Details for gene set HALLMARK_G2M

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MEP.MEP.mega_Pheno.cls #Group3_versus_Group4.MEP.mega_Pheno.cls #Group3_versus_Group4_repos
Phenotype	MEP.mega_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Upregulated in class	2
GeneSet	HALLMARK_G2M_CHECKPOINT
Enrichment Score (ES)	0.42313778
Normalized Enrichment Score (NES)	1.4470828
Nominal p-value	0.14619882
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	0.526

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Ccnd1	6	1.387	0.0394	Yes
2	Cdc25b	716	0.555	0.0182	Yes
3	Dbf4	802	0.529	0.0288	Yes
4	Upf1	1072	0.474	0.0283	Yes
5	Bub1	1295	0.448	0.0295	Yes
6	Dmd	1315	0.446	0.0413	Yes
7	Bcl3	1368	0.441	0.0512	Yes
8	Kif23	1474	0.431	0.0580	Yes
9	Meis2	1537	0.424	0.0669	Yes
10	Nek2	1672	0.407	0.0715	Yes
11	Kif2c	1739	0.400	0.0795	Yes
12	Espl1	1868	0.388	0.0839	Yes
13	Xpo1	1876	0.387	0.0946	Yes
14	Exo1	1889	0.385	0.1050	Yes
15	Ube2c	1960	0.378	0.1121	Yes
16	Ccna2	1986	0.375	0.1215	Yes
17	Cdc20	2161	0.356	0.1226	Yes
18	Ttk	2210	0.350	0.1301	Yes
19	Tacc3	2276	0.342	0.1365	Yes
20	Chaf1a	2286	0.342	0.1458	Yes
21	Ccnb2	2296	0.341	0.1551	Yes
22	Plk1	2416	0.331	0.1584	Yes
23	Cdk1	2456	0.329	0.1657	Yes
24	Traip	2460	0.328	0.1750	Yes
25	Slc7a5	2486	0.326	0.1830	Yes
26	Cks1b	2603	0.318	0.1860	Yes
27	Smad3	2626	0.315	0.1938	Yes
28	Hmmr	2671	0.312	0.2005	Yes
29	Incenp	2731	0.307	0.2062	Yes
30	Mki67	2767	0.305	0.2130	Yes
31	Prc1	2784	0.303	0.2209	Yes
32	Suv39h1	2858	0.297	0.2256	Yes
33	Kif11	2869	0.296	0.2335	Yes
34	Fbxo5	2882	0.295	0.2413	Yes
35	Rpa2	3014	0.285	0.2426	Yes
36	Cdkn2c	3041	0.283	0.2493	Yes
37	Tent4a	3203	0.272	0.2487	Yes
38	Map3k20	3311	0.268	0.2508	Yes
39	Cenpe	3319	0.267	0.2580	Yes
40	Stmn1	3332	0.266	0.2650	Yes
41	Nsd2	3337	0.266	0.2724	Yes
42	Pole	3372	0.263	0.2782	Yes
43	Chek1	3420	0.259	0.2831	Yes
44	Lmnb1	3433	0.258	0.2899	Yes
45	Srsf1	3451	0.256	0.2963	Yes
46	Ccnf	3455	0.256	0.3035	Yes
47	Racgap1	3464	0.255	0.3104	Yes
48	Sqle	3528	0.255	0.3144	Yes
49	Srsf2	3624	0.248	0.3165	Yes
50	Hspa8	3715	0.246	0.3188	Yes
51	Bard1	3839	0.242	0.3193	Yes
52	Knl1	3850	0.241	0.3257	Yes
53	Kif15	3913	0.237	0.3292	Yes
54	Cdc6	3974	0.234	0.3328	Yes
55	Odf2	3983	0.234	0.3391	Yes
