.025	0.1556	No
75	Csrp3	9185	0.019	0.1466	No
76	Ifrd1	9322	0.014	0.1399	No
77	Sgcd	9324	0.013	0.1403	No
78	Plxnb2	9340	0.013	0.1399	No
79	Ckb	9348	0.012	0.1400	No
80	Myh11	9605	0.004	0.1267	No
81	Mef2a	9676	0.001	0.1231	No
82	Ckmt2	9720	0.000	0.1209	No
83	Tnnt3	9761	0.000	0.1188	No
84	Itgb1	9942	-0.001	0.1094	No
85	Tnnt1	10009	-0.003	0.1061	No
86	Kifc3	10021	-0.004	0.1056	No
87	Chrnb1	10025	-0.004	0.1056	No
88	Fgf2	10086	-0.006	0.1027	No
89	Lpin1	10723	-0.029	0.0704	No
90	Stc2	10793	-0.031	0.0678	No
91	Gsn	10880	-0.034	0.0644	No
92	Mef2d	11524	-0.057	0.0326	No
93	Pick1	11619	-0.060	0.0296	No
94	Prnp	11741	-0.064	0.0254	No
95	Igf1	11815	-0.067	0.0237	No
96	Flii	11838	-0.068	0.0247	No
97	Atp2a1	11868	-0.069	0.0254	No
98	Rb1	12043	-0.075	0.0187	No
99	Sh2b1	12308	-0.087	0.0077	No
100	Fkbp1b	12547	-0.096	-0.0017	No
101	Mef2c	12575	-0.097	-0.0000	No
102	Gnao1	12600	-0.099	0.0019	No
103	Myl6b	12642	-0.101	0.0029	No
104	Ocel1	12793	-0.107	-0.0015	No
105	Dapk2	12955	-0.114	-0.0063	No
106	Cdh13	12960	-0.114	-0.0029	No
107	Sparc	13052	-0.119	-0.0038	No
108	Akt2	13131	-0.122	-0.0040	No
109	Mapre3	13783	-0.152	-0.0332	No
110	Mras	14053	-0.164	-0.0420	No
111	Vipr1	14215	-0.171	-0.0450	No
112	Eif4a2	14244	-0.172	-0.0410	No
113	Tnnc1	14411	-0.179	-0.0440	No
114	Ctf1	14440	-0.180	-0.0397	No
115	Bag1	14469	-0.181	-0.0354	No
116	Tgfb1	14662	-0.191	-0.0394	No
117	Ptp4a3	15099	-0.214	-0.0554	No
118	Ncam1	15222	-0.221	-0.0547	No
119	Cox7a1	15337	-0.227	-0.0535	No
120	Ak1	15423	-0.231	-0.0506	No
121	Col1a1	16099	-0.267	-0.0773	No
122	Pfkm	16391	-0.286	-0.0834	No
123	Atp6ap1	16613	-0.301	-0.0854	No
124	Sspn	16647	-0.303	-0.0775	No
125	Lsp1	16650	-0.303	-0.0680	No
126	Klf5	16963	-0.324	-0.0740	No
127	Ankrd2	16985	-0.325	-0.0648	No
128	Ephb3	17333	-0.353	-0.0717	No
129	Kcnh2	17433	-0.361	-0.0655	No
130	Pkia	17482	-0.366	-0.0564	No
131	Sphk1	18184	-0.446	-0.0788	No
132	Tpd52l1	18347	-0.464	-0.0725	No
133	Syngr2	18448	-0.481	-0.0625	No
134	Foxo4	18450	-0.481	-0.0473	No
135	Eno3	18489	-0.490	-0.0337	No
136	Ryr1	18595	-0.511	-0.0230	No
137	Cd36	18795	-0.554	-0.0158	No
138	Camk2b	18812	-0.558	0.0010	No
139	Gpx3	19226	-0.781	0.0042	No