Details for gene set HALLMARK_G2M

Table: GSEA Results Summary

Dataset	HSC.HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group4.HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group4_repos
Phenotype	HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group4_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_G2M_CHECKPOINT
Enrichment Score (ES)	0.33316395
Normalized Enrichment Score (NES)	1.119613
Nominal p-value	0.2919132
FDR q-value	0.5607022
FWER p-Value	0.967

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Smc1a	23	1.295	0.0242	Yes
2	Pds5b	121	0.941	0.0351	Yes
3	Tra2b	302	0.760	0.0357	Yes
4	Hnrnpd	387	0.713	0.0431	Yes
5	Cdkn1b	569	0.638	0.0411	Yes
6	Kif23	613	0.624	0.0501	Yes
7	Upf1	626	0.619	0.0616	Yes
8	Cdc20	637	0.616	0.0732	Yes
9	Egf	669	0.606	0.0828	Yes
10	Pttg1	711	0.595	0.0914	Yes
11	Nup98	717	0.593	0.1030	Yes
12	Racgap1	718	0.592	0.1149	Yes
13	Tgfb1	781	0.575	0.1214	Yes
14	Stil	815	0.567	0.1301	Yes
15	Hnrnpu	816	0.567	0.1415	Yes
16	Tacc3	842	0.563	0.1508	Yes
17	Ube2s	870	0.559	0.1598	Yes
18	Slc12a2	945	0.543	0.1647	Yes
19	Hmmr	962	0.540	0.1742	Yes
20	Rpa2	964	0.540	0.1850	Yes
21	E2f3	997	0.534	0.1931	Yes
22	Fbxo5	1011	0.532	0.2028	Yes
23	Ttk	1018	0.531	0.2129	Yes
24	Orc5	1080	0.517	0.2183	Yes
25	Hus1	1143	0.506	0.2234	Yes
26	Ctcf	1239	0.486	0.2254	Yes
27	Foxn3	1298	0.477	0.2302	Yes
28	Cdk1	1303	0.476	0.2395	Yes
29	Mtf2	1356	0.467	0.2446	Yes
30	Bub1	1436	0.454	0.2473	Yes
31	Cdc45	1464	0.451	0.2541	Yes
32	Top2a	1544	0.438	0.2565	Yes
33	Sfpq	1588	0.433	0.2616	Yes
34	Kif4	1769	0.412	0.2552	Yes
35	Nasp	2150	0.369	0.2314	Yes
36	Rad54l	2164	0.367	0.2377	Yes
37	Odc1	2172	0.366	0.2445	Yes
38	Mki67	2269	0.355	0.2438	Yes
39	E2f2	2305	0.350	0.2480	Yes
40	Map3k20	2306	0.350	0.2550	Yes
41	Smad3	2328	0.349	0.2603	Yes
42	Syncrip	2504	0.329	0.2526	Yes
43	Smc4	2516	0.328	0.2583	Yes
44	Srsf2	2572	0.323	0.2602	Yes
45	Cenpf	2603	0.320	0.2642	Yes
46	Ccnd1	2615	0.318	0.2697	Yes
47	Dkc1	2650	0.315	0.2733	Yes
48	Cul3	2740	0.305	0.2721	Yes
49	Myc	2754	0.303	0.2771	Yes
50	Meis1	2776	0.300	0.2814	Yes
51	Nup50	2827	0.296	0.2833	Yes
52	Mcm6	2830	0.296	0.2891	Yes
53	Smc2	2840	0.294	0.2942	Yes
54	Mapk14	2871	0.292	0.2976	Yes
55	Tle3	2873	0.292	0.3034	Yes
56	H2az2	2934	0.287	0.3043	Yes
57	Ddx39a	2944	0.286	0.3093	Yes
58	Katna1	2947	0.286	0.3149	Yes
59	Dbf4	2971	0.282	0.3187	Yes
60	Cdc27	3061	0.273	0.3168	Yes
61	Cks2	3089	0.270	0.3200	Yes
62	Cdc7	3132	0.265	0.3219	Yes
63	Birc5	3177	0.261	0.3236	Yes
64	Dr1	3201	0.259	0.3269	Yes
65	Smarcc1	3335	0.248	0.3210	Yes
66	Prc1	3488	0.235	0.3132	Yes
67	Hmgb3	3495	0.234	0.3174	Yes
68	Ccnb2	3510	0.233	0.3210	Yes
69	Bcl3	3533	0.232	0.3238	Yes
70	Ndc80	3576	0.227	0.3250	Yes
71	Srsf1	3582	0.226	0.3291	Yes
72	Tnpo2	3589	0.226	0.3332	Yes
73	Bub3	3677	0.222	0.3305	No
74	Cdc25a	3787	0.212	0.3258	No
75	Ewsr1	3853	0.209	0.3247	No
76	Atrx	3969	0.200	0.3193	No
77	Nsd2	4004	0.197	0.3205	No
78	Cenpe	4046	0.194	0.3210	No
79	Chek1	4075	0.192	0.3225	No
80	Pola2	4081	0.191	0.3260	No
81	Rad23b	4328	0.169	0.3092	No
82	Prim2	4336	0.169	0.3120	No
83	Lig3	4355	0.167	0.3139	No
84	Kif11	4386	0.165	0.3148	No
