Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MEP.MEP.mega_Pheno.cls #Group1_versus_Group4.MEP.mega_Pheno.cls #Group1_versus_Group4_repos
Phenotype	MEP.mega_Pheno.cls#Group1_versus_Group4_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_MYOGENESIS
Enrichment Score (ES)	0.23279326
Normalized Enrichment Score (NES)	0.8665819
Nominal p-value	0.6792079
FDR q-value	0.8878225
FWER p-Value	0.998

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Gpx3	91	0.847	0.0200	Yes
2	Ppfia4	174	0.766	0.0382	Yes
3	Fdps	255	0.705	0.0546	Yes
4	Flii	320	0.671	0.0709	Yes
5	Ryr1	487	0.608	0.0800	Yes
6	Ncam1	507	0.603	0.0966	Yes
7	Myom1	549	0.591	0.1118	Yes
8	Mras	635	0.571	0.1240	Yes
9	Eif4a2	733	0.546	0.1350	Yes
10	Dtna	739	0.546	0.1507	Yes
11	Ephb3	850	0.524	0.1602	Yes
12	Sorbs1	863	0.522	0.1749	Yes
13	Mapre3	945	0.508	0.1855	Yes
14	Gabarapl2	1002	0.497	0.1971	Yes
15	Dmpk	1041	0.492	0.2095	Yes
16	Wwtr1	1643	0.414	0.1903	Yes
17	Igfbp7	1948	0.382	0.1856	Yes
18	Hdac5	1962	0.381	0.1961	Yes
19	Hbegf	2129	0.365	0.1981	Yes
20	Erbb3	2255	0.356	0.2020	Yes
21	Tsc2	2349	0.350	0.2074	Yes
22	Schip1	2379	0.348	0.2160	Yes
23	Vipr1	2389	0.347	0.2257	Yes
24	Ankrd2	2527	0.335	0.2284	Yes
25	Agl	2743	0.322	0.2266	Yes
26	Sspn	2915	0.307	0.2266	Yes
27	App	3023	0.302	0.2299	Yes
28	Sptan1	3359	0.278	0.2205	Yes
29	Foxo4	3569	0.266	0.2174	Yes
30	Cox7a1	3991	0.240	0.2024	Yes
31	Pde4dip	4110	0.233	0.2031	Yes
32	Gja5	4149	0.232	0.2079	Yes
33	Mapk12	4201	0.230	0.2120	Yes
34	Acsl1	4239	0.229	0.2167	Yes
35	Stc2	4354	0.224	0.2173	Yes
36	Camk2b	4355	0.224	0.2239	Yes
37	Nav2	4461	0.218	0.2248	Yes
38	Adcy9	4546	0.212	0.2266	Yes
39	Aebp1	4562	0.211	0.2320	Yes
40	Tnnt1	4755	0.202	0.2279	Yes
41	Cdh13	4774	0.201	0.2328	Yes
42	Ache	5045	0.188	0.2242	No
43	Sparc	5105	0.185	0.2265	No
44	Pfkm	5294	0.177	0.2219	No
45	Slc6a8	5612	0.160	0.2100	No
46	Mylpf	5696	0.155	0.2103	No
47	Rb1	6163	0.132	0.1898	No
48	Ckb	6778	0.111	0.1610	No
49	Crat	6781	0.111	0.1641	No
50	Myo1c	6977	0.101	0.1569	No
51	Ak1	6992	0.101	0.1591	No
52	Sh2b1	7015	0.099	0.1609	No
53	Myl6b	7088	0.096	0.1600	No
54	Bhlhe40	7094	0.096	0.1625	No
55	Notch1	7221	0.090	0.1586	No
56	Ctf1	7472	0.079	0.1478	No
57	Sirt2	7901	0.058	0.1272	No
58	Ablim1	7943	0.056	0.1267	No
59	Tpm3	8022	0.053	0.1242	No
60	Col1a1	8040	0.052	0.1248	No
61	Tagln	8245	0.042	0.1154	No
62	Itgb1	8292	0.041	0.1142	No
63	Myh11	8298	0.041	0.1151	No
64	Csrp3	8321	0.040	0.1151	No
65	Reep1	8421	0.037	0.1111	No
