Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	HSC.HSC_Pheno.cls#Group2_versus_Group4.HSC_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Phenotype	HSC_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_ADIPOGENESIS
Enrichment Score (ES)	0.22227605
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0924778
Nominal p-value	0.24031007
FDR q-value	0.63515174
FWER p-Value	0.975

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Ndufs3	3	1.607	0.0362	Yes
2	Abca1	39	1.009	0.0563	Yes
3	Crat	92	0.878	0.0720	Yes
4	Elmod3	168	0.772	0.0833	Yes
5	Arl4a	189	0.750	0.0987	Yes
6	Ak2	369	0.644	0.0987	Yes
7	Cox7b	444	0.613	0.1065	Yes
8	Rreb1	465	0.603	0.1186	Yes
9	Immt	490	0.596	0.1302	Yes
10	Ndufb7	579	0.569	0.1359	Yes
11	Tob1	696	0.541	0.1386	Yes
12	Ppm1b	801	0.522	0.1419	Yes
13	Pfkl	812	0.519	0.1529	Yes
14	Samm50	823	0.516	0.1638	Yes
15	Scp2	961	0.488	0.1636	Yes
16	Adipor2	1100	0.466	0.1629	Yes
17	Cpt2	1108	0.464	0.1728	Yes
18	Cs	1175	0.452	0.1777	Yes
19	Prdx3	1208	0.448	0.1852	Yes
20	Gpam	1217	0.447	0.1947	Yes
21	Miga2	1230	0.446	0.2039	Yes
22	Retsat	1268	0.441	0.2108	Yes
23	Atl2	1338	0.431	0.2150	Yes
24	Taldo1	1412	0.421	0.2186	Yes
25	Ifngr1	1482	0.413	0.2223	Yes
26	Ubc	1661	0.390	0.2165	No
27	Tkt	1798	0.376	0.2139	No
28	Lama4	1803	0.375	0.2221	No
29	Reep5	2032	0.352	0.2114	No
30	Abcb8	2049	0.349	0.2180	No
31	Echs1	2448	0.312	0.1925	No
32	Plin2	2557	0.303	0.1905	No
33	Slc25a1	2577	0.301	0.1958	No
34	Dld	2664	0.294	0.1954	No
35	Acadm	2754	0.285	0.1946	No
36	Riok3	2781	0.282	0.1989	No
37	Cavin1	2798	0.281	0.2039	No
38	Ptcd3	2800	0.280	0.2102	No
39	Etfb	2903	0.272	0.2080	No
40	Ppp1r15b	3027	0.262	0.2039	No
41	Fah	3035	0.261	0.2092	No
42	Grpel1	3073	0.257	0.2120	No
43	Idh3a	3137	0.252	0.2126	No
44	Chuk	3182	0.248	0.2146	No
45	Apoe	3193	0.247	0.2194	No
46	Lpcat3	3517	0.221	0.1979	No
47	Dlat	3552	0.218	0.2001	No
48	Pgm1	3589	0.217	0.2021	No
49	Slc1a5	3632	0.214	0.2035	No
50	Acox1	3653	0.212	0.2067	No
51	Decr1	3721	0.206	0.2059	No
52	Col4a1	3833	0.196	0.2012	No
53	Qdpr	3852	0.195	0.2042	No
54	Slc19a1	4137	0.173	0.1848	No
55	Pdcd4	4166	0.170	0.1864	No
56	Stom	4167	0.170	0.1902	No
57	Phyh	4179	0.169	0.1932	No
58	Ucp2	4225	0.166	0.1932	No
59	Cox8a	4256	0.164	0.1945	No
60	Phldb1	4293	0.161	0.1952	No
61	Uqcr11	4368	0.154	0.1926	No
62	Rtn3	4426	0.150	0.1914	No
63	Esrra	4481	0.146	0.1903	No
64	Acaa2	4547	0.141	0.1881	No
65	Vegfb	4571	0.138	0.1894	No
66	Ccng2	4575	0.138	0.1923	No
67	Dgat1	4603	0.136	0.1931	No
68	Sdhc	4655	0.132	0.1919	No
69	Uqcrc1	4690	0.128	0.1921	No
70	Pfkfb3	4712	0.126	0.1932	No
71	Acadl	4761	0.123	0.1921	No
72	Nmt1	4765	0.123	0.1946	No
73	Ywhag	4829	0.119	0.1922	No
74	Cyp4b1	5025	0.110	0.1787	No
75	Esyt1	5113	0.104	0.1739	No
76	Angpt1	5139	0.102	0.1742	No
77	Gphn	5181	0.099	0.1730	No
78	Gbe1	5380	0.083	0.1587	No
79	G3bp2	5617	0.066	0.1408	No
80	Coq5	5910	0.046	0.1179	No
81	Adcy6	6003	0.039	0.1113	No
