Details for gene set HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	HSC.HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group4.HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group4_repos
Phenotype	HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group4_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA_NFKB
Enrichment Score (ES)	0.30516717
Normalized Enrichment Score (NES)	1.3006854
Nominal p-value	0.13052209
FDR q-value	0.54991317
FWER p-Value	0.776

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Dusp4	39	1.157	0.0295	Yes
2	Ehd1	312	0.756	0.0286	Yes
3	Plk2	450	0.681	0.0367	Yes
4	Btg3	537	0.650	0.0480	Yes
5	Ier5	676	0.605	0.0538	Yes
6	Fosb	694	0.600	0.0694	Yes
7	Trib1	888	0.555	0.0693	Yes
8	Mcl1	933	0.546	0.0811	Yes
9	Nr4a1	953	0.541	0.0949	Yes
10	Gadd45b	967	0.540	0.1090	Yes
11	Sdc4	1000	0.534	0.1215	Yes
12	Dusp2	1084	0.517	0.1293	Yes
13	Per1	1169	0.501	0.1366	Yes
14	Jag1	1339	0.470	0.1361	Yes
15	Pde4b	1341	0.469	0.1492	Yes
16	Snn	1365	0.465	0.1605	Yes
17	Ppp1r15a	1432	0.454	0.1679	Yes
18	Dnajb4	1468	0.450	0.1778	Yes
19	Nr4a2	1513	0.444	0.1867	Yes
20	Zc3h12a	1600	0.431	0.1919	Yes
21	Fut4	1685	0.421	0.1969	Yes
22	Map3k8	1831	0.404	0.1965	Yes
23	Dram1	1851	0.402	0.2063	Yes
24	Socs3	1861	0.401	0.2169	Yes
25	Rhob	1879	0.400	0.2268	Yes
26	Tlr2	1899	0.397	0.2365	Yes
27	Kdm6b	1940	0.394	0.2443	Yes
28	Egr1	1969	0.389	0.2530	Yes
29	Clcf1	2070	0.378	0.2555	Yes
30	Smad3	2328	0.349	0.2444	Yes
31	Trip10	2333	0.348	0.2539	Yes
32	Nfkb2	2448	0.336	0.2541	Yes
33	Maff	2473	0.333	0.2615	Yes
34	Ifngr2	2491	0.331	0.2695	Yes
35	Nfkb1	2500	0.330	0.2782	Yes
36	Fosl2	2530	0.326	0.2850	Yes
37	Ccnd1	2615	0.318	0.2871	Yes
38	Zfp36	2690	0.311	0.2899	Yes
39	Myc	2754	0.303	0.2933	Yes
40	Il18	2805	0.298	0.2976	Yes
41	Pdlim5	2816	0.297	0.3052	Yes
42	Dusp1	3054	0.273	0.2935	No
43	Litaf	3130	0.265	0.2949	No
44	Birc3	3421	0.242	0.2780	No
45	Bcl3	3533	0.232	0.2755	No
46	Eif1	3686	0.221	0.2693	No
47	Nfe2l2	3775	0.213	0.2681	No
48	Abca1	3828	0.210	0.2698	No
49	Cebpd	3834	0.209	0.2753	No
50	Ier3	3911	0.204	0.2748	No
51	Gpr183	4058	0.193	0.2683	No
52	Tank	4372	0.166	0.2474	No
53	Plaur	4379	0.165	0.2516	No
54	Relb	4455	0.161	0.2500	No
55	Plek	4497	0.158	0.2511	No
56	Tnip1	4769	0.138	0.2329	No
57	Ifih1	4790	0.136	0.2351	No
58	Tgif1	4906	0.126	0.2292	No
59	B4galt5	5049	0.116	0.2209	No
60	Serpinb8	5107	0.112	0.2194	No
61	Irs2	5114	0.112	0.2220	No
62	Ccnl1	5137	0.109	0.2233	No
