Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	MEP.MEP.ery_Pheno.cls #Group3_versus_Group4.MEP.ery_Pheno.cls #Group3_versus_Group4_repos
Phenotype	MEP.ery_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Upregulated in class	2
GeneSet	HALLMARK_COMPLEMENT
Enrichment Score (ES)	0.23636648
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0582876
Nominal p-value	0.35365853
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	0.996

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Lgals3	118	0.914	0.0214	Yes
2	Itgam	313	0.761	0.0357	Yes
3	Fcnb	384	0.727	0.0536	Yes
4	Me1	402	0.721	0.0733	Yes
5	Serpinb2	546	0.668	0.0868	Yes
6	Cpm	550	0.666	0.1055	Yes
7	Kynu	660	0.637	0.1194	Yes
8	Lgmn	688	0.630	0.1361	Yes
9	Tfpi2	979	0.573	0.1417	Yes
10	Serping1	1300	0.517	0.1445	Yes
11	Ccl5	1515	0.496	0.1507	Yes
12	Kcnip3	1549	0.490	0.1632	Yes
13	Mmp8	1618	0.484	0.1744	Yes
14	Hspa5	2051	0.438	0.1709	Yes
15	Dusp6	2456	0.420	0.1680	Yes
16	Ctsh	2734	0.399	0.1691	Yes
17	Cda	3064	0.376	0.1677	Yes
18	Ctsd	3099	0.372	0.1769	Yes
19	Cdh13	3291	0.357	0.1800	Yes
20	Cfh	3430	0.346	0.1847	Yes
21	F2	3653	0.335	0.1860	Yes
22	Dgkh	3723	0.329	0.1928	Yes
23	Cebpb	3735	0.328	0.2016	Yes
24	Rce1	3764	0.327	0.2098	Yes
25	Pclo	3954	0.314	0.2117	Yes
26	Plat	4461	0.292	0.2015	Yes
27	Casp9	4588	0.287	0.2049	Yes
28	Mmp13	4598	0.287	0.2127	Yes
29	Gzmb	4612	0.286	0.2203	Yes
30	Mmp14	4720	0.281	0.2243	Yes
31	Actn2	4890	0.274	0.2258	Yes
32	Lipa	5006	0.267	0.2291	Yes
33	Prss36	5259	0.261	0.2273	Yes
34	Timp1	5673	0.240	0.2189	Yes
35	Src	5746	0.236	0.2230	Yes
36	S100a9	5797	0.233	0.2277	Yes
37	Dyrk2	6149	0.226	0.2213	Yes
38	Kcnip2	6213	0.223	0.2252	Yes
39	Ctsc	6217	0.223	0.2314	Yes
40	Ctsl	6763	0.209	0.2174	Yes
41	Gp1ba	6771	0.208	0.2230	Yes
42	Pcsk9	6799	0.207	0.2279	Yes
43	Plg	6828	0.206	0.2326	Yes
44	Lrp1	6992	0.199	0.2323	Yes
45	Fyn	7033	0.198	0.2364	Yes
46	C1s1	7714	0.172	0.2164	No
47	Pla2g4a	7750	0.171	0.2200	No
48	Rbsn	7822	0.168	0.2221	No
49	Dock4	8113	0.159	0.2160	No
50	Pdgfb	8139	0.158	0.2195	No
51	Dusp5	8291	0.151	0.2183	No
52	Ctss	8367	0.149	0.2197	No
53	Rnf4	8554	0.144	0.2170	No
54	Cfb	8914	0.132	0.2076	No
55	Ctsb	9193	0.124	0.2010	No
56	Was	9419	0.116	0.1960	No
57	Rasgrp1	9435	0.116	0.1987	No
58	Fcer1g	9592	0.111	0.1962	No
59	Clu	9688	0.108	0.1958	No
60	Xpnpep1	9792	0.105	0.1950	No
61	Usp8	10009	0.099	0.1899	No
62	Usp14	10074	0.097	0.1903	No
63	Pdp1	10129	0.096	0.1910	No
64	C1qa	10357	0.091	0.1853	No
65	C3	10473	0.088	0.1836	No
66	Rhog	10579	0.085	0.1822	No
67	Anxa5	10620	0.084	0.1831	No
68	Sirt6	10751	0.081	0.1806	No
69	Gca	10806	0.080	0.1809	No
70	Ehd1	10980	0.075	0.1767	No
71	Jak2	11062	0.073	0.1758	No
72	Prdm4	11262	0.068	0.1705	No
73	Dgkg	11347	0.066	0.1693	No
74	Csrp1	11391	0.065	0.1695	No
75	Gpd2	11405	0.064	0.1708	No
76	Prep	11519	0.061	0.1684	No
77	Casp1	11761	0.054	0.1612	No
78	Calm3	11811	0.053	0.1609	No
79	Dock9	11862	0.052	0.1605	No
80	Psmb9	11959	0.049	0.1584	No
81	Dpp4	12036	0.047	0.1570	No
82	Plscr1	12127	0.045	0.1549	No
83	Ppp2cb	12253	0.041	0.1515	No
