Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	HSC.HSC_Pheno.cls#Group3_versus_Group4.HSC_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Phenotype	HSC_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Upregulated in class	2
GeneSet	HALLMARK_ADIPOGENESIS
Enrichment Score (ES)	0.22001524
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0579382
Nominal p-value	0.338843
FDR q-value	0.6208777
FWER p-Value	0.996

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Ywhag	82	0.888	0.0136	Yes
2	Ndufs3	212	0.721	0.0195	Yes
3	Atp1b3	224	0.714	0.0349	Yes
4	Gpam	248	0.704	0.0490	Yes
5	Miga2	283	0.682	0.0618	Yes
6	Atl2	298	0.674	0.0761	Yes
7	Immt	309	0.671	0.0906	Yes
8	Slc25a1	371	0.646	0.1003	Yes
9	Mtch2	468	0.606	0.1063	Yes
10	Ubc	590	0.573	0.1095	Yes
11	Acaa2	686	0.548	0.1142	Yes
12	Ccng2	747	0.534	0.1215	Yes
13	Echs1	917	0.499	0.1190	Yes
14	Cpt2	970	0.490	0.1259	Yes
15	Esrra	995	0.486	0.1351	Yes
16	Prdx3	1042	0.477	0.1422	Yes
17	Crat	1156	0.460	0.1434	Yes
18	Tank	1186	0.456	0.1515	Yes
19	Retsat	1318	0.439	0.1508	Yes
20	Rreb1	1580	0.404	0.1386	Yes
21	Reep5	1682	0.391	0.1392	Yes
22	Elmod3	1747	0.382	0.1427	Yes
23	Angpt1	1773	0.379	0.1493	Yes
24	Ak2	1796	0.376	0.1561	Yes
25	Acox1	1873	0.366	0.1582	Yes
26	Ucp2	1889	0.364	0.1653	Yes
27	Phldb1	1891	0.364	0.1735	Yes
28	Cox6a1	1913	0.360	0.1800	Yes
29	Lpl	1956	0.357	0.1847	Yes
30	Tob1	2012	0.350	0.1882	Yes
31	Phyh	2103	0.340	0.1886	Yes
32	Sod1	2126	0.338	0.1945	Yes
33	Lipe	2294	0.321	0.1882	Yes
34	Pdcd4	2389	0.312	0.1876	Yes
35	Abcb8	2514	0.302	0.1843	Yes
36	Cdkn2c	2598	0.294	0.1842	Yes
37	Apoe	2611	0.294	0.1899	Yes
38	Ppp1r15b	2657	0.289	0.1929	Yes
39	Grpel1	2659	0.289	0.1994	Yes
40	Arl4a	2679	0.287	0.2044	Yes
41	Cs	2761	0.283	0.2042	Yes
42	Rtn3	2796	0.280	0.2078	Yes
43	Decr1	2802	0.280	0.2138	Yes
44	Pfkfb3	2957	0.265	0.2072	Yes
45	Coq5	2964	0.265	0.2128	Yes
46	Coq3	3038	0.261	0.2128	Yes
47	Stom	3076	0.258	0.2156	Yes
48	Scp2	3159	0.251	0.2146	Yes
49	Lama4	3183	0.249	0.2184	Yes
50	Scarb1	3237	0.243	0.2196	Yes
51	Ech1	3337	0.234	0.2168	Yes
52	Map4k3	3394	0.230	0.2175	Yes
53	Samm50	3470	0.225	0.2165	Yes
54	Col4a1	3490	0.223	0.2200	Yes
55	G3bp2	3609	0.211	0.2152	No
56	Ifngr1	3698	0.206	0.2127	No
57	Uqcrc1	3738	0.204	0.2141	No
58	Ndufb7	3797	0.200	0.2139	No
59	Pgm1	3970	0.187	0.2041	No
60	Etfb	3990	0.186	0.2068	No
61	Nmt1	4030	0.183	0.2078	No
62	Ghitm	4131	0.175	0.2035	No
63	Cd151	4290	0.162	0.1943	No
64	Me1	4304	0.161	0.1969	No
65	Idh3g	4349	0.157	0.1969	No
66	Cox8a	4350	0.157	0.2005	No
67	Aco2	4356	0.157	0.2036	No
68	Vegfb	4413	0.153	0.2025	No
69	Cmpk1	4923	0.118	0.1635	No
70	Slc5a6	5022	0.111	0.1580	No
71	Aifm1	5055	0.109	0.1579	No
72	Itsn1	5066	0.109	0.1595	No
73	Por	5189	0.100	0.1518	No
74	Abca1	5193	0.099	0.1538	No
75	Cat	5210	0.098	0.1548	No
76	Pfkl	5458	0.080	0.1363	No
77	Fzd4	5465	0.079	0.1377	No
78	Dram2	5583	0.071	0.1297	No
79	Slc25a10	5609	0.069	0.1292	No
80	Uqcrq	5730	0.061	0.1208	No
