Details for gene set HALLMARK_G2M

Table: GSEA Results Summary

Dataset	HSC.HSC_Pheno.cls#Group3_versus_Group4.HSC_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Phenotype	HSC_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Upregulated in class	2
GeneSet	HALLMARK_G2M_CHECKPOINT
Enrichment Score (ES)	0.40819016
Normalized Enrichment Score (NES)	1.3885263
Nominal p-value	0.028806584
FDR q-value	0.2834003
FWER p-Value	0.563

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Map3k20	26	1.070	0.0186	Yes
2	Smad3	85	0.879	0.0309	Yes
3	Ccnd1	158	0.770	0.0399	Yes
4	Tgfb1	215	0.719	0.0493	Yes
5	Smc1a	281	0.684	0.0572	Yes
6	Rpa2	286	0.681	0.0701	Yes
7	Mcm3	296	0.675	0.0825	Yes
8	Rad54l	355	0.652	0.0903	Yes
9	Dkc1	385	0.637	0.1003	Yes
10	Upf1	408	0.628	0.1107	Yes
11	Hus1	431	0.617	0.1209	Yes
12	Myc	435	0.615	0.1326	Yes
13	Meis1	480	0.601	0.1406	Yes
14	Mcm6	544	0.582	0.1467	Yes
15	Racgap1	595	0.571	0.1537	Yes
16	Pds5b	626	0.562	0.1621	Yes
17	Hnrnpu	665	0.554	0.1698	Yes
18	Mtf2	670	0.553	0.1802	Yes
19	Cdk1	700	0.544	0.1883	Yes
20	Foxn3	754	0.533	0.1943	Yes
21	Birc5	794	0.522	0.2012	Yes
22	Ctcf	880	0.508	0.2041	Yes
23	Ilf3	895	0.504	0.2127	Yes
24	Mcm5	940	0.495	0.2187	Yes
25	Kif23	960	0.492	0.2267	Yes
26	Nup98	980	0.488	0.2346	Yes
27	Stil	1038	0.478	0.2392	Yes
28	Ccnb2	1060	0.475	0.2467	Yes
29	Fbxo5	1099	0.469	0.2527	Yes
30	E2f2	1145	0.462	0.2579	Yes
31	Mad2l1	1152	0.461	0.2664	Yes
32	Srsf1	1157	0.460	0.2750	Yes
33	Odc1	1173	0.458	0.2826	Yes
34	Cdk4	1337	0.436	0.2777	Yes
35	Cul1	1346	0.434	0.2855	Yes
36	Cdc7	1358	0.432	0.2929	Yes
37	Slc12a2	1365	0.432	0.3008	Yes
38	Cdc20	1445	0.418	0.3024	Yes
39	Orc5	1474	0.416	0.3082	Yes
40	Syncrip	1623	0.400	0.3038	Yes
41	Nasp	1631	0.398	0.3110	Yes
42	Cdc45	1663	0.394	0.3161	Yes
43	E2f3	1706	0.388	0.3202	Yes
44	Lmnb1	1709	0.388	0.3275	Yes
45	Ttk	1767	0.380	0.3302	Yes
46	Cul3	1786	0.377	0.3360	Yes
47	Mapk14	1883	0.365	0.3353	Yes
48	Hmgb3	1926	0.359	0.3388	Yes
49	Top2a	1929	0.359	0.3456	Yes
50	Kif4	1951	0.357	0.3508	Yes
51	Hmmr	1981	0.353	0.3552	Yes
52	Srsf10	1995	0.351	0.3610	Yes
53	Prc1	2056	0.346	0.3628	Yes
54	E2f4	2078	0.344	0.3677	Yes
55	Prim2	2110	0.339	0.3717	Yes
56	Kif11	2122	0.338	0.3774	Yes
57	Smc2	2137	0.337	0.3828	Yes
58	Tacc3	2161	0.335	0.3874	Yes
59	Atrx	2220	0.328	0.3890	Yes
60	Mki67	2236	0.327	0.3941	Yes
61	Bub1	2310	0.320	0.3943	Yes
62	G3bp1	2482	0.305	0.3862	Yes
63	Cdkn1b	2518	0.301	0.3891	Yes
64	Rad23b	2524	0.300	0.3946	Yes
65	Cdkn2c	2598	0.294	0.3943	Yes
66	Slc7a5	2626	0.292	0.3977	Yes
67	Tnpo2	2632	0.291	0.4030	Yes
68	Stmn1	2768	0.282	0.3973	Yes
69	Gins2	2778	0.282	0.4021	Yes
70	Pttg1	2911	0.270	0.3965	Yes
71	Ncl	2932	0.268	0.4000	Yes
72	Kpnb1	2946	0.266	0.4041	Yes
73	Smc4	2995	0.262	0.4053	Yes
74	Ube2s	3022	0.261	0.4082	Yes
75	Knl1	3107	0.254	0.4062	No
76	Cks2	3153	0.251	0.4074	No
77	Cenpe	3206	0.246	0.4079	No
78	Cdc25a	3468	0.225	0.3908	No
79	Tle3	3583	0.214	0.3856	No
80	Hif1a	3623	0.210	0.3865	No
81	Slc38a1	3749	0.204	0.3802	No
82	Ube2c	3923	0.190	0.3697	No
83	Katna1	3978	0.186	0.3689	No
84	Srsf2	4008	0.184	0.3700	No