66	Sgcd	8510	0.033	0.1074	No
67	Mef2c	8531	0.032	0.1073	No
68	Rit1	8567	0.032	0.1064	No
69	Ocel1	8725	0.025	0.0990	No
70	Cdkn1a	8757	0.023	0.0980	No
71	Cd36	8771	0.023	0.0980	No
72	Eno3	8874	0.018	0.0932	No
73	Svil	8940	0.015	0.0903	No
74	Itgb4	8981	0.013	0.0886	No
75	Gsn	9010	0.013	0.0875	No
76	Ptp4a3	9147	0.006	0.0806	No
77	Myh9	9156	0.005	0.0803	No
78	Sh3bgr	9508	-0.004	0.0621	No
79	Tpm2	9951	-0.024	0.0397	No
80	Pick1	10206	-0.037	0.0276	No
81	Chrnb1	10360	-0.042	0.0208	No
82	Itgb5	10438	-0.046	0.0181	No
83	Kcnh2	10684	-0.056	0.0070	No
84	Mylk	10727	-0.059	0.0065	No
85	Agrn	11126	-0.076	-0.0120	No
86	Large1	11204	-0.080	-0.0137	No
87	Fhl1	11347	-0.087	-0.0185	No
88	Sphk1	11361	-0.087	-0.0167	No
89	Kifc3	11402	-0.089	-0.0161	No
90	Pygm	11473	-0.092	-0.0171	No
91	Mef2a	11751	-0.105	-0.0285	No
92	Klf5	11891	-0.112	-0.0324	No
93	Pcx	12213	-0.125	-0.0455	No
94	Fgf2	12342	-0.130	-0.0484	No
95	Cnn3	12453	-0.134	-0.0502	No
96	Ifrd1	12475	-0.135	-0.0474	No
97	Psen2	12558	-0.139	-0.0476	No
98	Nos1	12579	-0.140	-0.0446	No
99	Dapk2	12648	-0.143	-0.0439	No
100	Lpin1	12670	-0.144	-0.0408	No
101	Mef2d	12792	-0.149	-0.0428	No
102	Atp2a1	12798	-0.149	-0.0387	No
103	Tnnt3	12859	-0.152	-0.0374	No
104	Dmd	13119	-0.163	-0.0461	No
105	Plxnb2	13241	-0.169	-0.0475	No
106	Smtn	13268	-0.169	-0.0439	No
107	Clu	13421	-0.175	-0.0467	No
108	Akt2	13897	-0.197	-0.0658	No
109	Gnao1	14316	-0.215	-0.0813	No
110	Adam12	14533	-0.227	-0.0859	No
111	Tpd52l1	14682	-0.235	-0.0868	No
112	Prnp	14736	-0.238	-0.0826	No
113	Mybpc3	14816	-0.243	-0.0796	No
114	Gaa	14879	-0.246	-0.0756	No
115	Nqo1	14954	-0.248	-0.0722	No
116	Fkbp1b	15140	-0.259	-0.0743	No
117	Tnnc1	15389	-0.274	-0.0793	No
118	Myl4	15507	-0.279	-0.0772	No
119	Myom2	15518	-0.280	-0.0695	No
120	Bag1	15611	-0.286	-0.0660	No
121	Atp6ap1	16042	-0.313	-0.0793	No
122	Pdlim7	16045	-0.313	-0.0702	No
123	Ldb3	16100	-0.317	-0.0637	No
124	Tgfb1	16301	-0.329	-0.0646	No
125	Tead4	16394	-0.336	-0.0595	No
126	Igf1	16593	-0.350	-0.0596	No
127	Col4a2	16703	-0.358	-0.0548	No
128	Cryab	17187	-0.398	-0.0684	No
129	Sorbs3	17320	-0.411	-0.0633	No
130	Kcnh1	17524	-0.427	-0.0614	No
131	Hspb8	17585	-0.432	-0.0518	No
132	Lsp1	18207	-0.512	-0.0693	No
133	Pkia	18245	-0.521	-0.0560	No
134	Gadd45b	18400	-0.548	-0.0480	No
135	Lama2	18516	-0.570	-0.0373	No
136	Syngr2	18520	-0.572	-0.0208	No
137	Bin1	18707	-0.615	-0.0125	No
138	Ckmt2	18787	-0.640	0.0021	No
139	Actn2	19171	-0.854	0.0071	No