Details for gene set HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MEP.MEP.ery_Pheno.cls #Group6_versus_Group8.MEP.ery_Pheno.cls #Group6_versus_Group8_repos
Phenotype	MEP.ery_Pheno.cls#Group6_versus_Group8_repos
Upregulated in class	4
GeneSet	HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA_NFKB
Enrichment Score (ES)	0.278242
Normalized Enrichment Score (NES)	0.90000767
Nominal p-value	0.58264464
FDR q-value	0.669002
FWER p-Value	0.99

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Fosl1	97	0.919	0.0239	Yes
2	Sdc4	352	0.703	0.0357	Yes
3	Egr2	433	0.677	0.0531	Yes
4	Plaur	573	0.633	0.0669	Yes
5	Trib1	603	0.626	0.0846	Yes
6	Fosl2	790	0.578	0.0951	Yes
7	Il18	1031	0.534	0.1024	Yes
8	Fut4	1411	0.486	0.1031	Yes
9	Egr3	1418	0.485	0.1174	Yes
10	Jag1	1544	0.469	0.1268	Yes
11	Klf4	1808	0.440	0.1304	Yes
12	Gem	1854	0.436	0.1418	Yes
13	Tnfaip6	2144	0.409	0.1435	Yes
14	Snn	2180	0.406	0.1544	Yes
15	Tnfsf9	2262	0.399	0.1634	Yes
16	Il6st	2581	0.375	0.1630	Yes
17	Maff	2693	0.366	0.1699	Yes
18	Trip10	2791	0.359	0.1771	Yes
19	Inhba	2830	0.356	0.1864	Yes
20	B4galt5	2914	0.349	0.1938	Yes
21	Tnc	2935	0.348	0.2035	Yes
22	Il1b	3214	0.328	0.2031	Yes
23	Fosb	3261	0.325	0.2112	Yes
24	Vegfa	3278	0.323	0.2203	Yes
25	Serpinb2	3484	0.309	0.2220	Yes
26	Cebpb	3582	0.303	0.2276	Yes
27	Dusp2	3652	0.299	0.2340	Yes
28	Pfkfb3	3823	0.289	0.2365	Yes
29	Atf3	4139	0.272	0.2331	Yes
30	Ppp1r15a	4167	0.270	0.2402	Yes
31	Btg2	4231	0.267	0.2459	Yes
32	F2rl1	4405	0.257	0.2473	Yes
33	Per1	4531	0.251	0.2502	Yes
34	Relb	4889	0.236	0.2443	Yes
35	Ptger4	5043	0.230	0.2455	Yes
36	Cebpd	5083	0.228	0.2509	Yes
37	Fos	5084	0.228	0.2577	Yes
38	Dusp1	5208	0.221	0.2599	Yes
39	Gadd45b	5276	0.218	0.2639	Yes
40	Rnf19b	5323	0.215	0.2687	Yes
41	Panx1	5526	0.208	0.2676	Yes
42	Tnfrsf9	5634	0.204	0.2698	Yes
43	Egr1	5680	0.202	0.2742	Yes
44	Jun	6000	0.191	0.2683	Yes
45	Dnajb4	6006	0.191	0.2738	Yes
46	Bhlhe40	6186	0.184	0.2728	Yes
47	Mcl1	6391	0.176	0.2706	Yes
48	Rela	6418	0.176	0.2749	Yes
49	Plk2	6471	0.174	0.2782	Yes
50	Tiparp	6822	0.162	0.2703	No
51	Sgk1	6896	0.160	0.2724	No
52	Bcl6	6964	0.158	0.2747	No
53	Irs2	7045	0.155	0.2765	No
54	Tnf	7491	0.141	0.2645	No
55	Plpp3	7664	0.136	0.2622	No
56	Nfat5	8038	0.126	0.2524	No
57	Map3k8	8073	0.125	0.2549	No
58	Cd44	8081	0.125	0.2584	No
59	Icosl	8162	0.123	0.2591	No
60	Tnfaip8	8193	0.122	0.2617	No
61	Nr4a3	8424	0.116	0.2568	No
62	Zbtb10	8514	0.113	0.2569	No
63	Csf1	8597	0.111	0.2573	No
64	Phlda1	8623	0.111	0.2597	No
65	Pdlim5	8668	0.110	0.2614	No
66	Plau	9196	0.097	0.2450	No
67	Rcan1	9693	0.086	0.2295	No
68	B4galt1	9854	0.082	0.2261	No
69	Tank	10028	0.078	0.2222	No
70	Kynu	10115	0.076	0.2213	No
71	Pde4b	10179	0.075	0.2213	No
72	Sat1	10259	0.074	0.2206	No
73	Slc2a3	10472	0.069	0.2149	No
74	Smad3	10616	0.066	0.2117	No
75	Kdm6b	10764	0.064	0.2082	No
76	Cd69	10795	0.063	0.2090	No
77	Ptpre	10833	0.062	0.2095	No
78	Traf1	10916	0.061	0.2084	No
79	Plek	11005	0.059	0.2069	No
80	Olr1	11014	0.059	0.2084	No
81	Il1a	11174	0.056	0.2042	No
82	Areg	11363	0.052	0.1989	No
83	Icam1	11763	0.044	0.1857	No
84	Nampt	11832	0.043	0.1845	No
85	Dusp4	12036	0.039	0.1783	No
86	Stat5a	12044	0.039	0.1792	No