84	Timp2	13031	0.022	0.1238	No
85	Rabif	13134	0.019	0.1207	No
86	Stx4a	13275	0.016	0.1160	No
87	Lap3	13317	0.015	0.1149	No
88	F5	13337	0.015	0.1147	No
89	Pla2g7	13434	0.013	0.1115	No
90	Gzmk	13604	0.011	0.1057	No
91	Usp15	13686	0.009	0.1030	No
92	Grb2	13701	0.009	0.1027	No
93	Pfn1	13765	0.008	0.1007	No
94	Sh2b3	13953	0.003	0.0939	No
95	Gmfb	14002	0.002	0.0923	No
96	Gata3	14022	0.002	0.0916	No
97	Irf1	14879	-0.001	0.0604	No
98	Atox1	14934	-0.003	0.0586	No
99	Gnai3	15138	-0.008	0.0514	No
100	Cd46	15594	-0.017	0.0352	No
101	Mmp15	15730	-0.020	0.0309	No
102	Lamp2	15736	-0.020	0.0313	No
103	Lta4h	15860	-0.024	0.0275	No
104	Casp3	15997	-0.027	0.0233	No
105	Olr1	16389	-0.037	0.0101	No
106	Serpine1	16543	-0.041	0.0056	No
107	Phex	16646	-0.044	0.0031	No
108	Prcp	16712	-0.045	0.0021	No
109	Brpf3	16958	-0.051	-0.0054	No
110	Zeb1	16973	-0.052	-0.0045	No
111	Pik3ca	17128	-0.056	-0.0085	No
112	Casp7	17168	-0.057	-0.0084	No
113	Lyn	17244	-0.059	-0.0094	No
114	Gp9	17295	-0.060	-0.0096	No
115	Gnb4	17447	-0.065	-0.0133	No
116	C2	17452	-0.065	-0.0116	No
117	Cp	17497	-0.066	-0.0113	No
118	Kif2a	17750	-0.071	-0.0185	No
119	Il6	17789	-0.072	-0.0179	No
120	Cblb	17961	-0.076	-0.0220	No
121	Raf1	18020	-0.078	-0.0219	No
122	Cr2	18058	-0.079	-0.0211	No
123	F10	18084	-0.079	-0.0197	No
124	Serpinc1	18323	-0.085	-0.0260	No
125	Scg3	18371	-0.086	-0.0253	No
126	Ppp4c	18401	-0.087	-0.0239	No
127	Car2	18550	-0.091	-0.0268	No
128	Irf2	18605	-0.092	-0.0261	No
129	Pik3cg	18657	-0.094	-0.0254	No
130	Prkcd	18695	-0.095	-0.0240	No
131	Psen1	18929	-0.101	-0.0297	No
132	Klkb1	19286	-0.111	-0.0395	No
133	Akap10	19467	-0.116	-0.0428	No
134	Plek	19779	-0.125	-0.0507	No
135	Gng2	19903	-0.129	-0.0515	No
136	Tmprss6	20023	-0.133	-0.0521	No
137	Vcpip1	20083	-0.135	-0.0505	No
138	Calm1	20342	-0.143	-0.0559	No
139	Dock10	20602	-0.152	-0.0611	No
140	Gnai2	20737	-0.156	-0.0616	No
141	F8	20780	-0.157	-0.0587	No
142	Col4a2	21167	-0.170	-0.0680	No
143	Usp16	21252	-0.172	-0.0662	No
144	Gnb2	21717	-0.190	-0.0778	No
145	Zfpm2	21891	-0.197	-0.0786	No
146	Spock2	22505	-0.219	-0.0948	No
147	Gngt2	22967	-0.229	-0.1051	No
148	Ctso	23005	-0.231	-0.1000	No
149	Cdk5r1	23100	-0.235	-0.0968	No
150	Cpq	23112	-0.236	-0.0906	No
151	F3	23137	-0.237	-0.0848	No
152	Msrb1	23436	-0.249	-0.0886	No
153	Casp4	23507	-0.253	-0.0841	No
154	Fn1	23511	-0.253	-0.0771	No
155	Tnfaip3	23521	-0.254	-0.0703	No
156	C1qc	23655	-0.260	-0.0678	No
157	Adam9	23872	-0.264	-0.0683	No
158	Lcp2	24389	-0.290	-0.0789	No
159	Pik3r5	24419	-0.291	-0.0718	No
160	Cd36	24481	-0.294	-0.0657	No
161	Cd40lg	24841	-0.314	-0.0700	No
162	C9	25274	-0.336	-0.0763	No
163	Fdx1	25412	-0.348	-0.0715	No
164	L3mbtl4	25419	-0.349	-0.0619	No
165	Plaur	25535	-0.358	-0.0561	No
166	Maff	25733	-0.370	-0.0529	No
167	S100a13	25759	-0.372	-0.0433	No
168	Ltf	25888	-0.382	-0.0372	No
169	Pim1	26257	-0.420	-0.0388	No
170	Lck	26580	-0.449	-0.0379	No
171	Hnf4a	26763	-0.472	-0.0313	No
172	Irf7	26817	-0.483	-0.0197	No
173	Notch4	26900	-0.495	-0.0087	No
174	F7	27032	-0.521	0.0011	No
175	Hspa1a	27456	-0.698	0.0053	No