Details for gene set HALLMARK_P53

Table: GSEA Results Summary

Dataset	HSC.HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group3.HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group3_repos
Phenotype	HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group3_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_P53_PATHWAY
Enrichment Score (ES)	0.23966314
Normalized Enrichment Score (NES)	1.1191195
Nominal p-value	0.22970296
FDR q-value	0.707535
FWER p-Value	0.987

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Plk2	102	0.976	0.0137	Yes
2	Ppp1r15a	282	0.760	0.0162	Yes
3	Notch1	301	0.752	0.0318	Yes
4	Coq8a	344	0.723	0.0447	Yes
5	Ip6k2	354	0.716	0.0601	Yes
6	Eps8l2	359	0.714	0.0759	Yes
7	Tcn2	443	0.664	0.0841	Yes
8	Ada	450	0.662	0.0986	Yes
9	Tgfa	527	0.622	0.1065	Yes
10	Sec61a1	542	0.616	0.1192	Yes
11	Jag2	905	0.514	0.1012	Yes
12	Jun	952	0.502	0.1088	Yes
13	Polh	967	0.499	0.1189	Yes
14	Pom121	972	0.498	0.1298	Yes
15	Ddit3	975	0.497	0.1409	Yes
16	Fam162a	995	0.493	0.1505	Yes
17	Foxo3	1035	0.482	0.1582	Yes
18	Wrap73	1050	0.480	0.1679	Yes
19	Rnf19b	1060	0.477	0.1780	Yes
20	Tpd52l1	1080	0.475	0.1871	Yes
21	Fos	1149	0.460	0.1920	Yes
22	H2ac25	1256	0.437	0.1932	Yes
23	Sat1	1396	0.417	0.1912	Yes
24	Ak1	1431	0.413	0.1978	Yes
25	Procr	1511	0.403	0.2004	Yes
26	Cgrrf1	1542	0.400	0.2070	Yes
27	Ankra2	1616	0.392	0.2099	Yes
28	Hbegf	1659	0.385	0.2152	Yes
29	Txnip	1855	0.363	0.2074	Yes
30	Irag2	1858	0.363	0.2154	Yes
31	Rpl36	1907	0.355	0.2195	Yes
32	Abhd4	1986	0.344	0.2209	Yes
33	Tprkb	2127	0.324	0.2168	Yes
34	Vwa5a	2315	0.304	0.2083	Yes
35	Csrnp2	2364	0.298	0.2111	Yes
36	Bak1	2397	0.294	0.2151	Yes
37	Tm7sf3	2399	0.294	0.2217	Yes
38	Xpc	2404	0.293	0.2280	Yes
39	Btg1	2455	0.286	0.2304	Yes
40	Osgin1	2478	0.283	0.2350	Yes
41	Blcap	2499	0.280	0.2397	Yes
42	Fas	2630	0.269	0.2351	No
43	Cd82	2849	0.248	0.2228	No
44	Ppm1d	2867	0.247	0.2270	No
45	Prmt2	2888	0.244	0.2309	No
46	Slc19a2	3136	0.224	0.2157	No
47	Tsc22d1	3161	0.223	0.2188	No
48	Pvt1	3188	0.220	0.2217	No
49	Apaf1	3232	0.217	0.2230	No
50	Vdr	3271	0.212	0.2247	No
51	Rps27l	3320	0.209	0.2255	No
52	Wwp1	3494	0.197	0.2158	No
53	Ier5	3525	0.195	0.2178	No
54	Mknk2	3527	0.194	0.2221	No
55	Rxra	3537	0.194	0.2257	No
56	Ercc5	3638	0.186	0.2217	No
57	Rap2b	3648	0.186	0.2252	No
58	Upp1	3654	0.185	0.2290	No
59	Abcc5	3684	0.182	0.2307	No
60	Fdxr	3730	0.178	0.2310	No
61	Ephx1	3868	0.165	0.2236	No
62	Ccng1	4163	0.141	0.2027	No
63	App	4218	0.137	0.2013	No
64	Slc3a2	4440	0.121	0.1860	No
65	Pidd1	4482	0.117	0.1853	No
66	Zmat3	4579	0.108	0.1799	No
67	Hdac3	4631	0.105	0.1780	No
68	Steap3	4902	0.084	0.1578	No
69	Dnttip2	5073	0.071	0.1455	No
70	Tm4sf1	5151	0.065	0.1407	No
71	Rpl18	5247	0.059	0.1342	No
