Details for gene set HALLMARK_APICAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MEP.MEP.mega_Pheno.cls #Group1_versus_Group2.MEP.mega_Pheno.cls #Group1_versus_Group2_repos
Phenotype	MEP.mega_Pheno.cls#Group1_versus_Group2_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_APICAL_JUNCTION
Enrichment Score (ES)	0.16057646
Normalized Enrichment Score (NES)	0.6731762
Nominal p-value	0.94386697
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Cd86	9	1.076	0.0325	Yes
2	Cdh1	250	0.661	0.0401	Yes
3	Gamt	320	0.628	0.0558	Yes
4	Nectin4	349	0.620	0.0733	Yes
5	Mvd	513	0.562	0.0819	Yes
6	Bmp1	667	0.524	0.0900	Yes
7	Cx3cl1	958	0.470	0.0892	Yes
8	Crat	1134	0.443	0.0936	Yes
9	Pkd1	1257	0.425	0.1003	Yes
10	Icam2	1340	0.416	0.1087	Yes
11	Tmem8b	1433	0.404	0.1163	Yes
12	Cldn15	1459	0.402	0.1273	Yes
13	Baiap2	1461	0.401	0.1395	Yes
14	Evl	1518	0.396	0.1487	Yes
15	Actn1	1767	0.372	0.1471	Yes
16	Sorbs3	2286	0.328	0.1301	Yes
17	Arhgef6	2374	0.320	0.1353	Yes
18	Rac2	2487	0.310	0.1390	Yes
19	Wnk4	2506	0.309	0.1475	Yes
20	Tspan4	2805	0.291	0.1408	Yes
21	Nlgn2	2880	0.285	0.1457	Yes
22	Gnai1	3087	0.273	0.1433	Yes
23	Vcam1	3201	0.266	0.1455	Yes
24	Mapk14	3389	0.254	0.1435	Yes
25	Sympk	3449	0.250	0.1481	Yes
26	Pals1	3580	0.242	0.1487	Yes
27	Mapk11	3613	0.240	0.1544	Yes
28	Icam5	3856	0.227	0.1487	Yes
29	Layn	4010	0.220	0.1475	Yes
30	Icam4	4286	0.205	0.1394	Yes
31	Myl9	4432	0.198	0.1378	Yes
32	Vcl	4501	0.194	0.1402	Yes
33	Cdh8	4688	0.185	0.1362	Yes
34	Nrtn	4689	0.185	0.1418	Yes
35	Pfn1	4801	0.179	0.1415	Yes
36	Itga10	4868	0.177	0.1435	Yes
37	Insig1	4902	0.175	0.1471	Yes
38	Amigo2	4960	0.173	0.1494	Yes
39	Cap1	5243	0.159	0.1396	Yes
40	Arpc2	5277	0.158	0.1427	Yes
41	Lima1	5283	0.157	0.1472	Yes
42	Actn2	5291	0.157	0.1516	Yes
43	Vasp	5301	0.156	0.1559	Yes
44	Src	5367	0.153	0.1572	Yes
45	Amigo1	5403	0.152	0.1600	Yes
46	Ptk2	5481	0.149	0.1606	Yes
47	Crb3	5634	0.142	0.1570	No
48	Lamb3	5712	0.139	0.1572	No
49	Pard6g	5797	0.136	0.1570	No
50	Irs1	5845	0.134	0.1586	No
51	Gtf2f1	5896	0.132	0.1600	No
52	Itgb1	5989	0.128	0.1591	No
53	Actn4	6120	0.123	0.1561	No
54	Cercam	6346	0.115	0.1479	No
55	Vwf	6347	0.115	0.1514	No
56	Jup	6402	0.112	0.1520	No
57	Nf2	6617	0.104	0.1440	No
58	Tial1	6693	0.101	0.1432	No
59	Syk	6893	0.094	0.1357	No
60	Zyx	6995	0.090	0.1331	No
61	Ctnna1	7156	0.084	0.1274	No
62	Vav2	7303	0.079	0.1222	No
63	Dhx16	7309	0.078	0.1243	No
64	Shc1	7328	0.078	0.1257	No
65	Tsc1	7383	0.075	0.1252	No
66	Inppl1	7389	0.075	0.1272	No
67	Tro	7399	0.075	0.1291	No
68	Mpzl1	7511	0.071	0.1254	No
69	Itgb4	7617	0.068	0.1220	No
70	Exoc4	7641	0.067	0.1229	No
71	Adam15	8144	0.049	0.0982	No
72	Map3k20	8365	0.042	0.0880	No
73	Sdc3	8472	0.039	0.0836	No
74	Adra1b	8530	0.037	0.0818	No
