Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	HSC.HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group3.HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group3_repos
Phenotype	HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group3_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_HYPOXIA
Enrichment Score (ES)	0.2814011
Normalized Enrichment Score (NES)	1.3456987
Nominal p-value	0.04453441
FDR q-value	0.7760559
FWER p-Value	0.727

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Wsb1	0	2.165	0.0522	Yes
2	Ilvbl	2	1.823	0.0960	Yes
3	Eno3	93	0.993	0.1126	Yes
4	Ppp1r15a	282	0.760	0.1155	Yes
5	Maff	311	0.746	0.1312	Yes
6	Tgfb3	332	0.729	0.1471	Yes
7	Kdm3a	460	0.650	0.1524	Yes
8	Gpc1	564	0.608	0.1586	Yes
9	Hdlbp	580	0.603	0.1719	Yes
10	Inha	629	0.584	0.1821	Yes
11	Sult2b1	826	0.536	0.1790	Yes
12	Pnrc1	859	0.526	0.1890	Yes
13	Zfp36	904	0.514	0.1978	Yes
14	Dtna	909	0.513	0.2098	Yes
15	Jun	952	0.502	0.2185	Yes
16	Ddit3	975	0.497	0.2287	Yes
17	Fam162a	995	0.493	0.2390	Yes
18	Foxo3	1035	0.482	0.2474	Yes
19	Sdc4	1125	0.465	0.2513	Yes
20	Fos	1149	0.460	0.2606	Yes
21	Csrp2	1422	0.414	0.2483	Yes
22	Chst2	1465	0.410	0.2547	Yes
23	Plin2	1474	0.409	0.2639	Yes
24	Tpst2	1484	0.407	0.2730	Yes
25	Ankzf1	1502	0.406	0.2814	Yes
26	Sdc2	1714	0.380	0.2733	No
27	Pim1	1834	0.365	0.2724	No
28	Ets1	1902	0.355	0.2755	No
29	Noct	2059	0.333	0.2707	No
30	Ak4	2193	0.318	0.2675	No
31	Prkca	2394	0.294	0.2583	No
32	Btg1	2455	0.286	0.2603	No
33	Pygm	2573	0.275	0.2573	No
34	Hexa	2792	0.254	0.2456	No
35	Pfkl	2922	0.241	0.2409	No
36	Nr3c1	2953	0.238	0.2442	No
37	Lxn	3081	0.227	0.2392	No
38	Eno2	3173	0.221	0.2371	No
39	Tgfbi	3176	0.221	0.2423	No
40	Pdk1	3373	0.205	0.2312	No
41	Galk1	3389	0.204	0.2349	No
42	Siah2	3458	0.201	0.2342	No
43	Plaur	3465	0.200	0.2385	No
44	Cdkn1b	3503	0.197	0.2402	No
45	Slc6a6	3551	0.193	0.2410	No
46	Rora	3570	0.191	0.2442	No
47	Pdk3	3614	0.188	0.2452	No
48	Ampd3	3712	0.179	0.2416	No
49	Myh9	3728	0.178	0.2446	No
50	Bhlhe40	3877	0.165	0.2365	No
51	Bnip3l	3878	0.165	0.2405	No
52	Fosl2	3926	0.161	0.2405	No
53	Irs2	3962	0.158	0.2415	No
54	Dusp1	3990	0.156	0.2430	No
55	Pgk1	4297	0.131	0.2211	No
56	Phkg1	4352	0.127	0.2198	No
57	Ugp2	4492	0.116	0.2112	No
58	Bgn	4687	0.099	0.1977	No
59	Hs3st1	4812	0.091	0.1898	No
60	Vhl	4813	0.091	0.1920	No
61	Hoxb9	4969	0.079	0.1812	No
62	P4ha1	4989	0.078	0.1815	No