63	Lamb3	5292	0.098	0.2135	No
64	Btg1	5303	0.097	0.2154	No
65	Rel	5388	0.091	0.2111	No
66	Nfkbie	5434	0.088	0.2099	No
67	Plpp3	5528	0.080	0.2046	No
68	Jun	5539	0.079	0.2060	No
69	B4galt1	5573	0.077	0.2054	No
70	Il6st	5690	0.069	0.1979	No
71	Map2k3	5898	0.055	0.1825	No
72	Rcan1	6034	0.043	0.1727	No
73	Irf1	6146	0.036	0.1647	No
74	Pnrc1	6269	0.029	0.1555	No
75	Klf2	6284	0.028	0.1552	No
76	Rigi	6294	0.028	0.1552	No
77	Icosl	6573	0.008	0.1327	No
78	Klf4	6716	0.000	0.1211	No
79	Ninj1	6787	-0.002	0.1154	No
80	Ldlr	6895	-0.009	0.1069	No
81	Cflar	6969	-0.014	0.1014	No
82	Gem	7029	-0.018	0.0971	No
83	Junb	7041	-0.019	0.0967	No
84	Rela	7113	-0.024	0.0916	No
85	Zbtb10	7163	-0.027	0.0883	No
86	Sat1	7257	-0.034	0.0817	No
87	Icam1	7262	-0.035	0.0824	No
88	Nampt	7416	-0.046	0.0711	No
89	Gch1	7420	-0.046	0.0722	No
90	Ptpre	7470	-0.050	0.0696	No
91	Rnf19b	7588	-0.058	0.0617	No
92	Bcl6	7648	-0.062	0.0586	No
93	Fos	7915	-0.082	0.0391	No
94	Nfkbia	7948	-0.084	0.0389	No
95	Ier2	7952	-0.084	0.0410	No
96	Hbegf	8013	-0.090	0.0387	No
97	Atp2b1	8075	-0.095	0.0364	No
98	Pmepa1	8091	-0.096	0.0379	No
99	Ccrl2	8268	-0.108	0.0265	No
100	Dennd5a	8299	-0.111	0.0272	No
101	Tnfaip8	8337	-0.114	0.0274	No
102	Kynu	8381	-0.117	0.0271	No
103	Tiparp	8587	-0.132	0.0141	No
104	Klf10	8689	-0.138	0.0098	No
105	Traf1	8751	-0.143	0.0088	No
106	Slc16a6	8781	-0.144	0.0105	No
107	Pfkfb3	8782	-0.144	0.0146	No
108	Birc2	8992	-0.162	0.0021	No
109	Panx1	9020	-0.164	0.0045	No
110	Bhlhe40	9026	-0.165	0.0088	No
111	Marcks	9287	-0.187	-0.0072	No
112	Tsc22d1	9334	-0.189	-0.0056	No
113	Klf6	9348	-0.190	-0.0013	No
114	Tnfaip3	9424	-0.197	-0.0019	No
115	Tnfaip2	9652	-0.214	-0.0144	No
116	Yrdc	9751	-0.222	-0.0162	No
117	Sqstm1	10179	-0.262	-0.0437	No
118	Efna1	10188	-0.263	-0.0369	No
119	Ripk2	10202	-0.265	-0.0305	No
120	Slc2a3	10437	-0.287	-0.0415	No
121	Ets2	10498	-0.291	-0.0382	No
122	Inhba	10556	-0.298	-0.0344	No
123	Csf1	10612	-0.305	-0.0303	No
124	Dusp5	10687	-0.313	-0.0275	No
125	Klf9	10841	-0.329	-0.0307	No
126	Gfpt2	10970	-0.346	-0.0314	No
127	Mxd1	11057	-0.358	-0.0283	No
128	Sod2	11116	-0.363	-0.0228	No
129	Il15ra	11253	-0.382	-0.0231	No
130	Ptger4	11380	-0.401	-0.0221	No
131	Tnip2	11544	-0.430	-0.0232	No
132	Vegfa	11626	-0.448	-0.0172	No
133	Ifit2	11696	-0.463	-0.0098	No
134	Tap1	11800	-0.485	-0.0045	No
135	Nfat5	11950	-0.527	-0.0018	No
136	Cd44	11972	-0.534	0.0116	No
137	Stat5a	12251	-0.718	0.0092	No