56	Cenpa	4002	0.233	0.3448	Yes
57	Sfpq	4010	0.232	0.3511	Yes
58	Tpx2	4078	0.228	0.3541	Yes
59	Polq	4135	0.225	0.3576	Yes
60	Cenpf	4198	0.220	0.3606	Yes
61	Kif4	4397	0.211	0.3563	Yes
62	Nusap1	4410	0.211	0.3617	Yes
63	Kif20b	4442	0.209	0.3661	Yes
64	Rad21	4466	0.207	0.3708	Yes
65	Mcm6	4563	0.201	0.3715	Yes
66	Ewsr1	4569	0.201	0.3770	Yes
67	Ddx39a	4577	0.200	0.3823	Yes
68	Egf	4695	0.194	0.3817	Yes
69	Hnrnpu	4718	0.192	0.3861	Yes
70	Uck2	4758	0.190	0.3895	Yes
71	Tfdp1	4779	0.188	0.3938	Yes
72	Kif22	4887	0.182	0.3934	Yes
73	Aurkb	4923	0.181	0.3968	Yes
74	Aurka	5035	0.174	0.3959	Yes
75	Kpnb1	5103	0.170	0.3973	Yes
76	Nup98	5274	0.161	0.3930	Yes
77	Tnpo2	5339	0.158	0.3941	Yes
78	Cul4a	5450	0.152	0.3927	Yes
79	Tra2b	5510	0.149	0.3939	Yes
80	Top2a	5514	0.149	0.3980	Yes
81	Tmpo	5533	0.149	0.4013	Yes
82	Ube2s	5603	0.146	0.4019	Yes
83	Amd1	5644	0.144	0.4039	Yes
84	Rad23b	5733	0.139	0.4033	Yes
85	Cdc27	5761	0.138	0.4058	Yes
86	Pttg1	5812	0.136	0.4071	Yes
87	H2bc12	5829	0.135	0.4101	Yes
88	H2ax	5900	0.132	0.4102	Yes
89	Hif1a	5915	0.131	0.4132	Yes
90	Srsf10	5931	0.130	0.4162	Yes
91	Hnrnpd	6045	0.127	0.4139	Yes
92	E2f2	6086	0.125	0.4154	Yes
93	Stil	6148	0.122	0.4157	Yes
94	Kmt5a	6163	0.122	0.4184	Yes
95	Dr1	6211	0.120	0.4194	Yes
96	Cdkn3	6226	0.119	0.4221	Yes
97	Mybl2	6370	0.114	0.4179	Yes
98	Numa1	6428	0.111	0.4181	Yes
99	Ccnt1	6451	0.110	0.4200	Yes
100	Troap	6522	0.107	0.4195	Yes
101	Fancc	6549	0.106	0.4211	Yes
102	Rad54l	6569	0.105	0.4231	Yes
103	Mapk14	6811	0.096	0.4133	No
104	Smc4	7194	0.081	0.3956	No
105	Smc1a	7267	0.078	0.3941	No
106	Slc12a2	7362	0.075	0.3913	No
107	Mcm3	7481	0.072	0.3872	No
108	G3bp1	7508	0.070	0.3878	No
109	Lbr	7577	0.068	0.3862	No
110	Syncrip	7662	0.063	0.3836	No
111	Ctcf	7805	0.057	0.3778	No
112	Wrn	7806	0.057	0.3795	No
113	Cul3	7816	0.057	0.3807	No
114	Mcm5	7821	0.057	0.3821	No
115	Cdc45	7842	0.056	0.3826	No
116	Plk4	7900	0.054	0.3812	No
117	Katna1	7991	0.051	0.3780	No
118	Dtymk	8062	0.048	0.3757	No
119	Gins2	8094	0.047	0.3754	No
120	Birc5	8110	0.046	0.3759	No
121	Smarcc1	8116	0.046	0.3770	No
122	Pds5b	8222	0.042	0.3727	No
123	Casp8ap2	8333	0.038	0.3680	No
124	Prim2	8334	0.038	0.3691	No
125	Cul5	8360	0.037	0.3689	No
126	Mcm2	8463	0.033	0.3645	No