87	Tgif1	12063	0.039	0.1797	No
88	Slc2a6	12109	0.038	0.1792	No
89	Clcf1	12177	0.036	0.1778	No
90	Nr4a2	12194	0.036	0.1783	No
91	Ripk2	12438	0.031	0.1704	No
92	Il7r	12672	0.027	0.1627	No
93	Spsb1	12769	0.025	0.1599	No
94	Cflar	12911	0.023	0.1555	No
95	Atp2b1	13209	0.018	0.1452	No
96	Pmepa1	13434	0.013	0.1374	No
97	Sqstm1	13487	0.013	0.1359	No
98	Ifit2	13541	0.012	0.1343	No
99	Ccrl2	13542	0.012	0.1347	No
100	Lif	13702	0.008	0.1291	No
101	Slc16a6	13725	0.008	0.1285	No
102	Ets2	13933	0.004	0.1211	No
103	Tlr2	14117	0.001	0.1145	No
104	Tnfaip3	14306	-0.000	0.1076	No
105	Litaf	14655	-0.006	0.0951	No
106	Birc2	14666	-0.007	0.0950	No
107	Dusp5	14744	-0.008	0.0924	No
108	Btg3	15047	-0.013	0.0818	No
109	Cdkn1a	15145	-0.015	0.0787	No
110	Map2k3	15190	-0.016	0.0776	No
111	Ccnl1	15671	-0.025	0.0608	No
112	Eif1	15697	-0.025	0.0607	No
113	F3	15702	-0.026	0.0613	No
114	Klf2	15868	-0.028	0.0561	No
115	Ldlr	15892	-0.029	0.0562	No
116	Klf6	16035	-0.032	0.0519	No
117	Tnip2	16040	-0.032	0.0527	No
118	Abca1	16498	-0.041	0.0373	No
119	Mxd1	16508	-0.041	0.0382	No
120	Nr4a1	16578	-0.042	0.0369	No
121	Serpine1	16731	-0.045	0.0328	No
122	Ier2	16805	-0.047	0.0315	No
123	Yrdc	16898	-0.048	0.0296	No
124	Nfil3	16951	-0.050	0.0292	No
125	Sod2	17007	-0.051	0.0287	No
126	Bmp2	17496	-0.061	0.0127	No
127	Socs3	17722	-0.065	0.0065	No
128	Dennd5a	17843	-0.068	0.0041	No
129	Rhob	17997	-0.071	0.0007	No
130	Klf9	18071	-0.073	0.0002	No
131	Il6	18091	-0.074	0.0017	No
132	Nfkbie	18241	-0.077	-0.0014	No
133	Gch1	18260	-0.077	0.0002	No
134	Nfe2l2	18274	-0.077	0.0021	No
135	Fjx1	18415	-0.081	-0.0006	No
136	Il23a	18667	-0.087	-0.0072	No
137	Ifngr2	18749	-0.088	-0.0075	No
138	Lamb3	19385	-0.104	-0.0275	No
139	Cxcl5	19689	-0.111	-0.0352	No
140	Birc3	19759	-0.113	-0.0343	No
141	Ccnd1	19823	-0.115	-0.0332	No
142	Tsc22d1	20038	-0.119	-0.0375	No
143	Ifih1	20142	-0.121	-0.0376	No
144	Dram1	20372	-0.127	-0.0422	No
145	Bcl3	20649	-0.135	-0.0482	No
146	Zc3h12a	20760	-0.138	-0.0481	No
147	Marcks	20863	-0.141	-0.0476	No
148	Il15ra	21223	-0.152	-0.0561	No
149	Tnip1	21510	-0.160	-0.0618	No
150	Ninj1	21527	-0.161	-0.0576	No
151	Nfkbia	21570	-0.162	-0.0542	No
152	Serpinb8	21599	-0.163	-0.0504	No
153	Junb	21827	-0.171	-0.0535	No
154	Nfkb1	21874	-0.173	-0.0501	No
155	Pnrc1	21900	-0.174	-0.0458	No
156	Btg1	22256	-0.184	-0.0532	No
157	Gadd45a	22474	-0.193	-0.0553	No
158	Id2	22668	-0.200	-0.0564	No
159	Ehd1	23095	-0.216	-0.0655	No
160	Ccl5	23346	-0.226	-0.0678	No
161	Cd83	23434	-0.230	-0.0641	No
162	Tnfaip2	23477	-0.233	-0.0587	No
163	Myc	23524	-0.235	-0.0533	No
164	Hbegf	24002	-0.256	-0.0631	No
165	Klf10	24165	-0.263	-0.0611	No
166	Nfkb2	24383	-0.274	-0.0608	No
167	Gfpt2	24446	-0.277	-0.0548	No
168	Sphk1	24976	-0.304	-0.0649	No
169	Rigi	25071	-0.310	-0.0591	No
170	Zfp36	25082	-0.311	-0.0502	No
171	Gpr183	25397	-0.332	-0.0517	No
172	Rel	25502	-0.340	-0.0453	No
173	Cxcl10	25631	-0.349	-0.0395	No
174	Phlda2	25706	-0.355	-0.0316	No
175	Tap1	25947	-0.376	-0.0291	No
176	Ier5	26021	-0.381	-0.0204	No
177	Tubb2a	26272	-0.408	-0.0173	No
178	Ier3	26465	-0.431	-0.0114	No
179	Cd80	26643	-0.455	-0.0042	No
180	Irf1	27131	-0.551	-0.0055	No
181	Hes1	27515	-0.756	0.0032	No