Details for gene set HALLMARK_INTERFERON_GAMMA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	HSC.HSC_Pheno.cls#Group2_versus_Group3.HSC_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Phenotype	HSC_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_INTERFERON_GAMMA_RESPONSE
Enrichment Score (ES)	0.24319957
Normalized Enrichment Score (NES)	1.1244935
Nominal p-value	0.26262626
FDR q-value	0.4554842
FWER p-Value	0.983

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Txnip	71	0.904	0.0164	Yes
2	Il4ra	162	0.774	0.0280	Yes
3	Pim1	191	0.746	0.0440	Yes
4	Lysmd2	252	0.699	0.0562	Yes
5	Rnf213	288	0.675	0.0699	Yes
6	Ly6e	400	0.617	0.0759	Yes
7	Samhd1	448	0.601	0.0868	Yes
8	Oas3	524	0.573	0.0947	Yes
9	Casp3	729	0.512	0.0906	Yes
10	Fas	732	0.512	0.1030	Yes
11	Btg1	821	0.494	0.1079	Yes
12	Nampt	855	0.487	0.1171	Yes
13	Socs3	867	0.485	0.1281	Yes
14	Oas2	1102	0.440	0.1197	Yes
15	Xaf1	1123	0.436	0.1288	Yes
16	Cd74	1158	0.430	0.1366	Yes
17	Irf1	1170	0.427	0.1461	Yes
18	Ptpn6	1336	0.403	0.1425	Yes
19	Nfkbia	1383	0.397	0.1485	Yes
20	Nfkb1	1508	0.383	0.1477	Yes
21	Ube2l6	1534	0.380	0.1550	Yes
22	Arl4a	1560	0.377	0.1622	Yes
23	Selp	1645	0.366	0.1643	Yes
24	Rigi	1660	0.365	0.1721	Yes
25	Samd9l	1714	0.361	0.1766	Yes
26	Stat2	1741	0.359	0.1832	Yes
27	Ifih1	1793	0.353	0.1877	Yes
28	Pnp	1812	0.350	0.1948	Yes
29	Slc25a28	1831	0.348	0.2019	Yes
30	Herc6	1860	0.344	0.2081	Yes
31	Itgb7	1992	0.331	0.2055	Yes
32	Gch1	2022	0.328	0.2111	Yes
33	Oasl1	2124	0.315	0.2106	Yes
34	Zbp1	2136	0.314	0.2174	Yes
35	Sspn	2169	0.310	0.2224	Yes
36	Tor1b	2219	0.307	0.2259	Yes
37	Trim14	2401	0.284	0.2180	Yes
38	Upp1	2407	0.283	0.2245	Yes
39	Lgals3bp	2476	0.277	0.2258	Yes
40	Pde4b	2521	0.270	0.2288	Yes
41	Tdrd7	2615	0.261	0.2276	Yes
42	Tnfsf10	2739	0.250	0.2236	Yes
43	Cd38	2822	0.243	0.2228	Yes
44	Znfx1	2849	0.239	0.2266	Yes
45	Tnfaip2	2862	0.238	0.2314	Yes
46	Eif2ak2	2883	0.236	0.2356	Yes
47	Ifitm2	2947	0.230	0.2361	Yes
48	Il15	3037	0.221	0.2342	Yes
49	Nlrc5	3126	0.214	0.2322	Yes
50	B2m	3130	0.213	0.2372	Yes
51	Pnpt1	3144	0.211	0.2413	Yes
52	Cmpk2	3184	0.207	0.2432	Yes
53	Nmi	3279	0.198	0.2403	No
54	Il10ra	3310	0.194	0.2427	No
55	Ifitm3	3386	0.189	0.2412	No
56	Nup93	3572	0.175	0.2303	No
57	Psme2	3684	0.168	0.2253	No
58	St8sia4	3723	0.165	0.2263	No
59	Cd86	3903	0.152	0.2153	No
60	Mx2	3952	0.149	0.2151	No
61	Ifit2	3956	0.148	0.2184	No
62	Irf9	3965	0.148	0.2214	No
63	Parp12	3967	0.147	0.2249	No
64	Il18bp	4011	0.143	0.2249	No
65	Rsad2	4049	0.141	0.2254	No
66	Cmtr1	4055	0.141	0.2284	No
67	Lcp2	4105	0.137	0.2278	No
68	Pml	4286	0.122	0.2160	No
69	Nod1	4435	0.111	0.2066	No
70	Adar	4440	0.110	0.2090	No
71	Bank1	4469	0.110	0.2094	No