127	Ythdc1	8527	0.031	0.3621	No
128	Snrpd1	8751	0.024	0.3511	No
129	Smc2	8838	0.021	0.3472	No
130	Prpf4b	8852	0.020	0.3471	No
131	Dkc1	8948	0.018	0.3426	No
132	Abl1	8988	0.017	0.3411	No
133	Mtf2	9094	0.013	0.3360	No
134	Ndc80	9347	0.004	0.3229	No
135	Cbx1	9741	-0.004	0.3024	No
136	Slc38a1	9812	-0.006	0.2990	No
137	Cdc7	9856	-0.008	0.2969	No
138	Pml	10022	-0.013	0.2887	No
139	Pbk	10126	-0.017	0.2838	No
140	Mnat1	10224	-0.020	0.2793	No
141	Cul1	10280	-0.022	0.2770	No
142	Lig3	10405	-0.027	0.2713	No
143	Cdk4	10426	-0.028	0.2711	No
144	Gspt1	10444	-0.028	0.2710	No
145	Ezh2	10565	-0.032	0.2656	No
146	Rbl1	10595	-0.033	0.2651	No
147	Brca2	10693	-0.037	0.2610	No
148	Pafah1b1	10992	-0.047	0.2468	No
149	Myc	11047	-0.049	0.2454	No
150	Cks2	11119	-0.052	0.2431	No
151	Cdc25a	11151	-0.053	0.2430	No
152	Ilf3	11168	-0.054	0.2438	No
153	Slc7a1	11260	-0.057	0.2406	No
154	Chmp1a	11312	-0.059	0.2397	No
155	Nup50	11314	-0.059	0.2413	No
156	Atrx	11342	-0.060	0.2416	No
157	Meis1	11387	-0.062	0.2411	No
158	Jpt1	11436	-0.064	0.2404	No
159	Nasp	11627	-0.071	0.2325	No
160	Rasal2	11649	-0.072	0.2334	No
161	Top1	11884	-0.081	0.2235	No
162	E2f1	11889	-0.081	0.2256	No
163	Foxn3	11926	-0.082	0.2261	No
164	Kif5b	12105	-0.087	0.2193	No
165	Orc6	12231	-0.092	0.2154	No
166	Hira	12249	-0.093	0.2171	No
167	Mad2l1	12465	-0.102	0.2088	No
168	Rps6ka5	12590	-0.107	0.2054	No
169	Bub3	12649	-0.109	0.2054	No
170	Notch2	12744	-0.113	0.2037	No
171	Hmgb3	12851	-0.116	0.2015	No
172	Stag1	13273	-0.132	0.1833	No
173	Pura	13405	-0.137	0.1803	No
174	H2az2	13414	-0.137	0.1838	No
175	E2f3	13428	-0.138	0.1871	No
176	Arid4a	13493	-0.141	0.1878	No
177	Pola2	13527	-0.143	0.1901	No
178	Prmt5	13669	-0.148	0.1870	No
179	Ss18	13758	-0.152	0.1867	No
180	Ncl	13854	-0.156	0.1862	No
181	Tgfb1	13896	-0.158	0.1886	No
182	H2az1	14237	-0.173	0.1757	No
183	Cdkn1b	14634	-0.192	0.1605	No
184	E2f4	14862	-0.204	0.1545	No
185	Tle3	15103	-0.212	0.1480	No
186	Nolc1	15340	-0.223	0.1420	No
187	Orc5	15364	-0.225	0.1472	No
188	Hus1	15466	-0.230	0.1485	No
189	Efna5	15751	-0.243	0.1406	No
190	Hmga1b	16352	-0.276	0.1171	No
191	Odc1	16398	-0.279	0.1228	No
192	Atf5	16481	-0.284	0.1266	No
193	Marcks	17622	-0.364	0.0774	No
194	Sap30	17739	-0.375	0.0820	No