Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	HSC.HSC_Pheno.cls#Group6_versus_Group8.HSC_Pheno.cls#Group6_versus_Group8_repos
Phenotype	HSC_Pheno.cls#Group6_versus_Group8_repos
Upregulated in class	4
GeneSet	HALLMARK_HYPOXIA
Enrichment Score (ES)	0.2230599
Normalized Enrichment Score (NES)	0.9650077
Nominal p-value	0.5262136
FDR q-value	0.96980304
FWER p-Value	0.998

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Selenbp1	165	0.789	0.0095	Yes
2	Scarb1	166	0.789	0.0326	Yes
3	Siah2	234	0.735	0.0485	Yes
4	Ilvbl	235	0.735	0.0700	Yes
5	Slc6a6	370	0.661	0.0783	Yes
6	Irs2	423	0.635	0.0926	Yes
7	Bcl2	447	0.625	0.1089	Yes
8	Ero1a	617	0.574	0.1119	Yes
9	Tes	784	0.536	0.1140	Yes
10	Pfkfb3	893	0.516	0.1202	Yes
11	Bhlhe40	1031	0.488	0.1232	Yes
12	Ids	1108	0.475	0.1308	Yes
13	Pgm2	1247	0.450	0.1327	Yes
14	Ets1	1252	0.450	0.1455	Yes
15	Plac8	1278	0.446	0.1564	Yes
16	Anxa2	1285	0.445	0.1689	Yes
17	Pgk1	1351	0.437	0.1763	Yes
18	Ndst1	1521	0.410	0.1745	Yes
19	Gaa	1552	0.405	0.1839	Yes
20	Vhl	1677	0.391	0.1851	Yes
21	Myh9	1719	0.387	0.1930	Yes
22	Hk1	1822	0.372	0.1956	Yes
23	Mif	1996	0.353	0.1917	Yes
24	Ddit4	2003	0.352	0.2015	Yes
25	Atp7a	2011	0.352	0.2112	Yes
26	Pygm	2071	0.345	0.2164	Yes
27	Hspa5	2319	0.322	0.2056	Yes
28	Ak4	2377	0.315	0.2101	Yes
29	Ampd3	2495	0.303	0.2094	Yes
30	Pfkl	2542	0.298	0.2144	Yes
31	Pnrc1	2543	0.298	0.2231	Yes
32	Kif5a	2935	0.260	0.1987	No
33	Cdkn1c	2940	0.259	0.2059	No
34	Gpi1	3134	0.245	0.1973	No
35	Klhl24	3283	0.230	0.1919	No
36	Lxn	3319	0.227	0.1956	No
37	Ndst2	3342	0.225	0.2004	No
38	Hoxb9	3385	0.221	0.2034	No
39	Noct	3389	0.221	0.2096	No
40	Sdc3	3490	0.214	0.2077	No
41	Nr3c1	3764	0.191	0.1909	No
42	Xpnpep1	3882	0.182	0.1867	No
43	Gys1	3937	0.177	0.1874	No
44	Casp6	3941	0.177	0.1923	No
45	Rbpj	4013	0.170	0.1915	No
46	Hk2	4021	0.169	0.1958	No
47	Ldha	4046	0.167	0.1987	No
48	Mt1	4088	0.164	0.2001	No
49	Eno3	4216	0.155	0.1943	No
50	Jun	4681	0.118	0.1598	No
51	Bgn	4695	0.117	0.1621	No
52	Vegfa	4716	0.116	0.1639	No
53	Ugp2	4836	0.106	0.1572	No
54	Tpst2	4919	0.101	0.1535	No
55	Efna1	5050	0.090	0.1455	No
56	Foxo3	5060	0.089	0.1473	No
57	Gbe1	5069	0.089	0.1493	No
58	Ier3	5122	0.086	0.1475	No
59	Aldoa	5147	0.084	0.1480	No
60	Galk1	5228	0.079	0.1438	No
61	Cavin1	5312	0.071	0.1390	No
62	Eno2	5372	0.067	0.1362	No
63	Klf6	5408	0.064	0.1352	No
