Details for gene set HALLMARK_G2M

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MEP.MEP.mega_Pheno.cls #Group2_versus_Group4.MEP.mega_Pheno.cls #Group2_versus_Group4_repos
Phenotype	MEP.mega_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_G2M_CHECKPOINT
Enrichment Score (ES)	0.35611695
Normalized Enrichment Score (NES)	1.2668464
Nominal p-value	0.27667984
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	0.801

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Nek2	187	0.727	0.0086	Yes
2	Srsf1	209	0.714	0.0255	Yes
3	Hspa8	309	0.660	0.0370	Yes
4	Kif23	338	0.650	0.0520	Yes
5	Hnrnpu	438	0.608	0.0621	Yes
6	Lmnb1	478	0.598	0.0752	Yes
7	Upf1	533	0.583	0.0871	Yes
8	Xpo1	539	0.582	0.1015	Yes
9	Prc1	953	0.502	0.0926	Yes
10	Aurka	972	0.498	0.1042	Yes
11	Plk1	994	0.494	0.1156	Yes
12	Sfpq	1027	0.490	0.1263	Yes
13	Kif2c	1217	0.465	0.1281	Yes
14	Rad21	1273	0.457	0.1368	Yes
15	Cdkn2c	1327	0.450	0.1454	Yes
16	Amd1	1403	0.441	0.1526	Yes
17	Kpnb1	1522	0.426	0.1572	Yes
18	Bcl3	1605	0.420	0.1635	Yes
19	Hnrnpd	1638	0.416	0.1723	Yes
20	Ttk	1757	0.405	0.1764	Yes
21	Cdk1	1792	0.400	0.1847	Yes
22	Chaf1a	1853	0.395	0.1915	Yes
23	Racgap1	1920	0.389	0.1979	Yes
24	Hmmr	1928	0.388	0.2073	Yes
25	Incenp	1989	0.380	0.2138	Yes
26	Cdc25b	2006	0.379	0.2225	Yes
27	Bub1	2098	0.370	0.2271	Yes
28	Kif11	2119	0.368	0.2353	Yes
29	Numa1	2137	0.367	0.2437	Yes
30	Ccna2	2251	0.355	0.2468	Yes
31	Tpx2	2397	0.346	0.2479	Yes
32	Dmd	2457	0.343	0.2535	Yes
33	Espl1	2558	0.335	0.2567	Yes
34	Tent4a	2560	0.335	0.2651	Yes
35	Cenpf	2692	0.327	0.2665	Yes
36	Ccnf	2794	0.317	0.2693	Yes
37	Cenpe	2852	0.312	0.2741	Yes
38	Map3k20	3059	0.301	0.2710	Yes
39	Cul3	3090	0.298	0.2769	Yes
40	Dr1	3196	0.291	0.2788	Yes
41	Tacc3	3255	0.287	0.2830	Yes
42	Top2a	3260	0.287	0.2900	Yes
43	Prpf4b	3261	0.287	0.2973	Yes
44	Efna5	3287	0.285	0.3031	Yes
45	Cdc27	3419	0.276	0.3033	Yes
46	Mcm6	3486	0.271	0.3067	Yes
47	Smarcc1	3819	0.251	0.2956	Yes
48	Uck2	3863	0.248	0.2996	Yes
49	Slc12a2	3944	0.245	0.3016	Yes
50	Meis2	4042	0.241	0.3026	Yes
51	Cul5	4051	0.240	0.3083	Yes
52	Kif4	4199	0.231	0.3064	Yes
53	Lbr	4267	0.228	0.3087	Yes
54	Smad3	4271	0.227	0.3143	Yes
55	Kif22	4278	0.227	0.3197	Yes
56	Kif15	4290	0.226	0.3248	Yes
57	Cul4a	4300	0.226	0.3300	Yes
58	Aurkb	4310	0.225	0.3353	Yes
59	Dbf4	4328	0.223	0.3400	Yes
60	Fbxo5	4386	0.220	0.3426	Yes
61	Ilf3	4463	0.216	0.3441	Yes
62	Slc7a5	4571	0.212	0.3438	Yes
63	Chmp1a	4598	0.210	0.3477	Yes
64	Sap30	4686	0.204	0.3483	Yes
65	Mtf2	4748	0.200	0.3502	Yes
66	Ube2c	4777	0.198	0.3537	Yes
67	Syncrip	4832	0.195	0.3558	Yes
68	Suv39h1	4920	0.191	0.3561	Yes
69	Tfdp1	5146	0.180	0.3489	No
70	Smc1a	5296	0.176	0.3455	No
71	Rad54l	5367	0.172	0.3462	No
72	Tmpo	5408	0.169	0.3484	No
73	G3bp1	5495	0.165	0.3480	No
74	Knl1	5867	0.150	0.3324	No
75	Mki67	5972	0.144	0.3306	No
76	Odf2	6190	0.133	0.3226	No
77	Kif5b	6261	0.129	0.3222	No
78	Birc5	6280	0.129	0.3245	No
79	Nsd2	6297	0.128	0.3269	No
80	Cdc25a	6321	0.127	0.3289	No
81	Pafah1b1	6369	0.124	0.3296	No
82	Ewsr1	6421	0.122	0.3300	No
83	Pole	6461	0.120	0.3310	No
84	Hira	6467	0.119	0.3337	No
85	Chek1	6469	0.119	0.3367	No
86	Cul1	6477	0.119	0.3393	No
87	Plk4	6517	0.117	0.3402	No
88	Bard1	6605	0.112	0.3385	No
89	Hif1a	6610	0.112	0.3412	No
90	Ddx39a	6719	0.107	0.3382	No
91	Prim2	6746	0.106	0.3395	No
92	Cenpa	6815	0.103	0.3386	No