63	Cavin1	5068	0.071	0.1769	No
64	Ids	5100	0.069	0.1760	No
65	Cdkn1c	5157	0.065	0.1730	No
66	Tes	5164	0.064	0.1740	No
67	Klhl24	5317	0.054	0.1629	No
68	Gbe1	5474	0.043	0.1512	No
69	Slc2a3	5481	0.042	0.1517	No
70	Gys1	5581	0.036	0.1445	No
71	Rbpj	5837	0.017	0.1240	No
72	Ndst2	5915	0.012	0.1180	No
73	Vegfa	6004	0.006	0.1110	No
74	Jmjd6	6009	0.006	0.1108	No
75	Tpi1	6104	0.000	0.1031	No
76	Isg20	6173	-0.002	0.0976	No
77	Prdx5	6495	-0.025	0.0719	No
78	Klf6	6516	-0.026	0.0709	No
79	Hk2	6592	-0.031	0.0655	No
80	Ndrg1	6657	-0.036	0.0612	No
81	Atp7a	6691	-0.039	0.0594	No
82	Ddit4	6871	-0.050	0.0460	No
83	Gaa	6921	-0.054	0.0433	No
84	Casp6	6942	-0.055	0.0430	No
85	Tgm2	7210	-0.071	0.0229	No
86	Pdgfb	7338	-0.080	0.0144	No
87	Gpi1	7467	-0.088	0.0060	No
88	Plac8	7512	-0.091	0.0046	No
89	Pfkp	7666	-0.102	-0.0054	No
90	Slc2a1	7747	-0.108	-0.0094	No
91	Hk1	7815	-0.112	-0.0121	No
92	Tiparp	7991	-0.123	-0.0235	No
93	Map3k1	8135	-0.133	-0.0320	No
94	Nagk	8183	-0.136	-0.0325	No
95	Large1	8195	-0.137	-0.0301	No
96	Ext1	8284	-0.144	-0.0338	No
97	Ero1a	8320	-0.146	-0.0332	No
98	Tpd52	8321	-0.146	-0.0297	No
99	Ppargc1a	8557	-0.161	-0.0450	No
100	Efna1	8844	-0.184	-0.0640	No
101	Gcnt2	8888	-0.187	-0.0630	No
102	Tnfaip3	8893	-0.188	-0.0588	No
103	Anxa2	9053	-0.199	-0.0670	No
104	Ier3	9098	-0.203	-0.0657	No
105	Grhpr	9179	-0.209	-0.0672	No
106	Gpc3	9247	-0.213	-0.0676	No
107	Cited2	9399	-0.227	-0.0744	No
108	Pgm1	9428	-0.229	-0.0712	No
109	Vldlr	9637	-0.247	-0.0823	No
110	Pam	9654	-0.248	-0.0776	No
111	Cxcr4	9717	-0.253	-0.0766	No
112	Sdc3	9741	-0.255	-0.0723	No
113	Mt1	9935	-0.272	-0.0815	No
114	Hspa5	10061	-0.284	-0.0849	No
115	Pfkfb3	10408	-0.314	-0.1056	No
116	Aldoc	10535	-0.328	-0.1080	No
117	Klf7	10776	-0.355	-0.1191	No
118	Sap30	10799	-0.358	-0.1123	No
119	Slc25a1	11009	-0.389	-0.1200	No
120	Aldoa	11270	-0.429	-0.1309	No
121	Nedd4l	11359	-0.442	-0.1275	No
122	Mif	11375	-0.445	-0.1180	No
123	Ccng2	11451	-0.460	-0.1130	No
124	Xpnpep1	11587	-0.485	-0.1124	No
125	Ldha	11655	-0.498	-0.1058	No
126	Selenbp1	11858	-0.547	-0.1092	No
127	Kif5a	11871	-0.549	-0.0969	No
128	Glrx	11880	-0.552	-0.0843	No
129	Pklr	11915	-0.564	-0.0735	No
130	Bcl2	11943	-0.574	-0.0619	No
131	Ndst1	11958	-0.577	-0.0491	No
132	Mxi1	12105	-0.651	-0.0453	No
133	Zfp292	12148	-0.669	-0.0327	No
134	Pgm2	12349	-1.038	-0.0240	No
135	Scarb1	12350	-1.041	0.0011	No