72	Psmb9	4517	0.109	0.2083	No
73	Ifi35	4629	0.100	0.2016	No
74	Stat1	4638	0.100	0.2034	No
75	Socs1	4645	0.099	0.2054	No
76	Dhx58	4681	0.097	0.2049	No
77	St3gal5	4749	0.091	0.2016	No
78	Epsti1	4815	0.086	0.1984	No
79	Hif1a	4836	0.084	0.1988	No
80	Rbck1	4950	0.077	0.1915	No
81	Il15ra	5041	0.069	0.1858	No
82	Arid5b	5099	0.064	0.1827	No
83	Ddx60	5123	0.062	0.1823	No
84	Parp14	5129	0.062	0.1834	No
85	Auts2	5223	0.056	0.1772	No
86	Ifi27	5314	0.050	0.1710	No
87	Trim26	5396	0.043	0.1655	No
88	Ptpn1	5503	0.035	0.1576	No
89	Myd88	5609	0.028	0.1497	No
90	P2ry14	5685	0.023	0.1441	No
91	Lap3	5967	0.004	0.1212	No
92	Fgl2	5972	0.004	0.1210	No
93	Ifi44	5982	0.003	0.1203	No
94	Trim25	6115	-0.002	0.1095	No
95	Bpgm	6166	-0.006	0.1056	No
96	Wars1	6244	-0.011	0.0996	No
97	Tapbp	6395	-0.021	0.0878	No
98	Helz2	6418	-0.023	0.0865	No
99	Ncoa3	6615	-0.037	0.0714	No
100	Vamp8	6725	-0.046	0.0636	No
101	Trim21	7108	-0.073	0.0341	No
102	Mvp	7387	-0.096	0.0137	No
103	H2-Aa	7388	-0.096	0.0160	No
104	Psmb10	7482	-0.104	0.0110	No
105	Isoc1	7582	-0.110	0.0056	No
106	Jak2	7588	-0.111	0.0079	No
107	Cd274	7606	-0.112	0.0092	No
108	H2-DMa	7660	-0.117	0.0078	No
109	Irf7	7671	-0.118	0.0099	No
110	Icam1	7761	-0.125	0.0056	No
111	Batf2	7840	-0.131	0.0025	No
112	Irf2	7874	-0.133	0.0030	No
113	Ripk2	8003	-0.144	-0.0039	No
114	Gbp3	8084	-0.150	-0.0068	No
115	Rtp4	8122	-0.153	-0.0061	No
116	Vamp5	8128	-0.154	-0.0027	No
117	Mthfd2	8260	-0.165	-0.0094	No
118	Il7	8377	-0.174	-0.0146	No
119	Plscr1	8378	-0.174	-0.0104	No
120	Peli1	8414	-0.176	-0.0089	No
121	Stat3	8420	-0.176	-0.0050	No
122	Sri	8553	-0.186	-0.0113	No
123	Psma3	8698	-0.195	-0.0183	No
124	Psma2	8714	-0.196	-0.0147	No
125	Sod2	8812	-0.205	-0.0176	No
126	Casp4	8899	-0.211	-0.0195	No
127	Isg20	9083	-0.226	-0.0290	No
128	Psmb2	9120	-0.229	-0.0263	No
129	Trafd1	9127	-0.229	-0.0212	No
130	Casp8	9174	-0.233	-0.0192	No
131	Tnfaip3	9668	-0.274	-0.0529	No
132	Casp7	9764	-0.284	-0.0537	No
133	Rapgef6	9914	-0.295	-0.0587	No
134	Ifnar2	10083	-0.308	-0.0649	No
135	Pfkp	10146	-0.314	-0.0622	No
136	Ripk1	10269	-0.324	-0.0643	No
137	Pla2g4a	10469	-0.344	-0.0722	No
138	Sppl2a	10585	-0.358	-0.0728	No
139	Psmb8	10656	-0.365	-0.0696	No
140	Irf8	10940	-0.406	-0.0828	No
141	Ptpn2	10994	-0.415	-0.0769	No
142	Eif4e3	11018	-0.418	-0.0686	No
143	Psme1	11394	-0.473	-0.0877	No
144	Rnf31	11495	-0.491	-0.0838	No
145	Stat4	11513	-0.495	-0.0731	No
146	Casp1	11652	-0.526	-0.0715	No
147	Lats2	11796	-0.564	-0.0694	No
148	Bst2	11805	-0.566	-0.0561	No
149	Irf5	11887	-0.596	-0.0481	No
150	Tap1	12036	-0.662	-0.0440	No
151	Ciita	12073	-0.676	-0.0304	No
152	Ogfr	12082	-0.679	-0.0144	No
153	Usp18	12097	-0.684	0.0012	No
154	Sp110	12283	-0.835	0.0066	No