Details for gene set HALLMARK_DNA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	HSC.HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group4.HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group4_repos
Phenotype	HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group4_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_DNA_REPAIR
Enrichment Score (ES)	0.26553467
Normalized Enrichment Score (NES)	1.2165718
Nominal p-value	0.1375
FDR q-value	0.48274562
FWER p-Value	0.897

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Polr3gl	86	1.007	0.0187	Yes
2	Brf2	211	0.825	0.0296	Yes
3	Ercc4	243	0.796	0.0474	Yes
4	Taf1c	244	0.795	0.0677	Yes
5	Gtf2a2	513	0.655	0.0625	Yes
6	Rfc4	548	0.645	0.0762	Yes
7	Umps	562	0.640	0.0915	Yes
8	Pom121	819	0.567	0.0850	Yes
9	Taf10	954	0.541	0.0879	Yes
10	Rpa2	964	0.540	0.1010	Yes
11	Tyms	1030	0.528	0.1091	Yes
12	Smad5	1262	0.483	0.1025	Yes
13	Hcls1	1323	0.473	0.1097	Yes
14	Pde4b	1341	0.469	0.1203	Yes
15	Taf9	1371	0.465	0.1298	Yes
16	Eloa	1413	0.459	0.1382	Yes
17	Taf6	1420	0.457	0.1494	Yes
18	Pcna	1450	0.452	0.1585	Yes
19	Bcam	1530	0.440	0.1633	Yes
20	Vps37b	1614	0.429	0.1675	Yes
21	Zfp707	1626	0.428	0.1775	Yes
22	Gtf3c5	1667	0.423	0.1851	Yes
23	Tk2	1677	0.422	0.1951	Yes
24	Polr2a	1719	0.417	0.2024	Yes
25	Zwint	1837	0.403	0.2031	Yes
26	Ddb2	1868	0.401	0.2109	Yes
27	Pold4	1926	0.396	0.2164	Yes
28	Sec61a1	1943	0.393	0.2251	Yes
29	Rnmt	1993	0.386	0.2309	Yes
30	Polr1h	2002	0.385	0.2401	Yes
31	Srsf6	2167	0.367	0.2361	Yes
32	Tsg101	2171	0.366	0.2452	Yes
33	Nelfb	2287	0.352	0.2448	Yes
34	Ssrp1	2323	0.349	0.2508	Yes
35	Rfc3	2477	0.332	0.2468	Yes
36	Ercc1	2599	0.320	0.2451	Yes
37	Gtf2h1	2702	0.310	0.2447	Yes
38	Lig1	2837	0.295	0.2412	Yes
39	Rad51	2975	0.281	0.2372	Yes
40	Polr3c	3101	0.269	0.2338	Yes
41	Polh	3123	0.266	0.2389	Yes
42	Nelfcd	3148	0.264	0.2437	Yes
43	Usp11	3155	0.263	0.2499	Yes
44	Vps37d	3183	0.261	0.2544	Yes
45	Guk1	3187	0.261	0.2608	Yes
46	Ercc5	3211	0.258	0.2655	Yes
47	Adrm1	3654	0.223	0.2351	No
48	Polb	3691	0.221	0.2378	No
49	Dctn4	3742	0.217	0.2392	No
50	Nfx1	4062	0.193	0.2181	No
51	Pola2	4081	0.191	0.2215	No
52	Gpx4	4144	0.185	0.2211	No
53	Sf3a3	4222	0.179	0.2194	No
54	Dut	4450	0.161	0.2049	No
55	Gtf2f1	4483	0.159	0.2064	No
56	Vps28	4589	0.151	0.2016	No
57	Aaas	4675	0.143	0.1983	No
58	Cant1	4870	0.128	0.1858	No
59	Npr2	4881	0.127	0.1882	No
60	Supt5	5207	0.104	0.1642	No
61	Ada	5245	0.100	0.1638	No
62	Cox17	5282	0.098	0.1633	No
63	Nt5c	5297	0.097	0.1647	No
