Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MEP.MEP.ery_Pheno.cls #Group6_versus_Group8.MEP.ery_Pheno.cls #Group6_versus_Group8_repos
Phenotype	MEP.ery_Pheno.cls#Group6_versus_Group8_repos
Upregulated in class	4
GeneSet	HALLMARK_MYOGENESIS
Enrichment Score (ES)	0.2637446
Normalized Enrichment Score (NES)	1.153851
Nominal p-value	0.112840466
FDR q-value	0.8096609
FWER p-Value	0.89

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Kcnh1	39	1.029	0.0261	Yes
2	Col4a2	115	0.887	0.0471	Yes
3	Apod	145	0.862	0.0692	Yes
4	Speg	294	0.736	0.0835	Yes
5	Slc6a8	565	0.637	0.0907	Yes
6	Ephb3	681	0.606	0.1028	Yes
7	Ptgis	755	0.586	0.1158	Yes
8	Lama2	798	0.578	0.1297	Yes
9	Plxnb2	1070	0.527	0.1340	Yes
10	Casq1	1216	0.508	0.1423	Yes
11	Vipr1	1289	0.500	0.1531	Yes
12	Myom2	1690	0.453	0.1506	Yes
13	Tagln	1745	0.447	0.1606	Yes
14	Stc2	1763	0.445	0.1719	Yes
15	Pygm	2012	0.420	0.1741	Yes
16	Tead4	2066	0.415	0.1833	Yes
17	Ncam1	2169	0.407	0.1905	Yes
18	Ldb3	2460	0.384	0.1902	Yes
19	Ckm	2744	0.362	0.1896	Yes
20	Tpm2	3010	0.343	0.1891	Yes
21	Ckmt2	3169	0.331	0.1922	Yes
22	Cdh13	3210	0.328	0.1995	Yes
23	Tsc2	3306	0.321	0.2047	Yes
24	Rit1	3309	0.321	0.2132	Yes
25	Igf1	3342	0.318	0.2206	Yes
26	Gja5	3579	0.304	0.2201	Yes
27	Actn3	3595	0.302	0.2277	Yes
28	Myl4	3828	0.289	0.2270	Yes
29	Myh3	4030	0.278	0.2271	Yes
30	Notch1	4034	0.277	0.2344	Yes
31	Fkbp1b	4091	0.274	0.2397	Yes
32	Tnni1	4148	0.271	0.2449	Yes
33	Col3a1	4218	0.268	0.2496	Yes
34	Schip1	4247	0.266	0.2557	Yes
35	Crat	4383	0.258	0.2577	Yes
36	Sptan1	4552	0.250	0.2582	Yes
37	Ckb	4928	0.234	0.2508	Yes
38	Spdef	4983	0.232	0.2551	Yes
39	Smtn	5138	0.225	0.2555	Yes
40	Col6a2	5254	0.219	0.2571	Yes
41	Gadd45b	5276	0.218	0.2622	Yes
42	Des	5454	0.211	0.2614	Yes
43	Col6a3	5660	0.203	0.2594	Yes
44	Pdlim7	5777	0.199	0.2605	Yes
45	Gnao1	5900	0.194	0.2612	Yes
46	Bhlhe40	6186	0.184	0.2558	Yes
47	Ablim1	6220	0.183	0.2595	Yes
48	Dmpk	6424	0.175	0.2568	Yes
49	Col15a1	6441	0.175	0.2609	Yes
50	Myh9	6490	0.173	0.2637	Yes
51	Clu	6777	0.164	0.2577	No
52	Myl1	7039	0.156	0.2524	No
53	Agrn	7141	0.152	0.2528	No
54	Large1	7221	0.149	0.2539	No
55	Gabarapl2	7363	0.145	0.2526	No
56	Itga7	7629	0.137	0.2466	No
57	Ryr1	7864	0.130	0.2416	No
58	Pcx	7919	0.129	0.2430	No
59	Csrp3	8226	0.121	0.2351	No
60	Tpm3	8554	0.113	0.2262	No
61	Mras	8664	0.110	0.2252	No
62	Fxyd1	8764	0.107	0.2245	No
63	Tnnc2	8951	0.103	0.2204	No
64	Pgam2	9012	0.101	0.2209	No
65	Lpin1	9363	0.093	0.2107	No
66	Sorbs3	9477	0.090	0.2090	No
67	Ppfia4	9643	0.087	0.2053	No
68	Ache	9690	0.086	0.2059	No
69	Fgf2	9780	0.084	0.2049	No
70	Kcnh2	9891	0.081	0.2031	No
71	Myl6b	10072	0.077	0.1986	No
72	Mef2d	10287	0.073	0.1927	No
73	Tgfb1	10638	0.066	0.1817	No
74	Myl2	10805	0.063	0.1773	No
75	Casq2	10904	0.061	0.1754	No
76	Svil	10973	0.060	0.1745	No
77	Atp2a1	11173	0.056	0.1687	No
78	Sspn	11271	0.054	0.1667	No
79	Gsn	11442	0.050	0.1618	No
80	Sirt2	11630	0.047	0.1562	No
81	Sh2b1	11710	0.045	0.1546	No
82	Adcy9	11946	0.041	0.1471	No
83	Kifc3	11965	0.040	0.1475	No
84	Rb1	12022	0.039	0.1465	No
85	Myo1c	12031	0.039	0.1473	No
86	Dmd	12078	0.038	0.1466	No
