Details for gene set HALLMARK_APICAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MEP.MEP.mega_Pheno.cls #Group2_versus_Group3.MEP.mega_Pheno.cls #Group2_versus_Group3_repos
Phenotype	MEP.mega_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_APICAL_JUNCTION
Enrichment Score (ES)	0.27877322
Normalized Enrichment Score (NES)	1.1301552
Nominal p-value	0.26262626
FDR q-value	0.86418533
FWER p-Value	0.965

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Traf1	0	1.255	0.0325	Yes
2	Vcl	201	0.662	0.0393	Yes
3	Vcam1	230	0.638	0.0543	Yes
4	Cdh11	255	0.624	0.0693	Yes
5	Tgfbi	271	0.617	0.0845	Yes
6	Pik3cb	318	0.596	0.0975	Yes
7	Vwf	468	0.543	0.1038	Yes
8	Itga3	486	0.538	0.1169	Yes
9	Ikbkg	590	0.515	0.1249	Yes
10	Col16a1	655	0.502	0.1345	Yes
11	Nlgn3	719	0.491	0.1440	Yes
12	Mmp2	916	0.452	0.1455	Yes
13	Akt3	930	0.451	0.1565	Yes
14	Rsu1	1068	0.429	0.1604	Yes
15	Itga2	1095	0.424	0.1701	Yes
16	Cnn2	1250	0.408	0.1726	Yes
17	Myl9	1254	0.408	0.1830	Yes
18	Shroom2	1448	0.389	0.1831	Yes
19	Actg1	1530	0.382	0.1887	Yes
20	Nrxn2	1583	0.378	0.1958	Yes
21	Myh9	1697	0.365	0.1994	Yes
22	Epb41l2	1728	0.362	0.2072	Yes
23	Ywhah	1836	0.353	0.2108	Yes
24	Cap1	1856	0.351	0.2189	Yes
25	Adam9	2070	0.336	0.2165	Yes
26	Cdk8	2089	0.334	0.2242	Yes
27	Pecam1	2244	0.323	0.2245	Yes
28	Rasa1	2316	0.316	0.2290	Yes
29	Wnk4	2442	0.309	0.2305	Yes
30	Skap2	2475	0.306	0.2367	Yes
31	Zyx	2581	0.299	0.2390	Yes
32	Nectin1	2591	0.299	0.2463	Yes
33	Negr1	2639	0.295	0.2515	Yes
34	Sdc3	2906	0.276	0.2448	Yes
35	Nectin3	3060	0.266	0.2437	Yes
36	Cdh4	3115	0.263	0.2477	Yes
37	Itgb1	3140	0.261	0.2532	Yes
38	Adam15	3245	0.255	0.2544	Yes
39	Atp1a3	3260	0.254	0.2602	Yes
40	Ctnna1	3508	0.240	0.2535	Yes
41	Icam1	3576	0.235	0.2561	Yes
42	Irs1	3676	0.230	0.2569	Yes
43	Pten	4055	0.211	0.2427	Yes
44	Nexn	4088	0.210	0.2465	Yes
45	Ctnnd1	4130	0.208	0.2497	Yes
46	Pals1	4159	0.207	0.2536	Yes
47	Ldlrap1	4245	0.203	0.2544	Yes
48	Itga10	4326	0.198	0.2554	Yes
49	Src	4336	0.198	0.2600	Yes
50	Cd274	4337	0.198	0.2652	Yes
51	Plcg1	4377	0.196	0.2682	Yes
52	Icam5	4475	0.190	0.2681	Yes
53	Stx4a	4476	0.190	0.2730	Yes
54	Dlg1	4541	0.186	0.2745	Yes
55	Taok2	4552	0.186	0.2788	Yes
56	Sirpa	4732	0.178	0.2740	No
57	Kcnh2	4830	0.175	0.2735	No
58	Actn1	4984	0.167	0.2698	No
59	Nfasc	5050	0.164	0.2707	No
60	B4galt1	5356	0.152	0.2587	No
61	Vav2	5395	0.150	0.2606	No
62	Nf2	5546	0.144	0.2565	No
63	Ptk2	5967	0.126	0.2379	No
64	Dhx16	6294	0.112	0.2237	No
65	Akt2	6300	0.111	0.2264	No
66	Map4k2	6602	0.099	0.2132	No
67	Cldn14	6604	0.099	0.2157	No
68	Tsc1	6646	0.098	0.2161	No
69	Lima1	6868	0.089	0.2069	No
70	Pard6g	6925	0.087	0.2062	No
71	Vcan	6938	0.086	0.2078	No
72	Itga9	7252	0.073	0.1934	No
73	Pbx2	7394	0.068	0.1878	No