93	Mcm2	6820	0.103	0.3410	No
94	Wrn	6830	0.102	0.3431	No
95	H2bc12	6889	0.099	0.3425	No
96	Tra2b	6993	0.094	0.3395	No
97	Nup98	7046	0.092	0.3391	No
98	Mapk14	7053	0.091	0.3411	No
99	Nasp	7097	0.090	0.3411	No
100	Polq	7124	0.089	0.3420	No
101	Odc1	7289	0.082	0.3355	No
102	Kif20b	7360	0.079	0.3338	No
103	Cdkn1b	7415	0.076	0.3329	No
104	Tle3	7508	0.071	0.3299	No
105	Ccnd1	7774	0.061	0.3176	No
106	Abl1	7864	0.057	0.3144	No
107	Cdc7	7947	0.054	0.3114	No
108	Arid4a	7989	0.052	0.3106	No
109	Rad23b	8007	0.052	0.3110	No
110	Ccnt1	8014	0.051	0.3120	No
111	Rps6ka5	8125	0.047	0.3074	No
112	Pds5b	8154	0.045	0.3071	No
113	Traip	8214	0.043	0.3051	No
114	Smc2	8268	0.040	0.3034	No
115	Ythdc1	8290	0.039	0.3033	No
116	Rasal2	8427	0.033	0.2970	No
117	Egf	8490	0.029	0.2945	No
118	Tnpo2	8516	0.028	0.2939	No
119	E2f2	8541	0.027	0.2933	No
120	Mybl2	8615	0.023	0.2901	No
121	Orc5	8696	0.020	0.2864	No
122	Ndc80	8724	0.019	0.2854	No
123	Ccnb2	8729	0.019	0.2857	No
124	Ncl	8739	0.018	0.2857	No
125	Dkc1	8955	0.011	0.2747	No
126	Slc38a1	9051	0.007	0.2699	No
127	Atf5	9109	0.005	0.2671	No
128	Mcm3	9355	-0.002	0.2543	No
129	E2f3	9369	-0.003	0.2537	No
130	Pbk	9596	-0.013	0.2422	No
131	Smc4	9774	-0.020	0.2335	No
132	Srsf10	10069	-0.032	0.2189	No
133	Cdc20	10115	-0.034	0.2174	No
134	Sqle	10126	-0.035	0.2178	No
135	Nusap1	10145	-0.035	0.2177	No
136	Mnat1	10153	-0.036	0.2183	No
137	Notch2	10184	-0.038	0.2177	No
138	Hus1	10208	-0.039	0.2174	No
139	Prmt5	10293	-0.043	0.2141	No
140	Ube2s	10403	-0.047	0.2096	No
141	Ss18	10429	-0.048	0.2095	No
142	Ezh2	10482	-0.050	0.2080	No
143	Stil	10689	-0.058	0.1987	No
144	Mcm5	10802	-0.061	0.1944	No
145	Brca2	10909	-0.066	0.1905	No
146	Jpt1	11075	-0.073	0.1838	No
147	Stmn1	11077	-0.073	0.1855	No
148	Snrpd1	11085	-0.073	0.1870	No
149	Meis1	11182	-0.077	0.1840	No
150	Stag1	11183	-0.077	0.1859	No
151	Cks1b	11202	-0.078	0.1869	No
152	Fancc	11713	-0.098	0.1627	No
153	Atrx	11733	-0.098	0.1642	No
154	Lig3	11737	-0.099	0.1665	No
155	Katna1	11798	-0.101	0.1660	No
156	Cbx1	11847	-0.104	0.1661	No
157	Hmgb3	11902	-0.106	0.1659	No
158	Exo1	11970	-0.109	0.1652	No
159	Cks2	11980	-0.109	0.1675	No
160	Gins2	11993	-0.110	0.1696	No
161	Cdc6	12095	-0.115	0.1672	No
162	Foxn3	12245	-0.120	0.1625	No
163	Casp8ap2	12319	-0.123	0.1617	No
164	Srsf2	12437	-0.128	0.1589	No
165	Nolc1	12691	-0.140	0.1492	No
166	Gspt1	12855	-0.148	0.1444	No
167	Rpa2	13154	-0.161	0.1329	No
168	Troap	13234	-0.165	0.1329	No
169	E2f4	13254	-0.166	0.1361	No
170	Top1	13313	-0.169	0.1373	No
171	Rbl1	13404	-0.173	0.1370	No
172	Ctcf	13426	-0.174	0.1403	No
173	Pml	13773	-0.191	0.1270	No
174	Orc6	13793	-0.191	0.1308	No
175	Slc7a1	14486	-0.222	0.1002	No
176	H2az1	14508	-0.223	0.1048	No
177	Pttg1	14537	-0.225	0.1090	No
178	Cdc45	14629	-0.230	0.1100	No
179	Hmga1b	15030	-0.253	0.0955	No
180	Myc	15146	-0.258	0.0960	No
181	Mad2l1	15148	-0.258	0.1024	No
182	Cdk4	15202	-0.261	0.1062	No
183	Cdkn3	15261	-0.264	0.1099	No
184	Bub3	15526	-0.280	0.1031	No
185	Nup50	15542	-0.281	0.1094	No
186	H2ax	15892	-0.301	0.0988	No
187	Marcks	16206	-0.320	0.0905	No
188	Tgfb1	16242	-0.323	0.0968	No
189	Kmt5a	16558	-0.345	0.0891	No
190	Pola2	16600	-0.348	0.0957	No
191	Pura	17564	-0.425	0.0560	No
192	Dtymk	17872	-0.457	0.0515	No
193	H2az2	17910	-0.462	0.0613	No
194	E2f1	17957	-0.466	0.0706	No