72	Sertad3	5286	0.056	0.1324	No
73	Ei24	5334	0.052	0.1297	No
74	Nupr1	5337	0.052	0.1307	No
75	Rad9a	5345	0.052	0.1313	No
76	Stom	5515	0.040	0.1184	No
77	Ddb2	5621	0.033	0.1105	No
78	St14	5784	0.022	0.0977	No
79	Tspyl2	5884	0.014	0.0899	No
80	Zbtb16	5908	0.012	0.0883	No
81	Pcna	6061	0.002	0.0759	No
82	Mdm2	6203	-0.004	0.0645	No
83	Ralgds	6218	-0.005	0.0634	No
84	Iscu	6427	-0.020	0.0469	No
85	Ndrg1	6657	-0.036	0.0289	No
86	Ninj1	6820	-0.047	0.0167	No
87	Ddit4	6871	-0.050	0.0138	No
88	Hspa4l	6879	-0.051	0.0143	No
89	Rab40c	6906	-0.053	0.0134	No
90	Dgka	7041	-0.062	0.0038	No
91	Hexim1	7133	-0.067	-0.0021	No
92	Cdkn2aip	7265	-0.075	-0.0111	No
93	Ccnd3	7279	-0.076	-0.0105	No
94	Cyfip2	7304	-0.077	-0.0107	No
95	Fuca1	7408	-0.083	-0.0173	No
96	Cd81	7539	-0.092	-0.0258	No
97	Tob1	7584	-0.096	-0.0273	No
98	Slc35d1	7701	-0.104	-0.0344	No
99	Tgfb1	7830	-0.113	-0.0423	No
100	Baiap2	7911	-0.118	-0.0462	No
101	Elp1	8175	-0.136	-0.0647	No
102	H2aj	8250	-0.142	-0.0675	No
103	S100a10	8327	-0.147	-0.0704	No
104	Fgf13	8384	-0.151	-0.0716	No
105	Pitpnc1	8522	-0.159	-0.0792	No
106	Def6	8569	-0.162	-0.0794	No
107	Sp1	8582	-0.163	-0.0767	No
108	Mxd4	8669	-0.170	-0.0799	No
109	Prkab1	8730	-0.175	-0.0808	No
110	Rb1	8795	-0.179	-0.0820	No
111	Aen	8879	-0.186	-0.0846	No
112	Gm2a	8899	-0.188	-0.0819	No
113	Nol8	8953	-0.192	-0.0819	No
114	Mxd1	9031	-0.197	-0.0838	No
115	Ier3	9098	-0.203	-0.0846	No
116	Klf4	9170	-0.209	-0.0857	No
117	Socs1	9212	-0.210	-0.0843	No
118	Trafd1	9241	-0.212	-0.0818	No
119	Sesn1	9398	-0.227	-0.0894	No
120	Rack1	9401	-0.227	-0.0845	No
121	Plxnb2	9482	-0.233	-0.0857	No
122	Ldhb	9499	-0.235	-0.0817	No
123	Mapkapk3	9593	-0.242	-0.0839	No
124	Hint1	9696	-0.252	-0.0865	No
125	Dcxr	9710	-0.253	-0.0819	No
126	Acvr1b	9860	-0.265	-0.0881	No
127	Fbxw7	9980	-0.276	-0.0916	No
128	Rrp8	10051	-0.283	-0.0910	No
129	H1f2	10343	-0.308	-0.1078	No
130	Bax	10379	-0.311	-0.1037	No
131	Ptpn14	10422	-0.316	-0.1000	No
132	Ptpre	10514	-0.326	-0.1000	No
133	Rhbdf2	10588	-0.335	-0.0985	No
134	Rps12	10614	-0.338	-0.0929	No
135	Dram1	10808	-0.359	-0.1006	No
136	Ccnk	10813	-0.359	-0.0928	No
137	Ccp110	10849	-0.364	-0.0874	No
138	Irak1	10991	-0.386	-0.0902	No
139	Zfp36l1	11220	-0.420	-0.0994	No
140	Ctsf	11313	-0.435	-0.0971	No
141	Pmm1	11425	-0.456	-0.0959	No
142	Retsat	11487	-0.466	-0.0903	No
143	Ctsd	11512	-0.470	-0.0817	No
144	Klk8	11576	-0.484	-0.0759	No
145	Kif13b	11715	-0.510	-0.0757	No
146	Ccnd2	11816	-0.535	-0.0718	No
147	Abat	11959	-0.577	-0.0704	No
148	Trib3	12023	-0.604	-0.0619	No
149	Vamp8	12025	-0.604	-0.0483	No
150	F2r	12083	-0.630	-0.0388	No
151	Trp53	12088	-0.635	-0.0247	No
152	Casp1	12127	-0.661	-0.0129	No
153	Tap1	12173	-0.687	-0.0011	No
154	Rchy1	12218	-0.732	0.0119	No