64	Dguok	5316	0.096	0.1657	No
65	Rpa3	5386	0.091	0.1624	No
66	Pnp	5394	0.091	0.1641	No
67	Gsdme	5501	0.082	0.1575	No
68	Stx3	5555	0.078	0.1552	No
69	Mrpl40	5659	0.071	0.1485	No
70	Gtf2b	6005	0.045	0.1215	No
71	Dad1	6024	0.044	0.1211	No
72	Nme4	6080	0.041	0.1177	No
73	Polr2h	6131	0.037	0.1145	No
74	Mpc2	6148	0.036	0.1142	No
75	Snapc5	6341	0.024	0.0991	No
76	Ercc3	6485	0.015	0.0877	No
77	Rala	6499	0.014	0.0870	No
78	Gmpr2	6553	0.009	0.0829	No
79	Supt4a	6763	-0.001	0.0659	No
80	Adcy6	6784	-0.002	0.0643	No
81	Rev3l	6789	-0.002	0.0640	No
82	Itpa	6806	-0.003	0.0628	No
83	Ak1	6812	-0.004	0.0625	No
84	Surf1	7118	-0.024	0.0382	No
85	Cmpk2	7175	-0.028	0.0343	No
86	Sdcbp	7367	-0.042	0.0197	No
87	Clp1	7455	-0.048	0.0139	No
88	Arl6ip1	7499	-0.052	0.0117	No
89	Polr2g	7505	-0.052	0.0126	No
90	Bcap31	7554	-0.056	0.0101	No
91	Ak3	7617	-0.059	0.0065	No
92	Cstf3	7663	-0.064	0.0045	No
93	Trp53	7685	-0.065	0.0044	No
94	Polr1d	8067	-0.094	-0.0243	No
95	Edf1	8146	-0.100	-0.0282	No
96	Rfc2	8549	-0.130	-0.0577	No
97	Dgcr8	8649	-0.136	-0.0624	No
98	Ddb1	8715	-0.141	-0.0641	No
99	Taf13	8776	-0.144	-0.0653	No
100	Tarbp2	9083	-0.169	-0.0860	No
101	Snapc4	9234	-0.183	-0.0936	No
102	Gtf2h5	9292	-0.188	-0.0935	No
103	Polr2j	9414	-0.196	-0.0984	No
104	Poll	9460	-0.199	-0.0970	No
105	Nelfe	9504	-0.203	-0.0953	No
106	Upf3b	9507	-0.203	-0.0903	No
107	Alyref	9544	-0.206	-0.0880	No
108	Mpg	9747	-0.222	-0.0988	No
109	Aprt	9895	-0.235	-0.1048	No
110	Polr2e	9958	-0.243	-0.1037	No
111	Rbx1	10121	-0.257	-0.1104	No
112	Eif1b	10186	-0.263	-0.1089	No
113	Polr1c	10310	-0.275	-0.1119	No
114	Prim1	10367	-0.280	-0.1094	No
115	Ncbp2	10388	-0.282	-0.1038	No
116	Pole4	10450	-0.287	-0.1014	No
117	Fen1	10626	-0.307	-0.1079	No
118	Ago4	10802	-0.326	-0.1139	No
119	Pola1	10891	-0.335	-0.1126	No
120	Nudt21	10956	-0.343	-0.1090	No
121	Ercc8	11006	-0.350	-0.1041	No
122	Nme1	11014	-0.352	-0.0957	No
123	Polr2c	11075	-0.359	-0.0914	No
124	Pold3	11127	-0.364	-0.0863	No
125	Ell	11152	-0.367	-0.0789	No
126	Rae1	11232	-0.379	-0.0757	No
127	Taf12	11262	-0.384	-0.0682	No
128	Nudt9	11350	-0.396	-0.0652	No
129	Rfc5	11467	-0.418	-0.0640	No
130	Gtf2h3	11572	-0.438	-0.0614	No
131	Polr2f	11581	-0.440	-0.0508	No
132	Xpc	11651	-0.454	-0.0448	No
133	Pold1	11757	-0.476	-0.0413	No
134	Rad52	11776	-0.479	-0.0305	No
135	Impdh2	11869	-0.499	-0.0253	No
136	Cetn2	11894	-0.506	-0.0143	No
137	Ercc2	12028	-0.557	-0.0110	No
138	Nt5c3	12262	-0.731	-0.0114	No
139	Rrm2b	12291	-0.765	0.0059	No