85	Uck2	4020	0.183	0.3727	No
86	Chek1	4024	0.183	0.3760	No
87	H2az1	4073	0.179	0.3755	No
88	Aurka	4129	0.175	0.3744	No
89	Incenp	4155	0.173	0.3757	No
90	H2az2	4250	0.165	0.3712	No
91	Cenpf	4266	0.164	0.3731	No
92	Ccna2	4269	0.164	0.3762	No
93	Sap30	4280	0.163	0.3785	No
94	Suv39h1	4312	0.161	0.3791	No
95	Mnat1	4347	0.158	0.3793	No
96	Nolc1	4375	0.156	0.3801	No
97	Dtymk	4476	0.149	0.3748	No
98	Smarcc1	4542	0.144	0.3723	No
99	Pola2	4700	0.133	0.3619	No
100	Dbf4	4785	0.127	0.3575	No
101	Sfpq	4887	0.121	0.3516	No
102	Sqle	5039	0.110	0.3413	No
103	Egf	5047	0.109	0.3429	No
104	Nusap1	5223	0.098	0.3304	No
105	Exo1	5350	0.087	0.3217	No
106	Meis2	5382	0.085	0.3208	No
107	Plk4	5431	0.082	0.3185	No
108	Pole	5475	0.079	0.3165	No
109	Tmpo	5517	0.076	0.3146	No
110	Jpt1	5540	0.075	0.3143	No
111	Nsd2	5784	0.057	0.2954	No
112	Tpx2	5798	0.055	0.2954	No
113	Ndc80	5813	0.054	0.2953	No
114	Ddx39a	5856	0.051	0.2929	No
115	Mcm2	5871	0.050	0.2927	No
116	Prpf4b	6005	0.042	0.2826	No
117	Kif15	6054	0.041	0.2794	No
118	Rps6ka5	6194	0.032	0.2686	No
119	Polq	6259	0.026	0.2639	No
120	Tra2b	6270	0.025	0.2635	No
121	Pafah1b1	6308	0.022	0.2609	No
122	Rasal2	6320	0.022	0.2605	No
123	Wrn	6407	0.015	0.2537	No
124	Kif20b	6432	0.013	0.2520	No
125	Rbl1	6436	0.013	0.2520	No
126	Kif5b	6587	0.004	0.2397	No
127	Amd1	6779	-0.002	0.2241	No
128	Ythdc1	6900	-0.011	0.2145	No
129	Lbr	6935	-0.014	0.2119	No
130	Numa1	6989	-0.017	0.2079	No
131	Atf5	7010	-0.020	0.2067	No
132	Cul5	7069	-0.023	0.2023	No
133	Ss18	7183	-0.029	0.1936	No
134	Cbx1	7357	-0.042	0.1802	No
135	Hnrnpd	7455	-0.050	0.1733	No
136	Top1	7490	-0.053	0.1715	No
137	Marcks	7635	-0.062	0.1609	No
138	Ccnf	8069	-0.096	0.1272	No
139	Ewsr1	8138	-0.102	0.1236	No
140	Cenpa	8157	-0.103	0.1241	No
141	Orc6	8165	-0.104	0.1255	No
142	Nup50	8203	-0.106	0.1246	No
143	Stag1	8247	-0.109	0.1232	No
144	Ccnt1	8265	-0.110	0.1239	No
145	Dr1	8284	-0.112	0.1246	No
146	Rad21	8433	-0.125	0.1149	No
147	Tent4a	8498	-0.129	0.1121	No
148	Odf2	8505	-0.130	0.1142	No
149	Tfdp1	8553	-0.133	0.1129	No
150	Hspa8	8719	-0.148	0.1022	No
151	Snrpd1	8765	-0.153	0.1015	No
152	Casp8ap2	8778	-0.155	0.1035	No
153	Slc7a1	8829	-0.159	0.1025	No
154	Mybl2	8889	-0.163	0.1008	No
155	Gspt1	8963	-0.169	0.0981	No
156	Kmt5a	8965	-0.169	0.1013	No
157	Brca2	9127	-0.182	0.0916	No
158	Bard1	9189	-0.187	0.0902	No
159	Prmt5	9451	-0.208	0.0728	No
160	Fancc	9499	-0.213	0.0731	No
161	Xpo1	9566	-0.219	0.0719	No
162	Ezh2	9689	-0.229	0.0663	No
163	Lig3	9756	-0.234	0.0655	No
164	Dmd	10108	-0.268	0.0419	No
165	Cdc6	10256	-0.284	0.0353	No
166	Pura	10332	-0.290	0.0348	No
167	Notch2	10528	-0.314	0.0249	No
168	H2ax	10532	-0.314	0.0307	No
169	Cul4a	10585	-0.319	0.0326	No
170	Bcl3	10708	-0.335	0.0291	No
171	Chaf1a	10749	-0.341	0.0324	No
172	Hira	10916	-0.362	0.0258	No
173	Arid4a	11096	-0.389	0.0187	No
174	Bub3	11373	-0.428	0.0043	No
175	E2f1	11378	-0.429	0.0123	No
176	Abl1	11431	-0.436	0.0165	No
177	Cdc25b	11521	-0.455	0.0180	No
178	Traip	11786	-0.517	0.0064	No
179	Pml	12120	-0.645	-0.0084	No
180	Cdc27	12204	-0.715	-0.0014	No
181	Chmp1a	12222	-0.740	0.0116	No