Details for gene set HALLMARK_E2F

Table: GSEA Results Summary

Dataset	HSC.HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group4.HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group4_repos
Phenotype	HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group4_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_E2F_TARGETS
Enrichment Score (ES)	0.3230707
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0453326
Nominal p-value	0.39285713
FDR q-value	0.61399376
FWER p-Value	0.999

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Smc1a	23	1.295	0.0247	Yes
2	Pds5b	121	0.941	0.0361	Yes
3	Xrcc6	125	0.931	0.0550	Yes
4	Rad1	130	0.923	0.0737	Yes
5	Pms2	237	0.799	0.0814	Yes
6	Mlh1	295	0.767	0.0925	Yes
7	Tra2b	302	0.760	0.1076	Yes
8	Mthfd2	354	0.733	0.1185	Yes
9	Hnrnpd	387	0.713	0.1306	Yes
10	Shmt1	411	0.700	0.1431	Yes
11	Cdkn1b	569	0.638	0.1433	Yes
12	Cdc20	637	0.616	0.1505	Yes
13	Rnaseh2a	647	0.613	0.1624	Yes
14	Pttg1	711	0.595	0.1694	Yes
15	Racgap1	718	0.592	0.1811	Yes
16	Tacc3	842	0.563	0.1826	Yes
17	Ube2s	870	0.559	0.1919	Yes
18	Hmmr	962	0.540	0.1955	Yes
19	Rpa2	964	0.540	0.2066	Yes
20	Spc25	1006	0.533	0.2141	Yes
21	Ak2	1100	0.515	0.2171	Yes
22	Hus1	1143	0.506	0.2241	Yes
23	Ctcf	1239	0.486	0.2263	Yes
24	Ipo7	1289	0.479	0.2321	Yes
25	Cdk1	1303	0.476	0.2408	Yes
26	Pcna	1450	0.452	0.2381	Yes
27	Gins4	1490	0.446	0.2441	Yes
28	Bub1b	1537	0.439	0.2494	Yes
29	Top2a	1544	0.438	0.2579	Yes
30	Nop56	1591	0.432	0.2630	Yes
31	Smc3	1715	0.417	0.2615	Yes
32	Depdc1a	1741	0.415	0.2680	Yes
33	Kif4	1769	0.412	0.2742	Yes
34	Spag5	1845	0.403	0.2763	Yes
35	Kif18b	1999	0.385	0.2717	Yes
36	Rrm2	2057	0.380	0.2748	Yes
37	Hmgb2	2128	0.372	0.2767	Yes
38	Nasp	2150	0.369	0.2826	Yes
39	Exosc8	2174	0.366	0.2883	Yes
40	Mki67	2269	0.355	0.2878	Yes
41	Ssrp1	2323	0.349	0.2907	Yes
42	Rfc3	2477	0.332	0.2849	Yes
43	Syncrip	2504	0.329	0.2896	Yes
44	Smc4	2516	0.328	0.2954	Yes
45	Rfc1	2571	0.323	0.2976	Yes
46	Srsf2	2572	0.323	0.3043	Yes
47	Slbp	2605	0.320	0.3082	Yes
48	Myc	2754	0.303	0.3023	Yes
49	Paics	2821	0.296	0.3030	Yes
50	Mcm6	2830	0.296	0.3084	Yes
51	Lig1	2837	0.295	0.3140	Yes
52	Nup107	2942	0.286	0.3113	Yes
53	Pa2g4	2943	0.286	0.3172	Yes
54	Ddx39a	2944	0.286	0.3231	Yes
55	Wee1	3050	0.273	0.3201	No
56	Cks2	3089	0.270	0.3225	No
57	Birc5	3177	0.261	0.3207	No
58	Ran	3307	0.251	0.3153	No
59	Tfrc	3433	0.241	0.3100	No
60	Hmgb3	3495	0.234	0.3098	No
61	Ccnb2	3510	0.233	0.3134	No
62	Srsf1	3582	0.226	0.3123	No
63	Psmc3ip	3633	0.224	0.3128	No
64	Chek2	3682	0.222	0.3134	No
65	Cdc25a	3787	0.212	0.3092	No
66	Mre11a	3863	0.208	0.3073	No
67	Dek	3963	0.201	0.3033	No
68	Cenpe	4046	0.194	0.3006	No
69	Chek1	4075	0.192	0.3022	No
70	Pola2	4081	0.191	0.3057	No
71	Cbx5	4133	0.186	0.3054	No
72	Tk1	4141	0.185	0.3086	No
73	Msh2	4320	0.170	0.2975	No
74	Prim2	4336	0.169	0.2997	No
75	Dut	4450	0.161	0.2938	No
76	Cit	4524	0.156	0.2910	No
77	Rad21	4730	0.140	0.2770	No
78	Usp1	4738	0.139	0.2793	No
79	Brms1l	4741	0.139	0.2820	No
80	Rbbp7	4773	0.137	0.2823	No
81	Rad51ap1	4913	0.126	0.2735	No
82	Ilf3	4974	0.120	0.2710	No
83	Cdca8	4986	0.120	0.2726	No
