Details for gene set HALLMARK_APICAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	HSC.HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group4.HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group4_repos
Phenotype	HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group4_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_APICAL_JUNCTION
Enrichment Score (ES)	0.29028663
Normalized Enrichment Score (NES)	1.2324148
Nominal p-value	0.15447155
FDR q-value	0.5810183
FWER p-Value	0.89

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Ikbkg	10	1.395	0.0412	Yes
2	Myh9	137	0.913	0.0584	Yes
3	Mpzl1	171	0.865	0.0818	Yes
4	Cadm2	429	0.688	0.0816	Yes
5	Baiap2	482	0.668	0.0974	Yes
6	Pkd1	556	0.642	0.1108	Yes
7	Lima1	622	0.620	0.1242	Yes
8	Sirpa	667	0.606	0.1389	Yes
9	Itga10	677	0.604	0.1563	Yes
10	Nectin4	714	0.593	0.1713	Yes
11	Pten	739	0.587	0.1870	Yes
12	Map4k2	771	0.577	0.2018	Yes
13	Nectin1	874	0.558	0.2103	Yes
14	Nrap	915	0.550	0.2236	Yes
15	Syk	1047	0.524	0.2287	Yes
16	Skap2	1202	0.494	0.2310	Yes
17	Rsu1	1611	0.430	0.2107	Yes
18	Amigo2	1620	0.428	0.2229	Yes
19	Adam15	1970	0.389	0.2061	Yes
20	Akt2	2023	0.383	0.2134	Yes
21	Gnai1	2136	0.371	0.2154	Yes
22	Nf2	2223	0.360	0.2193	Yes
23	Cap1	2286	0.352	0.2248	Yes
24	Map3k20	2306	0.350	0.2338	Yes
25	Pard6g	2313	0.350	0.2439	Yes
26	Evl	2409	0.339	0.2463	Yes
27	Actn1	2443	0.336	0.2538	Yes
28	Myl12b	2561	0.324	0.2540	Yes
29	Plcg1	2759	0.302	0.2470	Yes
30	Ptprc	2770	0.301	0.2552	Yes
31	Mapk14	2871	0.292	0.2558	Yes
32	Dlg1	3013	0.278	0.2527	Yes
33	Pbx2	3058	0.273	0.2573	Yes
34	Nectin3	3069	0.272	0.2647	Yes
35	Vasp	3100	0.269	0.2704	Yes
36	Src	3106	0.268	0.2780	Yes
37	Tial1	3114	0.267	0.2855	Yes
38	Nrtn	3181	0.261	0.2880	Yes
39	Itgb1	3248	0.255	0.2903	Yes
40	Ctnnd1	3388	0.245	0.2863	Yes
41	Crat	3429	0.241	0.2903	Yes
42	Adam9	3728	0.218	0.2725	No
43	Cd276	3792	0.212	0.2738	No
44	Speg	3837	0.209	0.2765	No
45	Cd86	3952	0.202	0.2732	No
46	Cx3cl1	3983	0.199	0.2768	No
47	Cnn2	4025	0.196	0.2793	No
48	Fscn1	4073	0.192	0.2813	No
49	Cercam	4174	0.182	0.2786	No
50	Col16a1	4346	0.168	0.2697	No
51	Tspan4	4348	0.168	0.2747	No
52	Wasl	4468	0.160	0.2697	No
53	Gtf2f1	4483	0.159	0.2734	No
54	Myh10	4530	0.156	0.2743	No
55	Sorbs3	4534	0.155	0.2787	No
56	Sgce	4627	0.148	0.2757	No
57	Cd274	4685	0.143	0.2753	No
58	Vcl	4759	0.138	0.2735	No
59	Vcan	4824	0.133	0.2723	No
60	Epb41l2	4826	0.133	0.2762	No
61	Rasa1	4856	0.129	0.2777	No
62	Zyx	4902	0.126	0.2778	No
63	Dhx16	5020	0.118	0.2718	No
64	Lamb3	5292	0.098	0.2526	No
65	Ctnna1	5320	0.096	0.2533	No
66	Vav2	5370	0.092	0.2521	No
67	Tsc1	5489	0.083	0.2450	No
68	B4galt1	5573	0.077	0.2405	No
69	Tro	5628	0.073	0.2383	No
70	Inppl1	5701	0.068	0.2344	No
71	Lama3	5744	0.066	0.2330	No
72	Pals1	5831	0.060	0.2278	No
73	Insig1	6214	0.032	0.1975	No
74	Jam3	6326	0.026	0.1892	No
75	Itga9	6454	0.016	0.1794	No
76	Ldlrap1	6851	-0.006	0.1472	No
77	Rac2	6996	-0.016	0.1359	No
78	Gnai2	7202	-0.031	0.1201	No
79	Itga3	7207	-0.031	0.1207	No
80	Tjp1	7254	-0.034	0.1180	No
81	Icam1	7262	-0.035	0.1185	No
82	Tubg1	7300	-0.037	0.1165	No
83	Actg1	7334	-0.040	0.1151	No
84	Cdk8	7450	-0.048	0.1071	No
85	Bmp1	7477	-0.050	0.1065	No
86	Pik3cb	7484	-0.051	0.1075	No
87	Arpc2	7674	-0.065	0.0940	No
88	Jup	7782	-0.072	0.0875	No
89	Shroom2	7824	-0.076	0.0864	No
90	Nf1	7906	-0.081	0.0822	No
91	Exoc4	7992	-0.088	0.0779	No
92	Fbn1	8552	-0.130	0.0362	No
93	Ptk2	8642	-0.135	0.0330	No
94	Tmem8b	8727	-0.141	0.0304	No
95	Traf1	8751	-0.143	0.0328	No
96	Tgfbi	8761	-0.143	0.0364	No
97	Stx4a	8787	-0.145	0.0387	No
98	Cntn1	8823	-0.148	0.0403	No
99	Nlgn2	8882	-0.152	0.0402	No
100	Slit2	9067	-0.168	0.0302	No
101	Rras	9280	-0.186	0.0185	No
102	Layn	9376	-0.193	0.0166	No
103	Icam2	9413	-0.196	0.0195	No
104	Nrxn2	9473	-0.200	0.0207	No
105	Sympk	9506	-0.203	0.0242	No
106	Itga2	9557	-0.207	0.0264	No
107	Rhof	9700	-0.217	0.0214	No
108	Msn	9765	-0.223	0.0228	No
109	Amigo1	9924	-0.239	0.0171	No
110	Pfn1	10287	-0.273	-0.0042	No
111	Sdc3	10333	-0.277	0.0005	No
112	Mmp2	10459	-0.288	-0.0011	No
113	Actn4	10593	-0.303	-0.0028	No
114	Taok2	10674	-0.313	0.0001	No
115	Cd34	10838	-0.329	-0.0034	No
116	Pecam1	10873	-0.333	0.0039	No
117	Shc1	11176	-0.372	-0.0096	No
118	Hadh	11245	-0.381	-0.0036	No
119	Kcnh2	11386	-0.402	-0.0030	No
120	Vwf	11483	-0.420	0.0019	No
121	Akt3	11726	-0.470	-0.0038	No
122	Arhgef6	11955	-0.530	-0.0064	No
123	Ywhah	12177	-0.638	-0.0052	No
124	Actb	12217	-0.676	0.0119	No