Details for gene set HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MEP.MEP.mega_Pheno.cls #Group2_versus_Group3.MEP.mega_Pheno.cls #Group2_versus_Group3_repos
Phenotype	MEP.mega_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA_NFKB
Enrichment Score (ES)	0.22938582
Normalized Enrichment Score (NES)	0.88641083
Nominal p-value	0.62993765
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	0.999

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Traf1	0	1.255	0.0282	Yes
2	Rhob	172	0.681	0.0345	Yes
3	Olr1	180	0.675	0.0493	Yes
4	Ninj1	235	0.631	0.0606	Yes
5	Ier5	278	0.615	0.0722	Yes
6	Il1a	329	0.593	0.0829	Yes
7	Phlda1	377	0.575	0.0934	Yes
8	Sat1	435	0.555	0.1029	Yes
9	Jun	437	0.555	0.1153	Yes
10	Abca1	540	0.526	0.1217	Yes
11	Gpr183	628	0.508	0.1286	Yes
12	Birc2	656	0.502	0.1384	Yes
13	Plaur	827	0.469	0.1401	Yes
14	Il7r	1009	0.437	0.1404	Yes
15	Trip10	1127	0.420	0.1437	Yes
16	Slc2a3	1169	0.416	0.1509	Yes
17	Plek	1178	0.415	0.1598	Yes
18	Atf3	1187	0.414	0.1687	Yes
19	Tnfaip3	1239	0.409	0.1752	Yes
20	Mcl1	1247	0.409	0.1840	Yes
21	Tnip2	1264	0.407	0.1923	Yes
22	Mxd1	1285	0.404	0.2004	Yes
23	Fosb	1484	0.386	0.1987	Yes
24	Kynu	1725	0.362	0.1943	Yes
25	Dusp1	1797	0.357	0.1986	Yes
26	Bmp2	1873	0.350	0.2025	Yes
27	Il6	2038	0.339	0.2015	Yes
28	Fos	2111	0.332	0.2052	Yes
29	Klf6	2309	0.317	0.2020	Yes
30	Rnf19b	2473	0.307	0.2004	Yes
31	Socs3	2496	0.305	0.2061	Yes
32	Nampt	2500	0.304	0.2128	Yes
33	Junb	2761	0.286	0.2056	Yes
34	Slc2a6	2786	0.284	0.2107	Yes
35	Il1b	3038	0.268	0.2036	Yes
36	Dnajb4	3047	0.267	0.2092	Yes
37	Tank	3073	0.266	0.2138	Yes
38	Tsc22d1	3234	0.255	0.2112	Yes
39	Plk2	3315	0.251	0.2126	Yes
40	Bhlhe40	3324	0.250	0.2178	Yes
41	Rigi	3352	0.248	0.2220	Yes
42	Ifih1	3376	0.247	0.2263	Yes
43	Btg2	3485	0.241	0.2261	Yes
44	Icam1	3576	0.235	0.2267	Yes
45	Serpinb2	3679	0.230	0.2265	Yes
46	Cd69	3845	0.220	0.2228	Yes
47	Litaf	3874	0.219	0.2263	Yes
48	Plpp3	4050	0.211	0.2219	Yes
49	Tiparp	4361	0.196	0.2101	Yes
50	Il6st	4406	0.194	0.2121	Yes
51	Pfkfb3	4409	0.194	0.2164	Yes
52	Birc3	4505	0.189	0.2157	Yes
53	Ifit2	4519	0.188	0.2192	Yes
54	Maff	4592	0.184	0.2196	Yes
55	Tnfaip8	4611	0.183	0.2227	Yes
56	Dennd5a	4625	0.182	0.2261	Yes
57	Id2	4642	0.182	0.2294	Yes
58	Spsb1	4752	0.177	0.2277	No
59	Pdlim5	4892	0.172	0.2243	No
60	Klf10	4917	0.171	0.2268	No
61	Trib1	5026	0.165	0.2249	No
62	Cxcl5	5085	0.162	0.2255	No
63	Cxcl10	5112	0.161	0.2277	No
64	B4galt1	5356	0.152	0.2185	No
65	Map2k3	5383	0.151	0.2205	No
66	Btg3	5625	0.141	0.2111	No
67	Ccnl1	5753	0.135	0.2075	No
68	Ets2	5872	0.130	0.2042	No
69	Zfp36	5932	0.128	0.2040	No
70	Nfe2l2	5949	0.127	0.2060	No
71	Kdm6b	6236	0.114	0.1936	No
72	Gadd45a	6278	0.112	0.1940	No
73	Map3k8	6506	0.103	0.1844	No
74	Slc16a6	6531	0.102	0.1855	No
75	Tubb2a	6538	0.102	0.1874	No
76	Klf2	6723	0.095	0.1800	No
77	Cflar	6872	0.089	0.1742	No
78	Sgk1	6960	0.085	0.1716	No
79	Nr4a1	7032	0.082	0.1697	No
80	Icosl	7308	0.072	0.1570	No
81	Fut4	7330	0.071	0.1575	No