85	Knl1	4432	0.162	0.3143	No
86	Top1	4458	0.160	0.3155	No
87	Hira	4552	0.154	0.3110	No
88	Kif15	4640	0.147	0.3068	No
89	Rad21	4730	0.140	0.3023	No
90	Incenp	4781	0.137	0.3009	No
91	Hif1a	4872	0.128	0.2961	No
92	Ilf3	4974	0.120	0.2902	No
93	Nusap1	5003	0.118	0.2903	No
94	H2az1	5025	0.117	0.2910	No
95	Ythdc1	5026	0.117	0.2933	No
96	Lbr	5195	0.104	0.2816	No
97	Slc38a1	5213	0.103	0.2823	No
98	Amd1	5225	0.102	0.2834	No
99	Mcm2	5324	0.096	0.2773	No
100	Numa1	5351	0.094	0.2771	No
101	Kpnb1	5368	0.092	0.2776	No
102	Cdkn2c	5421	0.088	0.2751	No
103	Abl1	5490	0.083	0.2712	No
104	Atf5	5492	0.083	0.2728	No
105	Mad2l1	5625	0.073	0.2634	No
106	Ncl	5695	0.069	0.2591	No
107	Mcm5	5822	0.060	0.2500	No
108	Rasal2	5942	0.052	0.2413	No
109	Ube2c	6061	0.041	0.2324	No
110	Cul1	6226	0.031	0.2196	No
111	Mnat1	6242	0.031	0.2190	No
112	Slc7a5	6254	0.030	0.2187	No
113	Suv39h1	6276	0.029	0.2175	No
114	Plk4	6278	0.029	0.2180	No
115	Stag1	6300	0.027	0.2169	No
116	Stmn1	6313	0.026	0.2164	No
117	Nolc1	6567	0.008	0.1958	No
118	Pura	6571	0.008	0.1957	No
119	Mcm3	6703	0.001	0.1850	No
120	Hspa8	6755	-0.000	0.1808	No
121	Fancc	6811	-0.004	0.1764	No
122	Odf2	6865	-0.007	0.1722	No
123	Notch2	7015	-0.017	0.1603	No
124	Ccna2	7267	-0.035	0.1404	No
125	Kif20b	7432	-0.047	0.1279	No
126	Prpf4b	7564	-0.057	0.1183	No
127	Gspt1	7589	-0.058	0.1175	No
128	Orc6	7638	-0.061	0.1147	No
129	Dtymk	7760	-0.071	0.1062	No
130	Rps6ka5	7765	-0.071	0.1073	No
131	Kif5b	7799	-0.074	0.1061	No
132	Pole	7835	-0.076	0.1048	No
133	Dmd	7864	-0.078	0.1041	No
134	Brca2	8210	-0.104	0.0778	No
135	Traip	8223	-0.105	0.0790	No
136	Xpo1	8234	-0.105	0.0802	No
137	Prmt5	8300	-0.111	0.0771	No
138	Tpx2	8417	-0.119	0.0700	No
139	Polq	8497	-0.125	0.0661	No
140	Jpt1	8500	-0.126	0.0684	No
141	Cbx1	8501	-0.126	0.0710	No
142	Pafah1b1	8524	-0.128	0.0717	No
143	Srsf10	8566	-0.131	0.0710	No
144	Lmnb1	8740	-0.142	0.0597	No
145	Sap30	8942	-0.158	0.0463	No
146	Wrn	8946	-0.158	0.0493	No
147	Ss18	8948	-0.158	0.0524	No
148	G3bp1	8962	-0.159	0.0545	No
149	Exo1	8964	-0.160	0.0576	No
150	Mybl2	9107	-0.171	0.0494	No
151	Tmpo	9158	-0.176	0.0489	No
152	Meis2	9182	-0.178	0.0505	No
153	Bard1	9212	-0.180	0.0518	No
154	Marcks	9287	-0.187	0.0495	No
155	Aurka	9338	-0.189	0.0492	No
156	Chaf1a	9430	-0.197	0.0457	No
157	Slc7a1	9543	-0.206	0.0406	No
158	Tfdp1	9608	-0.211	0.0396	No
159	Uck2	9659	-0.215	0.0398	No
160	E2f4	9680	-0.216	0.0425	No
161	Cul4a	9726	-0.220	0.0433	No
162	Ccnt1	9793	-0.226	0.0424	No
163	Cul5	9861	-0.232	0.0416	No
164	Arid4a	10055	-0.252	0.0308	No
165	Ezh2	10181	-0.262	0.0258	No
166	Snrpd1	10271	-0.271	0.0240	No
167	Rbl1	10418	-0.285	0.0177	No
168	Cdc25b	10553	-0.298	0.0127	No
169	Kmt5a	10842	-0.329	-0.0043	No
170	Casp8ap2	10935	-0.341	-0.0050	No
171	Ccnf	11032	-0.354	-0.0057	No
172	Gins2	11090	-0.360	-0.0032	No
173	Sqle	11110	-0.362	0.0026	No
174	Tent4a	11249	-0.382	-0.0011	No
175	Cdc6	11407	-0.407	-0.0058	No
176	E2f1	11698	-0.463	-0.0203	No
177	Cenpa	11958	-0.530	-0.0308	No
178	H2ax	12003	-0.544	-0.0235	No
179	Cdk4	12274	-0.745	-0.0307	No
180	Pml	12344	-0.937	-0.0175	No
181	Chmp1a	12346	-0.942	0.0014	No