Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MEP.MEP.mega_Pheno.cls #Group2_versus_Group3.MEP.mega_Pheno.cls #Group2_versus_Group3_repos
Phenotype	MEP.mega_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_HYPOXIA
Enrichment Score (ES)	0.23745911
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0241809
Nominal p-value	0.4040404
FDR q-value	0.8800271
FWER p-Value	0.993

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Vldlr	75	0.776	0.0169	Yes
2	Ppargc1a	109	0.733	0.0348	Yes
3	Tgfbi	271	0.617	0.0430	Yes
4	Jun	437	0.555	0.0493	Yes
5	Sap30	542	0.526	0.0580	Yes
6	P4ha1	567	0.522	0.0707	Yes
7	Ets1	801	0.474	0.0712	Yes
8	Plaur	827	0.469	0.0825	Yes
9	Aldoc	993	0.440	0.0857	Yes
10	Pgk1	1001	0.439	0.0971	Yes
11	Slc2a3	1169	0.416	0.0996	Yes
12	Atf3	1187	0.414	0.1098	Yes
13	Tnfaip3	1239	0.409	0.1181	Yes
14	Klf7	1241	0.409	0.1290	Yes
15	Mxi1	1431	0.391	0.1296	Yes
16	Gpc4	1690	0.366	0.1260	Yes
17	Myh9	1697	0.365	0.1355	Yes
18	B4galnt2	1721	0.362	0.1440	Yes
19	Dusp1	1797	0.357	0.1496	Yes
20	Il6	2038	0.339	0.1462	Yes
21	Pgm2	2050	0.338	0.1547	Yes
22	Fos	2111	0.332	0.1604	Yes
23	Klf6	2309	0.317	0.1587	Yes
24	Kdm3a	2548	0.302	0.1543	Yes
25	Cp	2732	0.288	0.1525	Yes
26	Sdc3	2906	0.276	0.1509	Yes
27	Pim1	2968	0.272	0.1550	Yes
28	Cdkn1b	3003	0.270	0.1604	Yes
29	P4ha2	3089	0.265	0.1631	Yes
30	Plac8	3144	0.261	0.1673	Yes
31	Aldoa	3164	0.260	0.1733	Yes
32	Ppfia4	3244	0.255	0.1760	Yes
33	Ampd3	3290	0.252	0.1804	Yes
34	Bhlhe40	3324	0.250	0.1854	Yes
35	Pfkp	3402	0.245	0.1879	Yes
36	Csrp2	3418	0.244	0.1937	Yes
37	Hdlbp	3452	0.242	0.1985	Yes
38	Tmem45a	3466	0.241	0.2043	Yes
39	Cavin1	3714	0.228	0.1975	Yes
40	Foxo3	3868	0.219	0.1954	Yes
41	Cavin3	4025	0.212	0.1929	Yes
42	Ccng2	4091	0.210	0.1952	Yes
43	Rora	4143	0.207	0.1981	Yes
44	Errfi1	4182	0.205	0.2016	Yes
45	Tgfb3	4237	0.203	0.2042	Yes
46	Klhl24	4354	0.197	0.2034	Yes
47	Tiparp	4361	0.196	0.2084	Yes
48	Pfkfb3	4409	0.194	0.2111	Yes
49	Stc2	4418	0.194	0.2159	Yes
50	Gpc1	4485	0.190	0.2176	Yes
51	Prkca	4486	0.190	0.2226	Yes
52	Pam	4542	0.186	0.2248	Yes
53	Dcn	4547	0.186	0.2296	Yes
54	Maff	4592	0.184	0.2322	Yes
55	Tpd52	4606	0.183	0.2364	Yes
56	Vhl	4736	0.178	0.2345	Yes
57	Ext1	4770	0.176	0.2375	Yes
58	Slc25a1	4955	0.169	0.2324	No
59	Sult2b1	4980	0.167	0.2356	No
60	Inha	5090	0.162	0.2343	No
61	Casp6	5149	0.161	0.2355	No
62	Kdelr3	5234	0.157	0.2354	No
63	Map3k1	5766	0.135	0.2113	No
64	Gck	5858	0.131	0.2100	No
65	Plin2	5927	0.128	0.2099	No
66	Zfp36	5932	0.128	0.2131	No
67	Ndrg1	5950	0.127	0.2156	No
68	Ugp2	5952	0.127	0.2190	No
69	Eno1b	6034	0.123	0.2180	No
70	Hmox1	6069	0.121	0.2195	No
71	Wsb1	6150	0.118	0.2185	No
72	Gpi1	6499	0.103	0.2031	No
73	Cav1	6643	0.098	0.1982	No
74	Hk1	7061	0.081	0.1786	No
75	Gbe1	7063	0.081	0.1807	No
76	Hk2	7327	0.071	0.1689	No
77	Jmjd6	7476	0.066	0.1629	No
78	Prdx5	7598	0.060	0.1582	No
