Details for gene set HALLMARK_APICAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MEP.MEP.mega_Pheno.cls #Group1_versus_Group3.MEP.mega_Pheno.cls #Group1_versus_Group3_repos
Phenotype	MEP.mega_Pheno.cls#Group1_versus_Group3_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_APICAL_JUNCTION
Enrichment Score (ES)	0.25418103
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0420908
Nominal p-value	0.39341086
FDR q-value	0.6834494
FWER p-Value	0.989

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Traf1	25	0.930	0.0212	Yes
2	Cd86	30	0.911	0.0430	Yes
3	Vcam1	148	0.705	0.0539	Yes
4	Col16a1	166	0.693	0.0697	Yes
5	Cdh1	268	0.624	0.0795	Yes
6	Vwf	310	0.600	0.0919	Yes
7	Vcl	392	0.572	0.1015	Yes
8	Itga2	467	0.551	0.1109	Yes
9	Cap1	477	0.549	0.1238	Yes
10	Nectin4	506	0.543	0.1354	Yes
11	Myh9	807	0.483	0.1314	Yes
12	Actn1	814	0.481	0.1427	Yes
13	Evl	871	0.473	0.1512	Yes
14	Wnk4	901	0.467	0.1610	Yes
15	Icam5	915	0.465	0.1715	Yes
16	Pik3cb	1088	0.437	0.1731	Yes
17	Myl9	1260	0.420	0.1743	Yes
18	Sdc3	1499	0.391	0.1714	Yes
19	Itgb1	1518	0.389	0.1798	Yes
20	Pals1	1535	0.387	0.1883	Yes
21	Nrxn2	1575	0.384	0.1956	Yes
22	Pkd1	1824	0.361	0.1913	Yes
23	Irs1	1995	0.345	0.1908	Yes
24	Cldn15	2103	0.334	0.1933	Yes
25	Itga10	2270	0.323	0.1924	Yes
26	Ctnna1	2294	0.321	0.1990	Yes
27	Ptk2	2332	0.318	0.2047	Yes
28	Layn	2423	0.312	0.2076	Yes
29	Arhgef6	2438	0.311	0.2144	Yes
30	Ikbkg	2708	0.294	0.2074	Yes
31	Shroom2	2771	0.289	0.2112	Yes
32	Src	2807	0.287	0.2163	Yes
33	Zyx	2896	0.281	0.2185	Yes
34	Lima1	2913	0.280	0.2244	Yes
35	Cnn2	3077	0.271	0.2224	Yes
36	Nectin1	3093	0.269	0.2281	Yes
37	Akt3	3246	0.259	0.2265	Yes
38	Gnai1	3398	0.249	0.2246	Yes
39	Mapk14	3405	0.249	0.2303	Yes
40	Nf2	3420	0.248	0.2356	Yes
41	Skap2	3427	0.248	0.2412	Yes
42	Vav2	3506	0.244	0.2431	Yes
43	Nectin3	3528	0.243	0.2478	Yes
44	Pard6g	3693	0.233	0.2449	Yes
45	Ywhah	3759	0.231	0.2471	Yes
46	Itga3	3879	0.224	0.2463	Yes
47	Rsu1	3898	0.223	0.2507	Yes
48	Rasa1	3935	0.221	0.2542	Yes
49	Adam15	4201	0.205	0.2453	No
50	Baiap2	4260	0.201	0.2471	No
51	Epb41l2	4374	0.196	0.2460	No
52	Pecam1	4440	0.193	0.2473	No
53	Ctnnd1	4660	0.183	0.2403	No
54	Dhx16	4709	0.181	0.2421	No
55	Cdh11	4860	0.174	0.2385	No
56	Tsc1	4878	0.173	0.2418	No
57	Amigo2	4915	0.172	0.2440	No
58	Dlg1	4976	0.169	0.2450	No
59	Tmem8b	5014	0.168	0.2471	No
60	Pten	5091	0.165	0.2471	No
61	Gamt	5197	0.160	0.2455	No
62	Actg1	5273	0.158	0.2454	No
63	Ldlrap1	5346	0.154	0.2454	No
64	Cd274	5405	0.152	0.2460	No
65	Tial1	5425	0.151	0.2487	No
66	Taok2	5661	0.141	0.2398	No
67	Cercam	5857	0.133	0.2329	No
68	Nlgn3	5928	0.130	0.2324	No
69	Cx3cl1	6017	0.127	0.2308	No
70	B4galt1	6190	0.120	0.2248	No
71	Vasp	6435	0.112	0.2147	No
72	Exoc4	6731	0.101	0.2018	No
