Details for gene set HALLMARK_APICAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MEP.MEP.ery_Pheno.cls #Group6_versus_Group8.MEP.ery_Pheno.cls #Group6_versus_Group8_repos
Phenotype	MEP.ery_Pheno.cls#Group6_versus_Group8_repos
Upregulated in class	4
GeneSet	HALLMARK_APICAL_JUNCTION
Enrichment Score (ES)	0.24654435
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0222427
Nominal p-value	0.42052314
FDR q-value	0.834104
FWER p-Value	0.972

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Thy1	13	1.189	0.0326	Yes
2	Adra1b	207	0.793	0.0477	Yes
3	Atp1a3	262	0.756	0.0668	Yes
4	Speg	294	0.736	0.0862	Yes
5	Vcam1	338	0.712	0.1044	Yes
6	Nrxn2	777	0.582	0.1046	Yes
7	Cdk8	918	0.550	0.1149	Yes
8	Actg2	971	0.542	0.1281	Yes
9	Cldn11	1103	0.522	0.1378	Yes
10	Nectin2	1231	0.506	0.1473	Yes
11	Nexn	1388	0.488	0.1552	Yes
12	Amh	1464	0.479	0.1658	Yes
13	Nlgn3	1468	0.478	0.1790	Yes
14	Layn	1738	0.448	0.1817	Yes
15	Lima1	1958	0.425	0.1855	Yes
16	Cadm3	2179	0.406	0.1888	Yes
17	Adamts5	2284	0.397	0.1961	Yes
18	Cd86	2373	0.390	0.2037	Yes
19	Actg1	2590	0.375	0.2063	Yes
20	Cdh1	2825	0.356	0.2077	Yes
21	Actn1	2950	0.346	0.2128	Yes
22	Rhof	3014	0.342	0.2201	Yes
23	Actn3	3595	0.302	0.2073	Yes
24	Arhgef6	4031	0.278	0.1992	Yes
25	Itga10	4169	0.270	0.2017	Yes
26	Cd34	4206	0.268	0.2079	Yes
27	Itga3	4355	0.260	0.2097	Yes
28	Crat	4383	0.258	0.2159	Yes
29	Myh10	4629	0.247	0.2139	Yes
30	Cercam	4637	0.246	0.2205	Yes
31	Cnn2	4898	0.235	0.2175	Yes
32	Tgfbi	5089	0.227	0.2169	Yes
33	Lamc2	5166	0.223	0.2204	Yes
34	Ppp2r2c	5222	0.220	0.2245	Yes
35	Src	5250	0.219	0.2296	Yes
36	Vav2	5256	0.219	0.2355	Yes
37	Cx3cl1	5351	0.214	0.2381	Yes
38	Cldn15	5436	0.212	0.2409	Yes
39	Cdh3	5590	0.206	0.2411	Yes
40	Adam15	5598	0.206	0.2465	Yes
41	Flnc	6115	0.187	0.2329	No
42	Lama3	6342	0.178	0.2297	No
43	Wnk4	6361	0.178	0.2340	No
44	Cdh6	6458	0.174	0.2353	No
45	Myh9	6490	0.173	0.2390	No
46	Syk	6493	0.173	0.2437	No
47	Irs1	6756	0.164	0.2388	No
48	Nectin4	6811	0.162	0.2413	No
49	Taok2	7001	0.157	0.2388	No
50	Slc30a3	7420	0.143	0.2275	No
51	Msn	7498	0.141	0.2287	No
52	Pik3r3	7539	0.140	0.2311	No
53	Mpzl1	7560	0.139	0.2342	No
54	Sirpa	7562	0.139	0.2381	No
55	Rac2	7662	0.136	0.2382	No
56	Ywhah	7715	0.135	0.2401	No
57	Mpzl2	7771	0.133	0.2418	No
58	Mapk14	8298	0.120	0.2259	No
59	Cap1	8432	0.115	0.2243	No
60	Dsc3	8553	0.113	0.2231	No
61	Nf2	8663	0.110	0.2221	No
62	Pecam1	8769	0.107	0.2213	No
63	Vwf	8774	0.107	0.2241	No
64	Mdk	8817	0.106	0.2255	No
65	Baiap2	8985	0.102	0.2223	No
66	Dlg1	9180	0.097	0.2179	No
67	Epb41l2	9300	0.094	0.2162	No
68	Sorbs3	9477	0.090	0.2123	No
69	Rras	9503	0.090	0.2139	No
70	Col9a1	9541	0.089	0.2150	No
71	Rasa1	9559	0.089	0.2169	No
72	Nrap	9783	0.084	0.2111	No
73	B4galt1	9854	0.082	0.2108	No
74	Kcnh2	9891	0.081	0.2118	No
75	Tial1	10062	0.077	0.2077	No
76	Map3k20	10440	0.070	0.1959	No
77	Evl	10737	0.064	0.1869	No
78	Traf1	10916	0.061	0.1821	No
79	Itga2	11071	0.058	0.1781	No
80	Sympk	11546	0.048	0.1622	No
81	Tsc1	11560	0.048	0.1630	No
82	Nectin1	11648	0.047	0.1611	No
83	Icam1	11763	0.044	0.1582	No
84	Tjp1	11964	0.041	0.1521	No
85	Icam5	12033	0.039	0.1507	No
86	Skap2	12317	0.034	0.1413	No
87	Dhx16	12341	0.033	0.1414	No
88	Hras	12514	0.030	0.1359	No