75	Cadm3	9158	0.015	0.0495	No
76	Nectin1	9255	0.012	0.0449	No
77	Cnn2	9410	0.007	0.0371	No
78	Itga2	9819	-0.005	0.0159	No
79	Pik3r3	9858	-0.007	0.0141	No
80	Dlg1	10163	-0.017	-0.0012	No
81	Myh9	10197	-0.019	-0.0024	No
82	Nectin3	10227	-0.020	-0.0033	No
83	Sgce	10337	-0.023	-0.0083	No
84	Ctnnd1	10374	-0.024	-0.0094	No
85	B4galt1	10613	-0.032	-0.0208	No
86	Jam3	10981	-0.044	-0.0387	No
87	Col16a1	10983	-0.044	-0.0374	No
88	Pten	11043	-0.046	-0.0390	No
89	Taok2	11059	-0.047	-0.0384	No
90	Cd274	11095	-0.048	-0.0387	No
91	Tubg1	11123	-0.050	-0.0386	No
92	Wasl	11176	-0.051	-0.0398	No
93	Ldlrap1	11226	-0.053	-0.0407	No
94	Skap2	11392	-0.059	-0.0475	No
95	Gnai2	11421	-0.060	-0.0471	No
96	Cadm2	11728	-0.070	-0.0610	No
97	Myh10	11740	-0.071	-0.0594	No
98	Nfasc	12038	-0.084	-0.0723	No
99	Myl12b	12059	-0.085	-0.0708	No
100	Rasa1	12414	-0.096	-0.0863	No
101	Kcnh2	12452	-0.098	-0.0853	No
102	Nrap	12534	-0.101	-0.0864	No
103	Stx4a	12826	-0.112	-0.0981	No
104	Pik3cb	12880	-0.114	-0.0974	No
105	Rhof	12899	-0.115	-0.0948	No
106	Adamts5	13011	-0.119	-0.0970	No
107	Col17a1	13012	-0.119	-0.0933	No
108	Shroom2	13089	-0.121	-0.0936	No
109	Pecam1	13312	-0.130	-0.1012	No
110	Map4k2	13324	-0.131	-0.0978	No
111	Nrxn2	13348	-0.132	-0.0950	No
112	Sirpa	13451	-0.136	-0.0961	No
113	Msn	13576	-0.140	-0.0983	No
114	Actb	13587	-0.140	-0.0945	No
115	Slit2	13616	-0.142	-0.0917	No
116	Ikbkg	13670	-0.144	-0.0900	No
117	Hadh	13745	-0.147	-0.0894	No
118	Ywhah	13906	-0.155	-0.0930	No
119	Amh	13981	-0.158	-0.0920	No
120	Epb41l2	14180	-0.166	-0.0973	No
121	Ptprc	14216	-0.168	-0.0940	No
122	Lama3	14279	-0.170	-0.0920	No
123	Plcg1	14377	-0.176	-0.0917	No
124	Cd276	14517	-0.182	-0.0934	No
125	Cd34	14553	-0.183	-0.0896	No
126	Nf1	14673	-0.188	-0.0901	No
127	Akt3	14790	-0.193	-0.0902	No
128	Rsu1	15052	-0.207	-0.0975	No
129	Itga9	15057	-0.207	-0.0914	No
130	Akt2	15063	-0.208	-0.0853	No
131	Atp1a3	15114	-0.210	-0.0815	No
132	Actg1	15469	-0.228	-0.0930	No
133	Fbn1	15540	-0.231	-0.0895	No
134	Hras	16167	-0.269	-0.1140	No
135	Rras	16378	-0.281	-0.1164	No
136	Nexn	16512	-0.290	-0.1144	No
137	Thy1	16577	-0.295	-0.1087	No
138	Thbs3	16584	-0.296	-0.1000	No
139	Negr1	16676	-0.302	-0.0955	No
140	Cldn14	16828	-0.311	-0.0939	No
141	Vcan	16993	-0.325	-0.0925	No
142	Nlgn3	16996	-0.325	-0.0826	No
143	Itga3	17010	-0.327	-0.0733	No
144	Cdh11	17145	-0.338	-0.0700	No
145	Adam9	17515	-0.368	-0.0780	No
146	Pbx2	17608	-0.377	-0.0713	No
147	Mmp2	17651	-0.381	-0.0618	No
148	Nectin2	18271	-0.448	-0.0804	No
149	Tgfbi	18597	-0.505	-0.0819	No
150	Icam1	18721	-0.534	-0.0720	No
151	Cdk8	18794	-0.552	-0.0588	No
152	Mdk	18867	-0.574	-0.0450	No
153	Cdh4	19145	-0.704	-0.0380	No
154	Tjp1	19153	-0.708	-0.0167	No
155	Traf1	19235	-0.805	0.0038	No