82	Dbt	6069	0.034	0.1067	No
83	Ubqln1	6174	0.026	0.0988	No
84	Aldoa	6191	0.025	0.0980	No
85	Itsn1	6206	0.024	0.0974	No
86	Ech1	6218	0.023	0.0970	No
87	Bckdha	6266	0.019	0.0936	No
88	Ghitm	6274	0.018	0.0935	No
89	Cyc1	6275	0.018	0.0939	No
90	Sqor	6291	0.017	0.0930	No
91	Ndufab1	6402	0.009	0.0842	No
92	Hibch	6425	0.007	0.0826	No
93	Tank	6491	0.002	0.0773	No
94	Slc27a1	6578	-0.001	0.0703	No
95	Idh1	6625	-0.004	0.0666	No
96	Sult1a1	6646	-0.005	0.0650	No
97	Pex14	6701	-0.009	0.0608	No
98	Nabp1	6918	-0.025	0.0437	No
99	Cdkn2c	6978	-0.029	0.0395	No
100	Baz2a	7037	-0.032	0.0355	No
101	Cat	7049	-0.033	0.0353	No
102	Coq9	7071	-0.034	0.0344	No
103	Atp1b3	7192	-0.044	0.0255	No
104	Nkiras1	7205	-0.045	0.0256	No
105	Dhrs7b	7211	-0.046	0.0262	No
106	Ddt	7249	-0.049	0.0243	No
107	Ptger3	7378	-0.061	0.0152	No
108	Cox6a1	7463	-0.067	0.0098	No
109	Coq3	7481	-0.068	0.0099	No
110	Suclg1	7485	-0.068	0.0112	No
111	Cd151	7549	-0.074	0.0077	No
112	Cavin2	7681	-0.084	-0.0011	No
113	Aplp2	7684	-0.084	0.0007	No
114	Dram2	7707	-0.086	0.0008	No
115	Aldh2	7761	-0.090	-0.0015	No
116	Slc5a6	7836	-0.096	-0.0054	No
117	Mtarc2	7978	-0.105	-0.0146	No
118	Sorbs1	8038	-0.109	-0.0169	No
119	Hadh	8053	-0.111	-0.0155	No
120	Aco2	8079	-0.113	-0.0150	No
121	Jagn1	8085	-0.113	-0.0129	No
122	Preb	8116	-0.115	-0.0127	No
123	Acly	8192	-0.121	-0.0162	No
124	Bcl6	8397	-0.138	-0.0297	No
125	Map4k3	8438	-0.142	-0.0298	No
126	Mdh2	8561	-0.152	-0.0364	No
127	Bcl2l13	8688	-0.161	-0.0430	No
128	Araf	8760	-0.163	-0.0451	No
129	Lpl	8817	-0.169	-0.0459	No
130	Lipe	8997	-0.186	-0.0564	No
131	Idh3g	9087	-0.192	-0.0593	No
132	Rmdn3	9215	-0.205	-0.0651	No
133	Pim3	9341	-0.215	-0.0704	No
134	Fzd4	9346	-0.215	-0.0659	No
135	Uqcr10	9440	-0.222	-0.0685	No
136	Agpat3	9554	-0.232	-0.0725	No
137	Por	9716	-0.248	-0.0800	No
138	Ndufa5	9860	-0.261	-0.0858	No
139	Acads	9891	-0.263	-0.0823	No
140	Me1	10001	-0.274	-0.0850	No
141	Mrpl15	10020	-0.275	-0.0803	No
142	Sdhb	10136	-0.287	-0.0832	No
143	Cmpk1	10156	-0.287	-0.0782	No
144	Mgll	10191	-0.290	-0.0744	No
145	Dhrs7	10226	-0.295	-0.0705	No
146	Scarb1	10291	-0.301	-0.0689	No
147	Gpd2	10381	-0.312	-0.0691	No
148	Pemt	10600	-0.334	-0.0794	No
149	Aifm1	10816	-0.362	-0.0888	No
150	Mtch2	10846	-0.366	-0.0829	No
151	Reep6	10886	-0.372	-0.0776	No
152	Mccc1	10918	-0.378	-0.0716	No
153	Mylk	10953	-0.382	-0.0657	No
154	Sod1	11016	-0.388	-0.0620	No
155	Elovl6	11149	-0.405	-0.0636	No
156	Uqcrq	11316	-0.428	-0.0675	No
157	Itih5	11398	-0.441	-0.0641	No
158	Gpx3	11515	-0.461	-0.0632	No
159	Gpx4	11529	-0.464	-0.0537	No
160	Stat5a	11564	-0.469	-0.0459	No
161	Dnajb9	11613	-0.479	-0.0389	No
162	Gpat4	11674	-0.491	-0.0327	No
163	Dhcr7	11782	-0.519	-0.0297	No
164	Rnf11	11797	-0.521	-0.0190	No
165	Slc25a10	11832	-0.530	-0.0097	No
166	Dnajc15	11836	-0.530	0.0020	No
167	Sspn	11909	-0.553	0.0087	No
168	Cd302	11917	-0.556	0.0207	No
169	Uck1	12196	-0.693	0.0137	No