Details for gene set HALLMARK_APICAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	HSC.HSC_Pheno.cls#Group3_versus_Group4.HSC_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Phenotype	HSC_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Upregulated in class	2
GeneSet	HALLMARK_APICAL_JUNCTION
Enrichment Score (ES)	0.29268003
Normalized Enrichment Score (NES)	1.2782453
Nominal p-value	0.104950495
FDR q-value	0.3912975
FWER p-Value	0.826

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Syk	13	1.219	0.0356	Yes
2	Map3k20	26	1.070	0.0667	Yes
3	Pard6g	109	0.851	0.0856	Yes
4	Cap1	187	0.743	0.1017	Yes
5	Map4k2	277	0.686	0.1150	Yes
6	Gnai1	361	0.650	0.1278	Yes
7	Nectin4	456	0.608	0.1383	Yes
8	Baiap2	586	0.573	0.1450	Yes
9	Ikbkg	679	0.550	0.1540	Yes
10	Lama3	711	0.540	0.1677	Yes
11	Nrap	829	0.517	0.1737	Yes
12	Myh9	948	0.494	0.1789	Yes
13	Myl12b	972	0.490	0.1918	Yes
14	Wasl	1021	0.482	0.2023	Yes
15	Crat	1156	0.460	0.2052	Yes
16	Lima1	1293	0.442	0.2074	Yes
17	Src	1386	0.429	0.2128	Yes
18	Ptprc	1407	0.426	0.2239	Yes
19	Pten	1412	0.425	0.2364	Yes
20	Nectin3	1481	0.416	0.2433	Yes
21	Adam15	1517	0.412	0.2528	Yes
22	Sgce	1569	0.405	0.2608	Yes
23	Sirpa	1875	0.366	0.2469	Yes
24	Mapk14	1883	0.365	0.2573	Yes
25	Actn1	1884	0.365	0.2683	Yes
26	Rsu1	1899	0.363	0.2781	Yes
27	Cd86	2016	0.350	0.2791	Yes
28	Cd276	2163	0.334	0.2772	Yes
29	Epb41l2	2174	0.334	0.2864	Yes
30	Pkd1	2279	0.322	0.2876	Yes
31	Speg	2335	0.318	0.2927	Yes
32	Pbx2	2620	0.292	0.2783	No
33	Pik3cb	2651	0.290	0.2845	No
34	Rasa1	2816	0.278	0.2795	No
35	Mmp2	2953	0.265	0.2763	No
36	Tspan4	3216	0.245	0.2623	No
37	Plcg1	3336	0.234	0.2596	No
38	Myh10	3363	0.233	0.2645	No
39	Layn	3433	0.226	0.2656	No
40	Itga9	3566	0.216	0.2613	No
41	Cdk8	3598	0.212	0.2652	No
42	Nrtn	3654	0.209	0.2670	No
43	Amigo2	3656	0.209	0.2732	No
44	Nlgn2	3692	0.208	0.2765	No
45	Arhgef6	3766	0.203	0.2767	No
46	Evl	3824	0.197	0.2779	No
47	Arpc2	3890	0.192	0.2784	No
48	Ctnna1	3998	0.185	0.2752	No
49	Exoc4	4035	0.182	0.2777	No
50	Gtf2f1	4069	0.179	0.2804	No
51	Vcl	4343	0.158	0.2629	No
52	Skap2	4373	0.156	0.2652	No
53	Lamb3	4457	0.150	0.2629	No
54	Tubg1	4491	0.148	0.2646	No
55	B4galt1	4495	0.147	0.2688	No
56	Itga2	4496	0.147	0.2733	No
57	Tro	4561	0.143	0.2723	No
58	Itga10	4741	0.130	0.2616	No
59	Stx4a	4775	0.128	0.2627	No
60	Slit2	4847	0.123	0.2606	No
61	Zyx	4939	0.117	0.2567	No
62	Ctnnd1	4978	0.114	0.2570	No
63	Pfn1	5050	0.109	0.2545	No
64	Jam3	5180	0.100	0.2470	No
65	Nectin1	5460	0.079	0.2266	No
66	Cercam	5503	0.077	0.2255	No
67	Dhx16	5550	0.074	0.2239	No
68	Tial1	5565	0.073	0.2250	No
69	Vasp	5662	0.065	0.2191	No
70	Sorbs3	5941	0.046	0.1978	No
71	Sdc3	6055	0.041	0.1898	No
72	Tjp1	6056	0.040	0.1910	No
73	Cnn2	6057	0.040	0.1922	No
74	Actg1	6067	0.040	0.1927	No
75	Rac2	6205	0.031	0.1824	No
76	Adam9	6341	0.020	0.1719	No
77	Dlg1	6505	0.008	0.1589	No
78	Vcan	6549	0.006	0.1555	No
79	Icam2	6559	0.005	0.1550	No
80	Vav2	6983	-0.017	0.1209	No
81	Cx3cl1	7106	-0.025	0.1117	No
82	Akt2	7114	-0.026	0.1119	No
83	Inppl1	7292	-0.039	0.0986	No
84	Cadm2	7403	-0.047	0.0910	No
85	Ldlrap1	7439	-0.049	0.0896	No
86	Insig1	7451	-0.050	0.0902	No
87	Msn	7558	-0.057	0.0833	No
88	Ywhah	7570	-0.058	0.0841	No
89	Cd34	7588	-0.059	0.0845	No
90	Gnai2	7732	-0.070	0.0750	No
91	Sympk	7767	-0.073	0.0744	No
92	Mpzl1	7781	-0.074	0.0755	No
93	Rhof	7786	-0.074	0.0774	No
94	Bmp1	7869	-0.080	0.0731	No
95	Cd274	8115	-0.099	0.0561	No
96	Amigo1	8164	-0.104	0.0553	No
97	Tmem8b	8266	-0.110	0.0503	No
98	Nf1	8320	-0.115	0.0495	No
99	Fscn1	8811	-0.158	0.0142	No
100	Ptk2	8916	-0.165	0.0107	No
101	Nrxn2	8969	-0.169	0.0115	No
102	Jup	8996	-0.171	0.0145	No
103	Cntn1	9064	-0.175	0.0143	No
104	Rras	9082	-0.177	0.0182	No
105	Nf2	9322	-0.196	0.0046	No
106	Taok2	9460	-0.209	-0.0003	No
107	Actn4	9510	-0.214	0.0021	No
108	Col16a1	9662	-0.226	-0.0034	No
109	Icam1	9725	-0.232	-0.0015	No
110	Tsc1	9857	-0.245	-0.0048	No
111	Vwf	9863	-0.246	0.0021	No
112	Itgb1	9942	-0.255	0.0034	No
113	Traf1	10753	-0.342	-0.0525	No
114	Tgfbi	10855	-0.356	-0.0500	No
115	Pecam1	10933	-0.365	-0.0454	No
116	Shroom2	11009	-0.378	-0.0401	No
117	Actb	11183	-0.401	-0.0422	No
118	Pals1	11475	-0.447	-0.0526	No
119	Kcnh2	11638	-0.479	-0.0514	No
120	Shc1	11670	-0.485	-0.0394	No
121	Itga3	11841	-0.533	-0.0372	No
122	Hadh	11951	-0.567	-0.0291	No
123	Fbn1	12299	-0.863	-0.0315	No
124	Akt3	12354	-1.220	0.0007	No