Details for gene set HALLMARK_APICAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MEP.MEP.mega_Pheno.cls #Group6_versus_Group8.MEP.mega_Pheno.cls #Group6_versus_Group8_repos
Phenotype	MEP.mega_Pheno.cls#Group6_versus_Group8_repos
Upregulated in class	4
GeneSet	HALLMARK_APICAL_JUNCTION
Enrichment Score (ES)	0.20989999
Normalized Enrichment Score (NES)	0.9508014
Nominal p-value	0.5470588
FDR q-value	0.6967974
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Mmp2	152	0.763	0.0137	Yes
2	Itgb4	344	0.651	0.0221	Yes
3	Adamts5	786	0.523	0.0139	Yes
4	Vav2	843	0.516	0.0256	Yes
5	Sirpa	872	0.510	0.0385	Yes
6	Cdk8	876	0.509	0.0528	Yes
7	Adra1b	949	0.495	0.0630	Yes
8	Col16a1	1042	0.479	0.0718	Yes
9	Nrxn2	1052	0.476	0.0848	Yes
10	Rras	1097	0.468	0.0957	Yes
11	Nexn	1229	0.446	0.1015	Yes
12	Myl9	1233	0.445	0.1139	Yes
13	Fbn1	1237	0.444	0.1264	Yes
14	Layn	1524	0.407	0.1229	Yes
15	Actn1	1683	0.392	0.1258	Yes
16	Jam3	1887	0.380	0.1260	Yes
17	Rhof	2279	0.344	0.1153	Yes
18	Itga3	2291	0.342	0.1244	Yes
19	Tjp1	2345	0.338	0.1312	Yes
20	Pard6g	2380	0.334	0.1389	Yes
21	Tsc1	2452	0.329	0.1445	Yes
22	Nectin3	2669	0.311	0.1420	Yes
23	Cadm2	2834	0.298	0.1419	Yes
24	Atp1a3	2857	0.296	0.1491	Yes
25	Cap1	2863	0.296	0.1572	Yes
26	Baiap2	3129	0.278	0.1512	Yes
27	Cdh11	3135	0.277	0.1588	Yes
28	Sympk	3138	0.277	0.1665	Yes
29	Lama3	3177	0.274	0.1723	Yes
30	Vcam1	3250	0.272	0.1762	Yes
31	Taok2	3324	0.267	0.1800	Yes
32	Ptk2	3404	0.262	0.1833	Yes
33	Cd86	3671	0.249	0.1764	Yes
34	Sorbs3	3676	0.248	0.1832	Yes
35	Nf2	3680	0.248	0.1901	Yes
36	Msn	3787	0.244	0.1914	Yes
37	Myh9	3788	0.244	0.1984	Yes
38	Adam9	3821	0.242	0.2035	Yes
39	Rasa1	3831	0.242	0.2099	Yes
40	Nrtn	4283	0.214	0.1924	No
41	Epb41l2	4382	0.212	0.1933	No
42	Cercam	4417	0.210	0.1974	No
43	Akt3	4508	0.207	0.1986	No
44	Wasl	4932	0.188	0.1818	No
45	Bmp1	5065	0.181	0.1801	No
46	Wnk4	5240	0.174	0.1759	No
47	Vcl	5254	0.173	0.1801	No
48	Actn4	5433	0.165	0.1755	No
49	Shc1	5565	0.160	0.1732	No
50	Nf1	5579	0.159	0.1770	No
51	Ldlrap1	5612	0.157	0.1798	No
52	Lamb3	5660	0.155	0.1817	No
53	Myh10	5673	0.154	0.1855	No
54	Cd276	5856	0.146	0.1801	No
55	Mdk	6081	0.138	0.1723	No
56	Src	6127	0.136	0.1738	No
57	Cldn14	6215	0.132	0.1730	No
58	Nectin1	6299	0.128	0.1723	No
59	Cdh4	6424	0.123	0.1693	No
60	Mpzl1	6597	0.115	0.1636	No
61	Actn2	6791	0.108	0.1566	No
62	Col17a1	6864	0.106	0.1558	No
63	Plcg1	6947	0.103	0.1544	No
64	Pals1	6985	0.101	0.1554	No
65	Slit2	7126	0.096	0.1508	No
66	Pik3r3	7145	0.096	0.1526	No
67	Pkd1	7324	0.089	0.1458	No
68	Actg1	7628	0.077	0.1321	No
69	Nectin2	7693	0.074	0.1309	No
70	Syk	7992	0.063	0.1171	No
71	Crat	8009	0.062	0.1181	No
72	Ctnna1	8203	0.054	0.1095	No
73	Sgce	8238	0.053	0.1093	No
74	Pik3cb	8431	0.045	0.1005	No