82	Il15ra	7742	0.055	0.1372	No
83	Btg1	7809	0.053	0.1350	No
84	Klf9	7889	0.050	0.1320	No
85	Il18	8027	0.044	0.1258	No
86	Nfil3	8164	0.040	0.1196	No
87	Tnfrsf9	8258	0.036	0.1155	No
88	Per1	8367	0.032	0.1106	No
89	Nfat5	8879	0.013	0.0842	No
90	Nfkbie	8902	0.012	0.0833	No
91	Marcks	9006	0.009	0.0781	No
92	Tnip1	9196	0.002	0.0683	No
93	Serpinb8	9310	-0.001	0.0624	No
94	Jag1	9416	-0.005	0.0570	No
95	Csf1	9596	-0.011	0.0479	No
96	Bcl3	9938	-0.023	0.0306	No
97	Atp2b1	10127	-0.030	0.0215	No
98	Irf1	10147	-0.031	0.0212	No
99	Ier2	10189	-0.032	0.0198	No
100	Ier3	10398	-0.041	0.0098	No
101	Vegfa	10517	-0.046	0.0047	No
102	Hes1	10646	-0.051	-0.0009	No
103	Stat5a	10703	-0.053	-0.0026	No
104	Bcl6	10792	-0.055	-0.0060	No
105	Ehd1	10929	-0.061	-0.0117	No
106	Nr4a2	11078	-0.067	-0.0179	No
107	Cd80	11139	-0.070	-0.0195	No
108	Zbtb10	11496	-0.082	-0.0363	No
109	Smad3	11626	-0.088	-0.0410	No
110	Cd44	11765	-0.094	-0.0462	No
111	Nfkb2	11782	-0.095	-0.0449	No
112	Rcan1	11805	-0.096	-0.0439	No
113	Pde4b	11869	-0.099	-0.0449	No
114	Sod2	11918	-0.100	-0.0452	No
115	Irs2	11962	-0.103	-0.0451	No
116	Zc3h12a	12002	-0.104	-0.0448	No
117	Klf4	12023	-0.105	-0.0435	No
118	Pmepa1	12530	-0.126	-0.0671	No
119	Tnfsf9	12551	-0.127	-0.0653	No
120	Cebpb	13106	-0.152	-0.0909	No
121	Gfpt2	13253	-0.157	-0.0949	No
122	Yrdc	13325	-0.160	-0.0951	No
123	Nfkb1	13465	-0.166	-0.0986	No
124	Sqstm1	13467	-0.166	-0.0949	No
125	Nfkbia	13511	-0.169	-0.0934	No
126	Pnrc1	13623	-0.174	-0.0953	No
127	Rel	13679	-0.177	-0.0942	No
128	Rela	14062	-0.194	-0.1098	No
129	Egr3	14293	-0.205	-0.1172	No
130	Myc	14460	-0.214	-0.1211	No
131	Panx1	14470	-0.215	-0.1167	No
132	Nr4a3	14633	-0.222	-0.1202	No
133	Snn	14682	-0.225	-0.1177	No
134	Cdkn1a	14702	-0.226	-0.1136	No
135	Gch1	14730	-0.227	-0.1099	No
136	Ppp1r15a	14807	-0.231	-0.1087	No
137	Fosl2	15190	-0.253	-0.1230	No
138	Sphk1	15366	-0.262	-0.1262	No
139	Gadd45b	15368	-0.262	-0.1204	No
140	Lamb3	15662	-0.277	-0.1295	No
141	Relb	15907	-0.294	-0.1356	No
142	Egr1	15913	-0.295	-0.1292	No
143	Tap1	15972	-0.300	-0.1255	No
144	Ptger4	15993	-0.301	-0.1198	No
145	Dusp4	16028	-0.304	-0.1148	No
146	Dram1	16096	-0.308	-0.1114	No
147	Tlr2	16173	-0.313	-0.1083	No
148	Hbegf	16198	-0.314	-0.1025	No
149	Tnfaip2	16205	-0.315	-0.0958	No
150	Ptpre	16293	-0.321	-0.0931	No
151	Ldlr	16762	-0.352	-0.1097	No
152	Ifngr2	16787	-0.354	-0.1030	No
153	Phlda2	16842	-0.358	-0.0978	No
154	Dusp5	16998	-0.372	-0.0975	No
155	Eif1	17119	-0.383	-0.0952	No
156	Ccl5	17185	-0.388	-0.0899	No
157	Plau	17290	-0.398	-0.0864	No
158	B4galt5	17454	-0.410	-0.0857	No
159	Tgif1	17619	-0.424	-0.0848	No
160	Clcf1	17774	-0.439	-0.0830	No
161	Ccrl2	18378	-0.528	-0.1026	No
162	Gem	18468	-0.546	-0.0950	No
163	Cebpd	18616	-0.580	-0.0897	No
164	Ripk2	18837	-0.630	-0.0870	No
165	Fjx1	18971	-0.687	-0.0785	No
166	Tnf	19253	-0.972	-0.0714	No
167	Ccnd1	19270	-1.031	-0.0491	No
168	Fosl1	19273	-1.042	-0.0258	No
169	Dusp2	19297	-1.227	0.0005	No