Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	HSC.HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group3.HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group3_repos
Phenotype	HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group3_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_MYOGENESIS
Enrichment Score (ES)	0.22234565
Normalized Enrichment Score (NES)	0.9599632
Nominal p-value	0.52716297
FDR q-value	0.88942957
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Eno3	93	0.993	0.0352	Yes
2	Notch1	301	0.752	0.0507	Yes
3	Ocel1	804	0.540	0.0331	Yes
4	Sirt2	907	0.513	0.0469	Yes
5	Dtna	909	0.513	0.0689	Yes
6	Itgb1	1015	0.490	0.0814	Yes
7	Smtn	1065	0.477	0.0980	Yes
8	Tpd52l1	1080	0.475	0.1173	Yes
9	Wwtr1	1171	0.456	0.1296	Yes
10	Gabarapl2	1189	0.452	0.1477	Yes
11	Ak1	1431	0.413	0.1459	Yes
12	Hbegf	1659	0.385	0.1440	Yes
13	Gsn	1937	0.350	0.1365	Yes
14	Lsp1	2099	0.328	0.1375	Yes
15	Eif4a2	2121	0.325	0.1498	Yes
16	Agl	2126	0.324	0.1634	Yes
17	Akt2	2338	0.301	0.1592	Yes
18	Adcy9	2475	0.283	0.1604	Yes
19	Pygm	2573	0.275	0.1643	Yes
20	Foxo4	2635	0.268	0.1709	Yes
21	Tpm2	2649	0.267	0.1813	Yes
22	Myom1	2654	0.267	0.1925	Yes
23	Schip1	2700	0.262	0.2001	Yes
24	Erbb3	2713	0.261	0.2104	Yes
25	Sptan1	2980	0.234	0.1988	Yes
26	Dmpk	3072	0.227	0.2012	Yes
27	Cnn3	3087	0.226	0.2098	Yes
28	Ctf1	3137	0.224	0.2154	Yes
29	Kcnh2	3324	0.209	0.2093	Yes
30	Ptp4a3	3377	0.205	0.2139	Yes
31	Sspn	3394	0.204	0.2213	Yes
32	Dmd	3566	0.191	0.2156	Yes
33	Gpx3	3704	0.180	0.2122	Yes
34	Myh9	3728	0.178	0.2180	Yes
35	Bhlhe40	3877	0.165	0.2131	Yes
36	Ryr1	3919	0.162	0.2167	Yes
37	Sorbs3	4100	0.146	0.2083	Yes
38	Mylk	4110	0.146	0.2139	Yes
39	Camk2b	4177	0.140	0.2145	Yes
40	App	4218	0.137	0.2172	Yes
41	Mef2d	4228	0.137	0.2223	Yes
42	Igf1	4422	0.123	0.2119	No
43	Fhl1	4988	0.078	0.1692	No
44	Psen2	5052	0.073	0.1672	No
45	Chrnb1	5314	0.054	0.1483	No
46	Lpin1	5477	0.042	0.1369	No
47	Sh2b1	5725	0.026	0.1179	No
48	Ablim1	5810	0.020	0.1120	No
49	Aebp1	5950	0.010	0.1010	No
50	Tpm3	6020	0.005	0.0956	No
51	Gnao1	6112	0.000	0.0882	No
52	Pfkm	6231	-0.006	0.0789	No
53	Prnp	6373	-0.016	0.0681	No
54	Pick1	6621	-0.033	0.0494	No
55	Mef2c	6786	-0.044	0.0379	No
56	Pdlim7	6851	-0.049	0.0348	No
57	Pcx	6862	-0.050	0.0362	No
58	Mapk12	6866	-0.050	0.0381	No
59	Gaa	6921	-0.054	0.0360	No
60	Rit1	7429	-0.084	-0.0016	No
61	Flii	7619	-0.099	-0.0128	No
62	Tgfb1	7830	-0.113	-0.0250	No
63	Myo1c	7969	-0.122	-0.0310	No
64	Large1	8195	-0.137	-0.0434	No
65	Syngr2	8397	-0.151	-0.0533	No
66	Pkia	8509	-0.158	-0.0555	No
67	Hdac5	8590	-0.163	-0.0550	No
68	Clu	8746	-0.176	-0.0601	No
69	Rb1	8795	-0.179	-0.0563	No
70	Ache	9326	-0.219	-0.0900	No
71	Speg	9351	-0.222	-0.0824	No
72	Mapre3	9459	-0.231	-0.0811	No
73	Plxnb2	9482	-0.233	-0.0729	No
74	Pde4dip	9740	-0.255	-0.0828	No
75	Nav2	9752	-0.256	-0.0727	No
76	Sorbs1	10040	-0.281	-0.0840	No
77	Mras	10058	-0.283	-0.0731	No
78	Mef2a	10131	-0.288	-0.0666	No
79	Tsc2	10155	-0.291	-0.0559	No
80	Bin1	10329	-0.307	-0.0568	No
81	Gadd45b	10506	-0.326	-0.0571	No
82	Fdps	10714	-0.348	-0.0590	No
83	Crat	10742	-0.351	-0.0460	No
84	Ifrd1	10762	-0.353	-0.0324	No
85	Atp6ap1	11081	-0.398	-0.0411	No
86	Bag1	11337	-0.438	-0.0430	No
87	Acsl1	11488	-0.466	-0.0352	No
88	Col4a2	11621	-0.492	-0.0247	No
89	Agrn	11917	-0.564	-0.0245	No
90	Svil	11947	-0.575	-0.0020	No
91	Ncam1	12303	-0.832	0.0049	No