75	Ywhah	8496	0.043	0.0984	No
76	Tro	8648	0.038	0.0916	No
77	Evl	8680	0.036	0.0910	No
78	Amigo2	8687	0.036	0.0917	No
79	Exoc4	9217	0.017	0.0646	No
80	Map3k20	9221	0.017	0.0649	No
81	Crb3	9744	0.000	0.0376	No
82	Itgb1	9942	-0.001	0.0274	No
83	Ctnnd1	10052	-0.005	0.0218	No
84	Vasp	10232	-0.011	0.0128	No
85	Shroom2	10322	-0.015	0.0085	No
86	B4galt1	10350	-0.016	0.0076	No
87	Nfasc	10375	-0.016	0.0068	No
88	Icam1	10448	-0.019	0.0036	No
89	Skap2	10592	-0.025	-0.0032	No
90	Icam2	10700	-0.028	-0.0080	No
91	Cldn15	10872	-0.034	-0.0160	No
92	Cd34	11020	-0.039	-0.0225	No
93	Hras	11055	-0.041	-0.0231	No
94	Hadh	11092	-0.043	-0.0238	No
95	Dlg1	11177	-0.045	-0.0269	No
96	Cdh8	11422	-0.053	-0.0382	No
97	Dhx16	11518	-0.057	-0.0415	No
98	Cadm3	11624	-0.060	-0.0453	No
99	Pten	11677	-0.062	-0.0463	No
100	Itga10	12049	-0.076	-0.0635	No
101	Rsu1	12462	-0.093	-0.0824	No
102	Mapk14	12465	-0.093	-0.0798	No
103	Gtf2f1	12637	-0.101	-0.0859	No
104	Rac2	12738	-0.105	-0.0882	No
105	Arhgef6	12798	-0.108	-0.0882	No
106	Tial1	12862	-0.110	-0.0884	No
107	Stx4a	13018	-0.117	-0.0931	No
108	Thbs3	13049	-0.118	-0.0914	No
109	Vcan	13054	-0.119	-0.0882	No
110	Akt2	13131	-0.122	-0.0887	No
111	Ptprc	13161	-0.123	-0.0868	No
112	Vwf	13250	-0.126	-0.0878	No
113	Zyx	13267	-0.127	-0.0850	No
114	Tgfbi	13354	-0.131	-0.0858	No
115	Arpc2	13566	-0.141	-0.0928	No
116	Thy1	13788	-0.152	-0.1001	No
117	Nlgn2	13825	-0.153	-0.0976	No
118	Tubg1	13996	-0.161	-0.1019	No
119	Traf1	14227	-0.172	-0.1091	No
120	Pecam1	14233	-0.172	-0.1045	No
121	Tspan4	14760	-0.196	-0.1264	No
122	Pfn1	14956	-0.206	-0.1308	No
123	Ikbkg	15163	-0.217	-0.1354	No
124	Negr1	15259	-0.223	-0.1340	No
125	Nrap	15321	-0.226	-0.1308	No
126	Irs1	15413	-0.231	-0.1290	No
127	Lima1	15616	-0.239	-0.1328	No
128	Adam15	15784	-0.247	-0.1346	No
129	Gamt	15960	-0.258	-0.1364	No
130	Inppl1	16067	-0.265	-0.1344	No
131	Cx3cl1	16172	-0.272	-0.1322	No
132	Gnai2	16599	-0.299	-0.1459	No
133	Sdc3	16651	-0.303	-0.1400	No
134	Actb	16846	-0.316	-0.1412	No
135	Cd274	16934	-0.321	-0.1367	No
136	Tmem8b	17051	-0.329	-0.1334	No
137	Nectin4	17077	-0.331	-0.1254	No
138	Cdh1	17153	-0.337	-0.1197	No
139	Gnai1	17383	-0.357	-0.1216	No
140	Mvd	17411	-0.359	-0.1129	No
141	Kcnh2	17433	-0.361	-0.1037	No
142	Icam5	17491	-0.367	-0.0963	No
143	Myl12b	17541	-0.371	-0.0884	No
144	Map4k2	17555	-0.373	-0.0785	No
145	Cnn2	17756	-0.394	-0.0778	No
146	Itga2	17871	-0.408	-0.0722	No
147	Pbx2	18013	-0.426	-0.0675	No
148	Nlgn3	18104	-0.437	-0.0598	No
149	Jup	18320	-0.460	-0.0580	No
150	Amh	18332	-0.462	-0.0455	No
151	Mapk11	18504	-0.492	-0.0405	No
152	Insig1	18536	-0.499	-0.0281	No
153	Itga9	18899	-0.583	-0.0305	No
154	Amigo1	19270	-0.865	-0.0253	No
155	Icam4	19288	-0.961	0.0010	No