89	Pten	12636	0.028	0.1323	No
90	Pcdh1	12673	0.027	0.1317	No
91	Pkd1	12868	0.024	0.1253	No
92	Cldn14	12970	0.022	0.1222	No
93	Amigo1	12977	0.022	0.1226	No
94	Cdh4	13044	0.021	0.1208	No
95	Col17a1	13080	0.020	0.1201	No
96	Parva	13301	0.016	0.1125	No
97	Ldlrap1	13496	0.012	0.1057	No
98	Actn4	13584	0.011	0.1029	No
99	Nlgn2	13676	0.009	0.0998	No
100	Pik3cb	13688	0.008	0.0996	No
101	Itga9	13771	0.007	0.0968	No
102	Vcl	13802	0.006	0.0959	No
103	Rsu1	13835	0.006	0.0949	No
104	Wasl	13925	0.005	0.0918	No
105	Slit2	14145	0.001	0.0838	No
106	Mapk11	14641	-0.006	0.0660	No
107	Shc1	14649	-0.006	0.0659	No
108	Itgb4	14773	-0.008	0.0616	No
109	Tmem8b	14868	-0.010	0.0585	No
110	Akt3	14901	-0.011	0.0576	No
111	Nf1	15081	-0.014	0.0515	No
112	Ptk2	15186	-0.016	0.0481	No
113	Exoc4	15187	-0.016	0.0486	No
114	Myl12b	15425	-0.020	0.0405	No
115	Akt2	15428	-0.020	0.0410	No
116	Egfr	15491	-0.022	0.0393	No
117	Actn2	15589	-0.023	0.0364	No
118	Map4k2	15785	-0.027	0.0301	No
119	Pals1	16096	-0.033	0.0197	No
120	Alox8	16123	-0.034	0.0197	No
121	Tspan4	16129	-0.034	0.0204	No
122	Plcg1	16287	-0.036	0.0157	No
123	Ctnnd1	16345	-0.038	0.0147	No
124	Zyx	16400	-0.039	0.0138	No
125	Cdh15	16669	-0.044	0.0053	No
126	Pard6g	16974	-0.050	-0.0044	No
127	Ptprc	17033	-0.051	-0.0051	No
128	Itgb1	17082	-0.052	-0.0054	No
129	Ctnna1	17269	-0.056	-0.0106	No
130	Cdh11	17392	-0.058	-0.0134	No
131	Fbn1	18118	-0.074	-0.0378	No
132	Mmp9	18504	-0.083	-0.0495	No
133	Nectin3	18514	-0.084	-0.0475	No
134	Vcan	18587	-0.085	-0.0478	No
135	Fscn1	18616	-0.086	-0.0464	No
136	Mapk13	18831	-0.090	-0.0517	No
137	Ikbkg	18970	-0.094	-0.0541	No
138	Pbx2	19139	-0.098	-0.0575	No
139	Lamb3	19385	-0.104	-0.0636	No
140	Arpc2	19637	-0.110	-0.0697	No
141	Adam9	19677	-0.111	-0.0680	No
142	Calb2	19811	-0.114	-0.0697	No
143	Gnai1	19963	-0.117	-0.0719	No
144	Gnai2	20066	-0.119	-0.0723	No
145	Vasp	20775	-0.138	-0.0943	No
146	Cldn18	20854	-0.140	-0.0932	No
147	Tubg1	20875	-0.141	-0.0900	No
148	Gtf2f1	20939	-0.143	-0.0883	No
149	Cldn7	20984	-0.144	-0.0859	No
150	Adam23	21611	-0.163	-0.1042	No
151	Stx4a	21923	-0.174	-0.1107	No
152	Dsc1	22027	-0.176	-0.1095	No
153	Hadh	22277	-0.185	-0.1135	No
154	Pfn1	22343	-0.188	-0.1106	No
155	Inppl1	22777	-0.205	-0.1207	No
156	Icam2	23229	-0.221	-0.1310	No
157	Actb	23645	-0.240	-0.1394	No
158	Cd209b	23770	-0.245	-0.1371	No
159	Acta1	23804	-0.247	-0.1314	No
160	Bmp1	24261	-0.267	-0.1406	No
161	Jam3	24342	-0.272	-0.1360	No
162	Tro	24465	-0.278	-0.1327	No
163	Thbs3	24650	-0.287	-0.1314	No
164	Amigo2	24750	-0.292	-0.1269	No
165	Jup	24803	-0.295	-0.1205	No
166	Mvd	24846	-0.297	-0.1138	No
167	Cdh8	24900	-0.300	-0.1074	No
168	Myl9	25266	-0.322	-0.1117	No
169	Gamt	25342	-0.328	-0.1053	No
170	Sdc3	25422	-0.334	-0.0989	No
171	Negr1	25424	-0.334	-0.0896	No
172	Sgce	25524	-0.341	-0.0838	No
173	Nfasc	25559	-0.343	-0.0754	No
174	Cd276	25751	-0.358	-0.0724	No
175	Cd274	25773	-0.360	-0.0632	No
176	Mmp2	26176	-0.397	-0.0668	No
177	Col16a1	26526	-0.439	-0.0673	No
178	Nrtn	26641	-0.454	-0.0588	No
179	Icam4	26789	-0.479	-0.0508	No
180	Insig1	26791	-0.479	-0.0375	No
181	Shroom2	26980	-0.514	-0.0301	No
182	Cadm2	27127	-0.550	-0.0201	No
183	Crb3	27328	-0.623	-0.0100	No
184	Cntn1	27480	-0.716	0.0044	No