73	Stx4a	6737	0.101	0.2040	No
74	Syk	6759	0.100	0.2053	No
75	Crat	6777	0.099	0.2068	No
76	Tspan4	6812	0.098	0.2074	No
77	Nfasc	7027	0.089	0.1983	No
78	Bmp1	7226	0.082	0.1900	No
79	Map3k20	7396	0.075	0.1830	No
80	Actn4	7868	0.057	0.1598	No
81	Sympk	8055	0.050	0.1513	No
82	Sirpa	8073	0.050	0.1516	No
83	Gtf2f1	8123	0.048	0.1502	No
84	Kcnh2	8300	0.041	0.1419	No
85	Nlgn2	8506	0.033	0.1320	No
86	Mvd	8684	0.025	0.1234	No
87	Plcg1	8747	0.023	0.1207	No
88	Mapk11	8861	0.019	0.1153	No
89	Mmp2	8955	0.016	0.1108	No
90	Sgce	9218	0.007	0.0973	No
91	Wasl	9236	0.006	0.0965	No
92	Atp1a3	9558	-0.003	0.0799	No
93	Negr1	9609	-0.005	0.0774	No
94	Arpc2	9934	-0.019	0.0609	No
95	Myh10	10145	-0.027	0.0506	No
96	Sorbs3	10147	-0.027	0.0512	No
97	Pik3r3	10233	-0.029	0.0474	No
98	Adam9	10595	-0.042	0.0296	No
99	Map4k2	10613	-0.043	0.0298	No
100	Jam3	10978	-0.057	0.0122	No
101	Inppl1	11047	-0.060	0.0100	No
102	Akt2	11088	-0.061	0.0094	No
103	Gnai2	11145	-0.063	0.0080	No
104	Cadm3	11165	-0.064	0.0086	No
105	Cadm2	11232	-0.067	0.0068	No
106	Mpzl1	11478	-0.078	-0.0042	No
107	Lamb3	11515	-0.079	-0.0041	No
108	Tro	11573	-0.081	-0.0051	No
109	Cdk8	11706	-0.086	-0.0099	No
110	Itgb4	11749	-0.088	-0.0100	No
111	Tgfbi	11940	-0.096	-0.0176	No
112	Nrap	12311	-0.111	-0.0343	No
113	Rac2	12392	-0.115	-0.0357	No
114	Icam4	12718	-0.129	-0.0495	No
115	Ptprc	13366	-0.160	-0.0794	No
116	Shc1	13452	-0.165	-0.0799	No
117	Cdh8	13494	-0.166	-0.0780	No
118	Crb3	13843	-0.184	-0.0917	No
119	Actb	14071	-0.195	-0.0989	No
120	Nf1	14195	-0.200	-0.1005	No
121	Itga9	14393	-0.210	-0.1057	No
122	Nexn	14405	-0.211	-0.1012	No
123	Amigo1	14703	-0.227	-0.1112	No
124	Icam2	14772	-0.230	-0.1092	No
125	Jup	14821	-0.234	-0.1060	No
126	Rhof	15348	-0.259	-0.1272	No
127	Amh	15398	-0.262	-0.1235	No
128	Adamts5	15440	-0.265	-0.1192	No
129	Actn2	15479	-0.266	-0.1147	No
130	Cldn14	15563	-0.270	-0.1125	No
131	Pfn1	15723	-0.279	-0.1141	No
132	Fbn1	15767	-0.282	-0.1095	No
133	Icam1	15826	-0.286	-0.1057	No
134	Rras	15971	-0.296	-0.1060	No
135	Slit2	16053	-0.304	-0.1029	No
136	Pbx2	16140	-0.309	-0.0999	No
137	Hadh	16247	-0.316	-0.0978	No
138	Msn	16461	-0.331	-0.1010	No
139	Cdh4	16778	-0.359	-0.1088	No
140	Vcan	16857	-0.366	-0.1040	No
141	Adra1b	17041	-0.383	-0.1043	No
142	Insig1	17405	-0.417	-0.1132	No
143	Myl12b	17576	-0.432	-0.1116	No
144	Col17a1	17976	-0.475	-0.1210	No
145	Tubg1	18339	-0.527	-0.1271	No
146	Mdk	18576	-0.581	-0.1254	No
147	Lama3	18581	-0.583	-0.1115	No
148	Hras	18832	-0.646	-0.1090	No
149	Tjp1	18870	-0.660	-0.0950	No
150	Cd276	18914	-0.674	-0.0809	No
151	Thy1	18993	-0.710	-0.0678	No
152	Cd34	19086	-0.765	-0.0542	No
153	Nrtn	19158	-0.827	-0.0379	No
154	Thbs3	19164	-0.836	-0.0180	No
155	Nectin2	19269	-1.050	0.0020	No