87	Hspb8	12362	0.033	0.1372	No
88	Sgca	12528	0.029	0.1320	No
89	Cox7a1	12582	0.028	0.1308	No
90	Nav2	12833	0.024	0.1223	No
91	Sorbs1	13064	0.020	0.1145	No
92	Agl	13160	0.018	0.1115	No
93	Mef2c	13264	0.017	0.1082	No
94	Ifrd1	13469	0.013	0.1011	No
95	Hdac5	13640	0.010	0.0952	No
96	Dapk2	13920	0.005	0.0851	No
97	Cfd	14609	-0.006	0.0602	No
98	Nos1	14750	-0.008	0.0553	No
99	Itgb4	14773	-0.008	0.0547	No
100	Myl3	14857	-0.010	0.0519	No
101	Eif4a2	14927	-0.011	0.0497	No
102	Igfbp7	15062	-0.013	0.0452	No
103	Pde4dip	15072	-0.014	0.0452	No
104	Cdkn1a	15145	-0.015	0.0430	No
105	Sgcg	15252	-0.017	0.0396	No
106	Mef2a	15361	-0.019	0.0362	No
107	Akt2	15428	-0.020	0.0343	No
108	Bdkrb2	15528	-0.022	0.0313	No
109	Actn2	15589	-0.023	0.0298	No
110	Chrnb1	16148	-0.034	0.0103	No
111	Klf5	16207	-0.035	0.0091	No
112	Camk2b	16414	-0.039	0.0027	No
113	Myoz1	16809	-0.047	-0.0104	No
114	Acsl1	16960	-0.050	-0.0146	No
115	Fabp3	17004	-0.051	-0.0148	No
116	Fdps	17045	-0.052	-0.0149	No
117	Cnn3	17059	-0.052	-0.0139	No
118	Itgb1	17082	-0.052	-0.0133	No
119	Tcap	17300	-0.057	-0.0197	No
120	Mybpc3	17345	-0.058	-0.0198	No
121	Sparc	17795	-0.067	-0.0344	No
122	Adam12	18005	-0.072	-0.0401	No
123	Pfkm	18212	-0.076	-0.0456	No
124	Ptp4a3	18472	-0.083	-0.0528	No
125	Myh8	18489	-0.083	-0.0511	No
126	Mylpf	18511	-0.084	-0.0497	No
127	Sgcd	18805	-0.089	-0.0580	No
128	Foxo4	18910	-0.092	-0.0593	No
129	Tnnt3	19267	-0.101	-0.0696	No
130	Dtna	19907	-0.116	-0.0898	No
131	Eno3	19918	-0.116	-0.0870	No
132	Gaa	19962	-0.117	-0.0854	No
133	Cryab	20056	-0.119	-0.0856	No
134	Erbb3	20125	-0.121	-0.0849	No
135	Pkia	20360	-0.126	-0.0900	No
136	Flii	20411	-0.128	-0.0884	No
137	Myom1	21010	-0.145	-0.1064	No
138	Bag1	21122	-0.148	-0.1064	No
139	Gpx3	21243	-0.152	-0.1067	No
140	Cox6a2	21282	-0.153	-0.1040	No
141	Efs	21302	-0.154	-0.1006	No
142	Myh11	21507	-0.160	-0.1037	No
143	Psen2	21765	-0.169	-0.1086	No
144	Prnp	21841	-0.171	-0.1067	No
145	Ocel1	22172	-0.181	-0.1139	No
146	Ankrd2	22890	-0.208	-0.1345	No
147	Pick1	23236	-0.222	-0.1411	No
148	Atp6ap1	23362	-0.227	-0.1396	No
149	App	23553	-0.236	-0.1402	No
150	Acta1	23804	-0.247	-0.1427	No
151	Bin1	23956	-0.254	-0.1414	No
152	Hbegf	24002	-0.256	-0.1362	No
153	Mapk12	24079	-0.260	-0.1320	No
154	Nqo1	24255	-0.267	-0.1312	No
155	Cacna1h	24319	-0.271	-0.1263	No
156	Myh2	24379	-0.274	-0.1211	No
157	Syngr2	24637	-0.286	-0.1228	No
158	Fhl1	24639	-0.286	-0.1152	No
159	Sh3bgr	24797	-0.294	-0.1130	No
160	Cd36	24959	-0.304	-0.1107	No
161	Sphk1	24976	-0.304	-0.1032	No
162	Cacng1	25186	-0.317	-0.1023	No
163	Aebp1	25359	-0.329	-0.0998	No
164	Col1a1	25385	-0.331	-0.0918	No
165	Tpd52l1	25492	-0.339	-0.0866	No
166	Myh4	25548	-0.342	-0.0794	No
167	Mylk	25600	-0.346	-0.0720	No
168	Reep1	25750	-0.358	-0.0679	No
169	Tnnc1	25765	-0.359	-0.0588	No
170	Ctf1	25858	-0.368	-0.0522	No
171	Ak1	25860	-0.369	-0.0424	No
172	Wwtr1	25953	-0.377	-0.0357	No
173	Tnnt2	26408	-0.423	-0.0409	No
174	Mb	26441	-0.427	-0.0306	No
175	Lsp1	27028	-0.524	-0.0380	No
176	Itgb5	27322	-0.621	-0.0320	No
177	Tnnt1	27443	-0.690	-0.0179	No
178	Mapre3	27570	-0.883	0.0012	No