Details for gene set HALLMARK_UV_RESPONSE

Table: GSEA Results Summary

Dataset	HSC.HSC_Pheno.cls#Group2_versus_Group4.HSC_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Phenotype	HSC_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_UV_RESPONSE_DN
Enrichment Score (ES)	0.22299819
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0935475
Nominal p-value	0.25502008
FDR q-value	0.67970586
FWER p-Value	0.975

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Mmp16	199	0.740	0.0104	Yes
2	Atxn1	309	0.669	0.0255	Yes
3	Nfkb1	336	0.658	0.0471	Yes
4	Kit	364	0.646	0.0681	Yes
5	Synj2	452	0.609	0.0829	Yes
6	Anxa2	856	0.509	0.0684	Yes
7	Syne1	997	0.483	0.0743	Yes
8	Pten	1078	0.470	0.0847	Yes
9	Tjp1	1293	0.438	0.0830	Yes
10	Anxa4	1359	0.428	0.0931	Yes
11	Plpp3	1426	0.420	0.1028	Yes
12	Nr3c1	1431	0.419	0.1176	Yes
13	Atrn	1670	0.389	0.1121	Yes
14	Dlg1	1756	0.379	0.1188	Yes
15	Tgfbr3	1779	0.377	0.1306	Yes
16	Nr1d2	1901	0.364	0.1338	Yes
17	Grk5	1998	0.355	0.1388	Yes
18	Adgrl2	2027	0.352	0.1491	Yes
19	Myc	2100	0.344	0.1557	Yes
20	Itgb3	2153	0.340	0.1636	Yes
21	Cdkn1b	2166	0.338	0.1748	Yes
22	Ythdc1	2349	0.322	0.1715	Yes
23	Cap2	2486	0.310	0.1716	Yes
24	Bhlhe40	2506	0.308	0.1811	Yes
25	Sipa1l1	2587	0.300	0.1854	Yes
26	Prkar2b	2700	0.292	0.1867	Yes
27	Cited2	2783	0.282	0.1902	Yes
28	Sdc2	2876	0.275	0.1926	Yes
29	Lamc1	2980	0.266	0.1937	Yes
30	Pdlim5	3015	0.263	0.2004	Yes
31	Dusp1	3077	0.256	0.2047	Yes
32	Bckdhb	3087	0.256	0.2131	Yes
33	Zmiz1	3218	0.247	0.2114	Yes
34	Prkce	3454	0.227	0.2004	Yes
35	Nipbl	3469	0.225	0.2073	Yes
36	Cdon	3523	0.221	0.2109	Yes
37	Prkca	3577	0.217	0.2144	Yes
38	Rasa2	3737	0.205	0.2088	Yes
39	Scaf8	3814	0.198	0.2097	Yes
40	Magi2	3816	0.198	0.2168	Yes
41	Smad3	3827	0.196	0.2230	Yes
42	Prdm2	4046	0.178	0.2116	No
43	Atp2b1	4132	0.173	0.2109	No
44	Dmac2l	4344	0.157	0.1993	No
45	Ptpn21	4349	0.156	0.2046	No
46	Inpp4b	4405	0.151	0.2056	No
47	Smad7	4425	0.150	0.2094	No
48	Aggf1	4542	0.142	0.2050	No
49	Atrx	4544	0.141	0.2100	No
50	Vldlr	4621	0.135	0.2087	No
51	Igf1r	4677	0.130	0.2089	No
52	Kalrn	4824	0.120	0.2012	No
53	Gcnt1	4944	0.113	0.1956	No
54	Mt1	4980	0.110	0.1967	No
55	Apbb2	5158	0.101	0.1859	No
56	Celf2	5228	0.094	0.1836	No
57	Rxra	5235	0.094	0.1865	No
58	Atp2b4	5350	0.085	0.1803	No
59	Atp2c1	5398	0.081	0.1794	No
60	Togaram1	5410	0.080	0.1813	No
61	Rbpms	5508	0.074	0.1761	No
62	Tgfbr2	6102	0.032	0.1288	No
63	Map1b	6161	0.027	0.1251	No
64	Ptprm	6219	0.023	0.1213	No
65	Arhgef9	6228	0.022	0.1214	No
66	Nek7	6445	0.006	0.1040	No
67	Cacna1a	6499	0.002	0.0997	No
68	Pex14	6701	-0.009	0.0837	No
69	Fyn	6726	-0.011	0.0821	No
70	Wdr37	6816	-0.017	0.0755	No
71	Mapk14	6859	-0.020	0.0728	No
72	Slc22a18	7006	-0.030	0.0619	No
73	Pdgfrb	7018	-0.031	0.0621	No
74	Ldlr	7521	-0.071	0.0237	No
75	Abcc1	7560	-0.074	0.0232	No
76	Add3	7867	-0.097	0.0018	No
77	Dlc1	8109	-0.115	-0.0138	No
78	Vav2	8370	-0.136	-0.0301	No
79	Runx1	8400	-0.139	-0.0275	No
80	Sfmbt1	8673	-0.160	-0.0439	No
81	Spop	8687	-0.161	-0.0392	No
82	Rnd3	8692	-0.161	-0.0337	No
83	Bmpr1a	8757	-0.163	-0.0331	No
84	Slc7a1	8790	-0.166	-0.0297	No
85	Cdc42bpa	8856	-0.172	-0.0288	No
86	Cdk13	8894	-0.176	-0.0255	No
87	Ltbp1	9018	-0.188	-0.0288	No
88	Acvr2a	9085	-0.192	-0.0273	No
89	Pias3	9152	-0.198	-0.0255	No
90	Pik3cd	9185	-0.202	-0.0209	No
91	Col1a2	9247	-0.208	-0.0184	No
92	Dyrk1a	9384	-0.217	-0.0217	No
93	Schip1	9496	-0.226	-0.0226	No
94	Map2k5	9770	-0.253	-0.0358	No
95	Gja1	9933	-0.268	-0.0394	No
96	Plcb4	9953	-0.269	-0.0313	No
97	Mios	9985	-0.272	-0.0240	No
98	Notch2	10096	-0.282	-0.0228	No
99	Mgmt	10131	-0.285	-0.0153	No
100	Tfpi	10139	-0.287	-0.0056	No
101	Mgll	10191	-0.290	0.0007	No
102	Mrps31	10485	-0.323	-0.0116	No
103	Met	10727	-0.352	-0.0186	No
104	Tent4a	10785	-0.358	-0.0104	No
105	Dbp	11230	-0.418	-0.0316	No
106	Insig1	11302	-0.427	-0.0221	No
107	Sri	11416	-0.443	-0.0153	No
108	Ica1	11521	-0.463	-0.0072	No
109	Phf3	11636	-0.484	0.0009	No
110	Akt3	11700	-0.501	0.0138	No
111	Mta1	11911	-0.554	0.0166	No
112	Lpar1	11938	-0.562	0.0347	No