64	Pim1	5494	0.058	0.1299	No
65	Rora	5517	0.055	0.1297	No
66	Prdx5	5546	0.053	0.1290	No
67	Vldlr	5559	0.053	0.1295	No
68	Jmjd6	5621	0.047	0.1259	No
69	Zfp292	5840	0.031	0.1090	No
70	Gcnt2	5914	0.026	0.1038	No
71	Grhpr	5918	0.026	0.1043	No
72	Klf7	6079	0.013	0.0916	No
73	Ankzf1	6162	0.006	0.0851	No
74	Glrx	6163	0.006	0.0852	No
75	Zfp36	6223	0.002	0.0805	No
76	Inha	6236	0.002	0.0795	No
77	Sult2b1	6266	0.000	0.0772	No
78	Pklr	6301	0.000	0.0744	No
79	Dusp1	6476	-0.009	0.0604	No
80	Plaur	6504	-0.011	0.0585	No
81	Tgfb3	6737	-0.027	0.0404	No
82	Large1	6757	-0.028	0.0396	No
83	Tgm2	6851	-0.036	0.0331	No
84	Sap30	6950	-0.043	0.0263	No
85	Hs3st1	7144	-0.059	0.0122	No
86	Gpc3	7162	-0.060	0.0126	No
87	Tiparp	7219	-0.064	0.0099	No
88	P4ha1	7286	-0.068	0.0065	No
89	Ddit3	7319	-0.070	0.0059	No
90	Cited2	7634	-0.091	-0.0171	No
91	Map3k1	7823	-0.106	-0.0294	No
92	Tpi1	7862	-0.108	-0.0294	No
93	Csrp2	8071	-0.127	-0.0427	No
94	Btg1	8115	-0.131	-0.0424	No
95	Tnfaip3	8144	-0.132	-0.0408	No
96	Pfkp	8148	-0.132	-0.0372	No
97	Plin2	8165	-0.134	-0.0346	No
98	Sdc2	8188	-0.136	-0.0324	No
99	Hdlbp	8343	-0.147	-0.0407	No
100	Slc2a3	8673	-0.172	-0.0626	No
101	Slc2a1	8688	-0.173	-0.0587	No
102	Nedd4l	8696	-0.173	-0.0542	No
103	Fos	8712	-0.174	-0.0504	No
104	Chst2	8777	-0.180	-0.0504	No
105	Tpd52	8884	-0.190	-0.0535	No
106	Ndrg1	9027	-0.203	-0.0592	No
107	Slc25a1	9117	-0.211	-0.0603	No
108	Sdc4	9122	-0.212	-0.0544	No
109	Bnip3l	9256	-0.223	-0.0588	No
110	Hexa	9261	-0.223	-0.0526	No
111	Ppp1r15a	9450	-0.241	-0.0609	No
112	Pgm1	9711	-0.262	-0.0746	No
113	Prkca	9852	-0.272	-0.0781	No
114	Nagk	9864	-0.273	-0.0710	No
115	Phkg1	9944	-0.280	-0.0693	No
116	Cxcr4	9960	-0.281	-0.0623	No
117	Kdm3a	10061	-0.288	-0.0621	No
118	Pdk1	10094	-0.291	-0.0562	No
119	Dtna	10261	-0.308	-0.0608	No
120	Isg20	10390	-0.322	-0.0619	No
121	Gpc1	10408	-0.322	-0.0539	No
122	Aldoc	10533	-0.338	-0.0542	No
123	Fam162a	10638	-0.350	-0.0525	No
124	Wsb1	10825	-0.371	-0.0569	No
125	Fosl2	10974	-0.391	-0.0576	No
126	Tgfbi	11000	-0.393	-0.0481	No
127	Pdk3	11251	-0.430	-0.0560	No
128	Ppargc1a	11258	-0.431	-0.0439	No
129	Pdgfb	11534	-0.484	-0.0523	No
130	Maff	11677	-0.515	-0.0489	No
131	Ccng2	11707	-0.523	-0.0360	No
132	Cdkn1b	11845	-0.564	-0.0307	No
133	Pam	11924	-0.591	-0.0199	No
134	Ext1	11930	-0.593	-0.0030	No
135	Mxi1	12354	-1.313	0.0007	No