81	Cox7b	5735	0.061	0.1218	No
82	Nkiras1	5801	0.055	0.1177	No
83	Jagn1	5858	0.051	0.1143	No
84	Bckdha	5970	0.044	0.1062	No
85	Lpcat3	5992	0.043	0.1055	No
86	Cyp4b1	6030	0.041	0.1034	No
87	Acads	6031	0.041	0.1043	No
88	Slc19a1	6097	0.037	0.0998	No
89	Aldoa	6445	0.012	0.0717	No
90	Acadl	6493	0.009	0.0680	No
91	Dld	6920	-0.012	0.0333	No
92	Cavin1	6965	-0.016	0.0301	No
93	Mccc1	7027	-0.021	0.0256	No
94	Idh1	7076	-0.023	0.0222	No
95	Dhcr7	7177	-0.029	0.0146	No
96	Ptcd3	7179	-0.029	0.0152	No
97	Pex14	7354	-0.042	0.0019	No
98	Chuk	7394	-0.046	-0.0003	No
99	Ubqln1	7411	-0.047	-0.0005	No
100	Acly	7461	-0.051	-0.0034	No
101	Uqcr11	7466	-0.051	-0.0025	No
102	Riok3	7474	-0.051	-0.0019	No
103	Sdhc	7551	-0.056	-0.0069	No
104	Idh3a	7598	-0.059	-0.0093	No
105	Araf	7674	-0.065	-0.0139	No
106	Acadm	7700	-0.067	-0.0145	No
107	Dhrs7b	7802	-0.075	-0.0210	No
108	Dlat	7826	-0.077	-0.0211	No
109	Gphn	7828	-0.077	-0.0195	No
110	Cyc1	7841	-0.078	-0.0187	No
111	Reep6	7853	-0.079	-0.0178	No
112	Sdhb	7859	-0.079	-0.0164	No
113	Fah	7873	-0.080	-0.0156	No
114	Nabp1	7978	-0.089	-0.0221	No
115	Dnajc15	8071	-0.096	-0.0274	No
116	Baz2a	8092	-0.098	-0.0269	No
117	Stat5a	8120	-0.100	-0.0268	No
118	Esyt1	8130	-0.101	-0.0252	No
119	Ppm1b	8306	-0.114	-0.0370	No
120	Bcl6	8401	-0.122	-0.0419	No
121	Sqor	8552	-0.133	-0.0511	No
122	Itih5	8576	-0.136	-0.0499	No
123	Gpx4	8753	-0.151	-0.0609	No
124	Ddt	8807	-0.158	-0.0616	No
125	Slc1a5	8919	-0.166	-0.0670	No
126	Dhrs7	8993	-0.171	-0.0690	No
127	Ndufab1	9007	-0.172	-0.0662	No
128	Cavin2	9076	-0.177	-0.0677	No
129	Adcy6	9145	-0.183	-0.0691	No
130	Adipor2	9338	-0.197	-0.0804	No
131	Suclg1	9363	-0.199	-0.0778	No
132	Gpat4	9404	-0.203	-0.0764	No
133	Taldo1	9455	-0.208	-0.0758	No
134	Mdh2	9539	-0.217	-0.0776	No
135	Aldh2	9546	-0.217	-0.0732	No
136	Pim3	9601	-0.222	-0.0725	No
137	Uqcr10	9609	-0.222	-0.0680	No
138	Gpx3	9638	-0.224	-0.0652	No
139	Mylk	9794	-0.238	-0.0725	No
140	Aplp2	9800	-0.238	-0.0674	No
141	Mgll	9810	-0.240	-0.0627	No
142	Ptger3	9915	-0.251	-0.0655	No
143	Gbe1	9986	-0.258	-0.0653	No
144	Slc27a1	10027	-0.261	-0.0626	No
145	Hibch	10092	-0.266	-0.0618	No
146	Agpat3	10478	-0.306	-0.0864	No
147	Rnf11	10502	-0.311	-0.0812	No
148	Tkt	10562	-0.317	-0.0788	No
149	Dnajb9	10687	-0.332	-0.0814	No
150	Sult1a1	10706	-0.335	-0.0752	No
151	Dgat1	10718	-0.336	-0.0684	No
152	Elovl6	10874	-0.358	-0.0730	No
153	Plin2	10881	-0.358	-0.0653	No
154	Sorbs1	11029	-0.380	-0.0687	No
155	Qdpr	11216	-0.404	-0.0747	No
156	Preb	11224	-0.404	-0.0660	No
157	Mrpl15	11236	-0.406	-0.0576	No
158	Uck1	11255	-0.410	-0.0498	No
159	Bcl2l13	11271	-0.413	-0.0416	No
160	Coq9	11416	-0.434	-0.0435	No
161	Ndufa5	11743	-0.503	-0.0587	No
162	Cd302	11750	-0.504	-0.0477	No
163	Rmdn3	11769	-0.509	-0.0375	No
164	Dbt	11863	-0.538	-0.0329	No
165	Mtarc2	11925	-0.557	-0.0252	No
166	Hadh	11951	-0.567	-0.0142	No
167	Sspn	12043	-0.605	-0.0079	No
168	Gpd2	12158	-0.678	-0.0017	No
169	Pemt	12268	-0.809	0.0078	No