74	Rras	7505	0.064	0.1837	No
75	Wasl	7708	0.057	0.1747	No
76	Tial1	7885	0.050	0.1668	No
77	Exoc4	8299	0.034	0.1461	No
78	Cercam	8309	0.034	0.1465	No
79	Map3k20	8340	0.033	0.1458	No
80	Sgce	8428	0.029	0.1420	No
81	Myh10	8586	0.024	0.1345	No
82	Cdh1	8756	0.018	0.1261	No
83	Ptprc	9031	0.008	0.1120	No
84	Mdk	9054	0.007	0.1110	No
85	Syk	9083	0.006	0.1097	No
86	Cadm2	9321	-0.001	0.0974	No
87	Gnai2	9373	-0.003	0.0948	No
88	Mapk14	9420	-0.005	0.0925	No
89	Cldn15	9468	-0.006	0.0902	No
90	Jam3	9517	-0.008	0.0879	No
91	Arhgef6	9530	-0.009	0.0875	No
92	Gnai1	9552	-0.010	0.0867	No
93	Nf1	9639	-0.012	0.0825	No
94	Pik3r3	9838	-0.019	0.0727	No
95	Nrap	10072	-0.028	0.0612	No
96	Pkd1	10234	-0.034	0.0537	No
97	Evl	10249	-0.034	0.0539	No
98	Slit2	10346	-0.039	0.0499	No
99	Amigo2	10498	-0.045	0.0432	No
100	Vasp	10503	-0.046	0.0441	No
101	Layn	10511	-0.046	0.0449	No
102	Actb	10699	-0.052	0.0365	No
103	Actn4	11053	-0.066	0.0198	No
104	Amh	11355	-0.078	0.0061	No
105	Tjp1	11440	-0.080	0.0038	No
106	Gtf2f1	11578	-0.086	-0.0011	No
107	Cadm3	11709	-0.091	-0.0055	No
108	Hadh	12434	-0.122	-0.0402	No
109	Tro	12841	-0.139	-0.0578	No
110	Rhof	12936	-0.144	-0.0589	No
111	Inppl1	13202	-0.156	-0.0687	No
112	Cd86	13270	-0.159	-0.0681	No
113	Itgb4	13410	-0.164	-0.0711	No
114	Mpzl1	13434	-0.165	-0.0680	No
115	Thy1	13446	-0.165	-0.0643	No
116	Sympk	13658	-0.176	-0.0708	No
117	Arpc2	13660	-0.176	-0.0662	No
118	Nectin4	13697	-0.178	-0.0635	No
119	Adamts5	13772	-0.180	-0.0627	No
120	Tspan4	14015	-0.192	-0.0704	No
121	Msn	14088	-0.195	-0.0691	No
122	Nlgn2	14288	-0.205	-0.0742	No
123	Baiap2	14298	-0.205	-0.0693	No
124	Fbn1	14542	-0.217	-0.0764	No
125	Bmp1	14578	-0.219	-0.0725	No
126	Sorbs3	14799	-0.231	-0.0780	No
127	Shc1	14926	-0.238	-0.0784	No
128	Tmem8b	15364	-0.262	-0.0944	No
129	Cd276	15424	-0.265	-0.0907	No
130	Cdh8	15526	-0.270	-0.0889	No
131	Jup	15599	-0.274	-0.0856	No
132	Lamb3	15662	-0.277	-0.0816	No
133	Mapk11	15898	-0.294	-0.0863	No
134	Amigo1	15997	-0.302	-0.0836	No
135	Rac2	16226	-0.317	-0.0873	No
136	Crat	16416	-0.329	-0.0886	No
137	Myl12b	16509	-0.335	-0.0847	No
138	Icam4	16515	-0.335	-0.0763	No
139	Insig1	16941	-0.367	-0.0890	No
140	Mvd	16959	-0.368	-0.0803	No
141	Col17a1	17276	-0.397	-0.0865	No
142	Crb3	17335	-0.400	-0.0792	No
143	Pfn1	17412	-0.406	-0.0726	No
144	Actn2	17725	-0.435	-0.0776	No
145	Adra1b	17737	-0.436	-0.0669	No
146	Tubg1	17964	-0.460	-0.0668	No
147	Lama3	18103	-0.481	-0.0615	No
148	Gamt	18227	-0.500	-0.0550	No
149	Hras	18354	-0.524	-0.0479	No
150	Thbs3	18473	-0.547	-0.0399	No
151	Icam2	18538	-0.560	-0.0287	No
152	Cx3cl1	18594	-0.574	-0.0167	No
153	Cd34	18647	-0.585	-0.0043	No
154	Nectin2	18787	-0.617	0.0044	No
155	Nrtn	19209	-0.874	0.0051	No