Details for gene set HALLMARK_INFLAMMATORY

Table: GSEA Results Summary

Dataset	HSC.HSC_Pheno.cls#Group2_versus_Group3.HSC_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Phenotype	HSC_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_INFLAMMATORY_RESPONSE
Enrichment Score (ES)	0.30161294
Normalized Enrichment Score (NES)	1.2734797
Nominal p-value	0.104627766
FDR q-value	0.3660696
FWER p-Value	0.815

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Abca1	50	0.947	0.0279	Yes
2	Ifitm1	87	0.871	0.0543	Yes
3	Osmr	98	0.845	0.0820	Yes
4	Il4ra	162	0.774	0.1029	Yes
5	Mxd1	185	0.751	0.1265	Yes
6	Irak2	201	0.737	0.1501	Yes
7	Ly6e	400	0.617	0.1547	Yes
8	Itgb3	560	0.561	0.1607	Yes
9	Hbegf	652	0.533	0.1712	Yes
10	Cd82	673	0.529	0.1874	Yes
11	Pik3r5	851	0.488	0.1894	Yes
12	Nampt	855	0.487	0.2056	Yes
13	Tlr3	1024	0.454	0.2072	Yes
14	Irf1	1170	0.427	0.2098	Yes
15	Nfkbia	1383	0.397	0.2059	Yes
16	Slc31a2	1477	0.388	0.2114	Yes
17	Nfkb1	1508	0.383	0.2218	Yes
18	Tacr1	1566	0.377	0.2299	Yes
19	Il18r1	1708	0.361	0.2306	Yes
20	Kif1b	1745	0.359	0.2397	Yes
21	Ptger4	1895	0.341	0.2391	Yes
22	Plaur	1908	0.339	0.2495	Yes
23	Gch1	2022	0.328	0.2514	Yes
24	Abi1	2103	0.319	0.2556	Yes
25	Psen1	2277	0.300	0.2516	Yes
26	Adrm1	2392	0.285	0.2519	Yes
27	Pcdh7	2424	0.281	0.2589	Yes
28	Gpr183	2444	0.279	0.2667	Yes
29	Emp3	2457	0.278	0.2751	Yes
30	Tnfrsf1b	2506	0.272	0.2804	Yes
31	Axl	2519	0.270	0.2885	Yes
32	Pde4b	2521	0.270	0.2975	Yes
33	Ebi3	2616	0.261	0.2987	Yes
34	Tnfsf10	2739	0.250	0.2971	Yes
35	Scarf1	2832	0.241	0.2978	Yes
36	Eif2ak2	2883	0.236	0.3016	Yes
37	Il15	3037	0.221	0.2966	No
38	Ptafr	3261	0.200	0.2851	No
39	Nmi	3279	0.198	0.2904	No
40	Il10ra	3310	0.194	0.2945	No
41	Rhog	3477	0.182	0.2871	No
42	Chst2	3538	0.177	0.2882	No
43	Rela	3629	0.174	0.2867	No
44	Klf6	3650	0.173	0.2909	No
45	Inhba	3930	0.150	0.2732	No
46	Lcp2	4105	0.137	0.2636	No
47	Ifnar1	4287	0.122	0.2529	No
48	Rgs1	4418	0.112	0.2461	No
49	Sema4d	4424	0.112	0.2495	No
50	Slamf1	4573	0.104	0.2409	No
51	Il18	4716	0.094	0.2325	No
52	Rnf144b	4799	0.087	0.2288	No
53	Hif1a	4836	0.084	0.2287	No
54	Acvr1b	4871	0.081	0.2286	No
55	Atp2c1	4908	0.079	0.2284	No
56	Mmp14	4916	0.078	0.2304	No
57	Il15ra	5041	0.069	0.2227	No
58	Csf1	5382	0.044	0.1964	No
59	Met	5620	0.027	0.1780	No
60	Slc31a1	5879	0.010	0.1573	No
61	Ccrl2	6038	0.000	0.1444	No
62	Slc7a1	6272	-0.013	0.1258	No
63	Ptpre	6291	-0.014	0.1248	No
64	Icosl	6302	-0.015	0.1245	No
65	Il18rap	6335	-0.017	0.1225	No
66	Tapbp	6395	-0.021	0.1184	No
67	Atp2a2	6401	-0.021	0.1187	No
68	Ahr	6567	-0.034	0.1064	No
69	Slc28a2	6613	-0.037	0.1040	No
70	Itga5	6986	-0.064	0.0758	No
71	P2rx4	7014	-0.066	0.0758	No
72	Csf3r	7090	-0.071	0.0721	No
73	Gabbr1	7393	-0.096	0.0507	No
74	Tlr2	7441	-0.100	0.0502	No
75	Irf7	7671	-0.118	0.0355	No
76	Icam1	7761	-0.125	0.0325	No
77	Gpr132	7801	-0.128	0.0336	No
78	Ripk2	8003	-0.144	0.0221	No
79	Gnai3	8066	-0.149	0.0220	No
80	Rtp4	8122	-0.153	0.0227	No
81	Atp2b1	8336	-0.170	0.0111	No
82	Dcbld2	8364	-0.173	0.0147	No
83	Gna15	8371	-0.173	0.0200	No
84	Sri	8553	-0.186	0.0115	No
85	Myc	8610	-0.191	0.0134	No
86	Acvr2a	8938	-0.213	-0.0061	No
87	Nod2	8945	-0.213	0.0006	No
88	P2ry2	9164	-0.232	-0.0093	No
89	Selenos	9235	-0.238	-0.0070	No
90	Lyn	9410	-0.251	-0.0127	No
91	Cx3cl1	9688	-0.276	-0.0260	No
92	Lck	9745	-0.281	-0.0211	No
93	Pvr	9976	-0.298	-0.0298	No
94	Sell	10039	-0.305	-0.0246	No
95	Gpc3	10282	-0.325	-0.0334	No
96	Fzd5	10331	-0.329	-0.0262	No
97	Ldlr	10478	-0.346	-0.0265	No
98	Il1r1	10562	-0.355	-0.0213	No
99	Calcrl	10665	-0.367	-0.0172	No
100	Aqp9	10734	-0.375	-0.0101	No
101	Lpar1	11326	-0.462	-0.0428	No
102	Bst2	11805	-0.566	-0.0627	No
103	P2rx7	11827	-0.573	-0.0451	No
104	Ifngr2	12120	-0.699	-0.0453	No
105	Raf1	12131	-0.707	-0.0223	No
106	Slc11a2	12357	-1.220	0.0005	No