79	Mt1	7647	0.059	0.1573	No
80	Hs3st1	7667	0.058	0.1579	No
81	Zfp292	7723	0.056	0.1565	No
82	Large1	7768	0.055	0.1557	No
83	Btg1	7809	0.053	0.1550	No
84	Xpnpep1	7935	0.049	0.1498	No
85	Bnip3l	7965	0.047	0.1496	No
86	Nfil3	8164	0.040	0.1403	No
87	Ilvbl	8213	0.037	0.1388	No
88	Bcl2	8238	0.036	0.1385	No
89	Slc37a4	8298	0.034	0.1363	No
90	Tgm2	8478	0.028	0.1277	No
91	Rbpj	8534	0.026	0.1256	No
92	Ankzf1	8623	0.022	0.1216	No
93	Fbp1	8732	0.019	0.1164	No
94	Sdc2	8986	0.009	0.1035	No
95	Siah2	8991	0.009	0.1035	No
96	Gapdhs	9051	0.007	0.1006	No
97	Ero1a	9150	0.003	0.0956	No
98	Nedd4l	9156	0.003	0.0954	No
99	Atp7a	9289	-0.000	0.0885	No
100	Pklr	9292	-0.000	0.0884	No
101	Ndst2	9459	-0.006	0.0799	No
102	Slc6a6	9859	-0.020	0.0596	No
103	Gpc3	10121	-0.030	0.0467	No
104	Pdk1	10277	-0.036	0.0396	No
105	Nagk	10376	-0.040	0.0356	No
106	Ier3	10398	-0.041	0.0356	No
107	Pdk3	10403	-0.041	0.0365	No
108	Akap12	10467	-0.044	0.0344	No
109	Vegfa	10517	-0.046	0.0330	No
110	Col5a1	10645	-0.051	0.0278	No
111	Selenbp1	10825	-0.057	0.0199	No
112	Nr3c1	10864	-0.059	0.0195	No
113	Isg20	11043	-0.066	0.0120	No
114	Dtna	11447	-0.080	-0.0069	No
115	Tpst2	11812	-0.096	-0.0233	No
116	Hspa5	11927	-0.101	-0.0266	No
117	Irs2	11962	-0.103	-0.0256	No
118	Ddit3	12116	-0.109	-0.0307	No
119	Slc2a5	12704	-0.134	-0.0577	No
120	Gaa	12721	-0.135	-0.0550	No
121	Phkg1	13120	-0.153	-0.0716	No
122	Stbd1	13499	-0.168	-0.0869	No
123	Anxa2	13513	-0.169	-0.0830	No
124	Pnrc1	13623	-0.174	-0.0841	No
125	Eno2	13738	-0.179	-0.0852	No
126	Kif5a	13807	-0.181	-0.0839	No
127	Pygm	14392	-0.210	-0.1088	No
128	Pgm1	14559	-0.218	-0.1116	No
129	Ids	14591	-0.220	-0.1073	No
130	Cdkn1a	14702	-0.226	-0.1070	No
131	Tes	14770	-0.230	-0.1043	No
132	Ppp1r15a	14807	-0.231	-0.1000	No
133	Fosl2	15190	-0.253	-0.1132	No
134	Gys1	15536	-0.271	-0.1239	No
135	Galk1	15639	-0.276	-0.1218	No
136	Ndst1	15828	-0.288	-0.1239	No
137	Angptl4	15917	-0.296	-0.1206	No
138	Hexa	16000	-0.302	-0.1168	No
139	Car12	16124	-0.310	-0.1149	No
140	Grhpr	16206	-0.315	-0.1107	No
141	Pfkl	16486	-0.334	-0.1163	No
142	Scarb1	16534	-0.337	-0.1097	No
143	Tpi1	16599	-0.341	-0.1039	No
144	Gcnt2	16616	-0.342	-0.0956	No
145	Cxcr4	16820	-0.357	-0.0966	No
146	Fam162a	16885	-0.362	-0.0902	No
147	Glrx	16903	-0.363	-0.0814	No
148	Ddit4	16906	-0.364	-0.0717	No
149	Mif	17149	-0.385	-0.0740	No
150	Pdgfb	17675	-0.430	-0.0899	No
151	B3galt6	17734	-0.436	-0.0812	No
152	Slc2a1	17741	-0.436	-0.0699	No
153	Cited2	17889	-0.452	-0.0654	No
154	Cdkn1c	17985	-0.464	-0.0579	No
155	Adora2b	18064	-0.475	-0.0493	No
156	Eno3	18105	-0.482	-0.0384	No
157	Bgn	18119	-0.483	-0.0261	No
158	Noct	18127	-0.485	-0.0135	No
159	Lxn	18223	-0.500	-0.0050	No
160	S100a4	18225	-0.500	0.0083	No
161	Ldha	18254	-0.504	0.0204	No
162	Rragd	18256	-0.504	0.0339	No
163	Ak4	19105	-0.782	0.0106	No