84	H2az1	5025	0.117	0.2719	No
85	Ing3	5073	0.114	0.2704	No
86	Ncapd2	5084	0.113	0.2719	No
87	Cse1l	5088	0.113	0.2740	No
88	Lbr	5195	0.104	0.2674	No
89	Mcm2	5324	0.096	0.2589	No
90	Rpa3	5386	0.091	0.2557	No
91	Cdkn2c	5421	0.088	0.2548	No
92	Mms22l	5557	0.078	0.2453	No
93	Prkdc	5600	0.075	0.2434	No
94	Mad2l1	5625	0.073	0.2429	No
95	Donson	5681	0.070	0.2398	No
96	Dnmt1	5773	0.064	0.2337	No
97	Mcm5	5822	0.060	0.2310	No
98	Prps1	5825	0.060	0.2320	No
99	Gins3	5938	0.052	0.2239	No
100	Nbn	5960	0.050	0.2232	No
101	Dclre1b	5981	0.048	0.2226	No
102	Zw10	6059	0.042	0.2171	No
103	Tubb5	6167	0.035	0.2090	No
104	Gins1	6232	0.031	0.2044	No
105	Eed	6247	0.031	0.2039	No
106	Suv39h1	6276	0.029	0.2022	No
107	Plk4	6278	0.029	0.2027	No
108	Stag1	6300	0.027	0.2015	No
109	Stmn1	6313	0.026	0.2011	No
110	Atad2	6474	0.015	0.1883	No
111	Rpa1	6484	0.015	0.1878	No
112	Nolc1	6567	0.008	0.1813	No
113	Dlgap5	6649	0.004	0.1747	No
114	Ube2t	6660	0.003	0.1740	No
115	Cenpm	6673	0.003	0.1730	No
116	Mcm3	6703	0.001	0.1707	No
117	Nap1l1	6796	-0.003	0.1632	No
118	Rad50	6808	-0.004	0.1624	No
119	Timeless	6845	-0.006	0.1595	No
120	Pnn	6860	-0.007	0.1585	No
121	Tubg1	7300	-0.037	0.1232	No
122	Mcm7	7415	-0.046	0.1148	No
123	Trip13	7463	-0.049	0.1120	No
124	E2f8	7526	-0.053	0.1080	No
125	Gspt1	7589	-0.058	0.1041	No
126	Orc6	7638	-0.061	0.1014	No
127	Trp53	7685	-0.065	0.0990	No
128	Diaph3	7757	-0.071	0.0946	No
129	Mcm4	7807	-0.075	0.0921	No
130	Pole	7835	-0.076	0.0915	No
131	Tbrg4	7980	-0.086	0.0814	No
132	Pold2	8010	-0.090	0.0809	No
133	Hells	8083	-0.095	0.0769	No
134	Brca2	8210	-0.104	0.0687	No
135	Xpo1	8234	-0.105	0.0690	No
136	Ccp110	8240	-0.106	0.0708	No
137	Lsm8	8361	-0.115	0.0633	No
138	Dck	8476	-0.123	0.0565	No
139	Ppm1d	8499	-0.126	0.0573	No
140	Jpt1	8500	-0.126	0.0598	No
141	Luc7l3	8511	-0.127	0.0616	No
142	Rfc2	8549	-0.130	0.0613	No
143	Tipin	8599	-0.132	0.0600	No
144	Lmnb1	8740	-0.142	0.0514	No
145	Mybl2	9107	-0.171	0.0249	No
146	Tmpo	9158	-0.176	0.0244	No
147	Pan2	9172	-0.177	0.0270	No
148	Bard1	9212	-0.180	0.0275	No
149	Ranbp1	9293	-0.188	0.0248	No
150	Aurka	9338	-0.189	0.0250	No
151	Psip1	9404	-0.195	0.0237	No
152	Orc2	9449	-0.199	0.0242	No
153	Ubr7	9482	-0.201	0.0257	No
154	Ppp1r8	9645	-0.213	0.0168	No
155	Anp32e	9866	-0.233	0.0035	No
156	Nup205	9926	-0.239	0.0036	No
157	Snrpb	10139	-0.259	-0.0085	No
158	Ezh2	10181	-0.262	-0.0064	No
159	Eif2s1	10352	-0.279	-0.0146	No
160	Lyar	10421	-0.285	-0.0144	No
161	Pole4	10450	-0.287	-0.0107	No
162	Cdc25b	10553	-0.298	-0.0130	No
163	Nudt21	10956	-0.343	-0.0389	No
164	Nme1	11014	-0.352	-0.0364	No
165	Pold3	11127	-0.364	-0.0381	No
166	Prdx4	11156	-0.368	-0.0328	No
167	Nup153	11221	-0.377	-0.0303	No
168	Asf1a	11414	-0.408	-0.0377	No
169	Phf5a	11510	-0.425	-0.0367	No
170	Dscc1	11534	-0.429	-0.0298	No
171	Wdr90	11618	-0.447	-0.0274	No
172	Dctpp1	11683	-0.460	-0.0232	No
173	Pold1	11757	-0.476	-0.0194	No
174	Cnot9	11852	-0.496	-0.0169	No
175	Ccne1	11862	-0.498	-0.0074	No
176	Brca1	11935	-0.521	-0.0026	No
177	Smc6	11963	-0.532	0.0062	No
178	H2ax	12003	-0.544	0.0141	No
179	Cdk4	12274	-0.745	0.0073	No